<=>End overlap alignment

Alignment #1 HSP: 2000 bps / non-identical: 0 bps

Full alignment

BX294114.8	1	AAGCTTTTATGACTTCTAGGCTGGATTACTGCAATGCTCTGTTCGCTGGT	50
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX465860.7	151902	AAGCTTTTATGACTTCTAGGCTGGATTACTGCAATGCTCTGTTCGCTGGT	151951

BX294114.8	51	TACCCAGCATCCTCTATTAACAAACTTCAGCTAGTACAAAATGCAGCTAC	100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX465860.7	151952	TACCCAGCATCCTCTATTAACAAACTTCAGCTAGTACAAAATGCAGCTAC	152001

BX294114.8	101	CAGAGTTCTTACCAGGTCTAGAACATATGATCCTATCAACCCAACTTCAA	150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX465860.7	152002	CAGAGTTCTTACCAGGTCTAGAACATATGATCCTATCAACCCAACTTCAA	152051

BX294114.8	151	CTCAGAAAACTGGAATGACACTTTCAATTTACTATAATCTTCTACGTTAA	200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX465860.7	152052	CTCAGAAAACTGGAATGACACTTTCAATTTACTATAATCTTCTACGTTAA	152101

BX294114.8	201	GCTACTTTGACCCAATTTACACTGTAAAAGCGCTATAGAAATAAAGATGA	250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX465860.7	152102	GCTACTTTGACCCAATTTACACTGTAAAAGCGCTATAGAAATAAAGATGA	152151

BX294114.8	251	AAACTGATGACTGTTGCAAATACACTTTTTGATCAGAAAAAAATACAATT	300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX465860.7	152152	AAACTGATGACTGTTGCAAATACACTTTTTGATCAGAAAAAAATACAATT	152201

BX294114.8	301	TTACATGTCTATCAGCCTTGTTGAGCTTCTTAATAAAAAATGGTTCTAAG	350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX465860.7	152202	TTACATGTCTATCAGCCTTGTTGAGCTTCTTAATAAAAAATGGTTCTAAG	152251

BX294114.8	351	AAATCAAATACATAAATTAATTTGAACTATGAACCACATCATCATAAATA	400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX465860.7	152252	AAATCAAATACATAAATTAATTTGAACTATGAACCACATCATCATAAATA	152301

BX294114.8	401	GTTGCTGATTTGGAAAAAACAAATCTTGAATTTGTTGACAAATCAGATCA	450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX465860.7	152302	GTTGCTGATTTGGAAAAAACAAATCTTGAATTTGTTGACAAATCAGATCA	152351

BX294114.8	451	AAACGAACTAAAATGAATACATATAACATGCTGAACAGATTACTTCCCAA	500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX465860.7	152352	AAACGAACTAAAATGAATACATATAACATGCTGAACAGATTACTTCCCAA	152401

BX294114.8	501	AATCCATGACCAAAACAAAACTGTGCAAAGAATTCCGCTGACAACAACAA	550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX465860.7	152402	AATCCATGACCAAAACAAAACTGTGCAAAGAATTCCGCTGACAACAACAA	152451

BX294114.8	551	ACCTTTATGCTTGTTAAACTGTGCCACGGCCAAAACCATTATTAACACAT	600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX465860.7	152452	ACCTTTATGCTTGTTAAACTGTGCCACGGCCAAAACCATTATTAACACAT	152501

BX294114.8	601	GAACATGAAAACTACATGTGACCCCTGCCTGCGGATATACCTTCAACGTA	650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX465860.7	152502	GAACATGAAAACTACATGTGACCCCTGCCTGCGGATATACCTTCAACGTA	152551

BX294114.8	651	TCGTCCCTCTTCATGACAGCTGTTTACACAAGAGAAGACGGTGTGCTTCT	700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX465860.7	152552	TCGTCCCTCTTCATGACAGCTGTTTACACAAGAGAAGACGGTGTGCTTCT	152601

BX294114.8	701	GAGGTCTGGCTCTGGTTCAGATAAAATAATACACAGGCGAAGTCAGCCAA	750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX465860.7	152602	GAGGTCTGGCTCTGGTTCAGATAAAATAATACACAGGCGAAGTCAGCCAA	152651

