<=>End overlap alignment

Alignment #1 HSP: 2000 bps / non-identical: 0 bps

Full alignment

BX682530.4	1	AAGCAAGGAATGGCATAGAGCCTGGCATGGGAACTAAGAAGAGAAAGCAA	50
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX296564.7	72847	AAGCAAGGAATGGCATAGAGCCTGGCATGGGAACTAAGAAGAGAAAGCAA	72896

BX682530.4	51	TAAGCTTCAGTTAGCAAGCTATGGATCTCCTTAGATGGCCTCTGGTACAT	100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX296564.7	72897	TAAGCTTCAGTTAGCAAGCTATGGATCTCCTTAGATGGCCTCTGGTACAT	72946

BX682530.4	101	CTTAAATAAACTGAAGCATCAGATTCACCCCCATTAGAAGCGTTTTTGAG	150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX296564.7	72947	CTTAAATAAACTGAAGCATCAGATTCACCCCCATTAGAAGCGTTTTTGAG	72996

BX682530.4	151	TCATTTTCTGTGCATAGTGTCAGTGTCTACGATAGAAGGGCCTGGGCTTA	200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX296564.7	72997	TCATTTTCTGTGCATAGTGTCAGTGTCTACGATAGAAGGGCCTGGGCTTA	73046

BX682530.4	201	TCAGAGACACTGTTCAGTTCTGGGGAGACAAGAGGAAAAAGATGTGGTTT	250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX296564.7	73047	TCAGAGACACTGTTCAGTTCTGGGGAGACAAGAGGAAAAAGATGTGGTTT	73096

BX682530.4	251	TCTTCCTTTCTCCTGTATTTATGTTTTTGTCTTCTACTTGAACGAGCCTG	300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX296564.7	73097	TCTTCCTTTCTCCTGTATTTATGTTTTTGTCTTCTACTTGAACGAGCCTG	73146

BX682530.4	301	AAAAATAGGGCAGGGTGTTTTGATCTTTTTTTCCTGCCTGACTTCAGCCA	350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX296564.7	73147	AAAAATAGGGCAGGGTGTTTTGATCTTTTTTTCCTGCCTGACTTCAGCCA	73196

BX682530.4	351	GCAGCCCTCCCTAAATAGCTACAGGCTCCTCTGTGATTTTTCACTCAAGC	400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX296564.7	73197	GCAGCCCTCCCTAAATAGCTACAGGCTCCTCTGTGATTTTTCACTCAAGC	73246

BX682530.4	401	TCATATTTTGCTTCTCTCTTTTCTTTCCTTCCCCTTTCTCTGAGGAGTGA	450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX296564.7	73247	TCATATTTTGCTTCTCTCTTTTCTTTCCTTCCCCTTTCTCTGAGGAGTGA	73296

BX682530.4	451	GAGAATTTGGGTGTATGTGTGGTTGTTTTTTGAAGGTGGCATAAAATTAT	500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX296564.7	73297	GAGAATTTGGGTGTATGTGTGGTTGTTTTTTGAAGGTGGCATAAAATTAT	73346

BX682530.4	501	TATTCTCCCTATTGCCTGACACAAATATCCCTTCAACTGCTATTTTGGTG	550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX296564.7	73347	TATTCTCCCTATTGCCTGACACAAATATCCCTTCAACTGCTATTTTGGTG	73396

BX682530.4	551	ACTTTGACATGGAAGTAAAACGTACGTCTCAATTCATTTTCTTCCTTCTA	600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX296564.7	73397	ACTTTGACATGGAAGTAAAACGTACGTCTCAATTCATTTTCTTCCTTCTA	73446

BX682530.4	601	CTTCCTCCTAACACATCAACATAATCCACACTGCCCTGGAGGAGTTATGA	650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX296564.7	73447	CTTCCTCCTAACACATCAACATAATCCACACTGCCCTGGAGGAGTTATGA	73496

