<=>End overlap alignment

Alignment #1 HSP: 2000 bps / non-identical: 0 bps

Full alignment

BX120007.9	1	GGCCGGCAGGAAAATATTCTGAGATGTGGATTCAAAGTTTCTAAGTGTGC	50
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX255945.6	94061	GGCCGGCAGGAAAATATTCTGAGATGTGGATTCAAAGTTTCTAAGTGTGC	94110

BX120007.9	51	ACACGTACACACACACACACCCCTACCTGCATGCATTTTCTAATTTACAA	100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX255945.6	94111	ACACGTACACACACACACACCCCTACCTGCATGCATTTTCTAATTTACAA	94160

BX120007.9	101	AGACTACTCAAGTAAAGAGGGGTAATTTCACACCTCAGGAGGTCTGTATA	150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX255945.6	94161	AGACTACTCAAGTAAAGAGGGGTAATTTCACACCTCAGGAGGTCTGTATA	94210

BX120007.9	151	AAGATAACTCTGGTCTTTAAAGCATCAGGTTTCAGGTAGAGGTGAAGAGA	200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX255945.6	94211	AAGATAACTCTGGTCTTTAAAGCATCAGGTTTCAGGTAGAGGTGAAGAGA	94260

BX120007.9	201	GAATGAATCAAACTCAAACTGCCATCCTCCCAGGTTAAAGATGAGTCCAG	250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX255945.6	94261	GAATGAATCAAACTCAAACTGCCATCCTCCCAGGTTAAAGATGAGTCCAG	94310

BX120007.9	251	TCATCGTGGAGCCCTCTATTAACACAGGACATGCTAGGAAGGCCCATTAA	300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX255945.6	94311	TCATCGTGGAGCCCTCTATTAACACAGGACATGCTAGGAAGGCCCATTAA	94360

BX120007.9	301	CCCACTGCCCTAGCACATTTGTTAACGTCCTAGTGCATTTGTTGATATCA	350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX255945.6	94361	CCCACTGCCCTAGCACATTTGTTAACGTCCTAGTGCATTTGTTGATATCA	94410

BX120007.9	351	ACAGTTCACAGTTTTTATTCTGATAGGGATCTATTCCAGCAGACCAGCTT	400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX255945.6	94411	ACAGTTCACAGTTTTTATTCTGATAGGGATCTATTCCAGCAGACCAGCTT	94460

BX120007.9	401	CTGTGACCTCTCAGGATGCGAAAAAGTAACACAAGAAAAGCTTCTTATGT	450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX255945.6	94461	CTGTGACCTCTCAGGATGCGAAAAAGTAACACAAGAAAAGCTTCTTATGT	94510

BX120007.9	451	AGTGAATTGAGAAGGAAATACCTAGATCAATATTCCCTCAGCACCTCTGG	500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX255945.6	94511	AGTGAATTGAGAAGGAAATACCTAGATCAATATTCCCTCAGCACCTCTGG	94560

BX120007.9	501	TAGGAAGTCCTTAGTAGGAGAAAAACACCATGAAGACCCTTAGTGCAGAA	550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX255945.6	94561	TAGGAAGTCCTTAGTAGGAGAAAAACACCATGAAGACCCTTAGTGCAGAA	94610

BX120007.9	551	GGAAAAGGGGGTAGGGGGTGGTGGAAGGGAAGCTAAAAGAAGGGGCTGGA	600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX255945.6	94611	GGAAAAGGGGGTAGGGGGTGGTGGAAGGGAAGCTAAAAGAAGGGGCTGGA	94660

BX120007.9	601	GGTTCTCAGAATTCAAACCACACAAACAAATGAAGTATTGAGGTCCCAGA	650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX255945.6	94661	GGTTCTCAGAATTCAAACCACACAAACAAATGAAGTATTGAGGTCCCAGA	94710

