<=>End overlap alignment

Alignment #1 HSP: 2000 bps / non-identical: 0 bps

Full alignment

BX005091.7	1	GGCCATCTTTCCACTCATCCCATGCAAGGTGGCCACAGGCTCTGAGGACA	50
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX284699.4	37109	GGCCATCTTTCCACTCATCCCATGCAAGGTGGCCACAGGCTCTGAGGACA	37158

BX005091.7	51	CAGACTCTATCACTTTATCATATGCTGTGAGGTAATATCAGTGACTACTC	100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX284699.4	37159	CAGACTCTATCACTTTATCATATGCTGTGAGGTAATATCAGTGACTACTC	37208

BX005091.7	101	ATTGCATATGTGCCTGCATTACAGGCTTGAAGTCCACCCTTTAGCACATC	150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX284699.4	37209	ATTGCATATGTGCCTGCATTACAGGCTTGAAGTCCACCCTTTAGCACATC	37258

BX005091.7	151	AATTCCAACAATCCTTCGACCCCCACCCTGGGAATACCAATCCAGTGATT	200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX284699.4	37259	AATTCCAACAATCCTTCGACCCCCACCCTGGGAATACCAATCCAGTGATT	37308

BX005091.7	201	CTGCCATCTACTCACTGTCCCTCATCGTTGGTGTCTTCTCTAACTTCATG	250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX284699.4	37309	CTGCCATCTACTCACTGTCCCTCATCGTTGGTGTCTTCTCTAACTTCATG	37358

BX005091.7	251	ACCCAAACCACATGGGGAGCCCCCACCAGGGCCAGCAATCACCCTCTCCC	300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX284699.4	37359	ACCCAAACCACATGGGGAGCCCCCACCAGGGCCAGCAATCACCCTCTCCC	37408

BX005091.7	301	TGCATGGCTCACCCTCAGCCTCCTCCTGGCCTAGGTGACCCTTACACACC	350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX284699.4	37409	TGCATGGCTCACCCTCAGCCTCCTCCTGGCCTAGGTGACCCTTACACACC	37458

BX005091.7	351	TTCTCTCTGTGCTCACACATCCAACCCTCCTTCCCCATTCTTATCTCAGC	400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX284699.4	37459	TTCTCTCTGTGCTCACACATCCAACCCTCCTTCCCCATTCTTATCTCAGC	37508

BX005091.7	401	TGACAACCTTGGTTCCTACCTCACTGAGAAAACTGAACACATTAGAAGAC	450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX284699.4	37509	TGACAACCTTGGTTCCTACCTCACTGAGAAAACTGAACACATTAGAAGAC	37558

BX005091.7	451	AGATTCCATCACCATCTGCTCATGCATTTGCAGCTGCAACACATGTCAGG	500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX284699.4	37559	AGATTCCATCACCATCTGCTCATGCATTTGCAGCTGCAACACATGTCAGG	37608

BX005091.7	501	TGTTTTACCATGTTGGGGACTGTTGTGGGTAAACCATTCTGCTCCCAGCC	550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX284699.4	37609	TGTTTTACCATGTTGGGGACTGTTGTGGGTAAACCATTCTGCTCCCAGCC	37658

BX005091.7	551	AGAGCCAATCCCTCTTCTGGTGCCCCAAACGTCATCCCTTATCATCTACT	600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX284699.4	37659	AGAGCCAATCCCTCTTCTGGTGCCCCAAACGTCATCCCTTATCATCTACT	37708

BX005091.7	601	TAAAGGTGTCAGTTCATCAATTAATACCTTTTTTTCTCTTTATCATCAAC	650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX284699.4	37709	TAAAGGTGTCAGTTCATCAATTAATACCTTTTTTTCTCTTTATCATCAAC	37758

BX005091.7	651	CTTTTTCCTCTCTCCCCACTGGATCATTGTGGCAGTCATGAGAATGCACA	700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX284699.4	37759	CTTTTTCCTCTCTCCCCACTGGATCATTGTGGCAGTCATGAGAATGCACA	37808

