<=>End overlap alignment

Alignment #1 HSP: 2000 bps / non-identical: 0 bps

Full alignment

BX510353.10	1	TCACTATCATGTGTTCAGTCACAAGGTGGAGAGAAGATGGTCTTTTCGGA	50
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX255970.8	156756	TCACTATCATGTGTTCAGTCACAAGGTGGAGAGAAGATGGTCTTTTCGGA	156805

BX510353.10	51	CTGTTTGAATGCATCTGACTACCTCTGAAAGTGGTCAAAAGGGGACAAAC	100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX255970.8	156806	CTGTTTGAATGCATCTGACTACCTCTGAAAGTGGTCAAAAGGGGACAAAC	156855

BX510353.10	101	GTGAAAACATTTTAGATTTCTTACATGTTATTTAATGTCGTTCAGATGAG	150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX255970.8	156856	GTGAAAACATTTTAGATTTCTTACATGTTATTTAATGTCGTTCAGATGAG	156905

BX510353.10	151	ATGGGATTGAGGAAAATGCATCATGTTAATAAACAGGGCCTTTGAACTTT	200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX255970.8	156906	ATGGGATTGAGGAAAATGCATCATGTTAATAAACAGGGCCTTTGAACTTT	156955

BX510353.10	201	AACAAACTATCTGTGATGTCCTAATGTAGAAAAATTAAATACCTCAGTTG	250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX255970.8	156956	AACAAACTATCTGTGATGTCCTAATGTAGAAAAATTAAATACCTCAGTTG	157005

BX510353.10	251	ATTTACTTTAACAAGTTTTACACAGTGTTTGTAGTAAATTGATTTAAAAA	300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX255970.8	157006	ATTTACTTTAACAAGTTTTACACAGTGTTTGTAGTAAATTGATTTAAAAA	157055

BX510353.10	301	AATAAATCTTAACCTAATTTAAAAAATCGTTAAATAAGTCAAAATTCAAA	350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX255970.8	157056	AATAAATCTTAACCTAATTTAAAAAATCGTTAAATAAGTCAAAATTCAAA	157105

BX510353.10	351	AGATTTTAATAAAAAGTGTAACAAAAGAAAATGTAACTACTACAATGATA	400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX255970.8	157106	AGATTTTAATAAAAAGTGTAACAAAAGAAAATGTAACTACTACAATGATA	157155

BX510353.10	401	TTAAGTCAGAAAAAATAATTACAAATATTTAAGTTGCATGCCTTTCTGAT	450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX255970.8	157156	TTAAGTCAGAAAAAATAATTACAAATATTTAAGTTGCATGCCTTTCTGAT	157205

BX510353.10	451	GTAGTTACATTTAAAATAATTCAAATATGTAACATTTCATTTGGCTACTA	500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX255970.8	157206	GTAGTTACATTTAAAATAATTCAAATATGTAACATTTCATTTGGCTACTA	157255

BX510353.10	501	AATATTTATTAAAGTTTGGGCAAATATATCCTGAAATTACCATTAATTAC	550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX255970.8	157256	AATATTTATTAAAGTTTGGGCAAATATATCCTGAAATTACCATTAATTAC	157305

BX510353.10	551	TGTGCACAAAATGTAATAATGGCACACTACACTCTAAATATGTTATGTTG	600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX255970.8	157306	TGTGCACAAAATGTAATAATGGCACACTACACTCTAAATATGTTATGTTG	157355

BX510353.10	601	TCATAACCCATGATTTAGATTAAACATGGACATGTCATTTAAACTTAATT	650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX255970.8	157356	TCATAACCCATGATTTAGATTAAACATGGACATGTCATTTAAACTTAATT	157405

BX510353.10	651	GCAAAATATTGTTGGGTTTGTCCATGTTGGGTTACGACAATCTAGCATTT	700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX255970.8	157406	GCAAAATATTGTTGGGTTTGTCCATGTTGGGTTACGACAATCTAGCATTT	157455

BX510353.10	701	GTAGCAACCTAGAGTATAACAATCAATACACACATATTGAGCAGCAGACA	750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX255970.8	157456	GTAGCAACCTAGAGTATAACAATCAATACACACATATTGAGCAGCAGACA	157505

