<=>End overlap alignment

Alignment #1 HSP: 2000 bps / non-identical: 0 bps

Full alignment

BX677670.5	1	AGGTTTGAACCAGTCAGTCATTCATTTATTTAAAAGGTGCTAAAAGTTTA	50
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX465202.4	168772	AGGTTTGAACCAGTCAGTCATTCATTTATTTAAAAGGTGCTAAAAGTTTA	168821

BX677670.5	51	TATTACCATTTGTTATTTGAATATATTTTAATTGGCTCTGATCAGAATAA	100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX465202.4	168822	TATTACCATTTGTTATTTGAATATATTTTAATTGGCTCTGATCAGAATAA	168871

BX677670.5	101	TTATGTTGCTTTAAGAGATTCCCTGCAGTAAACCATTAGAATATGCATAC	150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX465202.4	168872	TTATGTTGCTTTAAGAGATTCCCTGCAGTAAACCATTAGAATATGCATAC	168921

BX677670.5	151	AAATATTAGTTGACAATGTGAGGTGGTCAGATGTCCTGCAGGCATCTGAG	200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX465202.4	168922	AAATATTAGTTGACAATGTGAGGTGGTCAGATGTCCTGCAGGCATCTGAG	168971

BX677670.5	201	CTCTGTCTTCTCATGGCTTATTTTAAATTCTGGAAGTTGGTGATTTTTGG	250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX465202.4	168972	CTCTGTCTTCTCATGGCTTATTTTAAATTCTGGAAGTTGGTGATTTTTGG	169021

BX677670.5	251	CAAAGAAGAGAAAAGGTGAAGCACATCAATCTGGAGAGAGGTGGCGAAGA	300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX465202.4	169022	CAAAGAAGAGAAAAGGTGAAGCACATCAATCTGGAGAGAGGTGGCGAAGA	169071

BX677670.5	301	GGAGACTGGTAGTAAATGTTAATTACGTGGAAATAATTCAATAACACACT	350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX465202.4	169072	GGAGACTGGTAGTAAATGTTAATTACGTGGAAATAATTCAATAACACACT	169121

BX677670.5	351	ACAGCCTGTATCCTAATATTAGTATCTAGCACAGGGGTGCTCAACCCTGT	400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX465202.4	169122	ACAGCCTGTATCCTAATATTAGTATCTAGCACAGGGGTGCTCAACCCTGT	169171

BX677670.5	401	TCCTGGAGATCTACCTTCCTGCAGGTTTTAGGTTGCAACCCATATCTTAC	450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX465202.4	169172	TCCTGGAGATCTACCTTCCTGCAGGTTTTAGGTTGCAACCCATATCTTAC	169221

BX677670.5	451	AGACCTGCCTGTAATTATCCAGTGCTGTTAGGGTCCTAATTAATTGGTTC	500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX465202.4	169222	AGACCTGCCTGTAATTATCCAGTGCTGTTAGGGTCCTAATTAATTGGTTC	169271

BX677670.5	501	AGGTGTGTTTGATCAGGATTGGAGCTGAATGATTTTTAAAAGTAGTCCAC	550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX465202.4	169272	AGGTGTGTTTGATCAGGATTGGAGCTGAATGATTTTTAAAAGTAGTCCAC	169321

BX677670.5	551	TAGGAATTTGGATAACGGATTGGATCAAATCTTTAACATGGGTTTTTCAA	600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX465202.4	169322	TAGGAATTTGGATAACGGATTGGATCAAATCTTTAACATGGGTTTTTCAA	169371

BX677670.5	601	AAGAAAAAATGGATTACATAATTGGATAAGATCACTTTGATCCAAAAAAT	650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX465202.4	169372	AAGAAAAAATGGATTACATAATTGGATAAGATCACTTTGATCCAAAAAAT	169421

BX677670.5	651	CTGGATTAAACTGATCCCATCAGAAAGGTGGATTTCATGCCCAAAATGTA	700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX465202.4	169422	CTGGATTAAACTGATCCCATCAGAAAGGTGGATTTCATGCCCAAAATGTA	169471

