<=>End overlap alignment

Alignment #1 HSP: 2000 bps / non-identical: 0 bps

Full alignment

BX547940.7	1	GTTGTGCATAATATCTGTATTCATATTCTAGCAGACACACATCAGCACAC	50
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX470078.6	182334	GTTGTGCATAATATCTGTATTCATATTCTAGCAGACACACATCAGCACAC	182383

BX547940.7	51	ATTTTCCAATATATCCTGTCAGACAAACCTTAGATGTCTGAGATTGTTCA	100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX470078.6	182384	ATTTTCCAATATATCCTGTCAGACAAACCTTAGATGTCTGAGATTGTTCA	182433

BX547940.7	101	TGGACATTAGCATTTGTCAAATAAAAGATTTATCATTGCTGGGAAAAGAG	150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX470078.6	182434	TGGACATTAGCATTTGTCAAATAAAAGATTTATCATTGCTGGGAAAAGAG	182483

BX547940.7	151	CTGTTTTTTTCAATTGTTTAATTTGTGTTCGCTGCTCTTTGTGTTTTATA	200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX470078.6	182484	CTGTTTTTTTCAATTGTTTAATTTGTGTTCGCTGCTCTTTGTGTTTTATA	182533

BX547940.7	201	GACAAAACATGGAGAGGGGTCAATCAAAATCTGTCTGTTTGGACATCAAT	250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX470078.6	182534	GACAAAACATGGAGAGGGGTCAATCAAAATCTGTCTGTTTGGACATCAAT	182583

BX547940.7	251	GTCCTCCCTGTGCCTCTTTGAAATGAACAAACAGCAGATGCACTCTATAG	300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX470078.6	182584	GTCCTCCCTGTGCCTCTTTGAAATGAACAAACAGCAGATGCACTCTATAG	182633

BX547940.7	301	GTATGTCCAAAAGTATTAAGGCATTTTAAATTTAATAAAAATTTGGCTGA	350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX470078.6	182634	GTATGTCCAAAAGTATTAAGGCATTTTAAATTTAATAAAAATTTGGCTGA	182683

BX547940.7	351	CTTGAATAGGACACTAAAGGTGAAAATTCAAAATTGATCAAAATAACAGC	400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX470078.6	182684	CTTGAATAGGACACTAAAGGTGAAAATTCAAAATTGATCAAAATAACAGC	182733

BX547940.7	401	GAAGACATTCACTAACTTAATGCTGTGATCAATTTTTCAAATAGTGCTGA	450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX470078.6	182734	GAAGACATTCACTAACTTAATGCTGTGATCAATTTTTCAAATAGTGCTGA	182783

BX547940.7	451	TAAAAGTTAGCAAAATTAAAGCGTCCTAACAACTTTTTCCATTGATAATC	500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX470078.6	182784	TAAAAGTTAGCAAAATTAAAGCGTCCTAACAACTTTTTCCATTGATAATC	182833

BX547940.7	501	ATTTGAAATGTTTGTTAACCACCTAATCGACATATTAGATAATAAGGGCT	550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX470078.6	182834	ATTTGAAATGTTTGTTAACCACCTAATCGACATATTAGATAATAAGGGCT	182883

BX547940.7	551	CTTTTGACACCAAAGACCAATAGAATTGTTATGCTTTTTCTCCAATTATT	600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX470078.6	182884	CTTTTGACACCAAAGACCAATAGAATTGTTATGCTTTTTCTCCAATTATT	182933

BX547940.7	601	TCCACTGACCCCTAAACACTTCTTTGCAGCCCCCAGACCAGTTTGAACCC	650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX470078.6	182934	TCCACTGACCCCTAAACACTTCTTTGCAGCCCCCAGACCAGTTTGAACCC	182983

BX547940.7	651	CCCCTACAAATCCATTTATGTTTAATATGTATTTATTTTACCATAAAAAT	700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX470078.6	182984	CCCCTACAAATCCATTTATGTTTAATATGTATTTATTTTACCATAAAAAT	183033

