<=>End overlap alignment

Alignment #1 HSP: 2000 bps / non-identical: 0 bps

Full alignment

BX510937.6	90201	AAGCTTGTTCACACAAGCAAACAGTAAAAAGGACAACGTTTTCTTATTTC	90250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX255933.7	1	AAGCTTGTTCACACAAGCAAACAGTAAAAAGGACAACGTTTTCTTATTTC	50

BX510937.6	90251	TTACAGGTTCTGTTGAATACAAACTCAAAATGCTGCTATCTGAGCTCAAA	90300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX255933.7	51	TTACAGGTTCTGTTGAATACAAACTCAAAATGCTGCTATCTGAGCTCAAA	100

BX510937.6	90301	CTACATTTTCCTCTGTAGTTTACCATGTGTTTCCTTTTATGTGTGTGTGT	90350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX255933.7	101	CTACATTTTCCTCTGTAGTTTACCATGTGTTTCCTTTTATGTGTGTGTGT	150

BX510937.6	90351	GTGTGCGTGCGTGCGTGTGTGTGTGTATGTATATATATATATATATATAT	90400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX255933.7	151	GTGTGCGTGCGTGCGTGTGTGTGTGTATGTATATATATATATATATATAT	200

BX510937.6	90401	ATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATAT	90450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX255933.7	201	ATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATAT	250

BX510937.6	90451	ATATGTATATGTGTGTGTGTGTGTGTGTATGTATATACACAGAACACCCA	90500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX255933.7	251	ATATGTATATGTGTGTGTGTGTGTGTGTATGTATATACACAGAACACCCA	300

BX510937.6	90501	AACGCTGATGTGCTTTAGCATACTATGGATATCAATAATTACAGATATCC	90550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX255933.7	301	AACGCTGATGTGCTTTAGCATACTATGGATATCAATAATTACAGATATCC	350

BX510937.6	90551	AGTTTTCTTCATGTCTTCTTTTGTGTTAAAAAAAAAAGACAGGACAAGTT	90600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX255933.7	351	AGTTTTCTTCATGTCTTCTTTTGTGTTAAAAAAAAAAGACAGGACAAGTT	400

BX510937.6	90601	TGGAACAAGTGGATGATGAGAGAATTTTAAGTTTTGAGTGAAGTCTTTTG	90650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX255933.7	401	TGGAACAAGTGGATGATGAGAGAATTTTAAGTTTTGAGTGAAGTCTTTTG	450

BX510937.6	90651	AGTATGTCAAGCTGCTGTGTTAACCCATTGTAATGTGTTTTAGTGAATAT	90700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX255933.7	451	AGTATGTCAAGCTGCTGTGTTAACCCATTGTAATGTGTTTTAGTGAATAT	500

BX510937.6	90701	TAAATTACTAAAAGAGCTGCAGTTTATTTTGTATTTTCATAGGTATATTT	90750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX255933.7	501	TAAATTACTAAAAGAGCTGCAGTTTATTTTGTATTTTCATAGGTATATTT	550

BX510937.6	90751	TATGTTTTAAAAGTATAGCTTCAAAGCAAAGTACTAAGTAATCTGATTAC	90800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX255933.7	551	TATGTTTTAAAAGTATAGCTTCAAAGCAAAGTACTAAGTAATCTGATTAC	600

BX510937.6	90801	TTTTTGCATGACGTAATTAGTAATGTAATCAGATTACAATTTTCCAGTGG	90850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX255933.7	601	TTTTTGCATGACGTAATTAGTAATGTAATCAGATTACAATTTTCCAGTGG	650

BX510937.6	90851	TAGTCAATAATTTGTAATCTATTACTTTAAGTTACCCAACACCGACAAGG	90900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX255933.7	651	TAGTCAATAATTTGTAATCTATTACTTTAAGTTACCCAACACCGACAAGG	700

BX510937.6	90901	ACTATATACCTACATATAAAAATAAGAAGAGTGAATGTTGATTTTATACC	90950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX255933.7	701	ACTATATACCTACATATAAAAATAAGAAGAGTGAATGTTGATTTTATACC	750

