<=>End overlap alignment

Alignment #1 HSP: 2000 bps / non-identical: 0 bps

Full alignment

AL845443.3	1	GGCCGGGCCGGGACACGGCGGTGTAGAAATACCTCATGGAGTGGGAGCCT	50
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX322539.9	67496	GGCCGGGCCGGGACACGGCGGTGTAGAAATACCTCATGGAGTGGGAGCCT	67545

AL845443.3	51	GGGGGCGAGGAGGGGCTGAGACCCGCCCGACCCTCCTCCCTGCGCGGCTC	100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX322539.9	67546	GGGGGCGAGGAGGGGCTGAGACCCGCCCGACCCTCCTCCCTGCGCGGCTC	67595

AL845443.3	101	CCCGGGTCCTGCGCCCTCGCCGGGCGGGCCCCTCGCTCCTCTCCGCAGAG	150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX322539.9	67596	CCCGGGTCCTGCGCCCTCGCCGGGCGGGCCCCTCGCTCCTCTCCGCAGAG	67645

AL845443.3	151	GCCGTTTCCCTCCCAACCTCGCACTCACAGGCCCAGGTCTCGGTCAGGGC	200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX322539.9	67646	GCCGTTTCCCTCCCAACCTCGCACTCACAGGCCCAGGTCTCGGTCAGGGC	67695

AL845443.3	201	CAGGGCTCCCGAGAGCAGCAGGATGAGGGTTCGGGGCGCCATGACCCGCA	250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX322539.9	67696	CAGGGCTCCCGAGAGCAGCAGGATGAGGGTTCGGGGCGCCATGACCCGCA	67745

AL845443.3	251	TCTCGGCGTCTGGGGAGAATCCGAGTCCGGGTGGGTGACTGGGGACTTTA	300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX322539.9	67746	TCTCGGCGTCTGGGGAGAATCCGAGTCCGGGTGGGTGACTGGGGACTTTA	67795

AL845443.3	301	GAACCGGGACTGCGGAGACGCTGATTGGCTTCTCTAGAACCCGACACCCA	350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX322539.9	67796	GAACCGGGACTGCGGAGACGCTGATTGGCTTCTCTAGAACCCGACACCCA	67845

AL845443.3	351	ATGGGAGTGGGAATTGGGGACGCGTCATGAGTATTCAGGAAGAAGGACCC	400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX322539.9	67846	ATGGGAGTGGGAATTGGGGACGCGTCATGAGTATTCAGGAAGAAGGACCC	67895

AL845443.3	401	GACGCAGGTTGGAAGAAGAAGTGAAACTCAGGGGAGTGGAGAATCCTCAA	450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX322539.9	67896	GACGCAGGTTGGAAGAAGAAGTGAAACTCAGGGGAGTGGAGAATCCTCAA	67945

AL845443.3	451	CGCGGCGCCTCCCCAGTGCAGACACGGCCCTTGGAGCCTGAGACCCTGAG	500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX322539.9	67946	CGCGGCGCCTCCCCAGTGCAGACACGGCCCTTGGAGCCTGAGACCCTGAG	67995

AL845443.3	501	AGCCCCGCCCGGGACCTGGGACTTCGTCCTGATCCCTCTTCTCCTACACC	550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX322539.9	67996	AGCCCCGCCCGGGACCTGGGACTTCGTCCTGATCCCTCTTCTCCTACACC	68045

AL845443.3	551	AAGCATCTTTGTCACACTGTGTGCCTGAGTCCTGGCCAAGGATCTGTCTG	600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX322539.9	68046	AAGCATCTTTGTCACACTGTGTGCCTGAGTCCTGGCCAAGGATCTGTCTG	68095

AL845443.3	601	TGGAAACCAGGGAGAGACCCCCAGGCTGCGCCCAGCCCCTTCCCCTTCAC	650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX322539.9	68096	TGGAAACCAGGGAGAGACCCCCAGGCTGCGCCCAGCCCCTTCCCCTTCAC	68145

