<=>End overlap alignment

Alignment #1 HSP: 2000 bps / non-identical: 0 bps

Full alignment

BX957229.8	1	ATTATGTGTTATACCATGTAAAACGGGATCATTAAAGGAACATTCAAAAA	50
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX248397.8	158939	ATTATGTGTTATACCATGTAAAACGGGATCATTAAAGGAACATTCAAAAA	158988

BX957229.8	51	GCAACTCATGTAAACACCTTAATTGCCTTGTCTTAATTAAATCAAGGCAA	100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX248397.8	158989	GCAACTCATGTAAACACCTTAATTGCCTTGTCTTAATTAAATCAAGGCAA	159038

BX957229.8	101	ATATTTTGATTGCTGATGTCCATGTAAACATAGTCAGTGAGAGGTCTGAA	150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX248397.8	159039	ATATTTTGATTGCTGATGTCCATGTAAACATAGTCAGTGAGAGGTCTGAA	159088

BX957229.8	151	GCAAAGAATCTGATGCTTGCTCCGCAGACGCTACTGGTATATCTCACTTA	200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX248397.8	159089	GCAAAGAATCTGATGCTTGCTCCGCAGACGCTACTGGTATATCTCACTTA	159138

BX957229.8	201	TGACTAATCACTCGCACCTGCAGAGCCGAGCTCTGCTCACTCATTTGGCA	250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX248397.8	159139	TGACTAATCACTCGCACCTGCAGAGCCGAGCTCTGCTCACTCATTTGGCA	159188

BX957229.8	251	TTCATTGGCCCTTTTTCTTTCTTCTCAGAGTGATTGATCATCTAGCCAGA	300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX248397.8	159189	TTCATTGGCCCTTTTTCTTTCTTCTCAGAGTGATTGATCATCTAGCCAGA	159238

BX957229.8	301	CGCACGTTGGAGTTCCCATGAAGGGGAACTTCTAAGCAGCTCCTCATTTG	350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX248397.8	159239	CGCACGTTGGAGTTCCCATGAAGGGGAACTTCTAAGCAGCTCCTCATTTG	159288

BX957229.8	351	TTTTGGTGGTTGGCAAAAGAGAAACGCCATATCCAAACAGAGGTTGGCCC	400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX248397.8	159289	TTTTGGTGGTTGGCAAAAGAGAAACGCCATATCCAAACAGAGGTTGGCCC	159338

BX957229.8	401	AATAGATTGTGGATTCAATCACCCTTGCATTCTAAACTCAGGGGAAGCCA	450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX248397.8	159339	AATAGATTGTGGATTCAATCACCCTTGCATTCTAAACTCAGGGGAAGCCA	159388

BX957229.8	451	TGTCCCCAGGGGTGAGAGTGCACTCAACAAGGAGTGTAGTCTTCTTCTGA	500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX248397.8	159389	TGTCCCCAGGGGTGAGAGTGCACTCAACAAGGAGTGTAGTCTTCTTCTGA	159438

BX957229.8	501	GCATTAGCACACAGTACTTCAATTCATTGGCAGTTTTCATACATTTTAGT	550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX248397.8	159439	GCATTAGCACACAGTACTTCAATTCATTGGCAGTTTTCATACATTTTAGT	159488

BX957229.8	551	GATTGGTCTTCTAAGTGAACCCCAATACTGTCATTCTGACATAACGTCTT	600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX248397.8	159489	GATTGGTCTTCTAAGTGAACCCCAATACTGTCATTCTGACATAACGTCTT	159538

BX957229.8	601	CATTCCCTCTTTTGGGGAACAAGGGTACATCCGCTACCGGAATGTTTTAA	650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX248397.8	159539	CATTCCCTCTTTTGGGGAACAAGGGTACATCCGCTACCGGAATGTTTTAA	159588

BX957229.8	651	AAACTATTAATCAAATCATAGGTGTATGACTGACACATATTACATTTAAT	700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX248397.8	159589	AAACTATTAATCAAATCATAGGTGTATGACTGACACATATTACATTTAAT	159638

BX957229.8	701	ATTTACAATGGATGGACAATAAAACTGAAACACTGGTCAACTTAGTGTTG	750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX248397.8	159639	ATTTACAATGGATGGACAATAAAACTGAAACACTGGTCAACTTAGTGTTG	159688

BX957229.8	751	GAGGTTTGATGGCTAAATTTGACCAGCCATTGATTGAAAATTCCACTAGT	800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX248397.8	159689	GAGGTTTGATGGCTAAATTTGACCAGCCATTGATTGAAAATTCCACTAGT	159738

BX957229.8	801	AGGAGCAAAGTGTGAAGGTTTAATCAGCGGAGTAATAGAATTGTTTTGCT	850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX248397.8	159739	AGGAGCAAAGTGTGAAGGTTTAATCAGCGGAGTAATAGAATTGTTTTGCT	159788

BX957229.8	851	CTAAATATTGCAATGCAAAGAGCATTAAAAGTAAAATATCAGCGTTCAAA	900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX248397.8	159789	CTAAATATTGCAATGCAAAGAGCATTAAAAGTAAAATATCAGCGTTCAAA	159838