BX510937.6	90951	AACTTGGGTTTCGTGAACAGAAAATATTAAGGCTATAAAAACAACACTAG	91000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX255933.7	751	AACTTGGGTTTCGTGAACAGAAAATATTAAGGCTATAAAAACAACACTAG	800

BX510937.6	91001	CTGGGTTAGTTAAATAGTAAGAGATATGCGAGACGATATGCAAGAAAAAA	91050
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX255933.7	801	CTGGGTTAGTTAAATAGTAAGAGATATGCGAGACGATATGCAAGAAAAAA	850

BX510937.6	91051	ACATGAATGATTTTGCATTGGGGAAGCAAAGGCAAAGTTGCTGAAATGAA	91100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX255933.7	851	ACATGAATGATTTTGCATTGGGGAAGCAAAGGCAAAGTTGCTGAAATGAA	900

BX510937.6	91101	ATATGATTTTTCTCACAACAAAACAAGTTCTCACAAAAACAAACAAACAA	91150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX255933.7	901	ATATGATTTTTCTCACAACAAAACAAGTTCTCACAAAAACAAACAAACAA	950

BX510937.6	91151	CAGATACCATTACGGAAGTTCTAATGGTTTTTGTAATAGTTTGAATAGTT	91200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX255933.7	951	CAGATACCATTACGGAAGTTCTAATGGTTTTTGTAATAGTTTGAATAGTT	1000

BX510937.6	91201	CCAGTAAAGCCTGTATTGGTCCCGTTGGACTCTGGACTCAACCAGTTTTG	91250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX255933.7	1001	CCAGTAAAGCCTGTATTGGTCCCGTTGGACTCTGGACTCAACCAGTTTTG	1050

BX510937.6	91251	ACAAATGGATATCTGCCAAAACACATAGAAAACATTAAAATTGACTAGTT	91300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX255933.7	1051	ACAAATGGATATCTGCCAAAACACATAGAAAACATTAAAATTGACTAGTT	1100

BX510937.6	91301	TTAAAATGTAATGGTTAGGTTTATTGGTTTAATGGTATTTGTAGTGGAAT	91350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX255933.7	1101	TTAAAATGTAATGGTTAGGTTTATTGGTTTAATGGTATTTGTAGTGGAAT	1150

BX510937.6	91351	CTTCTTTTTAAGCAGAGGTTTTATTCCCATCACCATTAGAGGCTCTGTCT	91400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX255933.7	1151	CTTCTTTTTAAGCAGAGGTTTTATTCCCATCACCATTAGAGGCTCTGTCT	1200

BX510937.6	91401	TTCAGTATTCTCACAGCAAAGGAACTTTAATTAGTGGCTCAAAGTATTTT	91450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX255933.7	1201	TTCAGTATTCTCACAGCAAAGGAACTTTAATTAGTGGCTCAAAGTATTTT	1250

BX510937.6	91451	CTCCTAATCCTGACTCTTGAGAACGGGAATATATAAACAGCCTCTGAGGA	91500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX255933.7	1251	CTCCTAATCCTGACTCTTGAGAACGGGAATATATAAACAGCCTCTGAGGA	1300

BX510937.6	91501	AAGAGACCAGAAACAAGGCGAACAAATCATTCCCTCCCTCAGTCAACCAC	91550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX255933.7	1301	AAGAGACCAGAAACAAGGCGAACAAATCATTCCCTCCCTCAGTCAACCAC	1350

BX510937.6	91551	ACTGAGGCATACCTGAGCAACGCCATGATCTTCCTAATGGATTTACAGGT	91600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX255933.7	1351	ACTGAGGCATACCTGAGCAACGCCATGATCTTCCTAATGGATTTACAGGT	1400

BX510937.6	91601	GATGCTGCTGGATGTGCTGTACTTCATCCTGCGCTCCTGTCTGCGGCTCG	91650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX255933.7	1401	GATGCTGCTGGATGTGCTGTACTTCATCCTGCGCTCCTGTCTGCGGCTCG	1450

