<=>End overlap alignment

Alignment #1 HSP: 2000 bps / non-identical: 0 bps

Full alignment

BX284614.8	158829	ATTATGTTGAATAAATGAATACATGGTCATTTCAAATGTAATGTTTGAGT	158878
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX255928.7	1	ATTATGTTGAATAAATGAATACATGGTCATTTCAAATGTAATGTTTGAGT	50

BX284614.8	158879	TGCATTTTGAAATAGTATCAATTTGATGTTTAATTGTATTATATTAAAAA	158928
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX255928.7	51	TGCATTTTGAAATAGTATCAATTTGATGTTTAATTGTATTATATTAAAAA	100

BX284614.8	158929	GGTGATCTTAGTTCAATGAACAAAGTATCCTTGACTTGTGTGTGTTGTAT	158978
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX255928.7	101	GGTGATCTTAGTTCAATGAACAAAGTATCCTTGACTTGTGTGTGTTGTAT	150

BX284614.8	158979	CCAAGCATTTAAAAAAAAGAGTTAAGAGTTTTGCAAAAAAAAAAAAAAAA	159028
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX255928.7	151	CCAAGCATTTAAAAAAAAGAGTTAAGAGTTTTGCAAAAAAAAAAAAAAAA	200

BX284614.8	159029	AAAAAAAAAAGCAATTTTGGCAATGCTTGTGAATTTTGTATCTAGAGTTT	159078
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX255928.7	201	AAAAAAAAAAGCAATTTTGGCAATGCTTGTGAATTTTGTATCTAGAGTTT	250

BX284614.8	159079	TTAAAATTTAAAAATCCTCTCCAGTTCTGTCAGGTCAGAATGGTAAAGGT	159128
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX255928.7	251	TTAAAATTTAAAAATCCTCTCCAGTTCTGTCAGGTCAGAATGGTAAAGGT	300

BX284614.8	159129	TGGTGGACAGCTAATTTTAGGTCTCTCCAGGGATGCTCAATTGGGTTTAA	159178
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX255928.7	301	TGGTGGACAGCTAATTTTAGGTCTCTCCAGGGATGCTCAATTGGGTTTAA	350

BX284614.8	159179	GTCAGGGCTCTGGCTGAGCCATTCAAGAACAGTCATGGAGTTGTTGTGAA	159228
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX255928.7	351	GTCAGGGCTCTGGCTGAGCCATTCAAGAACAGTCATGGAGTTGTTGTGAA	400

BX284614.8	159229	GCCACCATATTGTTTGACATATCCAATATGATTCATTTCTTAAAGTTCAT	159278
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX255928.7	401	GCCACCATATTGTTTGACATATCCAATATGATTCATTTCTTAAAGTTCAT	450

BX284614.8	159279	GAAACATGCGGGTGGTTCTTCTAAGCGCAAAACAGATCAGATAAAGCCAG	159328
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX255928.7	451	GAAACATGCGGGTGGTTCTTCTAAGCGCAAAACAGATCAGATAAAGCCAG	500

BX284614.8	159329	TCTTACTGTTTTTATCCACTTTTTATTCTTTAATGTTTGGTTTGTCCACC	159378
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX255928.7	501	TCTTACTGTTTTTATCCACTTTTTATTCTTTAATGTTTGGTTTGTCCACC	550

BX284614.8	159379	TTTTGCAACACTTATTTTATATATTTCCTGAGAACTTTAAAACTAGTGTT	159428
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX255928.7	551	TTTTGCAACACTTATTTTATATATTTCCTGAGAACTTTAAAACTAGTGTT	600

BX284614.8	159429	ATTCCATGCTTGACAACAATTATACATGTAATTTAGCTTCTTCTGTGAAG	159478
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX255928.7	601	ATTCCATGCTTGACAACAATTATACATGTAATTTAGCTTCTTCTGTGAAG	650

BX284614.8	159479	GAACATGATTGTGTGACATTGACAGTGAAACATACCTAGCTTGTTTTTTT	159528
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX255928.7	651	GAACATGATTGTGTGACATTGACAGTGAAACATACCTAGCTTGTTTTTTT	700

