<=>End overlap alignment

Alignment #1 HSP: 2000 bps / non-identical: 0 bps

Full alignment

AL845353.7	1	GGCCACAGATTTCAAGTCCCAAGCAGCGTGGGCTGGTGGGGTGGGCAAGA	50
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX248507.3	20143	GGCCACAGATTTCAAGTCCCAAGCAGCGTGGGCTGGTGGGGTGGGCAAGA	20192

AL845353.7	51	TAGGTGGGAAGGGGCAGAAGACACAAGTGGTTGGGCTGGTGGCTGCTGTT	100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX248507.3	20193	TAGGTGGGAAGGGGCAGAAGACACAAGTGGTTGGGCTGGTGGCTGCTGTT	20242

AL845353.7	101	TTCCCTTTCCCCCCTCTCTCAGGATCCTTTCAAGGGCTTAGATGTTGCTG	150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX248507.3	20243	TTCCCTTTCCCCCCTCTCTCAGGATCCTTTCAAGGGCTTAGATGTTGCTG	20292

AL845353.7	151	CGGCTTGTTTCTGTTTTCCTCGTGGCCGGCCTGTCTTTCTCCGAGAAAAT	200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX248507.3	20293	CGGCTTGTTTCTGTTTTCCTCGTGGCCGGCCTGTCTTTCTCCGAGAAAAT	20342

AL845353.7	201	TCAAACCTGGGATAAAAGGAACACAAGGGAGAAAGATGTAATCAGTACGG	250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX248507.3	20343	TCAAACCTGGGATAAAAGGAACACAAGGGAGAAAGATGTAATCAGTACGG	20392

AL845353.7	251	GTTGCTTCAAAACACTCACAAATGCCATCTTTGTTGTCCCCAAACAAACC	300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX248507.3	20393	GTTGCTTCAAAACACTCACAAATGCCATCTTTGTTGTCCCCAAACAAACC	20442

AL845353.7	301	TGTGTCCCATCCTGATCGCAACCGCTTTAAGCCGTGGCTCTCAAATGAAC	350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX248507.3	20443	TGTGTCCCATCCTGATCGCAACCGCTTTAAGCCGTGGCTCTCAAATGAAC	20492

AL845353.7	351	CCATCCATCCCTATCCCGCTTCCCAGATCCAACGCTCTCCGCAAAATTTT	400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX248507.3	20493	CCATCCATCCCTATCCCGCTTCCCAGATCCAACGCTCTCCGCAAAATTTT	20542

AL845353.7	401	ACCCACTAGACGACAAAGTAGGCAAACTTACCTCTAAACGAACCCCAGAA	450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX248507.3	20543	ACCCACTAGACGACAAAGTAGGCAAACTTACCTCTAAACGAACCCCAGAA	20592

AL845353.7	451	TGGCGGCCGCCCGCTCGGGTGGAGTCTTTTATACCCGGACGCCGCCCAAC	500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX248507.3	20593	TGGCGGCCGCCCGCTCGGGTGGAGTCTTTTATACCCGGACGCCGCCCAAC	20642

AL845353.7	501	GCGCCCAAACGTGCTAGTGAAACGCCCTTGTCGCGAGACATTATACGCGA	550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX248507.3	20643	GCGCCCAAACGTGCTAGTGAAACGCCCTTGTCGCGAGACATTATACGCGA	20692

AL845353.7	551	GGCGTGAACTCATTGGTCAACCCAAATGACAACTCGCCAACTGATTGGCT	600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX248507.3	20693	GGCGTGAACTCATTGGTCAACCCAAATGACAACTCGCCAACTGATTGGCT	20742

AL845353.7	601	ACTCTCACTTCACCTTTGCTCCGCCCCTTTCCCTGGCACTCTCTTCCGCC	650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX248507.3	20743	ACTCTCACTTCACCTTTGCTCCGCCCCTTTCCCTGGCACTCTCTTCCGCC	20792

