<=>End overlap alignment

Alignment #1 HSP: 2000 bps / non-identical: 0 bps

Full alignment

BX294158.7	1	TTGCATAACCTTCAAAGGCCGGGTGCGGTGGCTCACATCTGTAATCCTAG	50
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX248580.4	55171	TTGCATAACCTTCAAAGGCCGGGTGCGGTGGCTCACATCTGTAATCCTAG	55220

BX294158.7	51	CACTTTGGGAGGCCAAGGCTGGTGGATCACTTGAGGTCAGGAGTTCGACA	100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX248580.4	55221	CACTTTGGGAGGCCAAGGCTGGTGGATCACTTGAGGTCAGGAGTTCGACA	55270

BX294158.7	101	TCAGCCTGGCCAACACGGTGAAACCCCATCTCTACTAAAAATATAAAAAT	150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX248580.4	55271	TCAGCCTGGCCAACACGGTGAAACCCCATCTCTACTAAAAATATAAAAAT	55320

BX294158.7	151	TAGCCAGATGTGGTGTTGGGCGCCTGTAATCCCAGCTCCTCTGGAGGCTG	200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX248580.4	55321	TAGCCAGATGTGGTGTTGGGCGCCTGTAATCCCAGCTCCTCTGGAGGCTG	55370

BX294158.7	201	AGGCAGGAGAACTGCTTGAACCTGGGAAGCGGAGGTTGCAGTGAGCTGAG	250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX248580.4	55371	AGGCAGGAGAACTGCTTGAACCTGGGAAGCGGAGGTTGCAGTGAGCTGAG	55420

BX294158.7	251	ATCACACCACTGCACTCCAGCCTGAGGGACAGAGTGAGATTCCATCTCAA	300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX248580.4	55421	ATCACACCACTGCACTCCAGCCTGAGGGACAGAGTGAGATTCCATCTCAA	55470

BX294158.7	301	AAAAAAAAAAAAAGAAAGAAACTGAAAGGGAGTGTCATTATATTAATGTG	350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX248580.4	55471	AAAAAAAAAAAAAGAAAGAAACTGAAAGGGAGTGTCATTATATTAATGTG	55520

BX294158.7	351	AATATGCAGGGAAAATAGTCATAAACCAGGCCAGTTCCTGGAAAACACAC	400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX248580.4	55521	AATATGCAGGGAAAATAGTCATAAACCAGGCCAGTTCCTGGAAAACACAC	55570

BX294158.7	401	ATGGTCACCCTATCCCTAGACCATATGCTGTCTTGCTCGGCATCCTTCTT	450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX248580.4	55571	ATGGTCACCCTATCCCTAGACCATATGCTGTCTTGCTCGGCATCCTTCTT	55620

BX294158.7	451	AACACTTTCCGTTTTTTTCTGCCCCTCAGACTACACCTTGTACTTCTCTA	500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX248580.4	55621	AACACTTTCCGTTTTTTTCTGCCCCTCAGACTACACCTTGTACTTCTCTA	55670

BX294158.7	501	CATAGTGAGATAAATGATAATGTCAGAGGGAGATGAAGAGAGGACCAGGC	550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX248580.4	55671	CATAGTGAGATAAATGATAATGTCAGAGGGAGATGAAGAGAGGACCAGGC	55720

BX294158.7	551	GGGAACCTAGATTACCAGCCACTGCAGACTCAAGAGATTATTATCTGTTT	600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX248580.4	55721	GGGAACCTAGATTACCAGCCACTGCAGACTCAAGAGATTATTATCTGTTT	55770

BX294158.7	601	ACTTTAGGGTCAGGGTGAGAAGTGAGCCATTGCTTTCTCCCCTTCCTTAG	650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX248580.4	55771	ACTTTAGGGTCAGGGTGAGAAGTGAGCCATTGCTTTCTCCCCTTCCTTAG	55820

BX294158.7	651	GTGACACCATGGATTGAGAAAGTTAACCAAACCAGGTTGTTCTGGGGACC	700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX248580.4	55821	GTGACACCATGGATTGAGAAAGTTAACCAAACCAGGTTGTTCTGGGGACC	55870

