<=>End overlap alignment

Alignment #1 HSP: 2000 bps / non-identical: 0 bps

Full alignment

BX248413.5	1	TGGCCAAGCTGATTCAGACAGCACAGCTTCCCGGTGTCTGCAGGGCTGGA	50
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX293545.10	22293	TGGCCAAGCTGATTCAGACAGCACAGCTTCCCGGTGTCTGCAGGGCTGGA	22342

BX248413.5	51	CCAAAGAGAAGAGTCTTCCGCGGGTGCTAGAAAAGCGAAGCACGCGTTAC	100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX293545.10	22343	CCAAAGAGAAGAGTCTTCCGCGGGTGCTAGAAAAGCGAAGCACGCGTTAC	22392

BX248413.5	101	CATGGAGACTGCGGAATGGAAAAGCGTTCGGTTTCTTGTTTCCTAGCCGC	150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX293545.10	22393	CATGGAGACTGCGGAATGGAAAAGCGTTCGGTTTCTTGTTTCCTAGCCGC	22442

BX248413.5	151	GAATGGGGTCGTGGTTCCTTCGACCTCGCCTGGGGAGAAAGGGGACGGAG	200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX293545.10	22443	GAATGGGGTCGTGGTTCCTTCGACCTCGCCTGGGGAGAAAGGGGACGGAG	22492

BX248413.5	201	GGCTTCGGGCTATACTTGGGCCACACAGCCGGGAAGCTGAGGCCGCGGGG	250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX293545.10	22493	GGCTTCGGGCTATACTTGGGCCACACAGCCGGGAAGCTGAGGCCGCGGGG	22542

BX248413.5	251	CAGGTCTGCGTGGCGGCGTCGAGTCCGAGCGGGGAAGCCCCTTTGCGGGA	300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX293545.10	22543	CAGGTCTGCGTGGCGGCGTCGAGTCCGAGCGGGGAAGCCCCTTTGCGGGA	22592

BX248413.5	301	ACTCTGGGGCGGGGCGGGGCGGGGAGGTGGGTAGGGAGGGTCCCGCCAGC	350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX293545.10	22593	ACTCTGGGGCGGGGCGGGGCGGGGAGGTGGGTAGGGAGGGTCCCGCCAGC	22642

BX248413.5	351	AGAGGCATCTTATTTTTAACCTCTTCTCGGCTGTTTTTCTCTCGTCCATT	400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX293545.10	22643	AGAGGCATCTTATTTTTAACCTCTTCTCGGCTGTTTTTCTCTCGTCCATT	22692

BX248413.5	401	TGCTCTCCTCCTTTAAGCCATCCTTTAATATTAAACATTAAAAAATATAT	450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX293545.10	22693	TGCTCTCCTCCTTTAAGCCATCCTTTAATATTAAACATTAAAAAATATAT	22742

BX248413.5	451	TTGGCAAACATTTGAATAGAGCGCGCTTATTCTGGGTCAGGTGTCGTTTT	500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX293545.10	22743	TTGGCAAACATTTGAATAGAGCGCGCTTATTCTGGGTCAGGTGTCGTTTT	22792

BX248413.5	501	AAATGCTTTATGTGTGCTAACTCATTTAATTCTCAAACAATCCAATGGGG	550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX293545.10	22793	AAATGCTTTATGTGTGCTAACTCATTTAATTCTCAAACAATCCAATGGGG	22842

BX248413.5	551	TAAGTATTATCATTATCCCAATTTTTAGATAGGCCTGGAGAAGATAATAA	600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX293545.10	22843	TAAGTATTATCATTATCCCAATTTTTAGATAGGCCTGGAGAAGATAATAA	22892

BX248413.5	601	ACTTACCAACAGTGTCACAGCTGGTAAGTTGAGGGTGGGAAACCCCGGCC	650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX293545.10	22893	ACTTACCAACAGTGTCACAGCTGGTAAGTTGAGGGTGGGAAACCCCGGCC	22942

