<=>End overlap alignment

Alignment #1 HSP: 2000 bps / non-identical: 0 bps

Full alignment

CR381655.6	1	TGCCCTCTCTTACCAAGGATGACTACCTGGACCTGGGTGTGACCCGAGTT	50
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX470081.7	82547	TGCCCTCTCTTACCAAGGATGACTACCTGGACCTGGGTGTGACCCGAGTT	82596

CR381655.6	51	GGCCATCGCATGAACATAGAGAGGGCGCTCAGGAGAGTTATGGACAGGTG	100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX470081.7	82597	GGCCATCGCATGAACATAGAGAGGGCGCTCAGGAGAGTTATGGACAGGTG	82646

CR381655.6	101	AGAGGAGAGAAAAGGGGGAAGCAGAGAGATGCAAGGGATGTCTGCAATGG	150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX470081.7	82647	AGAGGAGAGAAAAGGGGGAAGCAGAGAGATGCAAGGGATGTCTGCAATGG	82696

CR381655.6	151	AAAGGGATTAGGGTGAGGGGTAGTGCATGAGCAAAAAAGCTATTATACTT	200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX470081.7	82697	AAAGGGATTAGGGTGAGGGGTAGTGCATGAGCAAAAAAGCTATTATACTT	82746

CR381655.6	201	AAGGTAACTCTTGATATGCTATTGATTGCTAACTTCAGAGAACACTTGGA	250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX470081.7	82747	AAGGTAACTCTTGATATGCTATTGATTGCTAACTTCAGAGAACACTTGGA	82796

CR381655.6	251	GTGGGCCACTGCATGAGGTCCAGGATGGCATGGGGAAAGAAATGGAGAAC	300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX470081.7	82797	GTGGGCCACTGCATGAGGTCCAGGATGGCATGGGGAAAGAAATGGAGAAC	82846

CR381655.6	301	TGAGAGAGGGGGATGTGGGAGAGCAAGAGAAAAATACTTCCTTATAAAGA	350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX470081.7	82847	TGAGAGAGGGGGATGTGGGAGAGCAAGAGAAAAATACTTCCTTATAAAGA	82896

CR381655.6	351	CTTTCCACCTTCCCCCCCTATCATCAGGCTGTCTTCTAGCACTTTCCCCA	400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX470081.7	82897	CTTTCCACCTTCCCCCCCTATCATCAGGCTGTCTTCTAGCACTTTCCCCA	82946

CR381655.6	401	TTTCTGCTCTCTCTCCTCGAAATGGACGGACAAACAGAAGGAGAGATGAG	450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX470081.7	82947	TTTCTGCTCTCTCTCCTCGAAATGGACGGACAAACAGAAGGAGAGATGAG	82996

CR381655.6	451	GCCAACCGGAGTTGAGAGAACAGGAAAGATGAGGTGACAACTGCTGCCAT	500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX470081.7	82997	GCCAACCGGAGTTGAGAGAACAGGAAAGATGAGGTGACAACTGCTGCCAT	83046

CR381655.6	501	CAGAGATTATTCCCTGAATGAAGAATAAAGCAGGATGAGGTGACTTTGAA	550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX470081.7	83047	CAGAGATTATTCCCTGAATGAAGAATAAAGCAGGATGAGGTGACTTTGAA	83096

CR381655.6	551	ATCAGACTGCCTGCTTATGAATGGAGAGATACAGAAGAGAGTTGACGGCC	600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX470081.7	83097	ATCAGACTGCCTGCTTATGAATGGAGAGATACAGAAGAGAGTTGACGGCC	83146

CR381655.6	601	TGTCTGAACTGTGAACACGCCTGCGCTTACATGTGTGATTCAGTCAACGA	650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX470081.7	83147	TGTCTGAACTGTGAACACGCCTGCGCTTACATGTGTGATTCAGTCAACGA	83196

