<=>End overlap alignment

Alignment #1 HSP: 2000 bps / non-identical: 0 bps

Full alignment

BX005267.7	102036	ATACAGGCTAAATAAAATTAATACCTATGCCCATGACGTTACATTACAGC	102085
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX276125.6	1	ATACAGGCTAAATAAAATTAATACCTATGCCCATGACGTTACATTACAGC	50

BX005267.7	102086	ACAGGTGTCACACTCAGTTCCTGGAGCACCGCAGCTCTGCACAGTTTAGT	102135
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX276125.6	51	ACAGGTGTCACACTCAGTTCCTGGAGCACCGCAGCTCTGCACAGTTTAGT	100

BX005267.7	102136	TCCAACCCTAATTAAACACATCTGATCAAACTAACTGAGTCCTTCAAGTT	102185
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX276125.6	101	TCCAACCCTAATTAAACACATCTGATCAAACTAACTGAGTCCTTCAAGTT	150

BX005267.7	102186	TGTTTGAAACCTATAGGTAAGTGTGTTGAAGCAGGGTTGAAACTAAACTG	102235
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX276125.6	151	TGTTTGAAACCTATAGGTAAGTGTGTTGAAGCAGGGTTGAAACTAAACTG	200

BX005267.7	102236	TGCAATGGCTGCGGCTCTCCAGGCCCTGGTTTGACACCACTGCATTAAAG	102285
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX276125.6	201	TGCAATGGCTGCGGCTCTCCAGGCCCTGGTTTGACACCACTGCATTAAAG	250

BX005267.7	102286	TCTTATAAAGTTAAACTATCAGTATGTGAAGGCATCTACTTAAACACAGT	102335
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX276125.6	251	TCTTATAAAGTTAAACTATCAGTATGTGAAGGCATCTACTTAAACACAGT	300

BX005267.7	102336	GATCATTTTAATTTATATGATCTTATTAATGTATCATCAATGATCACAGG	102385
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX276125.6	301	GATCATTTTAATTTATATGATCTTATTAATGTATCATCAATGATCACAGG	350

BX005267.7	102386	TATATATTTTGTTTTTCCCGTTACTTTATGATTTTTTACTCTCAAAAAGC	102435
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX276125.6	351	TATATATTTTGTTTTTCCCGTTACTTTATGATTTTTTACTCTCAAAAAGC	400

BX005267.7	102436	CAGTAGCATTTTGACTTGCAATCATAAATCAACACTGACAACACTGTAAA	102485
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX276125.6	401	CAGTAGCATTTTGACTTGCAATCATAAATCAACACTGACAACACTGTAAA	450

BX005267.7	102486	AAATATAGGTTAAATAACAGATTAAAAATGCATTTTGTGATTCACACGTG	102535
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX276125.6	451	AAATATAGGTTAAATAACAGATTAAAAATGCATTTTGTGATTCACACGTG	500

BX005267.7	102536	TTTTTTGTTTATTACGTTTATTCCGTTTATTCATGGTTGTGAATTGTATT	102585
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX276125.6	501	TTTTTTGTTTATTACGTTTATTCCGTTTATTCATGGTTGTGAATTGTATT	550

BX005267.7	102586	ATGGGAGTTTTATCTCTGCTCTGTTGATTTTTTATTGTTGAAAATTCAAC	102635
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX276125.6	551	ATGGGAGTTTTATCTCTGCTCTGTTGATTTTTTATTGTTGAAAATTCAAC	600

BX005267.7	102636	TACAATTTATCAAAGTGACTTTTATTGACATTTTAGTCATTTGAAATAAT	102685
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX276125.6	601	TACAATTTATCAAAGTGACTTTTATTGACATTTTAGTCATTTGAAATAAT	650

BX005267.7	102686	ATACAGTATAAGAAGTAAAACAGAGAGAGAGAGAGACAGGTTTGTAAAAT	102735
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX276125.6	651	ATACAGTATAAGAAGTAAAACAGAGAGAGAGAGAGACAGGTTTGTAAAAT	700