BX294158.7	701	TTTAAGGGACCAGGCTCTGTAAAGGCAGGCTGGAAGAGTGAGGCAGGGGC	750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX248580.4	55871	TTTAAGGGACCAGGCTCTGTAAAGGCAGGCTGGAAGAGTGAGGCAGGGGC	55920

BX294158.7	751	ATTTAGCTATTCCCATCCTCATCTAGCTCCCCACTCTGGCTTCTCCCGCC	800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX248580.4	55921	ATTTAGCTATTCCCATCCTCATCTAGCTCCCCACTCTGGCTTCTCCCGCC	55970

BX294158.7	801	AGCGGATGTGACCCTGGACCCTGAGACAGCTCATCCTAACCTAGTCCTGT	850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX248580.4	55971	AGCGGATGTGACCCTGGACCCTGAGACAGCTCATCCTAACCTAGTCCTGT	56020

BX294158.7	851	CAGAGGATCGTAAGAGCGTCAAGTTCGTGGAGACAAGACTCCGGGATCTC	900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX248580.4	56021	CAGAGGATCGTAAGAGCGTCAAGTTCGTGGAGACAAGACTCCGGGATCTC	56070

BX294158.7	901	CCTGACACACCAAGGCGTTTCACCTTCTACCCTTGCGTCCTGGCTACTGA	950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX248580.4	56071	CCTGACACACCAAGGCGTTTCACCTTCTACCCTTGCGTCCTGGCTACTGA	56120

BX294158.7	951	GGGTTTCACCTCAGGTCGACACTACTGGGAGGTGGAGGTGGGCGACAAGA	1000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX248580.4	56121	GGGTTTCACCTCAGGTCGACACTACTGGGAGGTGGAGGTGGGCGACAAGA	56170

BX294158.7	1001	CCCACTGGGCAGTGGGTGTATGCCGGGACTCCGTGAGCCGAAAGGGCGAG	1050
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX248580.4	56171	CCCACTGGGCAGTGGGTGTATGCCGGGACTCCGTGAGCCGAAAGGGCGAG	56220

BX294158.7	1051	TTGACTCCACTCCCTGAGACTGGCTACTGGCGGGTGCGGCTATGGAATGG	1100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX248580.4	56221	TTGACTCCACTCCCTGAGACTGGCTACTGGCGGGTGCGGCTATGGAATGG	56270

BX294158.7	1101	GGACAAATATGCAGCCACCACCACACCTTTTACCCCTTTGCACATCAAGG	1150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX248580.4	56271	GGACAAATATGCAGCCACCACCACACCTTTTACCCCTTTGCACATCAAGG	56320

BX294158.7	1151	TGAAACCCAAGCGGGTAGGCATATTCCTAGACTATGAGGCCGGCACACTG	1200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX248580.4	56321	TGAAACCCAAGCGGGTAGGCATATTCCTAGACTATGAGGCCGGCACACTG	56370

BX294158.7	1201	TCTTTCTACAATGTCACAGACCGCTCTCATATCTACACCTTCACTGATAC	1250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX248580.4	56371	TCTTTCTACAATGTCACAGACCGCTCTCATATCTACACCTTCACTGATAC	56420

BX294158.7	1251	TTTTACTGAGAAACTTTGGCCCCTCTTCTACCCAGGCATCCGGGCTGGAC	1300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX248580.4	56421	TTTTACTGAGAAACTTTGGCCCCTCTTCTACCCAGGCATCCGGGCTGGAC	56470

BX294158.7	1301	GGAAGAATGCTGCACCACTTACCATCAGGCCCCCAACAGATTGGGAGTGA	1350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX248580.4	56471	GGAAGAATGCTGCACCACTTACCATCAGGCCCCCAACAGATTGGGAGTGA	56520

