<=>End overlap alignment

Alignment #1 HSP: 2000 bps / non-identical: 0 bps

Full alignment

BX465202.4	1	GAATTCAAGAAATACTTAGAAGACAGACTCAAAAAACCAGGGGAACGAGG	50
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX324001.6	145685	GAATTCAAGAAATACTTAGAAGACAGACTCAAAAAACCAGGGGAACGAGG	145734

BX465202.4	51	TGGCATTGCAGAACACGGTAAGTTAAATAACATCAGTGCATTAGAAATAA	100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX324001.6	145735	TGGCATTGCAGAACACGGTAAGTTAAATAACATCAGTGCATTAGAAATAA	145784

BX465202.4	101	CTTCATGTAGATGGAATGGAATTACCTGTATAATGAGGAACGTCAGGAAC	150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX324001.6	145785	CTTCATGTAGATGGAATGGAATTACCTGTATAATGAGGAACGTCAGGAAC	145834

BX465202.4	151	TTTGGGAAATGATGGATAAGTAAATGAATAGTAGTGGTCTACACTTAATT	200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX324001.6	145835	TTTGGGAAATGATGGATAAGTAAATGAATAGTAGTGGTCTACACTTAATT	145884

BX465202.4	201	TATGAACATTAAACAGCAAAAGTTTAAACACGGGGGAAGCACGTTGGCTT	250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX324001.6	145885	TATGAACATTAAACAGCAAAAGTTTAAACACGGGGGAAGCACGTTGGCTT	145934

BX465202.4	251	GGTGGTTAGCACTGTTGCCTCACAGCAAGAGGATTGCTTGATTGAGTCCC	300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX324001.6	145935	GGTGGTTAGCACTGTTGCCTCACAGCAAGAGGATTGCTTGATTGAGTCCC	145984

BX465202.4	301	GTCTGGGTCAGTTAGCATTTCTGTGTGGAGTTTGTATGTCCCCGTGTTCG	350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX324001.6	145985	GTCTGGGTCAGTTAGCATTTCTGTGTGGAGTTTGTATGTCCCCGTGTTCG	146034

BX465202.4	351	CGTGGGTTACGTCCCGGTGCTCCGGTTTCCTCCACAGTCCAAAGACATGC	400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX324001.6	146035	CGTGGGTTACGTCCCGGTGCTCCGGTTTCCTCCACAGTCCAAAGACATGC	146084

BX465202.4	401	ACTATAGGTGAATTGGGTAAACAAAATTGGGCGTAATGTATGAACATGAG	450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX324001.6	146085	ACTATAGGTGAATTGGGTAAACAAAATTGGGCGTAATGTATGAACATGAG	146134

BX465202.4	451	AGTGAATGGTTGTTTGCCTGAACTGTGTTGCAGCTGGTAGGGCATCTGCT	500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX324001.6	146135	AGTGAATGGTTGTTTGCCTGAACTGTGTTGCAGCTGGTAGGGCATCTGCT	146184

BX465202.4	501	GTGTAAAACATATGCCAGAAAGGTTGGTGGTTCATTCCACTGTGGCGACC	550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX324001.6	146185	GTGTAAAACATATGCCAGAAAGGTTGGTGGTTCATTCCACTGTGGCGACC	146234

BX465202.4	551	CCTGATAAATAAGGGACTAAGCGAAAGAAAAATTAATGAATGAGTCTACA	600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX324001.6	146235	CCTGATAAATAAGGGACTAAGCGAAAGAAAAATTAATGAATGAGTCTACA	146284

BX465202.4	601	CAGTCTACAGTATTCACAACAACATTTAAATATAAAAGGTTAATGGTAAG	650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX324001.6	146285	CAGTCTACAGTATTCACAACAACATTTAAATATAAAAGGTTAATGGTAAG	146334

BX465202.4	651	AAATTAACAAACTATATTTTGTACATTTCTAACTAATAAATATAATAATG	700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX324001.6	146335	AAATTAACAAACTATATTTTGTACATTTCTAACTAATAAATATAATAATG	146384