BX005091.7	701	TCCCAGCCCCTCAGCTAGAGTAAGCAGAATTGATAGTGGCCTCAACTTTT	750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX284699.4	37809	TCCCAGCCCCTCAGCTAGAGTAAGCAGAATTGATAGTGGCCTCAACTTTT	37858

BX005091.7	751	GAATCCTGAAACCTATTGCCACATTTGCTCTGAGACCACACCTGCCCCCT	800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX284699.4	37859	GAATCCTGAAACCTATTGCCACATTTGCTCTGAGACCACACCTGCCCCCT	37908

BX005091.7	801	GTCTTTTCCTGCCAATGACTGAGGAAAGCAGGGCAGAAACTAAGGCAGGA	850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX284699.4	37909	GTCTTTTCCTGCCAATGACTGAGGAAAGCAGGGCAGAAACTAAGGCAGGA	37958

BX005091.7	851	ACATTTCTTCTCTGAAGGCTGACTGAAGCTCTAGGGCTTCCTGCCACGCT	900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX284699.4	37959	ACATTTCTTCTCTGAAGGCTGACTGAAGCTCTAGGGCTTCCTGCCACGCT	38008

BX005091.7	901	TACTGAACTTCTGTTAGCCTGCACAGGGTCTAGGATGCTTCCAGCTGACC	950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX284699.4	38009	TACTGAACTTCTGTTAGCCTGCACAGGGTCTAGGATGCTTCCAGCTGACC	38058

BX005091.7	951	TTCCTGCACTGTTTACCTCACTGGGGTTCAGAGTTGCTTTGTGGTCTGAT	1000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX284699.4	38059	TTCCTGCACTGTTTACCTCACTGGGGTTCAGAGTTGCTTTGTGGTCTGAT	38108

BX005091.7	1001	GACACTCCCAGCATTTTCCGTCTGTGTCCTGAATTTCTCTCATAACTATT	1050
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX284699.4	38109	GACACTCCCAGCATTTTCCGTCTGTGTCCTGAATTTCTCTCATAACTATT	38158

BX005091.7	1051	TCCTCTAATAAATCCTTGCACATTGAATACTGTATTGGGGTCTGCTCCTC	1100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX284699.4	38159	TCCTCTAATAAATCCTTGCACATTGAATACTGTATTGGGGTCTGCTCCTC	38208

BX005091.7	1101	AGGGGACCCTAACTAACACAAGTAGTATGAAGGGTGATCCATGAAAACAG	1150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX284699.4	38209	AGGGGACCCTAACTAACACAAGTAGTATGAAGGGTGATCCATGAAAACAG	38258

BX005091.7	1151	GCAAAAATGAGAATTTGAAAAAAGCTTGCCCACTGCCTGGCAGGCCAAGA	1200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX284699.4	38259	GCAAAAATGAGAATTTGAAAAAAGCTTGCCCACTGCCTGGCAGGCCAAGA	38308

BX005091.7	1201	GGATGCCACCAGGGTTGTGGGAGACACAGAAATTCCATAGCACAAGATGC	1250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX284699.4	38309	GGATGCCACCAGGGTTGTGGGAGACACAGAAATTCCATAGCACAAGATGC	38358

BX005091.7	1251	AGCTGAGCTGCTATGGGTCTCACCCGTGCTGAGCTGAGAGGATGCCCTGG	1300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX284699.4	38359	AGCTGAGCTGCTATGGGTCTCACCCGTGCTGAGCTGAGAGGATGCCCTGG	38408

BX005091.7	1301	TTAGGGGAAGCTATGGCAGGTGGGGTGATAGAATGCCCTGCACAATAATG	1350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX284699.4	38409	TTAGGGGAAGCTATGGCAGGTGGGGTGATAGAATGCCCTGCACAATAATG	38458

