<=>End overlap alignment

Alignment #1 HSP: 2000 bps / non-identical: 0 bps

Full alignment

BX284927.5	1	GGCCAACATGGTGAAACCCCATCTCTACTAAAAATACAAAAAATTAGCCA	50
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX284686.9	78064	GGCCAACATGGTGAAACCCCATCTCTACTAAAAATACAAAAAATTAGCCA	78113

BX284927.5	51	AGCATGGTGGTCCACGCCTGTGATCCCAGTTACTTGGGAGGCTGAAGTAC	100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX284686.9	78114	AGCATGGTGGTCCACGCCTGTGATCCCAGTTACTTGGGAGGCTGAAGTAC	78163

BX284927.5	101	AAGAATCGCTTGAATCTGGGAGGCAGAGGTTGCAGTGAGCTGAGATCAAG	150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX284686.9	78164	AAGAATCGCTTGAATCTGGGAGGCAGAGGTTGCAGTGAGCTGAGATCAAG	78213

BX284927.5	151	TCACTGTGATCCAGCCTGGGCAACACAGCAAGACTCTGTCTCAAAAAAGG	200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX284686.9	78214	TCACTGTGATCCAGCCTGGGCAACACAGCAAGACTCTGTCTCAAAAAAGG	78263

BX284927.5	201	AAAAAAAATGCAAAAAATAGCAGATGCTGGCAAGGATGCAGAGAAAGGGG	250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX284686.9	78264	AAAAAAAATGCAAAAAATAGCAGATGCTGGCAAGGATGCAGAGAAAGGGG	78313

BX284927.5	251	AACCCTCATACACTGTTGGTGGGAATGTAAACTAACACAGCCAGTATGGA	300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX284686.9	78314	AACCCTCATACACTGTTGGTGGGAATGTAAACTAACACAGCCAGTATGGA	78363

BX284927.5	301	GAAAAGTATGGAAGTTTCTCAAAAATTAAAAATAGATCTACCATGTGATC	350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX284686.9	78364	GAAAAGTATGGAAGTTTCTCAAAAATTAAAAATAGATCTACCATGTGATC	78413

BX284927.5	351	AATCTACTGTTCATTACATATCCAAAGGAAATCAGTATCTTGAAGAGATA	400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX284686.9	78414	AATCTACTGTTCATTACATATCCAAAGGAAATCAGTATCTTGAAGAGATA	78463

BX284927.5	401	TCTGCATCCCCATATTTATTGCAGCACTGTTCACAATAGCTAACATATGG	450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX284686.9	78464	TCTGCATCCCCATATTTATTGCAGCACTGTTCACAATAGCTAACATATGG	78513

BX284927.5	451	AATTAACTGAAGTGCCATCAACAAATGAATGGAAAAAAGAAACTGTGTCA	500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX284686.9	78514	AATTAACTGAAGTGCCATCAACAAATGAATGGAAAAAAGAAACTGTGTCA	78563

BX284927.5	501	TATAGACACAATGGAATATTATTCAGCCAGAAAAAGAATGAAATCCTATC	550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX284686.9	78564	TATAGACACAATGGAATATTATTCAGCCAGAAAAAGAATGAAATCCTATC	78613

BX284927.5	551	ATTTTCAGCAACATGGATGAAACTGAAGGACATTATGTTAAGTGAAATAA	600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX284686.9	78614	ATTTTCAGCAACATGGATGAAACTGAAGGACATTATGTTAAGTGAAATAA	78663

BX284927.5	601	GCCAGGCACGGAAAGACAAATATTGCATGTCTCTCACCTTCACCTTTGTG	650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX284686.9	78664	GCCAGGCACGGAAAGACAAATATTGCATGTCTCTCACCTTCACCTTTGTG	78713

BX284927.5	651	CCACTGCCTTAGTTAGTCCTGACCTTTCTTGCATTCCAGGTAGATACTTG	700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX284686.9	78714	CCACTGCCTTAGTTAGTCCTGACCTTTCTTGCATTCCAGGTAGATACTTG	78763

