<=>End overlap alignment

Alignment #1 HSP: 2000 bps / non-identical: 0 bps

Full alignment

AL773562.15	125266	GGGGAAGAGGGAGGGAGAAAAGGTAGATTAATTTTCAATAAGAACATAAG	125315
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX322232.4	1	GGGGAAGAGGGAGGGAGAAAAGGTAGATTAATTTTCAATAAGAACATAAG	50

AL773562.15	125316	GATTCCACGAATCGGAGTATTCAGCCTTAGTCACAGTGGACTAAGGTTAC	125365
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX322232.4	51	GATTCCACGAATCGGAGTATTCAGCCTTAGTCACAGTGGACTAAGGTTAC	100

AL773562.15	125366	TCTGGCACAGAACCCAGAAATAAAACTTGAGGAAAAAAAGTCTAGGTTAG	125415
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX322232.4	101	TCTGGCACAGAACCCAGAAATAAAACTTGAGGAAAAAAAGTCTAGGTTAG	150

AL773562.15	125416	TGAGCTGAGGCTCAACACAAAACGAAAAGGACTGTTTTGGCACAAATCTG	125465
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX322232.4	151	TGAGCTGAGGCTCAACACAAAACGAAAAGGACTGTTTTGGCACAAATCTG	200

AL773562.15	125466	TAGCTAATGATGAAATTACCTCCCCTCCTGGCTGTCCTGGCATGGTTCTT	125515
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX322232.4	201	TAGCTAATGATGAAATTACCTCCCCTCCTGGCTGTCCTGGCATGGTTCTT	250

AL773562.15	125516	ATAGTCTGGGGCACAATGGTGGGGTGTTACAGAGCAGACTGGAGAGGGAG	125565
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX322232.4	251	ATAGTCTGGGGCACAATGGTGGGGTGTTACAGAGCAGACTGGAGAGGGAG	300

AL773562.15	125566	CCAAAATGAGGAACTGAGAGTGGGGTTCTCCTTTCCAGAACTGTGGTGGC	125615
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX322232.4	301	CCAAAATGAGGAACTGAGAGTGGGGTTCTCCTTTCCAGAACTGTGGTGGC	350

AL773562.15	125616	CCAGCCTGTGCAGGGAGCTGGGCAAGCAAGGCTGAACCACAGAGGGACCA	125665
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX322232.4	351	CCAGCCTGTGCAGGGAGCTGGGCAAGCAAGGCTGAACCACAGAGGGACCA	400

AL773562.15	125666	GCACCTTTCACTAGGAAGAGGAGGACCGGTTTTCCACTGACACTTCCAGT	125715
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX322232.4	401	GCACCTTTCACTAGGAAGAGGAGGACCGGTTTTCCACTGACACTTCCAGT	450

AL773562.15	125716	GGAGCAGGTTATACCAGTTATATATGTAAAATATAAGACAAACTAAAGGG	125765
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX322232.4	451	GGAGCAGGTTATACCAGTTATATATGTAAAATATAAGACAAACTAAAGGG	500

AL773562.15	125766	GCACAGACCAAAGGGTGAAGAGAATGGGATGAAGTTATTCCAGAATCATG	125815
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX322232.4	501	GCACAGACCAAAGGGTGAAGAGAATGGGATGAAGTTATTCCAGAATCATG	550

AL773562.15	125816	TTATTCAAAGTGGGGTGGGACCAAGAGCAGCAGCAACAAAGAGCCTGTTA	125865
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX322232.4	551	TTATTCAAAGTGGGGTGGGACCAAGAGCAGCAGCAACAAAGAGCCTGTTA	600

AL773562.15	125866	GAAATGCAGAATTGCAGGCCCCATCTTAGACTTCCTAATTCAGAAGGCGC	125915
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX322232.4	601	GAAATGCAGAATTGCAGGCCCCATCTTAGACTTCCTAATTCAGAAGGCGC	650

AL773562.15	125916	CATTTAACAAGTTCCTCAGAGGATGTGTATGCACATCGAAGTTTGAAAAC	125965
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX322232.4	651	CATTTAACAAGTTCCTCAGAGGATGTGTATGCACATCGAAGTTTGAAAAC	700