AL845443.3	651	TTCTCCTGGAATCCCCGTCCCTGAACTGGACTCCCTGCCTCCCACTCTTT	700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX322539.9	68146	TTCTCCTGGAATCCCCGTCCCTGAACTGGACTCCCTGCCTCCCACTCTTT	68195

AL845443.3	701	GCCTTACCTTACCTCAGGTAATATTAAACTACATCCAGCAAAATAAAGGA	750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX322539.9	68196	GCCTTACCTTACCTCAGGTAATATTAAACTACATCCAGCAAAATAAAGGA	68245

AL845443.3	751	CACTTACCTCTCCCCTTGGACTCTTGTACAGGGAAACTCACCATGGGGAA	800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX322539.9	68246	CACTTACCTCTCCCCTTGGACTCTTGTACAGGGAAACTCACCATGGGGAA	68295

AL845443.3	801	CTTGATGCCAGACAGTGAGCTCGCCCTGGGAATGGACGTGTAGAGTCAGG	850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX322539.9	68296	CTTGATGCCAGACAGTGAGCTCGCCCTGGGAATGGACGTGTAGAGTCAGG	68345

AL845443.3	851	AGTTTTCTCTTTAAACCTGGTGAAGTTTTGTCTGAAAGCACCAGGTAGAG	900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX322539.9	68346	AGTTTTCTCTTTAAACCTGGTGAAGTTTTGTCTGAAAGCACCAGGTAGAG	68395

AL845443.3	901	ATTCTCATAGAGACCAGTTTCCTTTTTGTTTATTGATACAGTAGGTAGCA	950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX322539.9	68396	ATTCTCATAGAGACCAGTTTCCTTTTTGTTTATTGATACAGTAGGTAGCA	68445

AL845443.3	951	CAATATTGGTAATCCCTGAATGATTAGAATTCCAATCTGTGAAAGACCTG	1000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX322539.9	68446	CAATATTGGTAATCCCTGAATGATTAGAATTCCAATCTGTGAAAGACCTG	68495

AL845443.3	1001	TGTCAAAACTGCATTACAATTAAATTCTCAAAGCTCCTGTTTTACTTTCG	1050
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX322539.9	68496	TGTCAAAACTGCATTACAATTAAATTCTCAAAGCTCCTGTTTTACTTTCG	68545

AL845443.3	1051	CAGACTATGGATCTGTGACTCTGGGTTGTTGCATTTAAAGTTATCCTCAT	1100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX322539.9	68546	CAGACTATGGATCTGTGACTCTGGGTTGTTGCATTTAAAGTTATCCTCAT	68595

AL845443.3	1101	TCTCTAGCCCGAGTTTCCTTGTGTGAGTCCAGAACATCTCCTGAATACAA	1150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX322539.9	68596	TCTCTAGCCCGAGTTTCCTTGTGTGAGTCCAGAACATCTCCTGAATACAA	68645

AL845443.3	1151	AGAAGCAGGGTTTGTTACTGTCTATTGCAACCGGGAGCCTGTAGTCATCA	1200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX322539.9	68646	AGAAGCAGGGTTTGTTACTGTCTATTGCAACCGGGAGCCTGTAGTCATCA	68695

AL845443.3	1201	CCTCAAAGTTGCGAGGGCTCAATGCAGTCCCAATGCTCTTCACCAGCGCT	1250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX322539.9	68696	CCTCAAAGTTGCGAGGGCTCAATGCAGTCCCAATGCTCTTCACCAGCGCT	68745

AL845443.3	1251	CCAGCACTGCCCGTTTTCCGGAACTATGCACATCTAAGCAGTGTGCATAT	1300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX322539.9	68746	CCAGCACTGCCCGTTTTCCGGAACTATGCACATCTAAGCAGTGTGCATAT	68795

AL845443.3	1301	TTTATTTGGACACTTGATATTTTTGTAACCCCTTTTTTAAAAAAAATCAT	1350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX322539.9	68796	TTTATTTGGACACTTGATATTTTTGTAACCCCTTTTTTAAAAAAAATCAT	68845

