<=>End overlap alignment

Alignment #1 HSP: 2000 bps / non-identical: 0 bps

Full alignment

AL589742.22	1	GAATTCCAGGGAATGTGATTCGTCAGACTGTACTGGCTGAGAAGAGCAGA	50
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX296547.4	2142	GAATTCCAGGGAATGTGATTCGTCAGACTGTACTGGCTGAGAAGAGCAGA	2191

AL589742.22	51	GTATACAACTAGCAAAATATCAAGATTTGCCTGCAGGTCTTATATAAATG	100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX296547.4	2192	GTATACAACTAGCAAAATATCAAGATTTGCCTGCAGGTCTTATATAAATG	2241

AL589742.22	101	CACGTATGAGACTGGGGCTTCTATATTAGTAGTATTATTGGCAATACATG	150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX296547.4	2242	CACGTATGAGACTGGGGCTTCTATATTAGTAGTATTATTGGCAATACATG	2291

AL589742.22	151	AGTATATTACCGATAAGTCCTATTTCAGAAAATAACTCATAGAATTATTC	200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX296547.4	2292	AGTATATTACCGATAAGTCCTATTTCAGAAAATAACTCATAGAATTATTC	2341

AL589742.22	201	AGATACAACTCATAGAATTGTTTCAAGAATTTGCATGGTCTTTATTAGAT	250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX296547.4	2342	AGATACAACTCATAGAATTGTTTCAAGAATTTGCATGGTCTTTATTAGAT	2391

AL589742.22	251	TTTTGTTGTACTGTCAGAACTATGTGCGGTCCTAGATTTGGGACCCTATT	300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX296547.4	2392	TTTTGTTGTACTGTCAGAACTATGTGCGGTCCTAGATTTGGGACCCTATT	2441

AL589742.22	301	CTAAGGCCGTTGAGGATACAGCTCCAATATCTTTCTAGTTGTTGCTGCCC	350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX296547.4	2442	CTAAGGCCGTTGAGGATACAGCTCCAATATCTTTCTAGTTGTTGCTGCCC	2491

AL589742.22	351	ACGCAGATTTGAGTTTCAGTTGCTTTTGAGTCTGGTGGCTAGAGAAAGGG	400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX296547.4	2492	ACGCAGATTTGAGTTTCAGTTGCTTTTGAGTCTGGTGGCTAGAGAAAGGG	2541

AL589742.22	401	TCCTGGTACCCTGTTTCCTCCTCTGGCTTTACCTTCTCAAGCCTGGTGAA	450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX296547.4	2542	TCCTGGTACCCTGTTTCCTCCTCTGGCTTTACCTTCTCAAGCCTGGTGAA	2591

AL589742.22	451	GAAGATAGGCAGGGTCTGAATGCCTGCCCAGTTAGGTAAAATGTAACAGA	500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX296547.4	2592	GAAGATAGGCAGGGTCTGAATGCCTGCCCAGTTAGGTAAAATGTAACAGA	2641

AL589742.22	501	AATGGAGCTTAGGAATCAGCTTTCCTTTGTAGGATCATCCCAGTAAGATG	550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX296547.4	2642	AATGGAGCTTAGGAATCAGCTTTCCTTTGTAGGATCATCCCAGTAAGATG	2691

AL589742.22	551	GCCCTGTGTCTTTCTAACTCAGGATATCAAAGGTAGAAAGAGGAGTGTAG	600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX296547.4	2692	GCCCTGTGTCTTTCTAACTCAGGATATCAAAGGTAGAAAGAGGAGTGTAG	2741

AL589742.22	601	GCCAAGTAATACCCCAGTGGCTGTTCATCTTGTCCTACACCTAGAGGGAG	650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX296547.4	2742	GCCAAGTAATACCCCAGTGGCTGTTCATCTTGTCCTACACCTAGAGGGAG	2791

