<=>End overlap alignment

Alignment #1 HSP: 2000 bps / non-identical: 0 bps

Full alignment

BX640585.2	94096	AAGCTTGGTGAGTGATGGGCATGGAGACCCCACCTGACCCTTAGCCCCAG	94145
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX324144.4	1	AAGCTTGGTGAGTGATGGGCATGGAGACCCCACCTGACCCTTAGCCCCAG	50

BX640585.2	94146	GGTCTCTGCCCAGGTCCTGTTCCCTTTGCCACCATTGCGAGCCCCATGCC	94195
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX324144.4	51	GGTCTCTGCCCAGGTCCTGTTCCCTTTGCCACCATTGCGAGCCCCATGCC	100

BX640585.2	94196	TGTCCCTCTGGGACTCGGCTCTCTGCCCTGTTCGTTCCATTACCATCTCC	94245
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX324144.4	101	TGTCCCTCTGGGACTCGGCTCTCTGCCCTGTTCGTTCCATTACCATCTCC	150

BX640585.2	94246	TTCTGACCCCTGGCCGGGTTGTCTGTTTCTAGGGCCCCCAGGGAGAGCCA	94295
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX324144.4	151	TTCTGACCCCTGGCCGGGTTGTCTGTTTCTAGGGCCCCCAGGGAGAGCCA	200

BX640585.2	94296	GGACCTCCTGGACAACAGGGCACTCCTGGGACCCAGGTGAGTGTCATGTC	94345
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX324144.4	201	GGACCTCCTGGACAACAGGGCACTCCTGGGACCCAGGTGAGTGTCATGTC	250

BX640585.2	94346	CACCCCTCCCCAACTTCAGTGACTTCTCCTGGGGGCCAGACCCAGAGGGG	94395
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX324144.4	251	CACCCCTCCCCAACTTCAGTGACTTCTCCTGGGGGCCAGACCCAGAGGGG	300

BX640585.2	94396	GTAGGAAATTAAGGGTCTCAATTTCCTCAGTTAAGGGTCTCGCGGCTTAT	94445
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX324144.4	301	GTAGGAAATTAAGGGTCTCAATTTCCTCAGTTAAGGGTCTCGCGGCTTAT	350

BX640585.2	94446	GCTCTGCCTGGGGATGTTGGCTGGGGGGAGAGTGGCCCCCCCCCCGGGGG	94495
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX324144.4	351	GCTCTGCCTGGGGATGTTGGCTGGGGGGAGAGTGGCCCCCCCCCCGGGGG	400

BX640585.2	94496	GGTCCCCTGTGACGTCTCTCTCCCATGTCTAGGGTCTCCCTGGGCCCCAA	94545
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX324144.4	401	GGTCCCCTGTGACGTCTCTCTCCCATGTCTAGGGTCTCCCTGGGCCCCAA	450

BX640585.2	94546	GGTGCCGTTGGCCCTCATGGAGAGAAGGTAAGTGACTAAGTGATCCAGGG	94595
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX324144.4	451	GGTGCCGTTGGCCCTCATGGAGAGAAGGTAAGTGACTAAGTGATCCAGGG	500

BX640585.2	94596	GACAGTGCAGATGCCAAGGGGGTTGTCGGGAGGGCCCCCGATGTCTGGCT	94645
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX324144.4	501	GACAGTGCAGATGCCAAGGGGGTTGTCGGGAGGGCCCCCGATGTCTGGCT	550

BX640585.2	94646	GAGATCTAGCCACGTTCAGACCTGACCCCTCTGGTGATCCCAAGCCTCCT	94695
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX324144.4	551	GAGATCTAGCCACGTTCAGACCTGACCCCTCTGGTGATCCCAAGCCTCCT	600

BX640585.2	94696	CATCTGCCTGCAGGGCCCTCAAGGGAAACCAGGCCTCCCCGGCATGCCCG	94745
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX324144.4	601	CATCTGCCTGCAGGGCCCTCAAGGGAAACCAGGCCTCCCCGGCATGCCCG	650

BX640585.2	94746	GCTCAGACGGACCTCCGGTGAGTGGGCCCCCACCTGCGAATTCACATTCC	94795
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX324144.4	651	GCTCAGACGGACCTCCGGTGAGTGGGCCCCCACCTGCGAATTCACATTCC	700

BX640585.2	94796	CCTTGACCCTCCACCCCAGAAAATGACCTCCAGTGAGTATCCATACCGTG	94845
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX324144.4	701	CCTTGACCCTCCACCCCAGAAAATGACCTCCAGTGAGTATCCATACCGTG	750