BX248413.5	651	TAACACATATATTTTCTTTTTATGTTCTGTAAGGATTGGGATCCTTTTCA	700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX293545.10	22943	TAACACATATATTTTCTTTTTATGTTCTGTAAGGATTGGGATCCTTTTCA	22992

BX248413.5	701	TTTTATTAGACAGAAAAGGACAGTTAGCACTGTCATTGAACCCTCAACAT	750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX293545.10	22993	TTTTATTAGACAGAAAAGGACAGTTAGCACTGTCATTGAACCCTCAACAT	23042

BX248413.5	751	GGTATGATCTCTTGAGAAGATTAAGCAGCCATTTGGTGGCAGATTGATCA	800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX293545.10	23043	GGTATGATCTCTTGAGAAGATTAAGCAGCCATTTGGTGGCAGATTGATCA	23092

BX248413.5	801	CTTTGAACCCTTTCTATTAATACCTTGCAGTGGGCAGAGACTCATCCTTA	850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX293545.10	23093	CTTTGAACCCTTTCTATTAATACCTTGCAGTGGGCAGAGACTCATCCTTA	23142

BX248413.5	851	TAGGGATTTGTATGTATTCCAGGTATAATTTTGCTTCCCTGTCTCCAATG	900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX293545.10	23143	TAGGGATTTGTATGTATTCCAGGTATAATTTTGCTTCCCTGTCTCCAATG	23192

BX248413.5	901	CCCCTGCTAATACTACCCAAGGACTCACAATGTCTGATGTACTGACATGG	950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX293545.10	23193	CCCCTGCTAATACTACCCAAGGACTCACAATGTCTGATGTACTGACATGG	23242

BX248413.5	951	AACCTTGCCTTACATCTCAGACCAAGGGACTCACTTTACTGTGAAGGATG	1000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX293545.10	23243	AACCTTGCCTTACATCTCAGACCAAGGGACTCACTTTACTGTGAAGGATG	23292

BX248413.5	1001	TGTTACAAAGGGCACATGATCATGGGATCTACTGGTCCTACCTTATTCTA	1050
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX293545.10	23293	TGTTACAAAGGGCACATGATCATGGGATCTACTGGTCCTACCTTATTCTA	23342

BX248413.5	1051	TATTACACAGAAATGGCAGCCTGTTTTTCCCCAGCTTTGCCAACATAATA	1100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX293545.10	23343	TATTACACAGAAATGGCAGCCTGTTTTTCCCCAGCTTTGCCAACATAATA	23392

BX248413.5	1101	ATTAGCAAAACTTTTTAATTATATGATAATATATTTCAGGAAGAAAACAC	1150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX293545.10	23393	ATTAGCAAAACTTTTTAATTATATGATAATATATTTCAGGAAGAAAACAC	23442

BX248413.5	1151	TGACAACCGTGAAATTCAAACTAGATAGTAGAGAAACTGGAATTGGGGAG	1200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX293545.10	23443	TGACAACCGTGAAATTCAAACTAGATAGTAGAGAAACTGGAATTGGGGAG	23492

BX248413.5	1201	ACCAGTTAGAAAGCGGTTTGGAAACAAAGATACACATGAGTTTTAAAGCT	1250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX293545.10	23493	ACCAGTTAGAAAGCGGTTTGGAAACAAAGATACACATGAGTTTTAAAGCT	23542

BX248413.5	1251	GTGGGCTAATGTAGATGTTGATGTGATTATAAGTCTCTGTTAAAAGAGTT	1300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX293545.10	23543	GTGGGCTAATGTAGATGTTGATGTGATTATAAGTCTCTGTTAAAAGAGTT	23592

BX248413.5	1301	AGGGTGAGGTTTGAGGTGGTTTTAGATTATTATTTTTGCTAAAGAACCCA	1350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX293545.10	23593	AGGGTGAGGTTTGAGGTGGTTTTAGATTATTATTTTTGCTAAAGAACCCA	23642

