<=>End overlap alignment

Alignment #1 HSP: 1990 bps / non-identical: 50 bps

Full alignment

BX323989.4	1	AAGCTTTAAAGTCATCAACTGACTGTTTCACAGGACTTCCAGGAGACATT	50
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX321900.10	71353	AAGCTTTAAAGTCATCAACTGACTGTTTCACAGGACTTCCAGGAGACATT	71402

BX323989.4	51	TGTGCTGTTTTGATTATTGACTTGAAACCAAAACTGTTGCTTAATGTGTT	100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX321900.10	71403	TGTGCTGTTTTGATTATTGACTTGAAACCAAAACTGTTGCTTAATGTGTT	71452

BX323989.4	101	TACTTGGAGAGCTCAATATTGTTTCAGTATTGACATTGAGATGTGCACAT	150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX321900.10	71453	TACTTGGAGAGCTCAATATTGTTTCAGTATTGACATTGAGATGTGCACAT	71502

BX323989.4	151	GTAAAAAATCAAGTACGAACAGGCTTGTGAGGATTTCCAAAAATGTATTC	200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX321900.10	71503	GTAAAAAATCAAGTACGAACAGGCTTGTGAGGATTTCCAAAAATGTATTC	71552

BX323989.4	201	CATCACGGTGATAAAATACTCCATAAAAAGTATTTACAATGTAATCCAAG	250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX321900.10	71553	CATCACGGTGATAAAATACTCCATAAAAAGTATTTACAATGTAATCCAAG	71602

BX323989.4	251	CACCATAAAATCAAAGTAATGTAATCTGATAACTTTTGGATTGTTTTATA	300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX321900.10	71603	CACCATAAAATCAAAGTAATGTAATCTGATAACTTTTGGATTGTTTTATA	71652

BX323989.4	301	ATGCATGTTATATATATTCATAATAAATGGGAGCTTTTTATGATGTTTGA	350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX321900.10	71653	ATGCATGTTATATATATTCATAATAAATGGGAGCTTTTTATGATGTTTGA	71702

BX323989.4	351	TGATTATTTTGTGCTTATATGTAACATATATATCACACACAGCCACATAC	400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX321900.10	71703	TGATTATTTTGTGCTTATATGTAACATATATATCACACACAGCCACATAC	71752

BX323989.4	401	AGATTTATATACATATTTGTGCCCATGTGTGTTTGATATATGTTATAAAT	450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX321900.10	71753	AGATTTATATACATATTTGTGCCCATGTGTGTTTGATATATGTTATAAAT	71802

BX323989.4	451	AAGCACAAATATATTATA----------TATATATATATATATAATTTAA	490
			||||||||||||||||||          ||||||||||||||||||||||
BX321900.10	71803	AAGCACAAATATATTATATATATATATATATATATATATATATAATTTAA	71852

BX323989.4	491	CTAATCCATGATGTAGCCTAACACAACATACAGTGGTCAGACCGGGTTGA	540
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX321900.10	71853	CTAATCCATGATGTAGCCTAACACAACATACAGTGGTCAGACCGGGTTGA	71902

BX323989.4	541	TCTATAAACCTGTAATGGGATTTAGAAACAATAAACAATGTAATTATGTG	590
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX321900.10	71903	TCTATAAACCTGTAATGGGATTTAGAAACAATAAACAATGTAATTATGTG	71952

BX323989.4	591	AACAGCATTGCACACTCTGTACAAACTGGCACACATATTCCATCTCATGA	640
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX321900.10	71953	AACAGCATTGCACACTCTGTACAAACTGGCACACATATTCCATCTCATGA	72002

BX323989.4	641	ATGACCTAAAACACACACAATCATTATTAAGAAGTTGAGATAAAAATTGC	690
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX321900.10	72003	ATGACCTAAAACACACACAATCATTATTAAGAAGTTGAGATAAAAATTGC	72052

