<=>End overlap alignment

Alignment #1 HSP: 2000 bps / non-identical: 0 bps

Full alignment

BX004787.8	1	AAGCTTGACAAGAACTTTACAGTACACAGTTCATGGATGAATTCCTTTCT	50
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX465189.9	130716	AAGCTTGACAAGAACTTTACAGTACACAGTTCATGGATGAATTCCTTTCT	130765

BX004787.8	51	CTATTTCACAAGTGTAAGGCCAAACCACAATTCTGTTTTTGTACCCCTAC	100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX465189.9	130766	CTATTTCACAAGTGTAAGGCCAAACCACAATTCTGTTTTTGTACCCCTAC	130815

BX004787.8	101	CCCTTCCCCTTAGCCCTTGCAACCGAGGGTTAAGGAGAAGGGCTTTAAAA	150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX465189.9	130816	CCCTTCCCCTTAGCCCTTGCAACCGAGGGTTAAGGAGAAGGGCTTTAAAA	130865

BX004787.8	151	TTTACCCCTAAGAATTGGGACAGCACTACATCACCTGCACACGTCATCAT	200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX465189.9	130866	TTTACCCCTAAGAATTGGGACAGCACTACATCACCTGCACACGTCATCAT	130915

BX004787.8	201	ATGTCCTCGCAATCTCTTGCTTTATATGAGTTCAGATGATGGTGACTACT	250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX465189.9	130916	ATGTCCTCGCAATCTCTTGCTTTATATGAGTTCAGATGATGGTGACTACT	130965

BX004787.8	251	GTAGTGATTCCCGTTGTGTTTTTTTTTTTTGGTATTTATCTTCAGGAAAT	300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX465189.9	130966	GTAGTGATTCCCGTTGTGTTTTTTTTTTTTGGTATTTATCTTCAGGAAAT	131015

BX004787.8	301	CACTGAAGCCATGTATTATGTTATCATAATGATCTAATGTGGCAATAAGA	350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX465189.9	131016	CACTGAAGCCATGTATTATGTTATCATAATGATCTAATGTGGCAATAAGA	131065

BX004787.8	351	TCATAACAGTACTGTTTATTTACACCGTGGCCATATTCATTAATGTAAAC	400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX465189.9	131066	TCATAACAGTACTGTTTATTTACACCGTGGCCATATTCATTAATGTAAAC	131115

BX004787.8	401	ACACCAAAAACAACATTAACATTATAGCAGACACTGTAAAAAGTCCATTC	450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX465189.9	131116	ACACCAAAAACAACATTAACATTATAGCAGACACTGTAAAAAGTCCATTC	131165

BX004787.8	451	CCAGTCACTAGACTTTTCTGACAGGGTATTCCAGTGTCATTGAGTGTCAT	500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX465189.9	131166	CCAGTCACTAGACTTTTCTGACAGGGTATTCCAGTGTCATTGAGTGTCAT	131215

BX004787.8	501	TGAGTGTCAGACTGTTGTGGGACTGCTGTGCAGAAGTTATTATTAGGGAT	550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX465189.9	131216	TGAGTGTCAGACTGTTGTGGGACTGCTGTGCAGAAGTTATTATTAGGGAT	131265

BX004787.8	551	TATAGATTGCAAAATTTAACGTTTTTTATTTTACCGTTAAAAAAAAAAAA	600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX465189.9	131266	TATAGATTGCAAAATTTAACGTTTTTTATTTTACCGTTAAAAAAAAAAAA	131315

BX004787.8	601	AAAAAAAAAGCATGACTGTAAAACACGAACGCAGTTATGAATATATTAAA	650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX465189.9	131316	AAAAAAAAAGCATGACTGTAAAACACGAACGCAGTTATGAATATATTAAA	131365

BX004787.8	651	ACGTGTTTGTTTGTTGTAAAAATTCATAATAATAACAACAAAAAAAGATC	700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX465189.9	131366	ACGTGTTTGTTTGTTGTAAAAATTCATAATAATAACAACAAAAAAAGATC	131415

BX004787.8	701	TCCTTATTTCCGGGTGCAGCTGGAGCTAGTGTATTCTGGAAATTTTTTCC	750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX465189.9	131416	TCCTTATTTCCGGGTGCAGCTGGAGCTAGTGTATTCTGGAAATTTTTTCC	131465