BX640585.2	94846	CACCCCTTGCACTGGAGGTCAATCCTGGGGCCTACCCATGGTCGGTCCAC	94895
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX324144.4	751	CACCCCTTGCACTGGAGGTCAATCCTGGGGCCTACCCATGGTCGGTCCAC	800

BX640585.2	94896	TTAATTAGGCCCCAGGGGCATTTGGGTTGAAGAAGTGTAGGGAGGGGTAC	94945
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX324144.4	801	TTAATTAGGCCCCAGGGGCATTTGGGTTGAAGAAGTGTAGGGAGGGGTAC	850

BX640585.2	94946	CCGGAGGTGACACACTCTCCTTCTCCCACCCCCAGGGTCACCCTGGCAAA	94995
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX324144.4	851	CCGGAGGTGACACACTCTCCTTCTCCCACCCCCAGGGTCACCCTGGCAAA	900

BX640585.2	94996	GAAGGTCCCCCTGGAACCAAAGGAAACCAGGTGAGATCTTCCTGCCTCCT	95045
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX324144.4	901	GAAGGTCCCCCTGGAACCAAAGGAAACCAGGTGAGATCTTCCTGCCTCCT	950

BX640585.2	95046	TTCATCCCAGCCCAGACCCTGGGCCTCCCATCTTTGGGGTTTCCTTGTCT	95095
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX324144.4	951	TTCATCCCAGCCCAGACCCTGGGCCTCCCATCTTTGGGGTTTCCTTGTCT	1000

BX640585.2	95096	CATCACGCGGCTCTGACAGTCTTCTTGGTCCCATGCCCTGTCACCCTGTC	95145
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX324144.4	1001	CATCACGCGGCTCTGACAGTCTTCTTGGTCCCATGCCCTGTCACCCTGTC	1050

BX640585.2	95146	CAGACTCCAATGTTGTCACTTCCATTTTTCCCACCCCCTGGAGCCCCTGA	95195
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX324144.4	1051	CAGACTCCAATGTTGTCACTTCCATTTTTCCCACCCCCTGGAGCCCCTGA	1100

BX640585.2	95196	CAGTGACATCCTGAGCCCCCTGTTATCGATGCCTCTCTTTCCTCTTCCAG	95245
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX324144.4	1101	CAGTGACATCCTGAGCCCCCTGTTATCGATGCCTCTCTTTCCTCTTCCAG	1150

BX640585.2	95246	GGTCCATCTGGTCCTCAGGGTCCTCTGGGATACCCAGGACCTCGAGGTGT	95295
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX324144.4	1151	GGTCCATCTGGTCCTCAGGGTCCTCTGGGATACCCAGGACCTCGAGGTGT	1200

BX640585.2	95296	CAAGGTAATGGACCACCGGGCTGGGAGATAAAGACTGAGGTCAGAGGAGC	95345
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX324144.4	1201	CAAGGTAATGGACCACCGGGCTGGGAGATAAAGACTGAGGTCAGAGGAGC	1250

BX640585.2	95346	CAGCTGGGGCCCCAGGAGCGCTCTCCTTCCAGCCCCGCCTCCCCCTTGAT	95395
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX324144.4	1251	CAGCTGGGGCCCCAGGAGCGCTCTCCTTCCAGCCCCGCCTCCCCCTTGAT	1300

BX640585.2	95396	CTCTCTGTCTCTCTCTCCCCTCCTCTAATTCTAGGGTGTGGACGGGATTC	95445
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX324144.4	1301	CTCTCTGTCTCTCTCTCCCCTCCTCTAATTCTAGGGTGTGGACGGGATTC	1350

BX640585.2	95446	GAGGTCTGAAAGGTCACAAGGGTGAAAAGGTGAGCCATGGGCCCCTGGCT	95495
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX324144.4	1351	GAGGTCTGAAAGGTCACAAGGGTGAAAAGGTGAGCCATGGGCCCCTGGCT	1400

BX640585.2	95496	TCCTGGGGCCTCCACCCTACCCCACACCAACCTTTCTGCCCATCCCTTCC	95545
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX324144.4	1401	TCCTGGGGCCTCCACCCTACCCCACACCAACCTTTCTGCCCATCCCTTCC	1450