BX294114.8	751	GATGTAATACAAGTGGATAACTGAGAGGGTGGAAAAAAAGAAGAGGAATT	800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX465860.7	152652	GATGTAATACAAGTGGATAACTGAGAGGGTGGAAAAAAAGAAGAGGAATT	152701

BX294114.8	801	TGTGAAATGCACATGGATATTTTCTCTTTCCTCCATGCACCTCCCAAACC	850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX465860.7	152702	TGTGAAATGCACATGGATATTTTCTCTTTCCTCCATGCACCTCCCAAACC	152751

BX294114.8	851	TTTCCTTCACCGTTCTCCACCGCTGGCCTAACCCCCTCTAAATATCTATC	900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX465860.7	152752	TTTCCTTCACCGTTCTCCACCGCTGGCCTAACCCCCTCTAAATATCTATC	152801

BX294114.8	901	TACCACTGAGCCCAGTCGGGAGTTTAAAGACAAACGGAAAATAAAGGGAC	950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX465860.7	152802	TACCACTGAGCCCAGTCGGGAGTTTAAAGACAAACGGAAAATAAAGGGAC	152851

BX294114.8	951	AAAAATAGAGACATATTGAAGTCGCACAATACATAAACTCACCACAATTG	1000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX465860.7	152852	AAAAATAGAGACATATTGAAGTCGCACAATACATAAACTCACCACAATTG	152901

BX294114.8	1001	AAGTTCTCAGTGTTCTGAAACTGAAGAGTCTGAGGAATGCGTTTAAAGGC	1050
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX465860.7	152902	AAGTTCTCAGTGTTCTGAAACTGAAGAGTCTGAGGAATGCGTTTAAAGGC	152951

BX294114.8	1051	CACATGCACATTAAAATCATAACTCGGGTTTGTGAATTTCCCCAAATTAT	1100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX465860.7	152952	CACATGCACATTAAAATCATAACTCGGGTTTGTGAATTTCCCCAAATTAT	153001

BX294114.8	1101	GCGCAACAGATTGCGAAGCACAAGAAAAAGGGCTTTTCTCCTCAGTTGTT	1150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX465860.7	153002	GCGCAACAGATTGCGAAGCACAAGAAAAAGGGCTTTTCTCCTCAGTTGTT	153051

BX294114.8	1151	TCCAATTTACGTGGCACAGTGCCAGGCTACATTACATGAATGCACACAAC	1200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX465860.7	153052	TCCAATTTACGTGGCACAGTGCCAGGCTACATTACATGAATGCACACAAC	153101

BX294114.8	1201	TCAAAAACAAAAACTAGACCGAAGCCTCCTGTTATCACACTATTCATTGG	1250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX465860.7	153102	TCAAAAACAAAAACTAGACCGAAGCCTCCTGTTATCACACTATTCATTGG	153151

BX294114.8	1251	AATACTGGAGTCTGATTGGTTGATCTGCAGTCATTTTTTTAAATGGTCAT	1300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX465860.7	153152	AATACTGGAGTCTGATTGGTTGATCTGCAGTCATTTTTTTAAATGGTCAT	153201

BX294114.8	1301	TAAACTATATCGCATAATACAATTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCT	1350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX465860.7	153202	TAAACTATATCGCATAATACAATTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCT	153251

BX294114.8	1351	TATTATTATTATTATTAGCTCAAACTAATAAAGATTCTTGCAAATTTATT	1400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX465860.7	153252	TATTATTATTATTATTAGCTCAAACTAATAAAGATTCTTGCAAATTTATT	153301

BX294114.8	1401	CTCAAAAAAGTAACAATAAATAAACCAAATGAGAAAACAAGACCCCTCAA	1450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX465860.7	153302	CTCAAAAAAGTAACAATAAATAAACCAAATGAGAAAACAAGACCCCTCAA	153351

BX294114.8	1451	CTTAGGTTTTACTAAATAATAATGACTTTTTTTTAATAATAATAATAAAA	1500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX465860.7	153352	CTTAGGTTTTACTAAATAATAATGACTTTTTTTTAATAATAATAATAAAA	153401