BX547940.7	701	AAACTAATATTTATCAAATAGTATGCAAATTAATATTATTTTAGTCAATT	750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX470078.6	183034	AAACTAATATTTATCAAATAGTATGCAAATTAATATTATTTTAGTCAATT	183083

BX547940.7	751	TATCATACACTCAACGGCCACTTTATTAGGTACACCTTACTAGTATTGAG	800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX470078.6	183084	TATCATACACTCAACGGCCACTTTATTAGGTACACCTTACTAGTATTGAG	183133

BX547940.7	801	TTGGATCCCCTTTTGCCTTCAGAACTGCCTTAATCCTTCGCGGCAGAGAT	850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX470078.6	183134	TTGGATCCCCTTTTGCCTTCAGAACTGCCTTAATCCTTCGCGGCAGAGAT	183183

BX547940.7	851	TCAGTACTGGAAATATTCCTCAGAGATTTTGCTCCATATTGATATGATAG	900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX470078.6	183184	TCAGTACTGGAAATATTCCTCAGAGATTTTGCTCCATATTGATATGATAG	183233

BX547940.7	901	CATCATGCAGTTGCTGCAGATTTGTCGGCTGCACATCCATGATGTGAAAC	950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX470078.6	183234	CATCATGCAGTTGCTGCAGATTTGTCGGCTGCACATCCATGATGTGAAAC	183283

BX547940.7	951	TTCCTTTCCACAACATCCCACAGGTGCTCCATTGGATTAAGATCTGGTGA	1000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX470078.6	183284	TTCCTTTCCACAACATCCCACAGGTGCTCCATTGGATTAAGATCTGGTGA	183333

BX547940.7	1001	CTGTGAAGGCCATTTGAGTACAGTGAACTCATTGTCATGCTCAAGAAACC	1050
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX470078.6	183334	CTGTGAAGGCCATTTGAGTACAGTGAACTCATTGTCATGCTCAAGAAACC	183383

BX547940.7	1051	AGTTTGAGATGATTCATGATTTATGACATGGTGCGTTATCATGCTGGAAG	1100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX470078.6	183384	AGTTTGAGATGATTCATGATTTATGACATGGTGCGTTATCATGCTGGAAG	183433

BX547940.7	1101	TAGCCATCAGAAGATGGGTACACTGTGGTCATAAAGGGATGGACATGGTC	1150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX470078.6	183434	TAGCCATCAGAAGATGGGTACACTGTGGTCATAAAGGGATGGACATGGTC	183483

BX547940.7	1151	AGAAACAATACTCAGGCTGTGGCATTGACACAATGCTCAATTGGTACTAA	1200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX470078.6	183484	AGAAACAATACTCAGGCTGTGGCATTGACACAATGCTCAATTGGTACTAA	183533

BX547940.7	1201	TGGACCCAAAGTGTGCCAAAAAATATCCCTCACACCATTACACCACCAGC	1250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX470078.6	183534	TGGACCCAAAGTGTGCCAAAAAATATCCCTCACACCATTACACCACCAGC	183583

BX547940.7	1251	AGCCTGCACCGTTAATACAAGGCAGGATGGATCCATCCTTTTATGTTGTT	1300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX470078.6	183584	AGCCTGCACCGTTAATACAAGGCAGGATGGATCCATCCTTTTATGTTGTT	183633

BX547940.7	1301	GATGTCAAATTCTGACCCTACCATCCGAATGTCACAGCAGAAATCGAGAC	1350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX470078.6	183634	GATGTCAAATTCTGACCCTACCATCCGAATGTCACAGCAGAAATCGAGAC	183683

BX547940.7	1351	TCCTCAGACCAGAAAACATTTTTCCAATCTTCTGTTGTCCAATTTTGGTA	1400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX470078.6	183684	TCCTCAGACCAGAAAACATTTTTCCAATCTTCTGTTGTCCAATTTTGGTA	183733

BX547940.7	1401	AGTATGTGTGAATTGTAGCCTCAGTTTCCTGTTCTTATCTGAACAATTTG	1450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX470078.6	183734	AGTATGTGTGAATTGTAGCCTCAGTTTCCTGTTCTTATCTGAACAATTTG	183783