AL773562.15	125966	CACTAAGATTTCTTGAGGAAGAAGACTTCTAAAGGCATTGATGAACAAGA	126015
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX322232.4	701	CACTAAGATTTCTTGAGGAAGAAGACTTCTAAAGGCATTGATGAACAAGA	750

AL773562.15	126016	GGGGAAAGGTAAGGCAAGCCTCAGGTAGTTCCCCAAGGGAATAGGACAGG	126065
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX322232.4	751	GGGGAAAGGTAAGGCAAGCCTCAGGTAGTTCCCCAAGGGAATAGGACAGG	800

AL773562.15	126066	CTGGGGAGAAATAGAGTTTATTTGTTAGCACCCTGGATTGAATGCGCGAA	126115
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX322232.4	801	CTGGGGAGAAATAGAGTTTATTTGTTAGCACCCTGGATTGAATGCGCGAA	850

AL773562.15	126116	GGAGCAGACAGGTTGATTGGCTGGGAGCCTTGAGACCAGCAATATGAATA	126165
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX322232.4	851	GGAGCAGACAGGTTGATTGGCTGGGAGCCTTGAGACCAGCAATATGAATA	900

AL773562.15	126166	GCACAGGTGGGCCTGAAGTCGCCATGCGGGCCCTCGTCGCTACCGCTATC	126215
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX322232.4	901	GCACAGGTGGGCCTGAAGTCGCCATGCGGGCCCTCGTCGCTACCGCTATC	950

AL773562.15	126216	ATTCACCACCAGCTCCACCATTCCCCACCCTATCCTCATTCGCCCCAATC	126265
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX322232.4	951	ATTCACCACCAGCTCCACCATTCCCCACCCTATCCTCATTCGCCCCAATC	1000

AL773562.15	126266	TCCCACTCCAGGCCTTCTCCAGACTTTAACTCTCAATAGCCAGGCTAGCT	126315
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX322232.4	1001	TCCCACTCCAGGCCTTCTCCAGACTTTAACTCTCAATAGCCAGGCTAGCT	1050

AL773562.15	126316	CGACCTCGCCTAGTTCAGTTCGATTTGGCCTAGTTCGGTTGCTAAGGCCT	126365
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX322232.4	1051	CGACCTCGCCTAGTTCAGTTCGATTTGGCCTAGTTCGGTTGCTAAGGCCT	1100

AL773562.15	126366	GGAGCTTCCCGGTTGCTGGGGGAGGGGAGGGAAATGATGTCACGTCCAGA	126415
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX322232.4	1101	GGAGCTTCCCGGTTGCTGGGGGAGGGGAGGGAAATGATGTCACGTCCAGA	1150

AL773562.15	126416	AGGCGGGCTAACCAGACCTCTCCCTCCTCCCGATTGGTTGCCGGGAACTT	126465
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX322232.4	1151	AGGCGGGCTAACCAGACCTCTCCCTCCTCCCGATTGGTTGCCGGGAACTT	1200

AL773562.15	126466	GAGTAGATTCGCTTTCACGCGGGCTCCAGGGTTAGCCGTTAGTGTCTCTC	126515
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX322232.4	1201	GAGTAGATTCGCTTTCACGCGGGCTCCAGGGTTAGCCGTTAGTGTCTCTC	1250

AL773562.15	126516	CTCAGCTGTCCCCTGCTCCCCCTGACCGTCCTCTCCGCCCGAAGCAAAAC	126565
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX322232.4	1251	CTCAGCTGTCCCCTGCTCCCCCTGACCGTCCTCTCCGCCCGAAGCAAAAC	1300

AL773562.15	126566	TCTAATGACAGTGCTCAGTAGAGCTTAGCTTCGGAAGGAGAGGTGATTCG	126615
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX322232.4	1301	TCTAATGACAGTGCTCAGTAGAGCTTAGCTTCGGAAGGAGAGGTGATTCG	1350