BX120007.9	651	CTTGATCTGGGCCCAGTGTGAAAGCCCTAACTTATTTCTCCAGAAGAATA	700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX255945.6	94711	CTTGATCTGGGCCCAGTGTGAAAGCCCTAACTTATTTCTCCAGAAGAATA	94760

BX120007.9	701	TGTCCTCTGGTTTTAGACTTGGCACTGTGGGGAGAACCAGAGTGATCTAT	750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX255945.6	94761	TGTCCTCTGGTTTTAGACTTGGCACTGTGGGGAGAACCAGAGTGATCTAT	94810

BX120007.9	751	GGTGGATATACACACAAACATAGACACACATATTTGCATTTAGTAATTTT	800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX255945.6	94811	GGTGGATATACACACAAACATAGACACACATATTTGCATTTAGTAATTTT	94860

BX120007.9	801	TGTAAAATTTCCATTTGCTTCTCTGATCCTGTCTGTATCTTTGGGAATAG	850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX255945.6	94861	TGTAAAATTTCCATTTGCTTCTCTGATCCTGTCTGTATCTTTGGGAATAG	94910

BX120007.9	851	ATGTAAGAATATTACATCTCTCAGGCTTGCTCTGCCCCAGGTTTCTGAAC	900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX255945.6	94911	ATGTAAGAATATTACATCTCTCAGGCTTGCTCTGCCCCAGGTTTCTGAAC	94960

BX120007.9	901	GTGGAATACATTTCTCCAGTGAAACTCAGTATTATGAGATTTGGGAGGTG	950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX255945.6	94961	GTGGAATACATTTCTCCAGTGAAACTCAGTATTATGAGATTTGGGAGGTG	95010

BX120007.9	951	GAAGTTAGGCCACAGCCATCTCAGGGACAGGTTTCACAGACATGAGTTTT	1000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX255945.6	95011	GAAGTTAGGCCACAGCCATCTCAGGGACAGGTTTCACAGACATGAGTTTT	95060

BX120007.9	1001	GGCAGCAGCCTTGTGTTCTAAAGACATTTACTCCTAGGGGCTCTAGAGGA	1050
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX255945.6	95061	GGCAGCAGCCTTGTGTTCTAAAGACATTTACTCCTAGGGGCTCTAGAGGA	95110

BX120007.9	1051	TCTGCAACATCAGCAGAAGCTTCCTGTGGGTTCCTGATCTTTTAAAATTA	1100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX255945.6	95111	TCTGCAACATCAGCAGAAGCTTCCTGTGGGTTCCTGATCTTTTAAAATTA	95160

BX120007.9	1101	GGGGTCTGCAGTGACTTGTGCTCCTCCAGACCCCCTAACAGTTTTAAGGG	1150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX255945.6	95161	GGGGTCTGCAGTGACTTGTGCTCCTCCAGACCCCCTAACAGTTTTAAGGG	95210

BX120007.9	1151	CTAATTCCCTGTAATATATTCAGTTCTGCTTAGACTGATTACAGGGATTC	1200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX255945.6	95211	CTAATTCCCTGTAATATATTCAGTTCTGCTTAGACTGATTACAGGGATTC	95260

BX120007.9	1201	CTATTTCTTGACTGAATTCTCATGGCTATAGTGGCTCGTCACCATTTGAC	1250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX255945.6	95261	CTATTTCTTGACTGAATTCTCATGGCTATAGTGGCTCGTCACCATTTGAC	95310

BX120007.9	1251	ATCACCAAGAAGTCCTCATTCAGGTGCCTTTGGAAATTCCCTCAAACACA	1300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX255945.6	95311	ATCACCAAGAAGTCCTCATTCAGGTGCCTTTGGAAATTCCCTCAAACACA	95360

BX120007.9	1301	CAGGAAATTAGAGTTTGAAAGAAAACGGAGAACCATGAGCACTGTCCAAA	1350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX255945.6	95361	CAGGAAATTAGAGTTTGAAAGAAAACGGAGAACCATGAGCACTGTCCAAA	95410