AL845353.7	651	TCCTTCCTGCCTCCCTGTCGCGTGCGCGTGACCAGGAGCCTAGCACCTCC	700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX248507.3	20793	TCCTTCCTGCCTCCCTGTCGCGTGCGCGTGACCAGGAGCCTAGCACCTCC	20842

AL845353.7	701	CTTTCCTCTGCTTCCGCCACTTCCGCCCTGGAGAACATTTCTCACCCAGG	750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX248507.3	20843	CTTTCCTCTGCTTCCGCCACTTCCGCCCTGGAGAACATTTCTCACCCAGG	20892

AL845353.7	751	ATTGGTAGAAACCTAAGAGCGCATGCGCACTGAGAGGATACCGCTAAAAA	800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX248507.3	20893	ATTGGTAGAAACCTAAGAGCGCATGCGCACTGAGAGGATACCGCTAAAAA	20942

AL845353.7	801	TCGCCTTCAAAATTGCTTAAAAGGCAAACTTTAACAATGCGATCTAAGAG	850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX248507.3	20943	TCGCCTTCAAAATTGCTTAAAAGGCAAACTTTAACAATGCGATCTAAGAG	20992

AL845353.7	851	TCGTAGTGACTGGCCAAAAAAAACCGCAATTTTGGGGTCTAATTCGATTG	900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX248507.3	20993	TCGTAGTGACTGGCCAAAAAAAACCGCAATTTTGGGGTCTAATTCGATTG	21042

AL845353.7	901	TGACGCAGTTGAAATTAGCTTCTCCCCCATGCCTTCCCTTTCACGCTTCC	950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX248507.3	21043	TGACGCAGTTGAAATTAGCTTCTCCCCCATGCCTTCCCTTTCACGCTTCC	21092

AL845353.7	951	GTCCTGACGCAAACGTGGGGCCGCCTTCCGCACTGCGGGCTTGTCCTTGG	1000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX248507.3	21093	GTCCTGACGCAAACGTGGGGCCGCCTTCCGCACTGCGGGCTTGTCCTTGG	21142

AL845353.7	1001	CCCTGCCCTACTCAGTTTCCTGAAGCATGCGCAGTTGCCTTTCCGTCAAT	1050
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX248507.3	21143	CCCTGCCCTACTCAGTTTCCTGAAGCATGCGCAGTTGCCTTTCCGTCAAT	21192

AL845353.7	1051	TCCTGTCCTGGGCGTACGTCAAGATGGCGGCGTCTGTATTAAACACCGTG	1100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX248507.3	21193	TCCTGTCCTGGGCGTACGTCAAGATGGCGGCGTCTGTATTAAACACCGTG	21242

AL845353.7	1101	CTGAGGCGGCTTCCTATGCTATCTCTCTTCCGAGGTTCTCACAGAGTTCA	1150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX248507.3	21243	CTGAGGCGGCTTCCTATGCTATCTCTCTTCCGAGGTTCTCACAGAGTTCA	21292

AL845353.7	1151	GGTAACTCTTCGAAAGACATTTTGCACAACCTCAAGTTGGTTATACCTTC	1200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX248507.3	21293	GGTAACTCTTCGAAAGACATTTTGCACAACCTCAAGTTGGTTATACCTTC	21342

AL845353.7	1201	TCGAGGTTGTCGCTCCACTGTCAGGAATCCACGAGTGGAGACCTTCCCAC	1250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX248507.3	21343	TCGAGGTTGTCGCTCCACTGTCAGGAATCCACGAGTGGAGACCTTCCCAC	21392

AL845353.7	1251	GTGTGTCTTAGCTGTCTAGGCAGTACTTCCTGCAACCCCCCCCCCACACC	1300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX248507.3	21393	GTGTGTCTTAGCTGTCTAGGCAGTACTTCCTGCAACCCCCCCCCCACACC	21442

AL845353.7	1301	CCGCGCATTTTCTAATCCCGAGCCGAGGACTAAACGCCAGGGTTAGGTAT	1350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX248507.3	21443	CCGCGCATTTTCTAATCCCGAGCCGAGGACTAAACGCCAGGGTTAGGTAT	21492