BX677670.5	701	ATGTAAAATGTATCAAATAATACTATATTTGGATTATGCAGTATGTTACA	750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX465202.4	169472	ATGTAAAATGTATCAAATAATACTATATTTGGATTATGCAGTATGTTACA	169521

BX677670.5	751	AGATATCCTATTTATTCATAAGGTTTTAATTGTATTTGTTCATCCGTCAT	800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX465202.4	169522	AGATATCCTATTTATTCATAAGGTTTTAATTGTATTTGTTCATCCGTCAT	169571

BX677670.5	801	GCTACAGTCATAGGCTTTAACGTATTCAACCTTACAGTATAGGCCTACAG	850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX465202.4	169572	GCTACAGTCATAGGCTTTAACGTATTCAACCTTACAGTATAGGCCTACAG	169621

BX677670.5	851	CAAAGTAGAAAGAGTTTGGCCTCATAAAAAAATCCCCCAAACACCAAAAA	900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX465202.4	169622	CAAAGTAGAAAGAGTTTGGCCTCATAAAAAAATCCCCCAAACACCAAAAA	169671

BX677670.5	901	CAATACATTTTATTCTGTCAATATGATCTTATTGTATATTCATCACAATG	950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX465202.4	169672	CAATACATTTTATTCTGTCAATATGATCTTATTGTATATTCATCACAATG	169721

BX677670.5	951	GAAAATATTTTTGTTTTAGAATATTTATTAGTGATGCATGCAATGATTAC	1000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX465202.4	169722	GAAAATATTTTTGTTTTAGAATATTTATTAGTGATGCATGCAATGATTAC	169771

BX677670.5	1001	AGAATAATAATAAAAAAATGCAAAGAATGACAATCACTGATATTTAAATC	1050
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX465202.4	169772	AGAATAATAATAAAAAAATGCAAAGAATGACAATCACTGATATTTAAATC	169821

BX677670.5	1051	ACTTTCAACAATAGCAAAAAGAGACTGAAAGGGCAGAAGCACAGCTTCAT	1100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX465202.4	169822	ACTTTCAACAATAGCAAAAAGAGACTGAAAGGGCAGAAGCACAGCTTCAT	169871

BX677670.5	1101	CTGGCAGAGGAACAACTGACTCTGACCAAACTGCAGCAAACCAAGACTAG	1150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX465202.4	169872	CTGGCAGAGGAACAACTGACTCTGACCAAACTGCAGCAAACCAAGACTAG	169921

BX677670.5	1151	ACCTGAGACCCGCCTATAAAAGAAATGACAATGCCTGTATTTTGTGTTTA	1200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX465202.4	169922	ACCTGAGACCCGCCTATAAAAGAAATGACAATGCCTGTATTTTGTGTTTA	169971

BX677670.5	1201	TAGTACGCTGCTAAGTCTTACTTTTGGTGTGTTTAATAATAGAAAAATTA	1250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX465202.4	169972	TAGTACGCTGCTAAGTCTTACTTTTGGTGTGTTTAATAATAGAAAAATTA	170021

BX677670.5	1251	CGATAACTGTTTTTTATTTATATTGTTCGCAAATATAGACATCATTTAAC	1300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX465202.4	170022	CGATAACTGTTTTTTATTTATATTGTTCGCAAATATAGACATCATTTAAC	170071

BX677670.5	1301	ATCTTAATGAAATTAAAAATATCCAGATAACACAAACAAAAATGTAAATT	1350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX465202.4	170072	ATCTTAATGAAATTAAAAATATCCAGATAACACAAACAAAAATGTAAATT	170121

BX677670.5	1351	TATGAAATAGACATAATTAAATAGACATAATTAAAACAAAACAAGATATT	1400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX465202.4	170122	TATGAAATAGACATAATTAAATAGACATAATTAAAACAAAACAAGATATT	170171