BX005091.7	1351	ACGGGGTTAGGGGGAAACCTACAAAGACAGTGGAGTTGGCTGGTTGCTGC	1400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX284699.4	38459	ACGGGGTTAGGGGGAAACCTACAAAGACAGTGGAGTTGGCTGGTTGCTGC	38508

BX005091.7	1401	TCAGCTGCAATGATGCCCTATGAAAGTATCATGAGAATCTGCAGATTGTT	1450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX284699.4	38509	TCAGCTGCAATGATGCCCTATGAAAGTATCATGAGAATCTGCAGATTGTT	38558

BX005091.7	1451	AACAGCTGTCACTGGCTACATGTGACAGCCTCTGCAGTGTCTCATGCAGA	1500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX284699.4	38559	AACAGCTGTCACTGGCTACATGTGACAGCCTCTGCAGTGTCTCATGCAGA	38608

BX005091.7	1501	GGTCTTTATCTCTTGTAGCGAAAGGGCAGATACCGTGGAATGGTAGCTGA	1550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX284699.4	38609	GGTCTTTATCTCTTGTAGCGAAAGGGCAGATACCGTGGAATGGTAGCTGA	38658

BX005091.7	1551	AGACATCATTATGAGGGCCACAGTGCTCCAGAGAGGTTTGCCACTCAGCC	1600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX284699.4	38659	AGACATCATTATGAGGGCCACAGTGCTCCAGAGAGGTTTGCCACTCAGCC	38708

BX005091.7	1601	AAGGCAGGCCTGTTAGAGGAAAGTCAGGACCCTGGTGGGGAAACCTGAGA	1650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX284699.4	38709	AAGGCAGGCCTGTTAGAGGAAAGTCAGGACCCTGGTGGGGAAACCTGAGA	38758

BX005091.7	1651	TTCTGCAAACAGGAACAGGGTTATCCGATGGGTGCCCTCCAGGATCCTCT	1700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX284699.4	38759	TTCTGCAAACAGGAACAGGGTTATCCGATGGGTGCCCTCCAGGATCCTCT	38808

BX005091.7	1701	GGGCATGCATAGGAGGCTCACCCTTCTCTAGTAATGGTTCCCACTTCCTA	1750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX284699.4	38809	GGGCATGCATAGGAGGCTCACCCTTCTCTAGTAATGGTTCCCACTTCCTA	38858

BX005091.7	1751	TGCTGGAAGATGCTACAGAAGTCTCACCCCCATGATACAGCAGGAATCCC	1800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX284699.4	38859	TGCTGGAAGATGCTACAGAAGTCTCACCCCCATGATACAGCAGGAATCCC	38908

BX005091.7	1801	ACTGAAGAGCTTTGCAGGAACTAGCTGGCACGTCCCCATAGGAGGCTGAG	1850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX284699.4	38909	ACTGAAGAGCTTTGCAGGAACTAGCTGGCACGTCCCCATAGGAGGCTGAG	38958

BX005091.7	1851	GAGCACTTCTGGGATTGGAATTTGAGGGTGTTTGATCAAGGAACCAGAAT	1900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX284699.4	38959	GAGCACTTCTGGGATTGGAATTTGAGGGTGTTTGATCAAGGAACCAGAAT	39008

BX005091.7	1901	TTCAAGCTGGAAGAATAAAAATCCTTTGGCTTGGAGGCACTTTCTCAAGG	1950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX284699.4	39009	TTCAAGCTGGAAGAATAAAAATCCTTTGGCTTGGAGGCACTTTCTCAAGG	39058

BX005091.7	1951	CATGGGTTTATCAAACACCCCAGGACTTTGATAAGGGGGGGGGCCAAACC	2000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX284699.4	39059	CATGGGTTTATCAAACACCCCAGGACTTTGATAAGGGGGGGGGCCAAACC	39108

Overview

Query
BX005091.7 - 92665 bps
Hit
BX284699.4 - 39108 bps
Total alignments
1
Best alignment
alignment #1 (HSP: 2000 bps)
Best alignment cartoon

Alternate alignments

Short-link