BX004787.8	751	TACCTCTTGGTTTCGAGTGTGGTCCTGAAAAATCTTCGTTTAAAGGAGTG	800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX465189.9	131466	TACCTCTTGGTTTCGAGTGTGGTCCTGAAAAATCTTCGTTTAAAGGAGTG	131515

BX004787.8	801	TATACCCCTTGCCCTTAGCCCTACGCCTTCGAGCTAAAGAGAATTGGGAC	850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX465189.9	131516	TATACCCCTTGCCCTTAGCCCTACGCCTTCGAGCTAAAGAGAATTGGGAC	131565

BX004787.8	851	ACCACTACCCCTTCACGTGGTCTAAAACCACATTGAAAATGTGACGCGTG	900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX465189.9	131566	ACCACTACCCCTTCACGTGGTCTAAAACCACATTGAAAATGTGACGCGTG	131615

BX004787.8	901	TCACTTTCTTCACAGATTTAAATGCATTTGTGAGCTCGCAATCCACTGCC	950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX465189.9	131616	TCACTTTCTTCACAGATTTAAATGCATTTGTGAGCTCGCAATCCACTGCC	131665

BX004787.8	951	ATTTGTCATTACTATAGCCTCCTGTATTGGGCTCACACATATACTCTGCA	1000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX465189.9	131666	ATTTGTCATTACTATAGCCTCCTGTATTGGGCTCACACATATACTCTGCA	131715

BX004787.8	1001	ATCTCACTACATCAAAATTGCTGATAAGCCATGGTGGGGGATTCTTTCTG	1050
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX465189.9	131716	ATCTCACTACATCAAAATTGCTGATAAGCCATGGTGGGGGATTCTTTCTG	131765

BX004787.8	1051	TCTTGCACTAAACACAGTCGACCAAATTGCAATAAACTGGGCCATCGGAC	1100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX465189.9	131766	TCTTGCACTAAACACAGTCGACCAAATTGCAATAAACTGGGCCATCGGAC	131815

BX004787.8	1101	CAATCAGCGCAGATTAGCATCGTGCTAAGGAGGGGTTTGGGAATAAATGA	1150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX465189.9	131816	CAATCAGCGCAGATTAGCATCGTGCTAAGGAGGGGTTTGGGAATAAATGA	131865

BX004787.8	1151	ATCGCTGAACGAATCATATGGGAGTTGTTGGGATAATTAGATAAAAATAA	1200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX465189.9	131866	ATCGCTGAACGAATCATATGGGAGTTGTTGGGATAATTAGATAAAAATAA	131915

BX004787.8	1201	ATGCATTATATAGGACAATGAGAGTGTTTTTTGACCTTGAATGCATATCA	1250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX465189.9	131916	ATGCATTATATAGGACAATGAGAGTGTTTTTTGACCTTGAATGCATATCA	131965

BX004787.8	1251	GCCTGTTGTTGGAGACCCTCAAAACCAAAATATGACCTCTAATAATGCAT	1300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX465189.9	131966	GCCTGTTGTTGGAGACCCTCAAAACCAAAATATGACCTCTAATAATGCAT	132015

BX004787.8	1301	AATAGGGGCTCTTTAAGCTTTTTTTTCAATATACAAATATTAAGATGTAC	1350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX465189.9	132016	AATAGGGGCTCTTTAAGCTTTTTTTTCAATATACAAATATTAAGATGTAC	132065

BX004787.8	1351	CTTTACAATTGAAAAAAACAAACAAAAAAGTCCACCAGTAGGTGGCGCCA	1400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX465189.9	132066	CTTTACAATTGAAAAAAACAAACAAAAAAGTCCACCAGTAGGTGGCGCCA	132115

BX004787.8	1401	AATTAAACAAGTAGAAAAATTGATGTCTAACTAAATTATGAATGTCTAAC	1450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX465189.9	132116	AATTAAACAAGTAGAAAAATTGATGTCTAACTAAATTATGAATGTCTAAC	132165