BX323989.4	691	ATAACTGTAATGTATTGTATAAAATAATGTAATATGGAATAGACATACGC	740
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX321900.10	72053	ATAACTGTAATGTATTGTATAAAATAATGTAATATGGAATAGACATACGC	72102

BX323989.4	741	AACTGACAGGGAGAACTGTTTGACTGCGTATTCTGCAACAAATCCTAACA	790
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX321900.10	72103	AACTGACAGGGAGAACTGTTTGACTGCGTATTCTGCAACAAATCCTAACA	72152

BX323989.4	791	TCATTTTTAGAGTCATATATAAATGAAAATGTTTTTATCTGAATAATGAT	840
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX321900.10	72153	TCATTTTTAGAGTCATATATAAATGAAAATGTTTTTATCTGAATAATGAT	72202

BX323989.4	841	AATAATCACTGTTAAATTTAGAAGACAACATTAAAATATAATATTAGCAA	890
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX321900.10	72203	AATAATCACTGTTAAATTTAGAAGACAACATTAAAATATAATATTAGCAA	72252

BX323989.4	891	CACAGTACATACACTGCCTGACCAAATAAAAATGGAGGACACCGTACACT	940
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX321900.10	72253	CACAGTACATACACTGCCTGACCAAATAAAAATGGAGGACACCGTACACT	72302

BX323989.4	941	GCGCTTCCAGTCCATCCCCTCACCAATGAGAAAAGCAATACATAGGCCCC	990
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX321900.10	72303	GCGCTTCCAGTCCATCCCCTCACCAATGAGAAAAGCAATACATAGGCCCC	72352

BX323989.4	991	AAGTCAAGGCCCTACTGTAATGTCCAACAGCTTATCAGAATGTCTTGTGC	1040
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX321900.10	72353	AAGTCAAGGCCCTACTGTAATGTCCAACAGCTTATCAGAATGTCTTGTGC	72402

BX323989.4	1041	AACGTAATAATAATAATATTAATAATAATTATACACACACACACACACAC	1090
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX321900.10	72403	AACGTAATAATAATAATATTAATAATAATTATACACACACACACACACAC	72452

BX323989.4	1091	ACACACACACACACACACACACACACACACATGTAATGCTTATTCCTAAA	1140
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX321900.10	72453	ACACACACACACACACACACACACACACACATGTAATGCTTATTCCTAAA	72502

BX323989.4	1141	TATTTTCATTTACTATAAATTGCTATAGTATTTTAATTATGTAACACCTG	1190
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX321900.10	72503	TATTTTCATTTACTATAAATTGCTATAGTATTTTAATTATGTAACACCTG	72552

BX323989.4	1191	GATTTATTGGATTTATTTATTTATTTTTCTGTTATATATTATAATTTATT	1240
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX321900.10	72553	GATTTATTGGATTTATTTATTTATTTTTCTGTTATATATTATAATTTATT	72602

BX323989.4	1241	TCTATTTAGTACAGCAAATTATTACAGTAAATAATTGAACTCAACAATTA	1290
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX321900.10	72603	TCTATTTAGTACAGCAAATTATTACAGTAAATAATTGAACTCAACAATTA	72652

BX323989.4	1291	TGCCTTATATGTTTCATTGACAGTTTTATTGTATTAATATATGACTGACT	1340
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX321900.10	72653	TGCCTTATATGTTTCATTGACAGTTTTATTGTATTAATATATGACTGACT	72702

BX323989.4	1341	TGGATTTAAGTTGCTTCAAATTAAAAATTAAAATTGCAAAACTAGCTTAG	1390
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX321900.10	72703	TGGATTTAAGTTGCTTCAAATTAAAAATTAAAATTGCAAAACTAGCTTAG	72752

BX323989.4	1391	ATGTATTTTATTTATTGCAAATGCCACAAAAAAAAAACCCTGCACAACTA	1440
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX321900.10	72753	ATGTATTTTATTTATTGCAAATGCCACAAAAAAAAAACCCTGCACAACTA	72802