BX284927.5	701	CATCAGCCTCCTATTGCATGTGTAATATTGCTCCTCACTCATATGTGGGA	750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX284686.9	78764	CATCAGCCTCCTATTGCATGTGTAATATTGCTCCTCACTCATATGTGGGA	78813

BX284927.5	751	GCTAAAAAAGTTAGTCTCATGGAAGTAGGGTAGAATGATGGTTACCAGAG	800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX284686.9	78814	GCTAAAAAAGTTAGTCTCATGGAAGTAGGGTAGAATGATGGTTACCAGAG	78863

BX284927.5	801	GTTAGAAAGGGTGGCAGGGAGGGGGAGATGAAGAGAGGTTGGTTAATGGA	850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX284686.9	78864	GTTAGAAAGGGTGGCAGGGAGGGGGAGATGAAGAGAGGTTGGTTAATGGA	78913

BX284927.5	851	TACAAAATTATGGTCATATAGAAGGAATAAGTTCTAGTGTTAGATAGCAG	900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX284686.9	78914	TACAAAATTATGGTCATATAGAAGGAATAAGTTCTAGTGTTAGATAGCAG	78963

BX284927.5	901	AGAAGGATGGTGATAGTTAACAATTTGTATTTCAAAATAACTAGAAGAGA	950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX284686.9	78964	AGAAGGATGGTGATAGTTAACAATTTGTATTTCAAAATAACTAGAAGAGA	79013

BX284927.5	951	AGATTTGAAATGTTCTCAACACAAAGAAATGATGTTTGAGATGATAGATA	1000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX284686.9	79014	AGATTTGAAATGTTCTCAACACAAAGAAATGATGTTTGAGATGATAGATA	79063

BX284927.5	1001	TCCCAATTACCCTGATTTGATCATGATACATTGTATGCATGTATCAAAAT	1050
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX284686.9	79064	TCCCAATTACCCTGATTTGATCATGATACATTGTATGCATGTATCAAAAT	79113

BX284927.5	1051	ATCACATGTGTCCAGGTGCGGTGGCTCATACCTGTAATCTTATCACTTTG	1100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX284686.9	79114	ATCACATGTGTCCAGGTGCGGTGGCTCATACCTGTAATCTTATCACTTTG	79163

BX284927.5	1101	GCAGGCTGAGTGGGTGGATCACTTTAGGTCAGGAGTTCTGAGACCAGCCT	1150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX284686.9	79164	GCAGGCTGAGTGGGTGGATCACTTTAGGTCAGGAGTTCTGAGACCAGCCT	79213

BX284927.5	1151	GCCCAACATGGTGAAACCCCATCTCTACTAAAAATACAAAAATTAGCCAG	1200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX284686.9	79214	GCCCAACATGGTGAAACCCCATCTCTACTAAAAATACAAAAATTAGCCAG	79263

BX284927.5	1201	GCGTGGTGGCGCGTTCCTGTAATCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGACATG	1250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX284686.9	79264	GCGTGGTGGCGCGTTCCTGTAATCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGACATG	79313

BX284927.5	1251	AGAACTGCTTGAACCTGGGAGGCGGGGGTTTCAGTGAGCCAAGATCATGC	1300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX284686.9	79314	AGAACTGCTTGAACCTGGGAGGCGGGGGTTTCAGTGAGCCAAGATCATGC	79363

BX284927.5	1301	CACTGCACTTCAGCCTGGGGGATAGAGCGACTCTGTCTCCAAAAACGAGA	1350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX284686.9	79364	CACTGCACTTCAGCCTGGGGGATAGAGCGACTCTGTCTCCAAAAACGAGA	79413

BX284927.5	1351	GAAAAAAAAAAAAGAAACCAAAAAACTCACATGTACCCCATAGATACGTA	1400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX284686.9	79414	GAAAAAAAAAAAAGAAACCAAAAAACTCACATGTACCCCATAGATACGTA	79463

