<=>End overlap alignment

Alignment #1 HSP: 2000 bps / non-identical: 0 bps

Full alignment

BX470181.7	184085	ATATTTGTACTTAAGCATGACAAAAATACAGAGCAACCCTCCCAACCAAC	184134
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX470100.6	1	ATATTTGTACTTAAGCATGACAAAAATACAGAGCAACCCTCCCAACCAAC	50

BX470181.7	184135	CAATTAACACTGACTGTAGGTATACATGTTGTTAATGAATACTACTCAGT	184184
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX470100.6	51	CAATTAACACTGACTGTAGGTATACATGTTGTTAATGAATACTACTCAGT	100

BX470181.7	184185	ACTTAAATGTACAACTATAGTGTAATAAAAAAACCATAAAATAAAGTGTA	184234
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX470100.6	101	ACTTAAATGTACAACTATAGTGTAATAAAAAAACCATAAAATAAAGTGTA	150

BX470181.7	184235	AGCAAACTATATGTGAATCTGTTCGAACAAAACATAAACAGAAGAGATCC	184284
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX470100.6	151	AGCAAACTATATGTGAATCTGTTCGAACAAAACATAAACAGAAGAGATCC	200

BX470181.7	184285	ATTATACACAAGTTCATAACATATCCATCTTCTAATTATTCTCTTGGTCT	184334
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX470100.6	201	ATTATACACAAGTTCATAACATATCCATCTTCTAATTATTCTCTTGGTCT	250

BX470181.7	184335	CATAAATAATGATGATGTGAGAAGGACGGTCTGAAGAAACAAATTACAGA	184384
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX470100.6	251	CATAAATAATGATGATGTGAGAAGGACGGTCTGAAGAAACAAATTACAGA	300

BX470181.7	184385	CCAAATAAAAAATAAATAAATACAAATCTCCCTGTGGAATAACAAAAAGC	184434
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX470100.6	301	CCAAATAAAAAATAAATAAATACAAATCTCCCTGTGGAATAACAAAAAGC	350

BX470181.7	184435	TTGTGCCACCACTTCTGCAGGAACTTCATTCATTTCCCTCCCTCAATTTC	184484
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX470100.6	351	TTGTGCCACCACTTCTGCAGGAACTTCATTCATTTCCCTCCCTCAATTTC	400

BX470181.7	184485	TTGGCACCAATATCTAGATGACAGGGCCCTGCATACTGCATACGGCCTTG	184534
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX470100.6	401	TTGGCACCAATATCTAGATGACAGGGCCCTGCATACTGCATACGGCCTTG	450

BX470181.7	184535	GCTCCTGTCTATAAAAAAAGATAAGACCCTGCCTTAATAAAGAGATGTGG	184584
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX470100.6	451	GCTCCTGTCTATAAAAAAAGATAAGACCCTGCCTTAATAAAGAGATGTGG	500

BX470181.7	184585	CATCTCCCAGGCAGTGCTGATGTGTTAGACATTTTCCAAATCAGCTCCGA	184634
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX470100.6	501	CATCTCCCAGGCAGTGCTGATGTGTTAGACATTTTCCAAATCAGCTCCGA	550

BX470181.7	184635	CTTTAATTAAATTCAGGGGCCCCATTCAGAGGCTTTGTGAGGAGCTGCTT	184684
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX470100.6	551	CTTTAATTAAATTCAGGGGCCCCATTCAGAGGCTTTGTGAGGAGCTGCTT	600

BX470181.7	184685	TGTATGGCGGGTGAGGAGTGCGGGGAGTGCCAGGCATAATTTGCCCAGAG	184734
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX470100.6	601	TGTATGGCGGGTGAGGAGTGCGGGGAGTGCCAGGCATAATTTGCCCAGAG	650

BX470181.7	184735	ACGTGAGCTTGAAGAAGACTGTCTGCAGCTCTAATAGTTTAATGCAGCCT	184784
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX470100.6	651	ACGTGAGCTTGAAGAAGACTGTCTGCAGCTCTAATAGTTTAATGCAGCCT	700