BX248413.5	1351	GAAATGACTAAGTTTATCCCTGTCAATCACTTCTGACACTCTACTCATAT	1400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX293545.10	23643	GAAATGACTAAGTTTATCCCTGTCAATCACTTCTGACACTCTACTCATAT	23692

BX248413.5	1401	CATGTTCCTAAGGAAGTTGAACAAAAGGAGCGATAGCCAAATGGGACTAA	1450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX293545.10	23693	CATGTTCCTAAGGAAGTTGAACAAAAGGAGCGATAGCCAAATGGGACTAA	23742

BX248413.5	1451	CTATAATAGCTAATATTTATTGAGTACTTAATACTGTACTAAAGATATTG	1500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX293545.10	23743	CTATAATAGCTAATATTTATTGAGTACTTAATACTGTACTAAAGATATTG	23792

BX248413.5	1501	TGTGCTACATTTTACTTAATATTCTATGGGGCAATAAGCAGAACTATTCA	1550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX293545.10	23793	TGTGCTACATTTTACTTAATATTCTATGGGGCAATAAGCAGAACTATTCA	23842

BX248413.5	1551	GAAATGATCCTGGGATCTCACTCTAGATTGCCCAGGAAATGTGCTAGCTA	1600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX293545.10	23843	GAAATGATCCTGGGATCTCACTCTAGATTGCCCAGGAAATGTGCTAGCTA	23892

BX248413.5	1601	CAACTGGAGTTTCCCGTTCCTCTTGGAAAGAGGGGCTGCACCTACGTATA	1650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX293545.10	23893	CAACTGGAGTTTCCCGTTCCTCTTGGAAAGAGGGGCTGCACCTACGTATA	23942

BX248413.5	1651	GCTTTGCATGAGACCAGCTGCTTACACTTTCTAACACGAAGGGGCTGCAA	1700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX293545.10	23943	GCTTTGCATGAGACCAGCTGCTTACACTTTCTAACACGAAGGGGCTGCAA	23992

BX248413.5	1701	CTGTCCATAGGATGCATGGTCTCCAGGTGTTGGGCATCTGGTCCTCAGAT	1750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX293545.10	23993	CTGTCCATAGGATGCATGGTCTCCAGGTGTTGGGCATCTGGTCCTCAGAT	24042

BX248413.5	1751	GCTTCCTCAGCTCTGCTAGCATCTAAACCCAGACTGCCCGGCAATCAAGT	1800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX293545.10	24043	GCTTCCTCAGCTCTGCTAGCATCTAAACCCAGACTGCCCGGCAATCAAGT	24092

BX248413.5	1801	AGTCTGCTTGTTGTCTTACTGAAAAGTGGTGTTCAAGTTTATCCTTGACA	1850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX293545.10	24093	AGTCTGCTTGTTGTCTTACTGAAAAGTGGTGTTCAAGTTTATCCTTGACA	24142

BX248413.5	1851	AGATAGAATAATTGGGTCAGGACCAGAGCCCCAACCTATTGCATGTGAAA	1900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX293545.10	24143	AGATAGAATAATTGGGTCAGGACCAGAGCCCCAACCTATTGCATGTGAAA	24192

BX248413.5	1901	TGGCTTGTTCTTGCCCCTGGTTCACCTCTCCATGGGATTATGAGAGGATT	1950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX293545.10	24193	TGGCTTGTTCTTGCCCCTGGTTCACCTCTCCATGGGATTATGAGAGGATT	24242

BX248413.5	1951	GAGAACTCTATGCCTCTTGTGCCTGACTCTTGCTTTCTAAGTTTCCCCAG	2000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX293545.10	24243	GAGAACTCTATGCCTCTTGTGCCTGACTCTTGCTTTCTAAGTTTCCCCAG	24292

Overview

Query
BX248413.5 - 75842 bps
Hit
BX293545.10 - 24292 bps
Total alignments
1
Best alignment
alignment #1 (HSP: 2000 bps)
Best alignment cartoon

Alternate alignments

Short-link