BX004787.8	1451	TGTATTTCTTTCAGTCTACTGCAATCTTTGTTTGAATTTTTTTGTTTGAC	1500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX465189.9	132166	TGTATTTCTTTCAGTCTACTGCAATCTTTGTTTGAATTTTTTTGTTTGAC	132215

BX004787.8	1501	AGTATTATAGATATTGTGCCAAAATTGTACGTTACTTAATATTAACTGTT	1550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX465189.9	132216	AGTATTATAGATATTGTGCCAAAATTGTACGTTACTTAATATTAACTGTT	132265

BX004787.8	1551	TGTGTTTTGAACTTCTACATAAAATCAATGTTAAGTAATATGACTGGCTA	1600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX465189.9	132266	TGTGTTTTGAACTTCTACATAAAATCAATGTTAAGTAATATGACTGGCTA	132315

BX004787.8	1601	CTTGTCCATTTGGGTAAATAAACATTTTTTAAACCTCTGTTAATGTTGAG	1650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX465189.9	132316	CTTGTCCATTTGGGTAAATAAACATTTTTTAAACCTCTGTTAATGTTGAG	132365

BX004787.8	1651	CACCGATTTTAATGTTAACTTTTTTTAAACAAAATAAATTAACAATAATA	1700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX465189.9	132366	CACCGATTTTAATGTTAACTTTTTTTAAACAAAATAAATTAACAATAATA	132415

BX004787.8	1701	TTAATTATCATGAAGTAATAGCTATCTGAACGATATATAGGTGATCCTTA	1750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX465189.9	132416	TTAATTATCATGAAGTAATAGCTATCTGAACGATATATAGGTGATCCTTA	132465

BX004787.8	1751	CCGAGAAGGTGTCGACTGGTGATGCCTTTTTCTGTAAGTGTGGCCTCCAA	1800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX465189.9	132466	CCGAGAAGGTGTCGACTGGTGATGCCTTTTTCTGTAAGTGTGGCCTCCAA	132515

BX004787.8	1801	AGTGCTTATAGGAGCAGGAAAGATGTAGGACTGCTGCAGCACCTGAGGTG	1850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX465189.9	132516	AGTGCTTATAGGAGCAGGAAAGATGTAGGACTGCTGCAGCACCTGAGGTG	132565

BX004787.8	1851	GATGAGGTCTGTCCAGAGAGCTGAACACCGTGCTGTTATAGAGCTCTGCT	1900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX465189.9	132566	GATGAGGTCTGTCCAGAGAGCTGAACACCGTGCTGTTATAGAGCTCTGCT	132615

BX004787.8	1901	CCCTCAAACAGCTCCAACACAGAAAACTCATTCCTGCGAAACTTGGAGTT	1950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX465189.9	132616	CCCTCAAACAGCTCCAACACAGAAAACTCATTCCTGCGAAACTTGGAGTT	132665

BX004787.8	1951	CCAGTACACATACTATAGGAAGGAGAGCAGAAAAGAAAGGCTTTATTCAG	2000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX465189.9	132666	CCAGTACACATACTATAGGAAGGAGAGCAGAAAAGAAAGGCTTTATTCAG	132715

Overview

Query
BX004787.8 - 198036 bps
Hit
BX465189.9 - 132715 bps
Total alignments
22
Best alignment
alignment #1 (HSP: 2000 bps)
Best alignment cartoon

Alternate alignments

#%IDscoreHSPstartendstrandhstarthendhstrand
1100194920001200011307161327151
283.29145390764180301354939371
386.032595461737317918-117834183841
487.031472831821518497117901181931
586.7224047776418117117905183781
686.782024187775578172-117933183481
779.881063107416874477122217225341
885.44159308164800165107122541228491
9901582355501355247130174304031
1081.651072645918459447-133237335031
1196.031101264434444469145525456501
1294.12107134152277152410145526456611
1384.242255441737517918-164677652091
1489.052163871741517801-198643990351
1587.561974027774978150-198643990441
1681.331203693844038808-198669990271
1790.1246370441054447411045351049081
1879.641173386946269799-11045771049101
1990.91122176184348184523-11045791047541
2085.47123234551195535211051161053491
2183.78313713469634767511067811074891
2288.07117216163491163706-11110091112261
Short-link