AL845353.7	1351	CATCCTTTTTCCAAAATGCCATTTCAGTAAAATAACTTAAGTGATGGAAT	1400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX248507.3	21493	CATCCTTTTTCCAAAATGCCATTTCAGTAAAATAACTTAAGTGATGGAAT	21542

AL845353.7	1401	TGACCCCTGTCCACCCTCAGTCATGCATAACCAGCTTTTTAAAAATTATT	1450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX248507.3	21543	TGACCCCTGTCCACCCTCAGTCATGCATAACCAGCTTTTTAAAAATTATT	21592

AL845353.7	1451	TAACTAATTAAGGGGCCATGCTAATCTCTGTATCGTTGCAATTTTAGCAT	1500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX248507.3	21593	TAACTAATTAAGGGGCCATGCTAATCTCTGTATCGTTGCAATTTTAGCAT	21642

AL845353.7	1501	AACATATGTACTCCCCAAGCGAGCGCCACAACCAGCTGTTAACTATGCAA	1550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX248507.3	21643	AACATATGTACTCCCCAAGCGAGCGCCACAACCAGCTGTTAACTATGCAA	21692

AL845353.7	1551	GTGGTGACTAAATCTGTGTTGCTCTGGAATGTCCTTGGGGAAATTAGGGA	1600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX248507.3	21693	GTGGTGACTAAATCTGTGTTGCTCTGGAATGTCCTTGGGGAAATTAGGGA	21742

AL845353.7	1601	TCCCAATTTCTACCAACCTTGCTATTTCTCAATAAGGTCAGGATATATTC	1650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX248507.3	21743	TCCCAATTTCTACCAACCTTGCTATTTCTCAATAAGGTCAGGATATATTC	21792

AL845353.7	1651	TTACGACCTGAGGACAGTTTCTCAGCTCTCTTTATTAAATCAGTTTCTTA	1700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX248507.3	21793	TTACGACCTGAGGACAGTTTCTCAGCTCTCTTTATTAAATCAGTTTCTTA	21842

AL845353.7	1701	TCGGAGTTATGAGAGCTTAACTCCGTCCTTTGAATTGAGGTTTCCCTCCA	1750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX248507.3	21843	TCGGAGTTATGAGAGCTTAACTCCGTCCTTTGAATTGAGGTTTCCCTCCA	21892

AL845353.7	1751	GTCTTGTGTACTCACCTCTCTGGAGGTTCTTGGTGGGGCACGGTGAGATA	1800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX248507.3	21893	GTCTTGTGTACTCACCTCTCTGGAGGTTCTTGGTGGGGCACGGTGAGATA	21942

AL845353.7	1801	GGAAGGCTTGCCCAGCTGCCACTCCCTAAAGTGGGACTGAAGAGTGGTGA	1850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX248507.3	21943	GGAAGGCTTGCCCAGCTGCCACTCCCTAAAGTGGGACTGAAGAGTGGTGA	21992

AL845353.7	1851	CAGAGGTCAACACAGAAATAATAACAGCCTTGGTAGCTTTAAAACTAGCG	1900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX248507.3	21993	CAGAGGTCAACACAGAAATAATAACAGCCTTGGTAGCTTTAAAACTAGCG	22042

AL845353.7	1901	TTAGGACTCAAGTTTGTTCTGCCCTGTAGAATGTTGACCTTCAGCTTTTA	1950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX248507.3	22043	TTAGGACTCAAGTTTGTTCTGCCCTGTAGAATGTTGACCTTCAGCTTTTA	22092

AL845353.7	1951	TGAAAATGGGCAACTCAGTGACTTCATTGGATTGATTTGGAGACTCACCT	2000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX248507.3	22093	TGAAAATGGGCAACTCAGTGACTTCATTGGATTGATTTGGAGACTCACCT	22142

Overview

Query
AL845353.7 - 130755 bps
Hit
BX248507.3 - 22142 bps
Total alignments
1
Best alignment
alignment #1 (HSP: 2000 bps)
Best alignment cartoon

Alternate alignments

Short-link