BX465202.4	701	ATGCCTTTATTTTAAAGAAGGAGTGGGATAATCAATCTTCCATGTTTTAA	750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX324001.6	146385	ATGCCTTTATTTTAAAGAAGGAGTGGGATAATCAATCTTCCATGTTTTAA	146434

BX465202.4	751	TTAATAATGTTAAACAAGTTTCATAGGGTGCCCAAAAATATTTTTGGTTA	800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX324001.6	146435	TTAATAATGTTAAACAAGTTTCATAGGGTGCCCAAAAATATTTTTGGTTA	146484

BX465202.4	801	TATTATTAATAAACTTTTGCTAAATGAAATACATCAGTTAATTGGACGTA	850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX324001.6	146485	TATTATTAATAAACTTTTGCTAAATGAAATACATCAGTTAATTGGACGTA	146534

BX465202.4	851	CTAAAAATAAATTGACCCATTAAAATCGAATCCGGAAAAATCACAAATTG	900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX324001.6	146535	CTAAAAATAAATTGACCCATTAAAATCGAATCCGGAAAAATCACAAATTG	146584

BX465202.4	901	ACAAAGTGTATTTAAATAATTTCGAGAGGAACATGTGATATGATTGATTA	950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX324001.6	146585	ACAAAGTGTATTTAAATAATTTCGAGAGGAACATGTGATATGATTGATTA	146634

BX465202.4	951	CGACTGGTCTCTCATCCATAATCAGCGATAATCCAATCAGATCGATCCAA	1000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX324001.6	146635	CGACTGGTCTCTCATCCATAATCAGCGATAATCCAATCAGATCGATCCAA	146684

BX465202.4	1001	GCCTACAATAAACAAACCAATTTCACCCTACTTGCCTTACTGTATCTTCG	1050
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX324001.6	146685	GCCTACAATAAACAAACCAATTTCACCCTACTTGCCTTACTGTATCTTCG	146734

BX465202.4	1051	TTTTGAAGAATCCACCCCATCTCCTCCTTTTCCTCCTTTACTAGAGGGAG	1100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX324001.6	146735	TTTTGAAGAATCCACCCCATCTCCTCCTTTTCCTCCTTTACTAGAGGGAG	146784

BX465202.4	1101	CTCTCGAGACCTACCTGATCTCGGACCCCCTTTATGCTAAGTGACGAGGA	1150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX324001.6	146785	CTCTCGAGACCTACCTGATCTCGGACCCCCTTTATGCTAAGTGACGAGGA	146834

BX465202.4	1151	AAGAACCCTGGCCGCAATTATCTCCTAGCTCAGGGTTCTCTCCTAGGACA	1200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX324001.6	146835	AAGAACCCTGGCCGCAATTATCTCCTAGCTCAGGGTTCTCTCCTAGGACA	146884

BX465202.4	1201	CCATGCCAACCCTGCGAATAGCGTCAAGCAATATCTAAATTGTGAACTTA	1250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX324001.6	146885	CCATGCCAACCCTGCGAATAGCGTCAAGCAATATCTAAATTGTGAACTTA	146934

BX465202.4	1251	ACTAGAAATAAAAATTTCTTTAACTAGAAATAAAAGAAGTTAAAATAAAA	1300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX324001.6	146935	ACTAGAAATAAAAATTTCTTTAACTAGAAATAAAAGAAGTTAAAATAAAA	146984

BX465202.4	1301	TAAAACTGATTTCCTAGACCCATGTTTTACTAAAGATTGAATACAAATAA	1350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX324001.6	146985	TAAAACTGATTTCCTAGACCCATGTTTTACTAAAGATTGAATACAAATAA	147034

BX465202.4	1351	ATATTGAAACATTGATTATTTTCCACAATAGATGAAGATACAGTTTGTTT	1400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX324001.6	147035	ATATTGAAACATTGATTATTTTCCACAATAGATGAAGATACAGTTTGTTT	147084

BX465202.4	1401	TGTTTTTAGTGCTGCAGATTGTCAAACTGCAAATTGAAGCGATGGACCTA	1450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX324001.6	147085	TGTTTTTAGTGCTGCAGATTGTCAAACTGCAAATTGAAGCGATGGACCTA	147134