AL773562.15	126616	AATGGTCGGGCTACCGCCACCAGGAGAGGCACTTCGGCCGCCCAGGTACT	126665
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX322232.4	1351	AATGGTCGGGCTACCGCCACCAGGAGAGGCACTTCGGCCGCCCAGGTACT	1400

AL773562.15	126666	TTTTGACTCGCTCGGGTATCCGTAGTTGGGACAGTGGCTCAAGCCGCAGG	126715
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX322232.4	1401	TTTTGACTCGCTCGGGTATCCGTAGTTGGGACAGTGGCTCAAGCCGCAGG	1450

AL773562.15	126716	GAATTGTGGAACTTATAGTTCGAATTAGTTCGGGGTTGGGAGGTAGGCTC	126765
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX322232.4	1451	GAATTGTGGAACTTATAGTTCGAATTAGTTCGGGGTTGGGAGGTAGGCTC	1500

AL773562.15	126766	GAATCCGACAGAGATTTTGAGGAGGGGGGAAAAAAAAAGAGAGAACTTTA	126815
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX322232.4	1501	GAATCCGACAGAGATTTTGAGGAGGGGGGAAAAAAAAAGAGAGAACTTTA	1550

AL773562.15	126816	AGGACCGGAGGCCTGGATCCCAGAAGGACAGAAAAGAAGTCTAAATAAGA	126865
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX322232.4	1551	AGGACCGGAGGCCTGGATCCCAGAAGGACAGAAAAGAAGTCTAAATAAGA	1600

AL773562.15	126866	TTCCTGCCAATAGCATTGTTTTGATTTTTTTTTCTTTTTTAATCAGGTGC	126915
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX322232.4	1601	TTCCTGCCAATAGCATTGTTTTGATTTTTTTTTCTTTTTTAATCAGGTGC	1650

AL773562.15	126916	TGATCTGAATCTGATCCATACCTTTCTGACCAAAACTGTTTACCCACGGT	126965
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX322232.4	1651	TGATCTGAATCTGATCCATACCTTTCTGACCAAAACTGTTTACCCACGGT	1700

AL773562.15	126966	GGAAGGGACTGGGTACCCAAATGGAGACGCCACCAGTCAGTCCACTGGGA	127015
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX322232.4	1701	GGAAGGGACTGGGTACCCAAATGGAGACGCCACCAGTCAGTCCACTGGGA	1750

AL773562.15	127016	GAGAAGAACATTTCTCAACCGCAACAACGATGGAAAAAGAACTCCCAGAA	127065
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX322232.4	1751	GAGAAGAACATTTCTCAACCGCAACAACGATGGAAAAAGAACTCCCAGAA	1800

AL773562.15	127066	GATCCTTGATTCAACTACTCAGATTAGGCAGCAGCCCCAAGACCCTTCTA	127115
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX322232.4	1801	GATCCTTGATTCAACTACTCAGATTAGGCAGCAGCCCCAAGACCCTTCTA	1850

AL773562.15	127116	CTGAACTTCTTGAGGGGAGAGTGAGCCCAGATCCAGCCGGCCAAATTCTA	127165
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX322232.4	1851	CTGAACTTCTTGAGGGGAGAGTGAGCCCAGATCCAGCCGGCCAAATTCTA	1900

AL773562.15	127166	GAAAATCTTCAAGAAATTGAAAAGCTGGCCGTTGGACGTGAAGGAGATTC	127215
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX322232.4	1901	GAAAATCTTCAAGAAATTGAAAAGCTGGCCGTTGGACGTGAAGGAGATTC	1950

AL773562.15	127216	TGATAAATCTCATGGACCAGCCAGTGAGATGCCAGAGCCCCTTCAAGCTT	127265
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX322232.4	1951	TGATAAATCTCATGGACCAGCCAGTGAGATGCCAGAGCCCCTTCAAGCTT	2000

Overview

Query
AL773562.15 - 127265 bps
Hit
BX322232.4 - 4001 bps
Total alignments
1
Best alignment
alignment #1 (HSP: 2000 bps)
Best alignment cartoon

Alternate alignments

#%IDscoreHSPstartendstrandhstarthendhstrand
1100199320001252661272651120001
Short-link