BX510353.10	751	CAAGATCAAAAAAATTGAACACAACAGCACAGTAATAAAAATGTGTAAAT	800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX255970.8	157506	CAAGATCAAAAAAATTGAACACAACAGCACAGTAATAAAAATGTGTAAAT	157555

BX510353.10	801	TAAACTTTTAAAACTGATCCGTCAAACAAACTCATTACTTATTAGTTCCT	850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX255970.8	157556	TAAACTTTTAAAACTGATCCGTCAAACAAACTCATTACTTATTAGTTCCT	157605

BX510353.10	851	GAGTGCATTTCTACTCTACTAATAATCAATCCACTTTATATTAGGTGACT	900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX255970.8	157606	GAGTGCATTTCTACTCTACTAATAATCAATCCACTTTATATTAGGTGACT	157655

BX510353.10	901	TTAATTGCTATGTACTTGCATCAAAAAATAAATACAATGTACTTACTGTG	950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX255970.8	157656	TTAATTGCTATGTACTTGCATCAAAAAATAAATACAATGTACTTACTGTG	157705

BX510353.10	951	ATTCCAATGTATTGCAGAAGACATCTGGGGGACTTGAGGTGGGATATGGG	1000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX255970.8	157706	ATTCCAATGTATTGCAGAAGACATCTGGGGGACTTGAGGTGGGATATGGG	157755

BX510353.10	1001	AAGGGTACAGGTTTGAGGGTATGTGTAGGTATAAGGTTAAGGTCAAAAGT	1050
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX255970.8	157756	AAGGGTACAGGTTTGAGGGTATGTGTAGGTATAAGGTTAAGGTCAAAAGT	157805

BX510353.10	1051	AGGATCAACAGTGTATTTACATGCAGGTATTTAATCAATCATAATACACA	1100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX255970.8	157806	AGGATCAACAGTGTATTTACATGCAGGTATTTAATCAATCATAATACACA	157855

BX510353.10	1101	GTAAGTATTAAATATTTTAAGTACATATTAGTTGAGGCCACCTAATGTGA	1150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX255970.8	157856	GTAAGTATTAAATATTTTAAGTACATATTAGTTGAGGCCACCTAATGTGA	157905

BX510353.10	1151	AGTGAGTCCTTAACTTTATTTGACAAATCAGTGCCCGAAAGGAAGAGTTT	1200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX255970.8	157906	AGTGAGTCCTTAACTTTATTTGACAAATCAGTGCCCGAAAGGAAGAGTTT	157955

BX510353.10	1201	ATCTGATGTTCCTAGTCCTATATGGCATTTGTGGATTTTACAATGGTCCG	1250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX255970.8	157956	ATCTGATGTTCCTAGTCCTATATGGCATTTGTGGATTTTACAATGGTCCG	158005

BX510353.10	1251	CCAATGGCTGTGTGTGTATATATAAATGTTCATCAACAAAATCCAACCCC	1300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX255970.8	158006	CCAATGGCTGTGTGTGTATATATAAATGTTCATCAACAAAATCCAACCCC	158055

BX510353.10	1301	GTAAGTGAGACATAGGTGATTTTTTAAATGCATCTGCTCCTGTTTAAAAC	1350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX255970.8	158056	GTAAGTGAGACATAGGTGATTTTTTAAATGCATCTGCTCCTGTTTAAAAC	158105

BX510353.10	1351	AGACATGGATGCATTATGAGGATTAATAAATGAAGACGATTGGCAAAAGA	1400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX255970.8	158106	AGACATGGATGCATTATGAGGATTAATAAATGAAGACGATTGGCAAAAGA	158155

BX510353.10	1401	TGCACAGAAAATCCATGTGGCTTTACTGACACCTCATCCAAATAACTACA	1450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX255970.8	158156	TGCACAGAAAATCCATGTGGCTTTACTGACACCTCATCCAAATAACTACA	158205