BX005267.7	102736	AACAGAAAAAAGTACCGGCAAGTTTTTGTACTGGATTATACAACACCAAC	102785
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX276125.6	701	AACAGAAAAAAGTACCGGCAAGTTTTTGTACTGGATTATACAACACCAAC	750

BX005267.7	102786	ACAGACAATATACCAATATAAACTCTTAAAAATGTTAATCAGAGTCACTT	102835
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX276125.6	751	ACAGACAATATACCAATATAAACTCTTAAAAATGTTAATCAGAGTCACTT	800

BX005267.7	102836	TTTGGAACTTTTTCCACGGTTAAAAGTTGATGAAAGAAAGATCAATGTCT	102885
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX276125.6	801	TTTGGAACTTTTTCCACGGTTAAAAGTTGATGAAAGAAAGATCAATGTCT	850

BX005267.7	102886	CATATAATGCAAAATACTTCAAAACCAAAAAATAAATGGGGATAAATGTA	102935
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX276125.6	851	CATATAATGCAAAATACTTCAAAACCAAAAAATAAATGGGGATAAATGTA	900

BX005267.7	102936	AAAATACAAACATAAATCACACTACTAATTTACTAATGATTTTTCGGTTT	102985
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX276125.6	901	AAAATACAAACATAAATCACACTACTAATTTACTAATGATTTTTCGGTTT	950

BX005267.7	102986	CAGATAAATCTTCTTTAAATTGGTACTTTGGGAAAAAGCAAAAGTAACTT	103035
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX276125.6	951	CAGATAAATCTTCTTTAAATTGGTACTTTGGGAAAAAGCAAAAGTAACTT	1000

BX005267.7	103036	ACACCTTGGATAGACTGAGGGTGATCAAGTAAATTGATAGCTACGCTTTT	103085
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX276125.6	1001	ACACCTTGGATAGACTGAGGGTGATCAAGTAAATTGATAGCTACGCTTTT	1050

BX005267.7	103086	CATTTTTGGGTAAACTTGGGTAAAATCTCAATAATTTTAATAATTGAGTA	103135
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX276125.6	1051	CATTTTTGGGTAAACTTGGGTAAAATCTCAATAATTTTAATAATTGAGTA	1100

BX005267.7	103136	AACAAGTTATTTTTGTAGCATTATGCTTAATAAATTTCTAAAGTATACTC	103185
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX276125.6	1101	AACAAGTTATTTTTGTAGCATTATGCTTAATAAATTTCTAAAGTATACTC	1150

BX005267.7	103186	TACTTTTCCAAAGTTTGGGGTACGATATCATAAATGTATGTGAAAGAAAT	103235
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX276125.6	1151	TACTTTTCCAAAGTTTGGGGTACGATATCATAAATGTATGTGAAAGAAAT	1200

BX005267.7	103236	CTCTCAAAAATTGAAATATGTAAAATTGTGAAAATTTAAGATACCTGATT	103285
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX276125.6	1201	CTCTCAAAAATTGAAATATGTAAAATTGTGAAAATTTAAGATACCTGATT	1250

BX005267.7	103286	TCTGTTTGAATAAATTTAAATTGGCTGAAACCACCAATTGTCAGCAGTCT	103335
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX276125.6	1251	TCTGTTTGAATAAATTTAAATTGGCTGAAACCACCAATTGTCAGCAGTCT	1300

BX005267.7	103336	CGTTACTTACTTTTCTAATAAATTAAATTAAATTCAAGTTTTTTGTATAG	103385
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX276125.6	1301	CGTTACTTACTTTTCTAATAAATTAAATTAAATTCAAGTTTTTTGTATAG	1350

BX005267.7	103386	CACTTTTCACAACAATGATTGTTTCAAAGCAGGTTTTCAAAAGGTCCACA	103435
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX276125.6	1351	CACTTTTCACAACAATGATTGTTTCAAAGCAGGTTTTCAAAAGGTCCACA	1400

BX005267.7	103436	TTTATAACATTACAAATAAATTTGGAAAAGTTAAGGTTATTAGTTACCAT	103485
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX276125.6	1401	TTTATAACATTACAAATAAATTTGGAAAAGTTAAGGTTATTAGTTACCAT	1450