BX294158.7	1351	CAGGTTGGGATGTGGGAATGACTGGGGTGAGGCAGGGTCAAGTGCTACGG	1400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX248580.4	56521	CAGGTTGGGATGTGGGAATGACTGGGGTGAGGCAGGGTCAAGTGCTACGG	56570

BX294158.7	1401	GCCTCCTTCCCGTGTCCTGCTGGAACGTCTTCGTGTCCACCTGGGTCCAG	1450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX248580.4	56571	GCCTCCTTCCCGTGTCCTGCTGGAACGTCTTCGTGTCCACCTGGGTCCAG	56620

BX294158.7	1451	TCCTGAATCATCTTGGAGAAACACCTTGGTTTCTAGGATGGTTTTGTGTG	1500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX248580.4	56621	TCCTGAATCATCTTGGAGAAACACCTTGGTTTCTAGGATGGTTTTGTGTG	56670

BX294158.7	1501	GAGGGGGAGGTAGGACTGGGCTGGATGAGAGAGCACAGCTGTGACTTCCT	1550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX248580.4	56671	GAGGGGGAGGTAGGACTGGGCTGGATGAGAGAGCACAGCTGTGACTTCCT	56720

BX294158.7	1551	CCTAACTGTCAGGGTGGGGAGCTGGTTCCCAGAGGATTGTCTACCCTGAA	1600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX248580.4	56721	CCTAACTGTCAGGGTGGGGAGCTGGTTCCCAGAGGATTGTCTACCCTGAA	56770

BX294158.7	1601	GTCCATCAGGTTTTCTGTTGCACAAGGACGGGTCAGGAAGGAAGGAGAGG	1650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX248580.4	56771	GTCCATCAGGTTTTCTGTTGCACAAGGACGGGTCAGGAAGGAAGGAGAGG	56820

BX294158.7	1651	CTTTTCCAGAAACAAAAAATCTGTGAGGGTCTGACTTGCTCAAACCAGAG	1700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX248580.4	56821	CTTTTCCAGAAACAAAAAATCTGTGAGGGTCTGACTTGCTCAAACCAGAG	56870

BX294158.7	1701	GAGGAAACAGAAACCCCTGCACATCTTTTTAGGGGGTTCTTTGACCCAGG	1750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX248580.4	56871	GAGGAAACAGAAACCCCTGCACATCTTTTTAGGGGGTTCTTTGACCCAGG	56920

BX294158.7	1751	ATAGTCTTGCTTCTTGAGGTAGATCACAGGGGTCTGTGTACCTCTGAATT	1800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX248580.4	56921	ATAGTCTTGCTTCTTGAGGTAGATCACAGGGGTCTGTGTACCTCTGAATT	56970

BX294158.7	1801	CATGAGAGATGAATGACAGATGCTCTCATGGGTCTAGATATTGAGGAGTT	1850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX248580.4	56971	CATGAGAGATGAATGACAGATGCTCTCATGGGTCTAGATATTGAGGAGTT	57020

BX294158.7	1851	TTTCTGAGGGCAGAGATTGGACATCAACAAGGCTAGAAGGGTCAGGGAAG	1900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX248580.4	57021	TTTCTGAGGGCAGAGATTGGACATCAACAAGGCTAGAAGGGTCAGGGAAG	57070

BX294158.7	1901	TGGGCTAAAGGAACAGATTCCTAGAGATTAATGAAGAGGAGGGAGGTTTC	1950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX248580.4	57071	TGGGCTAAAGGAACAGATTCCTAGAGATTAATGAAGAGGAGGGAGGTTTC	57120

BX294158.7	1951	TTTGGTCTTCTATTCCAAGGGTAAGGTTGCGATTATGGGTAAGATTGGCC	2000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX248580.4	57121	TTTGGTCTTCTATTCCAAGGGTAAGGTTGCGATTATGGGTAAGATTGGCC	57170

Overview

Query
BX294158.7 - 89053 bps
Hit
BX248580.4 - 57170 bps
Total alignments
1
Best alignment
alignment #1 (HSP: 2000 bps)
Best alignment cartoon

Alternate alignments

Short-link