BX120007.9	1351	TAGGAACTTCTCTCCTATCACAGAGAAAGGGAACTGAAAGTCATTTCTCA	1400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX255945.6	95411	TAGGAACTTCTCTCCTATCACAGAGAAAGGGAACTGAAAGTCATTTCTCA	95460

BX120007.9	1401	AGTCTCCCAAATTTAGTAATCTCACAAGAAGAACCAATCAGTGTTCTAGG	1450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX255945.6	95461	AGTCTCCCAAATTTAGTAATCTCACAAGAAGAACCAATCAGTGTTCTAGG	95510

BX120007.9	1451	ACTAAACAGTGTCATAAGTTGCTGAGCAACAACTTGGATTGAAGATGCTA	1500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX255945.6	95511	ACTAAACAGTGTCATAAGTTGCTGAGCAACAACTTGGATTGAAGATGCTA	95560

BX120007.9	1501	TTATAATATATGAAATGTCTTTGAATTTACCATGTTTTTCTCAAGCACCA	1550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX255945.6	95561	TTATAATATATGAAATGTCTTTGAATTTACCATGTTTTTCTCAAGCACCA	95610

BX120007.9	1551	TTTAAGAACAAGGCATTATGGCAGCCAGCAAAGGGCAGACATAGAAAATT	1600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX255945.6	95611	TTTAAGAACAAGGCATTATGGCAGCCAGCAAAGGGCAGACATAGAAAATT	95660

BX120007.9	1601	ATACATGGTTTTGCCTCTAAAAGAGGAGATGACAAGCTTAAATCATAGGA	1650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX255945.6	95661	ATACATGGTTTTGCCTCTAAAAGAGGAGATGACAAGCTTAAATCATAGGA	95710

BX120007.9	1651	TCAGACTCTTAGCACAGACTGATACCATAGGCTCTCATCTGGCCCATTCT	1700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX255945.6	95711	TCAGACTCTTAGCACAGACTGATACCATAGGCTCTCATCTGGCCCATTCT	95760

BX120007.9	1701	CCTGACTCTTTACCTTTCAGGAAAGGTATTCCTGAAAATTGCAGGAGAGA	1750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX255945.6	95761	CCTGACTCTTTACCTTTCAGGAAAGGTATTCCTGAAAATTGCAGGAGAGA	95810

BX120007.9	1751	CCATGCTGTAGGTCTCTTTCTAGCGATCTAGGAGTTAATGCCACAGTGTG	1800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX255945.6	95811	CCATGCTGTAGGTCTCTTTCTAGCGATCTAGGAGTTAATGCCACAGTGTG	95860

BX120007.9	1801	TTCAAAGCCCTTTGATGCGATCAGATAATCAGTAATGTATGGAATATTTG	1850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX255945.6	95861	TTCAAAGCCCTTTGATGCGATCAGATAATCAGTAATGTATGGAATATTTG	95910

BX120007.9	1851	TGTTCATAACTCGTGAGAACGGCTGCATGGCAGGACAAGACCCCAGCACA	1900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX255945.6	95911	TGTTCATAACTCGTGAGAACGGCTGCATGGCAGGACAAGACCCCAGCACA	95960

BX120007.9	1901	ACAGTATGGAAAATCCACCCTAAGCAGACATGTCATGACTGATGTTGAAC	1950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX255945.6	95961	ACAGTATGGAAAATCCACCCTAAGCAGACATGTCATGACTGATGTTGAAC	96010

BX120007.9	1951	AATGGACTCACCAGCCAGGCACGGTGGCTCATGCCTGTAATCCCAGCACT	2000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX255945.6	96011	AATGGACTCACCAGCCAGGCACGGTGGCTCATGCCTGTAATCCCAGCACT	96060

Overview

Query
BX120007.9 - 109682 bps
Hit
BX255945.6 - 96060 bps
Total alignments
1
Best alignment
alignment #1 (HSP: 2000 bps)
Best alignment cartoon

Alternate alignments

Short-link