BX682530.4	651	AAAATATTCTGAGTTTCTAGGTAGAATATTAAATCATACTTTTAGAGAAC	700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX296564.7	73497	AAAATATTCTGAGTTTCTAGGTAGAATATTAAATCATACTTTTAGAGAAC	73546

BX682530.4	701	ACATTGTTGAGCTACAGTTTAATTGAAGGAATTGTACTAGGCTAAGAATT	750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX296564.7	73547	ACATTGTTGAGCTACAGTTTAATTGAAGGAATTGTACTAGGCTAAGAATT	73596

BX682530.4	751	TTGCCAGCTCAAAATACTGGTTTAATTCTTTCTCAGTGGTGATTGACGTC	800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX296564.7	73597	TTGCCAGCTCAAAATACTGGTTTAATTCTTTCTCAGTGGTGATTGACGTC	73646

BX682530.4	801	TCAAACCAGCAAGAGGTGTAACATGAGGGGAAGGGGCTGGGGAAGAGGGA	850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX296564.7	73647	TCAAACCAGCAAGAGGTGTAACATGAGGGGAAGGGGCTGGGGAAGAGGGA	73696

BX682530.4	851	AAGGATGTAAGAAACAAAAGAAATAGTTAGAATTTGGGGTGTCCAAAGCA	900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX296564.7	73697	AAGGATGTAAGAAACAAAAGAAATAGTTAGAATTTGGGGTGTCCAAAGCA	73746

BX682530.4	901	AACTCATGATCCCACCTAGTGAGAATCCATTTGGAAACTGAGGAACCAAA	950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX296564.7	73747	AACTCATGATCCCACCTAGTGAGAATCCATTTGGAAACTGAGGAACCAAA	73796

BX682530.4	951	GGCTTTGGGCTCCAATCTGCAGCCACTTCTTTGATACGACTTTGGGATAG	1000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX296564.7	73797	GGCTTTGGGCTCCAATCTGCAGCCACTTCTTTGATACGACTTTGGGATAG	73846

BX682530.4	1001	GTGGACTCACCCGAAGTATTGTTTTACATGTACTATTTGCCTCAATTTCC	1050
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX296564.7	73847	GTGGACTCACCCGAAGTATTGTTTTACATGTACTATTTGCCTCAATTTCC	73896

BX682530.4	1051	CTGTGATGGTTTTGTCCATCACCTCATCCTGAAAAAATAAATGTTGGTGA	1100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX296564.7	73897	CTGTGATGGTTTTGTCCATCACCTCATCCTGAAAAAATAAATGTTGGTGA	73946

BX682530.4	1101	TGCTTTGTTCCACATATTCGTTCATTTGAACTCATTATTCCCAGGAAATA	1150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX296564.7	73947	TGCTTTGTTCCACATATTCGTTCATTTGAACTCATTATTCCCAGGAAATA	73996

BX682530.4	1151	TCCATTGAAATTCAAAATATCATGAACTTCCAAAGGGTTTTCTAGAAAAA	1200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX296564.7	73997	TCCATTGAAATTCAAAATATCATGAACTTCCAAAGGGTTTTCTAGAAAAA	74046

BX682530.4	1201	AAAAACAAAAAAAACCCCTTGATCTTAATGGGTGTTTTTTAATCTGTGCT	1250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX296564.7	74047	AAAAACAAAAAAAACCCCTTGATCTTAATGGGTGTTTTTTAATCTGTGCT	74096

BX682530.4	1251	AGAATCTGTTTGGAATGTTTTATTTAGGATTTTTGTGTCAGTATAATAAG	1300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX296564.7	74097	AGAATCTGTTTGGAATGTTTTATTTAGGATTTTTGTGTCAGTATAATAAG	74146

BX682530.4	1301	TAAATTCATCTACAATTTTTATATTTGTGCATTGTCATAGTTTAACATCA	1350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX296564.7	74147	TAAATTCATCTACAATTTTTATATTTGTGCATTGTCATAGTTTAACATCA	74196