CR381655.6	651	AAACATAACCACCCACATACACATCCGCATGTCAACCTCTGAACAAAATA	700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX470081.7	83197	AAACATAACCACCCACATACACATCCGCATGTCAACCTCTGAACAAAATA	83246

CR381655.6	701	CACTTAGTTTGAGCTTGCAGGCACTCACAAGGTGGTCAAATTGGAATTAA	750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX470081.7	83247	CACTTAGTTTGAGCTTGCAGGCACTCACAAGGTGGTCAAATTGGAATTAA	83296

CR381655.6	751	CTGAACAAATCACATAGGGGGATCTATCTCTGTAGGATTAAACATGTTCA	800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX470081.7	83297	CTGAACAAATCACATAGGGGGATCTATCTCTGTAGGATTAAACATGTTCA	83346

CR381655.6	801	CAACATGAGAAGGTAACATACTACATAACTGAGCCAAATAATTTGAGGGA	850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX470081.7	83347	CAACATGAGAAGGTAACATACTACATAACTGAGCCAAATAATTTGAGGGA	83396

CR381655.6	851	AACAATCAAAATGGTCTTATCTTTTCTGTTTTTCTTTTGGAAGAGATAGG	900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX470081.7	83397	AACAATCAAAATGGTCTTATCTTTTCTGTTTTTCTTTTGGAAGAGATAGG	83446

CR381655.6	901	GAGAAAGAGAGATATTGAAACCTCCTTTGCTGTCTTTCTCTTTTTCTCAG	950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX470081.7	83447	GAGAAAGAGAGATATTGAAACCTCCTTTGCTGTCTTTCTCTTTTTCTCAG	83496

CR381655.6	951	ATGTTGAGCTGAGTCTAGAACTGACAAACATTTACTAAGGGTATCATTTT	1000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX470081.7	83497	ATGTTGAGCTGAGTCTAGAACTGACAAACATTTACTAAGGGTATCATTTT	83546

CR381655.6	1001	TAGAGCAGGTTCAATGGAGACCATTGCTGGAAGGACAAGTACTGACAAAC	1050
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX470081.7	83547	TAGAGCAGGTTCAATGGAGACCATTGCTGGAAGGACAAGTACTGACAAAC	83596

CR381655.6	1051	CTCCTGTCTGGCACGACTAGGGAAGCCCTTAAAATAGAGGTCAATTTTAT	1100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX470081.7	83597	CTCCTGTCTGGCACGACTAGGGAAGCCCTTAAAATAGAGGTCAATTTTAT	83646

CR381655.6	1101	GGCAGGCACTTATTTGGTAAGACTGTGTTGATGCGTGGGTTCCTGTTGTT	1150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX470081.7	83647	GGCAGGCACTTATTTGGTAAGACTGTGTTGATGCGTGGGTTCCTGTTGTT	83696

CR381655.6	1151	TGTGTATGAGTGTGTGCGTGTGTGTACATGATAATGTGAAAGGTTATCAC	1200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX470081.7	83697	TGTGTATGAGTGTGTGCGTGTGTGTACATGATAATGTGAAAGGTTATCAC	83746

CR381655.6	1201	TAGAGGCATGACCGTGATTTGTTAGCCTATGTGTTTTTACCTCACCAGTG	1250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX470081.7	83747	TAGAGGCATGACCGTGATTTGTTAGCCTATGTGTTTTTACCTCACCAGTG	83796

CR381655.6	1251	GAGGATTCTATTTTGCCAAAGCCAAATTGAGGCTTGTGCTTATCTTATAT	1300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX470081.7	83797	GAGGATTCTATTTTGCCAAAGCCAAATTGAGGCTTGTGCTTATCTTATAT	83846

CR381655.6	1301	TTCACTAGAAATTCTTTACCTTCTCATGTCTTATAATGAAATTCTATATA	1350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX470081.7	83847	TTCACTAGAAATTCTTTACCTTCTCATGTCTTATAATGAAATTCTATATA	83896