BX510937.6	91651	TGTTCAGACCCCGCACGAAGCCCATAGACGGCGAGTTGGTGCTAATAACC	91700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX255933.7	1451	TGTTCAGACCCCGCACGAAGCCCATAGACGGCGAGTTGGTGCTAATAACC	1500

BX510937.6	91701	GGCTCTGGGGGTGCTTTGGGGCGGCTGTTCGCCCTGGAGTTCACCAAACA	91750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX255933.7	1501	GGCTCTGGGGGTGCTTTGGGGCGGCTGTTCGCCCTGGAGTTCACCAAACA	1550

BX510937.6	91751	CGGCGCAGAAGTGGTGCTGTGGGACGTCAACGGGGAAGCTAATGAGGACA	91800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX255933.7	1551	CGGCGCAGAAGTGGTGCTGTGGGACGTCAACGGGGAAGCTAATGAGGACA	1600

BX510937.6	91801	CCGCCAAACTGGTGAGGGCGCGAGGGGGGCAGGCGCACGCGTACACGGTG	91850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX255933.7	1601	CCGCCAAACTGGTGAGGGCGCGAGGGGGGCAGGCGCACGCGTACACGGTG	1650

BX510937.6	91851	GATGTGACAAAACGGGAAGAAGTTTACCGGACAGCCGACCTCGTACGGGA	91900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX255933.7	1651	GATGTGACAAAACGGGAAGAAGTTTACCGGACAGCCGACCTCGTACGGGA	1700

BX510937.6	91901	GGAGGTGGGAAGAGATGTGACCTACCTGGTGAACAATGCCGGGGTGGTCG	91950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX255933.7	1701	GGAGGTGGGAAGAGATGTGACCTACCTGGTGAACAATGCCGGGGTGGTCG	1750

BX510937.6	91951	CCGGTGAGAGACTTCTGGACTGTCCCGATTACTTGTTGGAGAGGACCCTG	92000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX255933.7	1751	CCGGTGAGAGACTTCTGGACTGTCCCGATTACTTGTTGGAGAGGACCCTG	1800

BX510937.6	92001	AAAGTAAACTGCCACGCTCTCTTCTGGGTAAAAAAAATGCGAATTTTAAT	92050
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX255933.7	1801	AAAGTAAACTGCCACGCTCTCTTCTGGGTAAAAAAAATGCGAATTTTAAT	1850

BX510937.6	92051	GTCACAATTAATTACTCTTTCATTTGTTTTAAATTAATGTTATCTGTGCA	92100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX255933.7	1851	GTCACAATTAATTACTCTTTCATTTGTTTTAAATTAATGTTATCTGTGCA	1900

BX510937.6	92101	GATTATTAATAAAATAATAATAATAAAATTGCCTTGGTAATCTACACCAA	92150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX255933.7	1901	GATTATTAATAAAATAATAATAATAAAATTGCCTTGGTAATCTACACCAA	1950

BX510937.6	92151	AACCACATCTCTCCGTTTGATTATTCTTTTTCAGGCGCGTGGGCGGGGCC	92200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX255933.7	1951	AACCACATCTCTCCGTTTGATTATTCTTTTTCAGGCGCGTGGGCGGGGCC	2000

Overview

Query
BX510937.6 - 92200 bps
Hit
BX255933.7 - 231623 bps
Total alignments
20
Best alignment
alignment #1 (HSP: 2000 bps)
Best alignment cartoon

Alternate alignments

#%IDscoreHSPstartendstrandhstarthendhstrand
11001955200090201922001120001
287.5899161988110041-122221223811
386.491072246516765390-129153293741
495.87711219033890458-130326304461
594.365566745416154834-131731324041
677.71793766421017170490708391
781.44942811732117601-174069743321
887.261132236511165333-174121743321
986.881082286622166448-174350745701
1085.16901854646646650-11417081418891
1184.621493084606346370-11420281423391
1282.941785106488265391-11473101478251
1387.14196379170851746311567861571661
1486.26126269662316649911567861570471
1589.81226372648826525311567941571661
1688.388815556305784-11826011827551
1778.391093835630601211871211875181
1886.652043498850188849-12232602236111
1985.461693237196972291-12232612235901
2083.031443302947229801-12232702236111
Short-link