AL589742.22	651	ATTTTTAAATTTTTACTTTATTTAATGTGTGTTTTCTACAAGTGTTTCTT	700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX296547.4	2792	ATTTTTAAATTTTTACTTTATTTAATGTGTGTTTTCTACAAGTGTTTCTT	2841

AL589742.22	701	TATGTGTGTGTGCACATGTGAGCCACAGCATGCATATGGAGGTCAGAGGA	750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX296547.4	2842	TATGTGTGTGTGCACATGTGAGCCACAGCATGCATATGGAGGTCAGAGGA	2891

AL589742.22	751	CAACTTCCAGAGTCTTTTACCTCTTTCCACTATTTGAAGATTTGACTTGG	800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX296547.4	2892	CAACTTCCAGAGTCTTTTACCTCTTTCCACTATTTGAAGATTTGACTTGG	2941

AL589742.22	801	AATCAGTGTGGAGATGTTGCACCTTGATACTAAGGTTGTAGTCTACCATG	850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX296547.4	2942	AATCAGTGTGGAGATGTTGCACCTTGATACTAAGGTTGTAGTCTACCATG	2991

AL589742.22	851	TTCAAACAGCTTTCCTGAGCTTGGTGAGAAATGGAGGGCTCCTTTTCTTG	900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX296547.4	2992	TTCAAACAGCTTTCCTGAGCTTGGTGAGAAATGGAGGGCTCCTTTTCTTG	3041

AL589742.22	901	GGGTGGTGATGGTGGAAGGGCTGGCTTCTCTTCTCTGTCTGATCTGGGGA	950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX296547.4	3042	GGGTGGTGATGGTGGAAGGGCTGGCTTCTCTTCTCTGTCTGATCTGGGGA	3091

AL589742.22	951	GCCCGACCAGCAATCTTCTACCCAAGGAATGCCACATATTCCTTGGGAAA	1000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX296547.4	3092	GCCCGACCAGCAATCTTCTACCCAAGGAATGCCACATATTCCTTGGGAAA	3141

AL589742.22	1001	ATTCCAGGTTCAACTTCTTCCCTCCAGATAAGAACCTGCTCAGCAAGCGC	1050
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX296547.4	3142	ATTCCAGGTTCAACTTCTTCCCTCCAGATAAGAACCTGCTCAGCAAGCGC	3191

AL589742.22	1051	CTGGTATTCCTGGAATGCTTCTCTGTGCAAAGGAGGCATCCACAGGGTTA	1100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX296547.4	3192	CTGGTATTCCTGGAATGCTTCTCTGTGCAAAGGAGGCATCCACAGGGTTA	3241

AL589742.22	1101	GCTTTCTGTCTAAGCTCCACCCCCACAGTTACCTGGCAACAGCTGCGTAG	1150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX296547.4	3242	GCTTTCTGTCTAAGCTCCACCCCCACAGTTACCTGGCAACAGCTGCGTAG	3291

AL589742.22	1151	GCACCACCCCACAGTTACTTGGCGATAGTCAGATAGGCCTGACTATAGAA	1200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX296547.4	3292	GCACCACCCCACAGTTACTTGGCGATAGTCAGATAGGCCTGACTATAGAA	3341

AL589742.22	1201	GGGGCTGCTTGCCCCCTCCTCTCTTTCCTGATCTTTTGTTCTCTTCCTCT	1250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX296547.4	3342	GGGGCTGCTTGCCCCCTCCTCTCTTTCCTGATCTTTTGTTCTCTTCCTCT	3391

AL589742.22	1251	CTTGGGCTCTTCCCTTTTTGCTCTCTGTCCCCTCATCCTTCCCCCATCCC	1300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX296547.4	3392	CTTGGGCTCTTCCCTTTTTGCTCTCTGTCCCCTCATCCTTCCCCCATCCC	3441

AL589742.22	1301	TTCCCAATTCCCTTCCCTCTTTTCTCTCCACTTGCTCATGGCGGGCCTCT	1350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX296547.4	3442	TTCCCAATTCCCTTCCCTCTTTTCTCTCCACTTGCTCATGGCGGGCCTCT	3491