BX470181.7	184785	TATTGATTAGCAGTTTAATGTACAACTAATGAATTGTTTCTTTAATACCC	184834
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX470100.6	701	TATTGATTAGCAGTTTAATGTACAACTAATGAATTGTTTCTTTAATACCC	750

BX470181.7	184835	TTTGCACATCTATTTACCAGCCCATCAGTATGGGCCACAGCGCTTGCACA	184884
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX470100.6	751	TTTGCACATCTATTTACCAGCCCATCAGTATGGGCCACAGCGCTTGCACA	800

BX470181.7	184885	AAAGAGGGAGGGCGAACCGTGGAAAAATGCTTTTTGAAAAAGCATGTTTG	184934
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX470100.6	801	AAAGAGGGAGGGCGAACCGTGGAAAAATGCTTTTTGAAAAAGCATGTTTG	850

BX470181.7	184935	CTTTTCGAAAGGCTGTGATTACGCATTCAGTATTACAAGAAAAGAAAATA	184984
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX470100.6	851	CTTTTCGAAAGGCTGTGATTACGCATTCAGTATTACAAGAAAAGAAAATA	900

BX470181.7	184985	ATGGTATTTGTCTGGAATTTTAACTATTTAAGGGCAACTTTATCAGTAGA	185034
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX470100.6	901	ATGGTATTTGTCTGGAATTTTAACTATTTAAGGGCAACTTTATCAGTAGA	950

BX470181.7	185035	CTGCAGTGCTTTCCACAGGTTTGAAATATACTAGCGGGGGAAACTGGATT	185084
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX470100.6	951	CTGCAGTGCTTTCCACAGGTTTGAAATATACTAGCGGGGGAAACTGGATT	1000

BX470181.7	185085	GAAACACACCTTTTACCTACAGCCCATAAATCGTTAACTACATGCGACAA	185134
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX470100.6	1001	GAAACACACCTTTTACCTACAGCCCATAAATCGTTAACTACATGCGACAA	1050

BX470181.7	185135	ACAAAAAAATAACATGATTTTTAACAATATTTTCATTCATTATGACACTG	185184
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX470100.6	1051	ACAAAAAAATAACATGATTTTTAACAATATTTTCATTCATTATGACACTG	1100

BX470181.7	185185	TTACTTTTTCTTTTCAATGGGTTAAAGGTTTTTTTTTCCAAAATGAAAAA	185234
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX470100.6	1101	TTACTTTTTCTTTTCAATGGGTTAAAGGTTTTTTTTTCCAAAATGAAAAA	1150

BX470181.7	185235	AGAAATCCACTATTTCTCTTTACCATTCAGGAGCCATGTGATCTTATTGG	185284
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX470100.6	1151	AGAAATCCACTATTTCTCTTTACCATTCAGGAGCCATGTGATCTTATTGG	1200

BX470181.7	185285	TAAAAGCTGCTCTATTTCTGCCCTAGTTCATTTTGTACAGTACTGCCAAA	185334
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX470100.6	1201	TAAAAGCTGCTCTATTTCTGCCCTAGTTCATTTTGTACAGTACTGCCAAA	1250

BX470181.7	185335	GCATTCAGTACATGTATACAATGTGTAATATATTTTCACCATCAAATTAT	185384
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX470100.6	1251	GCATTCAGTACATGTATACAATGTGTAATATATTTTCACCATCAAATTAT	1300

BX470181.7	185385	TCAAACATACAGCAAATGAGAAATAAATGACAAAAAAAAAAAGGAATAAA	185434
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX470100.6	1301	TCAAACATACAGCAAATGAGAAATAAATGACAAAAAAAAAAAGGAATAAA	1350

BX470181.7	185435	ACAAACAATATCTCTGGTTATATCTGGTTAACCACTTCTAATGGCGTATA	185484
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX470100.6	1351	ACAAACAATATCTCTGGTTATATCTGGTTAACCACTTCTAATGGCGTATA	1400

BX470181.7	185485	TACAGTACATTTAGCAGTCAGTTTAGATGATATTTCGTCCTCTACAGTGT	185534
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX470100.6	1401	TACAGTACATTTAGCAGTCAGTTTAGATGATATTTCGTCCTCTACAGTGT	1450