BX284927.5	1401	TGACTACCGTTTGTCAATAACAAAAGAAAATAAAATGGCAACCACACACA	1450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX284686.9	79464	TGACTACCGTTTGTCAATAACAAAAGAAAATAAAATGGCAACCACACACA	79513

BX284927.5	1451	CAAAAAAGTTGTGGTTCTGAGCATATGAATCAGGCTGCTTAGACTTGAAT	1500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX284686.9	79514	CAAAAAAGTTGTGGTTCTGAGCATATGAATCAGGCTGCTTAGACTTGAAT	79563

BX284927.5	1501	GCCAGCTTTGCCTCTCCTGGCTTAGTGACCTGGACCACAAAGAAGAGGCC	1550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX284686.9	79564	GCCAGCTTTGCCTCTCCTGGCTTAGTGACCTGGACCACAAAGAAGAGGCC	79613

BX284927.5	1551	CTAATCCAGCCTGGGGAGAAGTTAGGGACACCTTCCTGAAGAAGATGCCT	1600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX284686.9	79614	CTAATCCAGCCTGGGGAGAAGTTAGGGACACCTTCCTGAAGAAGATGCCT	79663

BX284927.5	1601	CCTGAACACCAGCCTGTGGAAGAGGGGTTGGGAAGGCCATTCCAGGTAGT	1650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX284686.9	79664	CCTGAACACCAGCCTGTGGAAGAGGGGTTGGGAAGGCCATTCCAGGTAGT	79713

BX284927.5	1651	GTCAATAGCAGGGATAAAGGCTGAGAGGCAAGAATCAGTATGGGGTACGT	1700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX284686.9	79714	GTCAATAGCAGGGATAAAGGCTGAGAGGCAAGAATCAGTATGGGGTACGT	79763

BX284927.5	1701	GGCAAAGTCAGCAGCAGTTTCATGTTGCTGGAGCAGAGAGTAGAAGGGTG	1750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX284686.9	79764	GGCAAAGTCAGCAGCAGTTTCATGTTGCTGGAGCAGAGAGTAGAAGGGTG	79813

BX284927.5	1751	GGATGGGGAGAGCTGAGGCCTGAGAGGCAGGCAGGGCTGGGTCATGCAGG	1800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX284686.9	79814	GGATGGGGAGAGCTGAGGCCTGAGAGGCAGGCAGGGCTGGGTCATGCAGG	79863

BX284927.5	1801	CCTTGGACTTTATTCAGAATGAGGCGGGCAGCCTCCGAAGGTTCAGCAGG	1850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX284686.9	79864	CCTTGGACTTTATTCAGAATGAGGCGGGCAGCCTCCGAAGGTTCAGCAGG	79913

BX284927.5	1851	GGAGAGACAGGTCAACTGGACATTTTCAGTAGAGTACCCTGGCCACGGGG	1900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX284686.9	79914	GGAGAGACAGGTCAACTGGACATTTTCAGTAGAGTACCCTGGCCACGGGG	79963

BX284927.5	1901	TAAAGGCTGAACCTATAGAAGGACAAGTGTGGAGGCAGAGACTGTAGTTA	1950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX284686.9	79964	TAAAGGCTGAACCTATAGAAGGACAAGTGTGGAGGCAGAGACTGTAGTTA	80013

BX284927.5	1951	GGAGGCTGATGCAAGTATCTATCTGGAACGCAACAAAGGTCAGGACTCAG	2000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX284686.9	80014	GGAGGCTGATGCAAGTATCTATCTGGAACGCAACAAAGGTCAGGACTCAG	80063

Overview

Query
BX284927.5 - 108760 bps
Hit
BX284686.9 - 80063 bps
Total alignments
1
Best alignment
alignment #1 (HSP: 2000 bps)
Best alignment cartoon

Alternate alignments

Short-link