BX005267.7	103486	AACTTTATTAGTTACGAATAACTTTAACTAATTAACTAGTAACTAGTAGC	103535
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX276125.6	1451	AACTTTATTAGTTACGAATAACTTTAACTAATTAACTAGTAACTAGTAGC	1500

BX005267.7	103536	TTTTAACAGTTATTAAATATAAACATAGTTAACCTGCAGTTATATAGTCT	103585
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX276125.6	1501	TTTTAACAGTTATTAAATATAAACATAGTTAACCTGCAGTTATATAGTCT	1550

BX005267.7	103586	ATAGGTCAGGGGTGTCAAACTCAGTTCCTGGAAGGCTGCAGCCCTGCACA	103635
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX276125.6	1551	ATAGGTCAGGGGTGTCAAACTCAGTTCCTGGAAGGCTGCAGCCCTGCACA	1600

BX005267.7	103636	GTTTAGTTCCAACCCTGCTCCAACACACTGAAGCTGCGATCACACTGCAC	103685
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX276125.6	1601	GTTTAGTTCCAACCCTGCTCCAACACACTGAAGCTGCGATCACACTGCAC	1650

BX005267.7	103686	TTTTTTTCCAATAGACTTCCATTCATACGCACGCGAATGCATCAGACAGG	103735
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX276125.6	1651	TTTTTTTCCAATAGACTTCCATTCATACGCACGCGAATGCATCAGACAGG	1700

BX005267.7	103736	AAACGCAGGGTCGTAGTTCGATGCATTGGAAAGTTCAAGTTTAGTGAACT	103785
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX276125.6	1701	AAACGCAGGGTCGTAGTTCGATGCATTGGAAAGTTCAAGTTTAGTGAACT	1750

BX005267.7	103786	CTGACTTGCGAAATAGCATCACATGATTGATTGAGACCAATCGAGGATCA	103835
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX276125.6	1751	CTGACTTGCGAAATAGCATCACATGATTGATTGAGACCAATCGAGGATCA	1800

BX005267.7	103836	AAACATGACCTCTCCGGACAGAAATTTAAAATATGGACCAATCGCTCGCT	103885
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX276125.6	1801	AAACATGACCTCTCCGGACAGAAATTTAAAATATGGACCAATCGCTCGCT	1850

BX005267.7	103886	TTTTAAAAAGTCTAATCACCTTGTTTAATCCCACCCCTTTTTGCAGCGCC	103935
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX276125.6	1851	TTTTAAAAAGTCTAATCACCTTGTTTAATCCCACCCCTTTTTGCAGCGCC	1900

BX005267.7	103936	ATATACAACAGAATTTCGCATGGGACCGCAGCATAACCTCTAGGTTTCAA	103985
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX276125.6	1901	ATATACAACAGAATTTCGCATGGGACCGCAGCATAACCTCTAGGTTTCAA	1950

BX005267.7	103986	ACAAGCCTGAATGACTTAATTAGTTTGATCAGGTGTGTTTAATTAAGCTT	104035
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX276125.6	1951	ACAAGCCTGAATGACTTAATTAGTTTGATCAGGTGTGTTTAATTAAGCTT	2000

Overview

Query
BX005267.7 - 104035 bps
Hit
BX276125.6 - 54430 bps
Total alignments
16
Best alignment
alignment #1 (HSP: 2000 bps)
Best alignment cartoon

Alternate alignments

#%IDscoreHSPstartendstrandhstarthendhstrand
1100190920001020361040351120001
288.5153883892339010-1363537211
384.6419539722454228501422946381
482.45263606218292243419580101891
587.82681162151121626-113621137351
692.17861153889639010-113621137351
781.251253441078211125113629139801
881.341142963846338758-113658139571
996.4342562135121406-113853139081
1092.8633422128621327-113940139811
1192.8633422128621327149090491311
1284.61372791077411052-149137494281
1388.371422302139721626149197494281
1493.8349819425394333149490495701
1579.01592259410694330149631498541
1686.09721529417994330149648497981
Short-link