BX470181.7	185535	AAAAAGTCATTTTGTGGCCTTGTAGATTTGATTAATATTAATATGCACAC	185584
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX470100.6	1451	AAAAAGTCATTTTGTGGCCTTGTAGATTTGATTAATATTAATATGCACAC	1500

BX470181.7	185585	TTTATTTAATACAATAAATTTCCTGATTTTAGGGCTTTTTTTTTTGCTTT	185634
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX470100.6	1501	TTTATTTAATACAATAAATTTCCTGATTTTAGGGCTTTTTTTTTTGCTTT	1550

BX470181.7	185635	GAAATTAATTAAAAATGTCTGTAATAAAATCAAATCAATTTTATTATAAG	185684
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX470100.6	1551	GAAATTAATTAAAAATGTCTGTAATAAAATCAAATCAATTTTATTATAAG	1600

BX470181.7	185685	AATTTAGGTGTTATTTTTAAATAATTTCAAAAAGAGAAAATATTAATTAA	185734
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX470100.6	1601	AATTTAGGTGTTATTTTTAAATAATTTCAAAAAGAGAAAATATTAATTAA	1650

BX470181.7	185735	GACCAACGTAATTAAAATGAGCATTTTCAAATTAGCCAGGGGCACACAAG	185784
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX470100.6	1651	GACCAACGTAATTAAAATGAGCATTTTCAAATTAGCCAGGGGCACACAAG	1700

BX470181.7	185785	TCAGTATGTTTAGCCGAAGACCAGCTGCCCTCGCCAGGTACACGAGTAAT	185834
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX470100.6	1701	TCAGTATGTTTAGCCGAAGACCAGCTGCCCTCGCCAGGTACACGAGTAAT	1750

BX470181.7	185835	GAGCGCCCGTCATGACCTTGAGGTGGACATCTCAGCAATTGTCAAAGGAC	185884
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX470100.6	1751	GAGCGCCCGTCATGACCTTGAGGTGGACATCTCAGCAATTGTCAAAGGAC	1800

BX470181.7	185885	ATAAACTACGGATTTGAGTTTTAAACAACTACATTCGTTAAACAACGAAT	185934
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX470100.6	1801	ATAAACTACGGATTTGAGTTTTAAACAACTACATTCGTTAAACAACGAAT	1850

BX470181.7	185935	TAATTGTTACTCAATCCATATATGTTGAATTGAATTAATAATATTGCTTG	185984
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX470100.6	1851	TAATTGTTACTCAATCCATATATGTTGAATTGAATTAATAATATTGCTTG	1900

BX470181.7	185985	TTTTGTTACCTCAAATTTATTGAGTAGATATGGGGTATTATTTTTTACAG	186034
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX470100.6	1901	TTTTGTTACCTCAAATTTATTGAGTAGATATGGGGTATTATTTTTTACAG	1950

BX470181.7	186035	TATACAAGTATATTGTAAAGTTTTTCTGAGTCGTTCAGATTAAAGAATTC	186084
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX470100.6	1951	TATACAAGTATATTGTAAAGTTTTTCTGAGTCGTTCAGATTAAAGAATTC	2000

Overview

Query
BX470181.7 - 186084 bps
Hit
BX470100.6 - 117304 bps
Total alignments
22
Best alignment
alignment #1 (HSP: 2000 bps)
Best alignment cartoon

Alternate alignments

#%IDscoreHSPstartendstrandhstarthendhstrand
1100192420001840851860841120001
288.341242271332231334491762578471
380.25158555142332142886111833123841
490.61132209133275133483-116284164961
587.98114207142364142570116289164961
689.95110196132979133174-116503166911
782.59110243144052144294-123774240201
888.95320556142331142886-143178437291
977.92106622141662142283-143218438241
1085.34128270133211133480143432436971
1186.81102181151803151983151218513991
1282.2714835112881638151226515691
1380.72123348149777150124-160302606331
1489.7110165161698161862162294624581
1591.9799137149995150131162888630241
1686.65163314149746150059164421647121
1789.59146224126360126583-164422646421
1885.23218473142364142836-165244657101
1985.99101223132976133198165248654611
2091.49155233133263133495165493657271
2187.4210016612921457-169004691701
2291.22108148161698161845169023691701
Short-link