BX323989.4	1441	AAATTTTAATTTTGTAACAACAGTAAGCACTCTTTTTGTTATAAGGTCTG	1490
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX321900.10	72803	AAATTTTAATTTTGTAACAACAGTAAGCACTCTTTTTGTTATAAGGTCTG	72852

BX323989.4	1491	GTTTTGTGGTGGCTGTACTTTAAAATTAAATTAATATAATGTTAATTTAA	1540
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX321900.10	72853	GTTTTGTGGTGGCTGTACTTTAAAATTAAATTAATATAATGTTAATTTAA	72902

BX323989.4	1541	GTGATGAGAGATTTTAAAATTCTAACAGTAAACAGAGCTACTGTATGGTC	1590
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX321900.10	72903	GTGATGAGAGATTTTAAAATTCTAACAGTAAACAGAGCTACTGTATGGTC	72952

BX323989.4	1591	ACACCTGCTTGGTATAAATGCTTGAAAATGATTTAGTTGAAAATATCCAT	1640
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX321900.10	72953	ACACCTGCTTGGTATAAATGCTTGAAAATGATTTAGTTGAAAATATCCAT	73002

BX323989.4	1641	TAGAAATTTAGGAGTAATCCAAAAGTAATCAGATGTAATCAGTTACTTTA	1690
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX321900.10	73003	TAGAAATTTAGGAGTAATCCAAAAGTAATCAGATGTAATCAGTTACTTTA	73052

BX323989.4	1691	CTTTTATAAAGTAATCGAAAATGTGCACAACTTATTACATTTTATATGTG	1740
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX321900.10	73053	CTTTTATAAAGTAATCGAAAATGTGCACAACTTATTACATTTTATATGTG	73102

BX323989.4	1741	GTAATTTGTAATCTGTAATCTATTACATTTCCAAAGTAACCTCCCCAACA	1790
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX321900.10	73103	GTAATTTGTAATCTGTAATCTATTACATTTCCAAAGTAACCTCCCCAACA	73152

BX323989.4	1791	TTGCCTGTATTTTATGACAGTTGTTTAAGTTTCAGTCCGTCTGTAGGAAT	1840
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX321900.10	73153	TTGCCTGTATTTTATGACAGTTGTTTAAGTTTCAGTCCGTCTGTAGGAAT	73202

BX323989.4	1841	TTAATTAGAGAAATTTTATTAGTGAGCTGTATGATAATGTATGTATATCT	1890
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX321900.10	73203	TTAATTAGAGAAATTTTATTAGTGAGCTGTATGATAATGTATGTATATCT	73252

BX323989.4	1891	ATATAAATATATTATGGGTTGGAATTGCGAACATTTGATCAGGTTTAAAT	1940
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX321900.10	73253	ATATAAATATATTATGGGTTGGAATTGCGAACATTTGATCAGGTTTAAAT	73302

BX323989.4	1941	TTTCACTTCACAATGTCTTCACAGCGTGCCTAAACTGATTGTTTGTTACT	1990
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX321900.10	73303	TTTCACTTCACAATGTCTTCACAGCGTGCCTAAACTGATTGTTTGTTACT	73352

Compact alignment

skip 450 bps 100% identity alignment

BX323989.4	451	AAGCACAAATATATTATA----------TATATATATATATATAATTTAA	490
			||||||||||||||||||          ||||||||||||||||||||||
BX321900.10	71803	AAGCACAAATATATTATATATATATATATATATATATATATATAATTTAA	71852

skip 1500 bps 100% identity alignment

Overview

Query
BX323989.4 - 198365 bps
Hit
BX321900.10 - 73352 bps
Total alignments
1
Best alignment
alignment #1 (HSP: 1990 bps)
Best alignment cartoon

Alternate alignments

Short-link