AL589742.22	1351	ACTTCTCTCTCGCTCTGTCTCTGTCTCTCTCTCTGTCTCTCCTTTTCTCT	1400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX296547.4	3492	ACTTCTCTCTCGCTCTGTCTCTGTCTCTCTCTCTGTCTCTCCTTTTCTCT	3541

AL589742.22	1401	GCCTCTACTACCCTCTTAACTAACCTCCCCATGCCCTACATAAACTCTAT	1450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX296547.4	3542	GCCTCTACTACCCTCTTAACTAACCTCCCCATGCCCTACATAAACTCTAT	3591

AL589742.22	1451	ACTATACCGTCATCATGTGGCTGGTCCTTCAGGGGGAAGGGATGCTTGCC	1500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX296547.4	3592	ACTATACCGTCATCATGTGGCTGGTCCTTCAGGGGGAAGGGATGCTTGCC	3641

AL589742.22	1501	TTGGCATGGCCCTGCTGCGGTTACTCTCTTCCCCTATAACTCACTACACA	1550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX296547.4	3642	TTGGCATGGCCCTGCTGCGGTTACTCTCTTCCCCTATAACTCACTACACA	3691

AL589742.22	1551	CCCATAGAACTTATTCCCTCTCTCCTTACCTTTTTATAAACACATCACCC	1600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX296547.4	3692	CCCATAGAACTTATTCCCTCTCTCCTTACCTTTTTATAAACACATCACCC	3741

AL589742.22	1601	AGAACTTTAAGCCTCACTCTAAGAACCTCTCATCACTCTCCAAGGTTCAT	1650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX296547.4	3742	AGAACTTTAAGCCTCACTCTAAGAACCTCTCATCACTCTCCAAGGTTCAT	3791

AL589742.22	1651	GAATGTAGCCCTTGATTGACACCACATAAGGTGTATGTACACAAGCTGTT	1700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX296547.4	3792	GAATGTAGCCCTTGATTGACACCACATAAGGTGTATGTACACAAGCTGTT	3841

AL589742.22	1701	TCACTGAATCACTGAATATCATATAAGATCATATAAGAGAGCTGTTTCAT	1750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX296547.4	3842	TCACTGAATCACTGAATATCATATAAGATCATATAAGAGAGCTGTTTCAT	3891

AL589742.22	1751	TGAATATCATTTAATAGAGCCGTAACACTAAAATCCTCAAGAAGGCCTTC	1800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX296547.4	3892	TGAATATCATTTAATAGAGCCGTAACACTAAAATCCTCAAGAAGGCCTTC	3941

AL589742.22	1801	AACTCTGCTCCCCTGTACTCCCTGCTGGACTAGGATCCTGCAGACCCCAC	1850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX296547.4	3942	AACTCTGCTCCCCTGTACTCCCTGCTGGACTAGGATCCTGCAGACCCCAC	3991

AL589742.22	1851	CTTTTCTTTTATCTTTCCAGCTCAGTGTGCAATAACACCCTGAGGGAGGA	1900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX296547.4	3992	CTTTTCTTTTATCTTTCCAGCTCAGTGTGCAATAACACCCTGAGGGAGGA	4041

AL589742.22	1901	AGCTGAACTCAGAACCACAGGAAAAAATTCTCAAAAAAGCTAAAAATCTC	1950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX296547.4	4042	AGCTGAACTCAGAACCACAGGAAAAAATTCTCAAAAAAGCTAAAAATCTC	4091

AL589742.22	1951	CCAGGTACTAACCCATACTGCCAATCACACCACCAGACTATAGTAATGTT	2000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX296547.4	4092	CCAGGTACTAACCCATACTGCCAATCACACCACCAGACTATAGTAATGTT	4141

Overview

Query
AL589742.22 - 125565 bps
Hit
BX296547.4 - 4141 bps
Total alignments
1
Best alignment
alignment #1 (HSP: 2000 bps)
Best alignment cartoon

Alternate alignments

Short-link