BX547940.7	1451	TGCCCCAGAACTGACGCTCACTGGATGTTTTCTCTTTTTTGGACCATTCT	1500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX470078.6	183784	TGCCCCAGAACTGACGCTCACTGGATGTTTTCTCTTTTTTGGACCATTCT	183833

BX547940.7	1501	CAGACCAGCCTGTCTGGCACCAAAAACCATGCCACGTTCAAAGTCACTTA	1550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX470078.6	183834	CAGACCAGCCTGTCTGGCACCAAAAACCATGCCACGTTCAAAGTCACTTA	183883

BX547940.7	1551	AACCCCCTTTTTTCCCCATTCTGATGCTCAGTTGGAACTGTAGCAGATCG	1600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX470078.6	183884	AACCCCCTTTTTTCCCCATTCTGATGCTCAGTTGGAACTGTAGCAGATCG	183933

BX547940.7	1601	TCTAGACCATGTCTACATGGCTAAATGCATTGAGTTGCTGCCATCTCATT	1650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX470078.6	183934	TCTAGACCATGTCTACATGGCTAAATGCATTGAGTTGCTGCCATCTCATT	183983

BX547940.7	1651	GGCTGATTAGAAATCTGCATTAACAAGCGGATATTAGGTATATTATCATA	1700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX470078.6	183984	GGCTGATTAGAAATCTGCATTAACAAGCGGATATTAGGTATATTATCATA	184033

BX547940.7	1701	TACCTAACTGTATTATACAGATAAATCAAATGGTCTTAGTCTGTTAATGT	1750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX470078.6	184034	TACCTAACTGTATTATACAGATAAATCAAATGGTCTTAGTCTGTTAATGT	184083

BX547940.7	1751	ATTTACTGTTTCACCATGTTTGTAAACAGTATATCACAGGCATATCTAAA	1800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX470078.6	184084	ATTTACTGTTTCACCATGTTTGTAAACAGTATATCACAGGCATATCTAAA	184133

BX547940.7	1801	ACTCAGCCTGAATATATAAACAAGAATGAATCCAACAAGAATCTCAACGG	1850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX470078.6	184134	ACTCAGCCTGAATATATAAACAAGAATGAATCCAACAAGAATCTCAACGG	184183

BX547940.7	1851	ACTTCCACAGGATTACATTTAATCTGGCTGCTGTAACAGTGAAGTTCTTA	1900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX470078.6	184184	ACTTCCACAGGATTACATTTAATCTGGCTGCTGTAACAGTGAAGTTCTTA	184233

BX547940.7	1901	CCTAAAATGGCCTGCTATTTCCACATCACCTGCATGGCCTTGCAAGTCTG	1950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX470078.6	184234	CCTAAAATGGCCTGCTATTTCCACATCACCTGCATGGCCTTGCAAGTCTG	184283

BX547940.7	1951	GACCAGGTTGGACTTTTTTTCTTAAATCATCTATAACCAAGGCCAAGCTT	2000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX470078.6	184284	GACCAGGTTGGACTTTTTTTCTTAAATCATCTATAACCAAGGCCAAGCTT	184333

Overview

Query
BX547940.7 - 50209 bps
Hit
BX470078.6 - 184333 bps
Total alignments
22
Best alignment
alignment #1 (HSP: 2000 bps)
Best alignment cartoon

Alternate alignments

#%IDscoreHSPstartendstrandhstarthendhstrand
1100195320001200011823341843331
293.71126159197211987918079651
392.482663501991720266196913141
489.398314020949210881133314641
594.742172832065620938-1501152951
693.5818926120268205281501152751
790.1681021934519446-152987530871
889.43651044399544098-152989530921
99565813477434854153008530871
1094.6447563850338558153013530681
1181.133158521405114902-162726635521
1285.042985878551441175584761911
1395.6576922621026301179322794131
1486.43118216755970197063972831
1590.711462382606426301199081993171
1692.35132198261022629911257241259191
178543813505035130-11384641385431
1885.2277201260532625311569921571941
1985.0582197260632625911595381597311
2081.2943132345103464111617331618711
2190.7475106384003850511793611794681
2291.0164894420544293-11793641794521
Short-link