BX284614.8	159529	TTTTTTTTCTGTAAGGAAATGACAAACATCACTTGATAGCTATATTATAT	159578
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX255928.7	701	TTTTTTTTCTGTAAGGAAATGACAAACATCACTTGATAGCTATATTATAT	750

BX284614.8	159579	GGATTTTAGAGCAGAATGATAACTTTGTAGATATTTTATTTGTTTTATGA	159628
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX255928.7	751	GGATTTTAGAGCAGAATGATAACTTTGTAGATATTTTATTTGTTTTATGA	800

BX284614.8	159629	TTAATATAATGGCCTATTCAGAGCAAGGCTTCTACTAGAAAATGTGTTCA	159678
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX255928.7	801	TTAATATAATGGCCTATTCAGAGCAAGGCTTCTACTAGAAAATGTGTTCA	850

BX284614.8	159679	CATAGTCTTAAAGGAACACTTTTTTTTTTTAGAAAATAGGCTCATTTGAC	159728
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX255928.7	851	CATAGTCTTAAAGGAACACTTTTTTTTTTTAGAAAATAGGCTCATTTGAC	900

BX284614.8	159729	AAAATTGAACAGTTGAGTTTTACCATATTTGAATCCATTCAGCTGATCTC	159778
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX255928.7	901	AAAATTGAACAGTTGAGTTTTACCATATTTGAATCCATTCAGCTGATCTC	950

BX284614.8	159779	CAGGTATGGTGGGAGCACTTTCAGCTTAGCTTAGCACAGGTCATTGCATT	159828
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX255928.7	951	CAGGTATGGTGGGAGCACTTTCAGCTTAGCTTAGCACAGGTCATTGCATT	1000

BX284614.8	159829	TATGCTAAGCCCTGCCATGGCTTAATATCATTAAATATCATAAATAATAA	159878
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX255928.7	1001	TATGCTAAGCCCTGCCATGGCTTAATATCATTAAATATCATAAATAATAA	1050

BX284614.8	159879	TATAATTAGTGTTGCAGCAAATTTCTTTGATTACTTTGGCAGAATGGGCC	159928
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX255928.7	1051	TATAATTAGTGTTGCAGCAAATTTCTTTGATTACTTTGGCAGAATGGGCC	1100

BX284614.8	159929	TAGTATCAGCCTGAAAAGGCGGTATTTTCTGTTGGTCTTTATACATGATG	159978
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX255928.7	1101	TAGTATCAGCCTGAAAAGGCGGTATTTTCTGTTGGTCTTTATACATGATG	1150

BX284614.8	159979	TACCTAGAGAAGAGTCAAGCTTTAAATAAAATAATTATTTAAAGTCTTAG	160028
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX255928.7	1151	TACCTAGAGAAGAGTCAAGCTTTAAATAAAATAATTATTTAAAGTCTTAG	1200

BX284614.8	160029	TTCCTTTTTGAGCAAGATGTCAAGGGTCTAATTTCAATCAGTGATTTATG	160078
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX255928.7	1201	TTCCTTTTTGAGCAAGATGTCAAGGGTCTAATTTCAATCAGTGATTTATG	1250

BX284614.8	160079	CTAAGTTAAGTTTAACTGCTTAACTCTAAGGCATTTGAATTTAAACATAC	160128
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX255928.7	1251	CTAAGTTAAGTTTAACTGCTTAACTCTAAGGCATTTGAATTTAAACATAC	1300

BX284614.8	160129	TACTCAACCATTGGAAAAGTACGTCTATACACTATGAATGTGAAAAGTAT	160178
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX255928.7	1301	TACTCAACCATTGGAAAAGTACGTCTATACACTATGAATGTGAAAAGTAT	1350

BX284614.8	160179	GAATGAAATTCAGACGTACTACATCCGCCATTTTGTCATGGTCACGTGAC	160228
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX255928.7	1351	GAATGAAATTCAGACGTACTACATCCGCCATTTTGTCATGGTCACGTGAC	1400

BX284614.8	160229	CTACCTGTGTCAGTTGCTTCACTGCACTTTACTCACATTCATGGATTCTA	160278
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX255928.7	1401	CTACCTGTGTCAGTTGCTTCACTGCACTTTACTCACATTCATGGATTCTA	1450