BX640585.2	95546	GCACACCCTGCCTCCAGCTCCCGAAATGCACCCCTCCACCCACAGTCTCC	95595
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX324144.4	1451	GCACACCCTGCCTCCAGCTCCCGAAATGCACCCCTCCACCCACAGTCTCC	1500

BX640585.2	95596	GAAATCCCTCATTTTAACCCCCGAGCCTCCATCACGTGGCCTCCTCTGTC	95645
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX324144.4	1501	GAAATCCCTCATTTTAACCCCCGAGCCTCCATCACGTGGCCTCCTCTGTC	1550

BX640585.2	95646	CCCATCTTTCTCAGGGCGAGGATGGCTTTCCTGGGTTCAAAGGTGACATG	95695
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX324144.4	1551	CCCATCTTTCTCAGGGCGAGGATGGCTTTCCTGGGTTCAAAGGTGACATG	1600

BX640585.2	95696	GGTGTGAAAGGTGACAGGGTGAGTAGAAACCCCCGCACTGCCCCCCCCCC	95745
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX324144.4	1601	GGTGTGAAAGGTGACAGGGTGAGTAGAAACCCCCGCACTGCCCCCCCCCC	1650

BX640585.2	95746	ACTCTAGATGCTAATGATCCTCCCTTTTGGAGCCCCCAGTTCCCAGCCTG	95795
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX324144.4	1651	ACTCTAGATGCTAATGATCCTCCCTTTTGGAGCCCCCAGTTCCCAGCCTG	1700

BX640585.2	95796	TTCCCTTGATACCCTTGACCCCTCATCTCCACTGCTGGGCTCCCTGTAGG	95845
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX324144.4	1701	TTCCCTTGATACCCTTGACCCCTCATCTCCACTGCTGGGCTCCCTGTAGG	1750

BX640585.2	95846	GCCTGATCCTAGCAGGAGCAGGGCCCCGCAGTCTGAGTCCTACTGGCTCA	95895
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX324144.4	1751	GCCTGATCCTAGCAGGAGCAGGGCCCCGCAGTCTGAGTCCTACTGGCTCA	1800

BX640585.2	95896	CCAGCCACAGCACTCTCCCTGCCCTGTGGGGCTCCCTGTCCTGCAGTAGC	95945
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX324144.4	1801	CCAGCCACAGCACTCTCCCTGCCCTGTGGGGCTCCCTGTCCTGCAGTAGC	1850

BX640585.2	95946	TTCTGGGATCCCCCACCAGCCCCACTCAGCCTCCCGGGGGCCTGCCTATC	95995
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX324144.4	1851	TTCTGGGATCCCCCACCAGCCCCACTCAGCCTCCCGGGGGCCTGCCTATC	1900

BX640585.2	95996	CTCTCAGGACTCAGCCCCCACCCCCACCACCCCCCCACCACCGTCCCTGT	96045
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX324144.4	1901	CTCTCAGGACTCAGCCCCCACCCCCACCACCCCCCCACCACCGTCCCTGT	1950

BX640585.2	96046	CCAACCCCCTCACCTGCCCACCCTCTCACCCAGGGCGAGGTTGGAGTCCC	96095
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX324144.4	1951	CCAACCCCCTCACCTGCCCACCCTCTCACCCAGGGCGAGGTTGGAGTCCC	2000

Overview

Query
BX640585.2 - 96095 bps
Hit
BX324144.4 - 124310 bps
Total alignments
26
Best alignment
alignment #1 (HSP: 2000 bps)
Best alignment cartoon

Alternate alignments

#%IDscoreHSPstartendstrandhstarthendhstrand
11001941200094096960951120001
291.981912593661336871-134398346591
391.571912604393744196-134399346591
490.071882713522235492-144363446341
591.541982703661336882-144363446341
685.12344762683127306146473469421
790.781982803661136890173928742091
888.851882884393644223173929742151
993.442152754602046294173929742021
1093.682292853522235506173930742141
1192.392162856771067994173930742181
1296.152492853456234846-173930742151
1391.75206281345663484611081471084251
1491.342032773522235498-11081491084251
1590.181912774601846294-11081541084281
1691.171992794393844216-11147221150041
1793.022052683661436881-11147331150041
1892.541992663522335488-11147371150041
1994.7195242346043484511147601150041
2094.251892424602446265-11147601150021
2193.881892426771167952-11147601150041
2293.14218278345693484611205381208141
2390.611972784393744214-11205381208141
2492.762142773522235498-11205391208141
2591.612022733661336885-11205411208141
2691.041942714602446294-11205441208111
Short-link