AL845443.3	1351	AAGGAGGCCATTAGTTTTAAGGCAGTCACACAAAAGGTATTAAATACCGA	1400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX322539.9	68846	AAGGAGGCCATTAGTTTTAAGGCAGTCACACAAAAGGTATTAAATACCGA	68895

AL845443.3	1401	ATGCAAAGAACCCCCTGCCAGGCTCTTCTACTGCTTTAGAATTCTTTCCT	1450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX322539.9	68896	ATGCAAAGAACCCCCTGCCAGGCTCTTCTACTGCTTTAGAATTCTTTCCT	68945

AL845443.3	1451	CTGCTCCTTTCCTCACCTCCTGCTTCTCCAGCCCTTCTGTCTGCCCCTCT	1500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX322539.9	68946	CTGCTCCTTTCCTCACCTCCTGCTTCTCCAGCCCTTCTGTCTGCCCCTCT	68995

AL845443.3	1501	CATCCCTCACACCCTCTTTCCCCTTTAGTCCCCGCCACCCTGTCACTCCT	1550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX322539.9	68996	CATCCCTCACACCCTCTTTCCCCTTTAGTCCCCGCCACCCTGTCACTCCT	69045

AL845443.3	1551	GAATTGTGGCACTAACACTGTCCCTCACCTCCTGCCCATGTCTGTTCTCC	1600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX322539.9	69046	GAATTGTGGCACTAACACTGTCCCTCACCTCCTGCCCATGTCTGTTCTCC	69095

AL845443.3	1601	CCACAGTGCTCAGCAGTCCTGCTAATGTGACTCAGGTCGTGTCATTTCTT	1650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX322539.9	69096	CCACAGTGCTCAGCAGTCCTGCTAATGTGACTCAGGTCGTGTCATTTCTT	69145

AL845443.3	1651	CACTTACAATGGTTGGATTTTGGTCTACCATTTTGCTATATGTTTTCAAT	1700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX322539.9	69146	CACTTACAATGGTTGGATTTTGGTCTACCATTTTGCTATATGTTTTCAAT	69195

AL845443.3	1701	TTGTCTCATATCTTTTTGTTTCTGTTCCTCCTTTGCTACTTTCTTATGTG	1750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX322539.9	69196	TTGTCTCATATCTTTTTGTTTCTGTTCCTCCTTTGCTACTTTCTTATGTG	69245

AL845443.3	1751	TCAAGTAAACATTTTTTAGCTTATGGTTTTAATTCTCCTAGTGGCTTTTA	1800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX322539.9	69246	TCAAGTAAACATTTTTTAGCTTATGGTTTTAATTCTCCTAGTGGCTTTTA	69295

AL845443.3	1801	GCTATATTTCTTTACATTAATTTTTTATTGTTGTAAGAATTGAAACCCAA	1850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX322539.9	69296	GCTATATTTCTTTACATTAATTTTTTATTGTTGTAAGAATTGAAACCCAA	69345

AL845443.3	1851	TTCCTTGACTTTTCACAGTGAAATTCAGGTAATATTAAGCTGCATCCAGC	1900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX322539.9	69346	TTCCTTGACTTTTCACAGTGAAATTCAGGTAATATTAAGCTGCATCCAGC	69395

AL845443.3	1901	AAAATAAAGGACACTTCAAATGGTGTAGTTTCACTTAAACTATCATTATG	1950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX322539.9	69396	AAAATAAAGGACACTTCAAATGGTGTAGTTTCACTTAAACTATCATTATG	69445

AL845443.3	1951	CTATTATTATTGTATATGTTACATCAATATACGTTATAAACTCAACGATA	2000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX322539.9	69446	CTATTATTATTGTATATGTTACATCAATATACGTTATAAACTCAACGATA	69495

Overview

Query
AL845443.3 - 148076 bps
Hit
BX322539.9 - 69495 bps
Total alignments
1
Best alignment
alignment #1 (HSP: 2000 bps)
Best alignment cartoon

Alternate alignments

Short-link