BX682530.4	1351	ATATTATACTTGCTTCATAAAAAAATTTTCTTCTATGCCATTGAGCCATT	1400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX296564.7	74197	ATATTATACTTGCTTCATAAAAAAATTTTCTTCTATGCCATTGAGCCATT	74246

BX682530.4	1401	TAATTTTTGTTTGTTTGTTTGTTTGTTTTAGAGACAAGGCCTCACTCTGT	1450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX296564.7	74247	TAATTTTTGTTTGTTTGTTTGTTTGTTTTAGAGACAAGGCCTCACTCTGT	74296

BX682530.4	1451	TGCCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCACAATCATAGCTCACTGCAGCCTTGAA	1500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX296564.7	74297	TGCCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCACAATCATAGCTCACTGCAGCCTTGAA	74346

BX682530.4	1501	CTGGGCCCAAGCGATCCTCCCACCTCAGCCAAGTAGTTGAAACCACAGGC	1550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX296564.7	74347	CTGGGCCCAAGCGATCCTCCCACCTCAGCCAAGTAGTTGAAACCACAGGC	74396

BX682530.4	1551	ACGAGCCACCACATCTGGCTAATTTTTGTATTTTTTGTAGAGACGGGTTT	1600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX296564.7	74397	ACGAGCCACCACATCTGGCTAATTTTTGTATTTTTTGTAGAGACGGGTTT	74446

BX682530.4	1601	TCGCTGTTGCCCACACTGGTCTTGAGCTCCTGAGTTCAAGCAATCCGACT	1650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX296564.7	74447	TCGCTGTTGCCCACACTGGTCTTGAGCTCCTGAGTTCAAGCAATCCGACT	74496

BX682530.4	1651	GCTTAGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTATAGGTGTGAGCCACTGCACCCG	1700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX296564.7	74497	GCTTAGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTATAGGTGTGAGCCACTGCACCCG	74546

BX682530.4	1701	GCCTCTATTTTCAATTTTAAAAGTTTGATATAGATGTAGCATATCTATTT	1750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX296564.7	74547	GCCTCTATTTTCAATTTTAAAAGTTTGATATAGATGTAGCATATCTATTT	74596

BX682530.4	1751	TTTTATTGATAGTAATATCTTCTATCTTCTGTGTTCATACTTTTTTTTTT	1800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX296564.7	74597	TTTTATTGATAGTAATATCTTCTATCTTCTGTGTTCATACTTTTTTTTTT	74646

BX682530.4	1801	TTTTTTTTTGAGGCAGAGTCTCACTGTGCCGCCCAGGCTGGAGTGCAGTG	1850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX296564.7	74647	TTTTTTTTTGAGGCAGAGTCTCACTGTGCCGCCCAGGCTGGAGTGCAGTG	74696

BX682530.4	1851	GTGCGATCTTGGCTCGCTACAACCTTTGCCTCCCAGATTCAAGCAATTCT	1900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX296564.7	74697	GTGCGATCTTGGCTCGCTACAACCTTTGCCTCCCAGATTCAAGCAATTCT	74746

BX682530.4	1901	CCTGCCTCGGCCTCCCAAGTAGCTGGGATTACAGGCGCCCACCACCACAC	1950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX296564.7	74747	CCTGCCTCGGCCTCCCAAGTAGCTGGGATTACAGGCGCCCACCACCACAC	74796

BX682530.4	1951	CCAGCTAATTTTTGTATTTTTGGTAGAGACAGGGTTTCACCATGTTGGCC	2000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX296564.7	74797	CCAGCTAATTTTTGTATTTTTGGTAGAGACAGGGTTTCACCATGTTGGCC	74846

Overview

Query
BX682530.4 - 19936 bps
Hit
BX296564.7 - 74846 bps
Total alignments
1
Best alignment
alignment #1 (HSP: 2000 bps)
Best alignment cartoon

Alternate alignments

Short-link