BX465202.4	1451	CAGACACGTCTCGCTAGTAAATATAAGACACAAGCGCAGATTGATGGTGA	1500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX324001.6	147135	CAGACACGTCTCGCTAGTAAATATAAGACACAAGCGCAGATTGATGGTGA	147184

BX465202.4	1501	GTGTTCATTATTTGATGTTGAGGAAATGTTGCAGTTGTAAGATGATCTGG	1550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX324001.6	147185	GTGTTCATTATTTGATGTTGAGGAAATGTTGCAGTTGTAAGATGATCTGG	147234

BX465202.4	1551	ATTGTTTTGTATTCATCTCCTTGAATGTTTTACAGTAATTACAAACCAGC	1600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX324001.6	147235	ATTGTTTTGTATTCATCTCCTTGAATGTTTTACAGTAATTACAAACCAGC	147284

BX465202.4	1601	TAGAGTACAAAAAAGGCCTTGTATCTGATCTGAAAGAGGAGAGAGAAGAG	1650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX324001.6	147285	TAGAGTACAAAAAAGGCCTTGTATCTGATCTGAAAGAGGAGAGAGAAGAG	147334

BX465202.4	1651	ATGACCGGAAACAAACTAAATATTGGTACGTTGTTCAGTGTTTGTTTTTT	1700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX324001.6	147335	ATGACCGGAAACAAACTAAATATTGGTACGTTGTTCAGTGTTTGTTTTTT	147384

BX465202.4	1701	CGCTTCCACCATTTTTTTGTAGGCCCAGAATAAATGTTTTAGCATGCATG	1750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX324001.6	147385	CGCTTCCACCATTTTTTTGTAGGCCCAGAATAAATGTTTTAGCATGCATG	147434

BX465202.4	1751	TTATGATACCCAAAAATATGGCGTGTGTCATCCCTTTTTTGTCTTGCATT	1800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX324001.6	147435	TTATGATACCCAAAAATATGGCGTGTGTCATCCCTTTTTTGTCTTGCATT	147484

BX465202.4	1801	CCAGATACACTCATTAAATCTCTGGATAAAGAAATACTGGACCTGAAGGC	1850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX324001.6	147485	CCAGATACACTCATTAAATCTCTGGATAAAGAAATACTGGACCTGAAGGC	147534

BX465202.4	1851	TGAATTATCAGCTCTTAAGCAAACACTTATTCAGCTTGATGGTACTAGAT	1900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX324001.6	147535	TGAATTATCAGCTCTTAAGCAAACACTTATTCAGCTTGATGGTACTAGAT	147584

BX465202.4	1901	TCACACTAGCGTTTATTTACGAATAATTTTGTATTCAGATATGCTAAGTA	1950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX324001.6	147585	TCACACTAGCGTTTATTTACGAATAATTTTGTATTCAGATATGCTAAGTA	147634

BX465202.4	1951	TTTTGCCGATGATTTGTATCTTGTAGGACTGGCGAAAGAATTTGATAACA	2000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX324001.6	147635	TTTTGCCGATGATTTGTATCTTGTAGGACTGGCGAAAGAATTTGATAACA	147684

Overview

Query
BX465202.4 - 170771 bps
Hit
BX324001.6 - 147684 bps
Total alignments
20
Best alignment
alignment #1 (HSP: 2000 bps)
Best alignment cartoon

Alternate alignments

#%IDscoreHSPstartendstrandhstarthendhstrand
1100194420001200011456851476841
279.821153416974870088-110024103551
383.631633526973170082132067324021
481.991413743892339296146168465281
581.93129318113459113776157874581831
690.15961412731827458-164180643211
782.671783978381684212166596669991
883.221403116977570085176347766441
984.231212586973169988-195517957761
1087.91162287113392113678-195517957891
1185.17189383113398113780198242986121
1283.061493576973670092198255986141
1382.1771958006580259-199628998171
1484.434128918157082460-11010861019841
1584.35147345127874128218-11046071049511
1686.35192397736037399911046071049941
1784.948816414782514798811274631276281
1893.118323214799414822511283091285401
198889149273142746211318651320141
2087.371142022731827519-11444221446271
Short-link