CR381655.6	1351	TATGAAAAAAAAAAAATATATATATATATAAATATATACAGACTGGTCAC	1400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX470081.7	83897	TATGAAAAAAAAAAAATATATATATATATAAATATATACAGACTGGTCAC	83946

CR381655.6	1401	TGTATTACAAACCCGTAGCAAAAATAAGTGCCCAGACCAACAGAAAACAC	1450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX470081.7	83947	TGTATTACAAACCCGTAGCAAAAATAAGTGCCCAGACCAACAGAAAACAC	83996

CR381655.6	1451	ACATAAATACTCTACCACATACAAACATACACACAGTACATTCTCAGATT	1500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX470081.7	83997	ACATAAATACTCTACCACATACAAACATACACACAGTACATTCTCAGATT	84046

CR381655.6	1501	ACTGATATATAAATATATATACACACTACAACCATGTCTTTTATTTATAT	1550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX470081.7	84047	ACTGATATATAAATATATATACACACTACAACCATGTCTTTTATTTATAT	84096

CR381655.6	1551	GACACATAATGGGACACAGTAAAATATCTATGTACGGAAACAAGATGACG	1600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX470081.7	84097	GACACATAATGGGACACAGTAAAATATCTATGTACGGAAACAAGATGACG	84146

CR381655.6	1601	ATCAAAATACGCAAAAAATCTTTTAACGAAGGATGATACAACATTGTAAA	1650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX470081.7	84147	ATCAAAATACGCAAAAAATCTTTTAACGAAGGATGATACAACATTGTAAA	84196

CR381655.6	1651	AAGAAAAGTATATATATATATATACACACACTGCAAATTTATCAACATTT	1700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX470081.7	84197	AAGAAAAGTATATATATATATATACACACACTGCAAATTTATCAACATTT	84246

CR381655.6	1701	TTACCAATGACTGTCAAAATATAGAAGTAACTACAACTTCAACGAACCTA	1750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX470081.7	84247	TTACCAATGACTGTCAAAATATAGAAGTAACTACAACTTCAACGAACCTA	84296

CR381655.6	1751	TCCACGATATCAAGGCTCCATTTTAAAACAGGAGACAGCATGGAGAAGAG	1800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX470081.7	84297	TCCACGATATCAAGGCTCCATTTTAAAACAGGAGACAGCATGGAGAAGAG	84346

CR381655.6	1801	GGAGAGGAAAAACCAAACTGCCTGTATTTCTCTTTTTCCAAGTCACTCTC	1850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX470081.7	84347	GGAGAGGAAAAACCAAACTGCCTGTATTTCTCTTTTTCCAAGTCACTCTC	84396

CR381655.6	1851	CCTCTCTTCTTCCAAAAATCAAAACACTTTCTATGGAGGCGAGGCAGGAC	1900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX470081.7	84397	CCTCTCTTCTTCCAAAAATCAAAACACTTTCTATGGAGGCGAGGCAGGAC	84446

CR381655.6	1901	GAACATGCACTCAGACATGGGTGAGGGATACGTGCTAATCTGTTTTAATA	1950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX470081.7	84447	GAACATGCACTCAGACATGGGTGAGGGATACGTGCTAATCTGTTTTAATA	84496

CR381655.6	1951	CAACGATTGTTCCTATAACAATTTTTAAACTCTAAATGGGTCTGGAATTC	2000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX470081.7	84497	CAACGATTGTTCCTATAACAATTTTTAAACTCTAAATGGGTCTGGAATTC	84546

Overview

Query
CR381655.6 - 92180 bps
Hit
BX470081.7 - 84546 bps
Total alignments
7
Best alignment
alignment #1 (HSP: 2000 bps)
Best alignment cartoon

Alternate alignments

#%IDscoreHSPstartendstrandhstarthendhstrand
11001962200012000182547845461
286.721482644729847561-1466149161
376.71744284681947246-1491953431
496.347546838568438-134198342511
590.941882642068820951-136854371181
686.21931752039020564-137679378521
781.671264153724837662-157655580741
Short-link