BX284614.8	160279	GCGAGGCATCATGGGATAGCGCAGCGTGCATGGGTGCATGGGATTCGCAC	160328
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX255928.7	1451	GCGAGGCATCATGGGATAGCGCAGCGTGCATGGGTGCATGGGATTCGCAC	1500

BX284614.8	160329	TTCAAAATCTCGCCGGAAGTGGTAAGTCATTCGGGTACTTCTGGCATACT	160378
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX255928.7	1501	TTCAAAATCTCGCCGGAAGTGGTAAGTCATTCGGGTACTTCTGGCATACT	1550

BX284614.8	160379	GATTTTCGAATTCTATGAATTCGGACATACTACTTAGCTCGCATACTGAT	160428
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX255928.7	1551	GATTTTCGAATTCTATGAATTCGGACATACTACTTAGCTCGCATACTGAT	1600

BX284614.8	160429	TTAAGCATACTATATAATATGGAAGTATGCAGTTTCGAACGCAGCCGTGG	160478
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX255928.7	1601	TTAAGCATACTATATAATATGGAAGTATGCAGTTTCGAACGCAGCCGTGG	1650

BX284614.8	160479	TCAAGACGATCTGCTGCAGTTCAAACCCAGCATCAAAATGGGGAAGAAAG	160528
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX255928.7	1651	TCAAGACGATCTGCTGCAGTTCAAACCCAGCATCAAAATGGGGAAGAAAG	1700

BX284614.8	160529	GTGATTTAAGTGACTTTGAAAATGACATGGTTGTTGATGCCAGTGCCAGA	160578
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX255928.7	1701	GTGATTTAAGTGACTTTGAAAATGACATGGTTGTTGATGCCAGTGCCAGA	1750

BX284614.8	160579	TGGGCTAGTCTGAGTGTTTCAGGGTGCTTTCACATCTGTAGTTCGGTTCA	160628
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX255928.7	1751	TGGGCTAGTCTGAGTGTTTCAGGGTGCTTTCACATCTGTAGTTCGGTTCA	1800

BX284614.8	160629	TTTGGTCCAGACCAAAGGCAATAAATGACACATTGTTGCATTTTCCACTG	160678
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX255928.7	1801	TTTGGTCCAGACCAAAGGCAATAAATGACACATTGTTGCATTTTCCACTG	1850

BX284614.8	160679	TCTTTGGGTCATTTTCACACCACACTGCTGGCTTTGGTCCGAACCAGTTG	160728
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX255928.7	1851	TCTTTGGGTCATTTTCACACCACACTGCTGGCTTTGGTCCGAACCAGTTG	1900

BX284614.8	160729	AAAAGAACTAAAATGCACTCATCTGACAAAATCCACATCACTCATTGGCC	160778
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX255928.7	1901	AAAAGAACTAAAATGCACTCATCTGACAAAATCCACATCACTCATTGGCC	1950

BX284614.8	160779	AAATGTTGTTCAACATATTTCCTAAACTGCTTATCGATTGGTTAGAATTC	160828
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX255928.7	1951	AAATGTTGTTCAACATATTTCCTAAACTGCTTATCGATTGGTTAGAATTC	2000

Overview

Query
BX284614.8 - 160828 bps
Hit
BX255928.7 - 132833 bps
Total alignments
21
Best alignment
alignment #1 (HSP: 2000 bps)
Best alignment cartoon

Alternate alignments

#%IDscoreHSPstartendstrandhstarthendhstrand
1100193320001588291608281120001
291.82198269108738109006-1424145091
391.411842562082721082-1424545001
490.692243181925019567-117107174281
583.5267576100050100625140349409361
684.532695283109931626140352408811
780.3167467116352116818-140354408351
884.78198399112560112958-140359407591
984.85353688100055100742143627443121
1084.66166380142219142598-148201485781
1183.071634317425774687148264487001
1292.222984232335423776-150297507331
1388.683405632265023212-150735512821
1486.3406746118551119296152740535051
1590.283585351534515879152987535111
1683.571794317425774687185801862321
1788.35176309142225142533-185801861091
1887.88160289151562151850-185890861781
1986.042054317425774687-187022874581
2086.96169344142219142562187143874871
2188.851822891927319561-11032091035041
Short-link