BX294114.8	1501	AAACAGGAATTAAATAAATGTTTGTTAAACTATGAAATAAATAAAAACTG	1550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX465860.7	153402	AAACAGGAATTAAATAAATGTTTGTTAAACTATGAAATAAATAAAAACTG	153451

BX294114.8	1551	AATTTACCGGATAAACTGAATCAACCGTCAGCTAGCTCTCTGCAACTCTC	1600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX465860.7	153452	AATTTACCGGATAAACTGAATCAACCGTCAGCTAGCTCTCTGCAACTCTC	153501

BX294114.8	1601	ACATGGTCGCCCACTGAAACTAAGCAGGGCTGTGCCCGGTCAGTACCTGG	1650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX465860.7	153502	ACATGGTCGCCCACTGAAACTAAGCAGGGCTGTGCCCGGTCAGTACCTGG	153551

BX294114.8	1651	ATGGGAGAACACATGCTAGGTTGCTGCCGAAAGTGGAGATTAAACCCAGT	1700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX465860.7	153552	ATGGGAGAACACATGCTAGGTTGCTGCCGAAAGTGGAGATTAAACCCAGT	153601

BX294114.8	1701	AAAACCCCGTAAACCCGGTAGAGGGTGCTCAACCTAGGTCTGTGCGGGTC	1750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX465860.7	153602	AAAACCCCGTAAACCCGGTAGAGGGTGCTCAACCTAGGTCTGTGCGGGTC	153651

BX294114.8	1751	CTAATGCCCTAGTATAGTGAAGGAGATTCTATACTGTTCAGTGAGCGGCA	1800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX465860.7	153652	CTAATGCCCTAGTATAGTGAAGGAGATTCTATACTGTTCAGTGAGCGGCA	153701

BX294114.8	1801	ACTTTCGGATGAAATGTTAAACAGAGGTCCTGACTTTTCATGGTCGTTAA	1850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX465860.7	153702	ACTTTCGGATGAAATGTTAAACAGAGGTCCTGACTTTTCATGGTCGTTAA	153751

BX294114.8	1851	AAAATCCTAAGGTGTCTTTCGAAAAGAGTAGGTTGTTTAACCCTGGTTTC	1900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX465860.7	153752	AAAATCCTAAGGTGTCTTTCGAAAAGAGTAGGTTGTTTAACCCTGGTTTC	153801

BX294114.8	1901	CTGGCCAAATTTGCCCACTAGCCTCTGTCCATCATGGCCTCCTAACTATC	1950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX465860.7	153802	CTGGCCAAATTTGCCCACTAGCCTCTGTCCATCATGGCCTCCTAACTATC	153851

BX294114.8	1951	CCCATATCATAACAGGTTTCATCTCTCTGTCTCCTCTCAACCAATCAGCT	2000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX465860.7	153852	CCCATATCATAACAGGTTTCATCTCTCTGTCTCCTCTCAACCAATCAGCT	153901

Overview

Query
BX294114.8 - 195651 bps
Hit
BX465860.7 - 153901 bps
Total alignments
21
Best alignment
alignment #1 (HSP: 2000 bps)
Best alignment cartoon

Alternate alignments

#%IDscoreHSPstartendstrandhstarthendhstrand
1100194720001200011519021539011
283.87250547133818134364139784403101
380.051313548701987372146804471641
492.27276362141814142175-156534568951
589.35197300117827118126156534568431
691.271592287527675503156535567631
788.582303618701287372156536568941
883.22129283110656110938156600568911
988.45151290174765175054157351576271
1086.431683417372974069-170049703871
1186.31193370141813142182-179065794221
1289.61227348117823118170179068794231
1386.411643168701287327179074793821
1484.1161347141819142165-183503838481
1581.6222359879898586-191726923561
1681.18165463190816191278192065925421
1784.25295598133767134364-11223511229471
1883.06221484177113177596-11224451229341
1984.716237094249793-11369601373251
2085.79181346117823118168-11450851454431
2188.322336614181414217911450851454431
Short-link