BX510353.10	1451	AAAGCTGTCCATGATTATTTCCTGTCGGATTTGCATGTGTTAAAACAGCT	1500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX255970.8	158206	AAAGCTGTCCATGATTATTTCCTGTCGGATTTGCATGTGTTAAAACAGCT	158255

BX510353.10	1501	TTGAACCCAGTGACCGTGAAGCTGATGCATGGCAGACAGAACAGAGCCGC	1550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX255970.8	158256	TTGAACCCAGTGACCGTGAAGCTGATGCATGGCAGACAGAACAGAGCCGC	158305

BX510353.10	1551	TGCAGCGCAGACACTGCGTTTTGTTTACTGCACACTGTCTGTTATTTATT	1600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX255970.8	158306	TGCAGCGCAGACACTGCGTTTTGTTTACTGCACACTGTCTGTTATTTATT	158355

BX510353.10	1601	TGGGTGTCATGAGGTCTCTCATCATCTCAACATGCCTAAATGCAATTGTG	1650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX255970.8	158356	TGGGTGTCATGAGGTCTCTCATCATCTCAACATGCCTAAATGCAATTGTG	158405

BX510353.10	1651	CGTCAAGCTGTCGAAGAAAATCCTGGCTCACTTTGCTTCTGCGCTGTTTA	1700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX255970.8	158406	CGTCAAGCTGTCGAAGAAAATCCTGGCTCACTTTGCTTCTGCGCTGTTTA	158455

BX510353.10	1701	GAAAAATACAAGAGAGCCATAAACTCCAGATTTGCACATGCAAATCACAT	1750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX255970.8	158456	GAAAAATACAAGAGAGCCATAAACTCCAGATTTGCACATGCAAATCACAT	158505

BX510353.10	1751	TCATGCAAACCCCCCCCCAAAATCTAACAATGACTTTTACAGCCACGTTC	1800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX255970.8	158506	TCATGCAAACCCCCCCCCAAAATCTAACAATGACTTTTACAGCCACGTTC	158555

BX510353.10	1801	CACGCAGGCACCTCTCCAAACAGCCCAGAGCTTTAGAATTGTGTTTATTC	1850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX255970.8	158556	CACGCAGGCACCTCTCCAAACAGCCCAGAGCTTTAGAATTGTGTTTATTC	158605

BX510353.10	1851	CCATTGATTAGACCAATAAATCTGGGAATCCATGAGTCTGTTCATAGACG	1900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX255970.8	158606	CCATTGATTAGACCAATAAATCTGGGAATCCATGAGTCTGTTCATAGACG	158655

BX510353.10	1901	GGATCGTGCCAACACGAAAGGAGAAGCGGAAACCTCCCATTTGTGCCTTG	1950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX255970.8	158656	GGATCGTGCCAACACGAAAGGAGAAGCGGAAACCTCCCATTTGTGCCTTG	158705

BX510353.10	1951	CGTCCGTGTGGTCCCCGCGTTCCTGTGTTTGCTCCCCGCAGCAGGAATTC	2000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX255970.8	158706	CGTCCGTGTGGTCCCCGCGTTCCTGTGTTTGCTCCCCGCAGCAGGAATTC	158755

Overview

Query
BX510353.10 - 77999 bps
Hit
BX255970.8 - 158755 bps
Total alignments
22
Best alignment
alignment #1 (HSP: 2000 bps)
Best alignment cartoon

Alternate alignments

#%IDscoreHSPstartendstrandhstarthendhstrand
1100193920001200011567561587551
284.2165169353343550212263961
383.817617833833560-1432744991
485.14417421346214191555056231
589.051082142930829521112886130951
696.83821262873428859112966130911
781.41853542850628859113455138091
883.34933572871829074113455138141
990.831883652916729531113456138151
10100771042875028853114362144651
1110073992934529443114365144631
1286.13861734020640378124353245251
1387.7852907393074019-124417245061
1486.986145458154595911223961225401
1593.4447614335843418-11301331301931
1686.43113201519655216511401751403731
1783.341113522850628857-11461841465371
1890.83571182896029077-11462301463491
1991.262404872909929585-11463501468411
2095.357386296242970911499891500741
2196.1540786668766764-11507531508301
2296.16437730503126-11507621508391
Short-link