BX677670.5	1401	ATGTTGTAATGGCTTGGGGAGATTGAGAAACTACGTGAATTTATTCGTTT	1450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX465202.4	170172	ATGTTGTAATGGCTTGGGGAGATTGAGAAACTACGTGAATTTATTCGTTT	170221

BX677670.5	1451	CAAACTCAACAACGCATAAGGCCATAATTGCTGTTGTTTAAAACGTTTGT	1500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX465202.4	170222	CAAACTCAACAACGCATAAGGCCATAATTGCTGTTGTTTAAAACGTTTGT	170271

BX677670.5	1501	TTTTACAATTAAATAACTAACCAACCTCTTAAAGATGGTTGACAACACTG	1550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX465202.4	170272	TTTTACAATTAAATAACTAACCAACCTCTTAAAGATGGTTGACAACACTG	170321

BX677670.5	1551	ACTGTGACTGGTCCTGCTTGAAGGTCGCTGAGAAAAGTAACGCCAGCCTT	1600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX465202.4	170322	ACTGTGACTGGTCCTGCTTGAAGGTCGCTGAGAAAAGTAACGCCAGCCTT	170371

BX677670.5	1601	GTGAGTTGTGATGATCACAGTAATAAAGTAAAAAAGTGATGGTGGCCGTG	1650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX465202.4	170372	GTGAGTTGTGATGATCACAGTAATAAAGTAAAAAAGTGATGGTGGCCGTG	170421

BX677670.5	1651	ACCATTGAATCAATTACATAAAGTGTGGGGAGTTAAAAGAGAAAAAAATG	1700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX465202.4	170422	ACCATTGAATCAATTACATAAAGTGTGGGGAGTTAAAAGAGAAAAAAATG	170471

BX677670.5	1701	CTCCACATTACAGGAACCGCGCGGGTCGTGTTAAATACTGCCAGGAGAAG	1750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX465202.4	170472	CTCCACATTACAGGAACCGCGCGGGTCGTGTTAAATACTGCCAGGAGAAG	170521

BX677670.5	1751	GTTTTCAGGATTTGGACACAAATGAACTTATGACCGGAATGCGATTAATA	1800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX465202.4	170522	GTTTTCAGGATTTGGACACAAATGAACTTATGACCGGAATGCGATTAATA	170571

BX677670.5	1801	AGACTTGCAAGTTGCAAACAGACAAACATAGCAGAGTACCGATCGAATCG	1850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX465202.4	170572	AGACTTGCAAGTTGCAAACAGACAAACATAGCAGAGTACCGATCGAATCG	170621

BX677670.5	1851	GTCCATTTTAGCACTGGCAGAAGCTATCCATGCTAGTGAGACTCTCTAGG	1900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX465202.4	170622	GTCCATTTTAGCACTGGCAGAAGCTATCCATGCTAGTGAGACTCTCTAGG	170671

BX677670.5	1901	CAAACTTTGTTTGTTCAATCTGAATATATATTAAAAGTGTACAGTTTATA	1950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX465202.4	170672	CAAACTTTGTTTGTTCAATCTGAATATATATTAAAAGTGTACAGTTTATA	170721

BX677670.5	1951	GTGTTATTTAATGGATTGTTGGATTTTACATTCAGCGAACAGGCGAATTC	2000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX465202.4	170722	GTGTTATTTAATGGATTGTTGGATTTTACATTCAGCGAACAGGCGAATTC	170771

Overview

Query
BX677670.5 - 21823 bps
Hit
BX465202.4 - 170771 bps
Total alignments
10
Best alignment
alignment #1 (HSP: 2000 bps)
Best alignment cartoon

Alternate alignments

#%IDscoreHSPstartendstrandhstarthendhstrand
1100192320001200011687721707711
2100417725572633113787138631
397.53408125532633-113812138921
498.7407725572633154442545181
598.73437925552633-154449545271
698.48376625552620-158020580851
798.61327225592630186307863781
897.33307525592633-186308863821
998.73457925592637-11006151006931
1010041772559263511006301007061
Short-link