BX957229.8	901	AGAGGACACATTGTTGGTGCGTCTCGATGTGACCAAGACACCAAGTCTTG	950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX248397.8	159839	AGAGGACACATTGTTGGTGCGTCTCGATGTGACCAAGACACCAAGTCTTG	159888

BX957229.8	951	TGATGTATCAAGAGCCCACTATTCGGCAAGAAAGTTTGGCTAAAAATACT	1000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX248397.8	159889	TGATGTATCAAGAGCCCACTATTCGGCAAGAAAGTTTGGCTAAAAATACT	159938

BX957229.8	1001	TCTGGCCACTGTGTTGTATCTGTCATTTTATGCTGTCAAAATTAATGCTG	1050
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX248397.8	159939	TCTGGCCACTGTGTTGTATCTGTCATTTTATGCTGTCAAAATTAATGCTG	159988

BX957229.8	1051	TATTGGCTGCAAAAGGAGGTCCTATACTTTGAAATACACTGCCCGAATAA	1100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX248397.8	159989	TATTGGCTGCAAAAGGAGGTCCTATACTTTGAAATACACTGCCCGAATAA	160038

BX957229.8	1101	TAAATTATTGTGGTTTAAATCCTTTGCTTTAAAAGCAAAGGGATTTGCTC	1150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX248397.8	160039	TAAATTATTGTGGTTTAAATCCTTTGCTTTAAAAGCAAAGGGATTTGCTC	160088

BX957229.8	1151	CCTTTTTAAGTCAAGTGAAATATTAAAAAGACACATCTTTTTGCCCATAA	1200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX248397.8	160089	CCTTTTTAAGTCAAGTGAAATATTAAAAAGACACATCTTTTTGCCCATAA	160138

BX957229.8	1201	TGTCAACTATCATTTCACAAGACCATGGATGTCCGACCATGGTGTATTAC	1250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX248397.8	160139	TGTCAACTATCATTTCACAAGACCATGGATGTCCGACCATGGTGTATTAC	160188

BX957229.8	1251	TGTCCGGATCCTACCTTTTCTCATTATTAAATTCAATTGCACTTTATTGG	1300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX248397.8	160189	TGTCCGGATCCTACCTTTTCTCATTATTAAATTCAATTGCACTTTATTGG	160238

BX957229.8	1301	TCAATAAACAACAATGCTGTGCACTACCCTATGTCTGTTGTATTTGGAGT	1350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX248397.8	160239	TCAATAAACAACAATGCTGTGCACTACCCTATGTCTGTTGTATTTGGAGT	160288

BX957229.8	1351	ATCATGACAATTCTATTGTGATATATAAAACAATGAACATGGCCTGATTT	1400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX248397.8	160289	ATCATGACAATTCTATTGTGATATATAAAACAATGAACATGGCCTGATTT	160338

BX957229.8	1401	TTTATCATCAATAATTTATGTAAGTCTTCTTCTTTATCACCCCTGTGTAT	1450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX248397.8	160339	TTTATCATCAATAATTTATGTAAGTCTTCTTCTTTATCACCCCTGTGTAT	160388

BX957229.8	1451	TTCAGGCATCTAATTACATGTTTTGTCTTCTAAATAGGTTTGTTGTTGAT	1500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX248397.8	160389	TTCAGGCATCTAATTACATGTTTTGTCTTCTAAATAGGTTTGTTGTTGAT	160438

BX957229.8	1501	TTAAGTAAAGGCCCAGACATTGCATGTCATGTAAACGTTAGCTTCAGTGA	1550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX248397.8	160439	TTAAGTAAAGGCCCAGACATTGCATGTCATGTAAACGTTAGCTTCAGTGA	160488

BX957229.8	1551	AGATGGAAATCCAAGGATTGGGTGTAACAGTCTGATTGGATCCATCTGGG	1600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX248397.8	160489	AGATGGAAATCCAAGGATTGGGTGTAACAGTCTGATTGGATCCATCTGGG	160538

BX957229.8	1601	GCAAAGAAGAGCGTGGGGTTTCCTCCTTCCATTTTTTCAGAGGAATGCCT	1650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX248397.8	160539	GCAAAGAAGAGCGTGGGGTTTCCTCCTTCCATTTTTTCAGAGGAATGCCT	160588

BX957229.8	1651	TTTGAGGTGAGTATGACACCAAACATTTCTTTTATTTTATATTTCACTAG	1700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX248397.8	160589	TTTGAGGTGAGTATGACACCAAACATTTCTTTTATTTTATATTTCACTAG	160638

BX957229.8	1701	TTTTATTTTGACCCAAAAGTGAAAAGTCTGTAATTAATCACTCACCCGTA	1750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX248397.8	160639	TTTTATTTTGACCCAAAAGTGAAAAGTCTGTAATTAATCACTCACCCGTA	160688

BX957229.8	1751	TGTCTTCCAATGCTGAGATCTTCATTCCTATTTATAACACAAATTAAGAT	1800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX248397.8	160689	TGTCTTCCAATGCTGAGATCTTCATTCCTATTTATAACACAAATTAAGAT	160738

BX957229.8	1801	ATTTTGTATGAAATTCGAAAGCTCCCTCAAGTTCAGAAAAGGAGCCAAAC	1850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX248397.8	160739	ATTTTGTATGAAATTCGAAAGCTCCCTCAAGTTCAGAAAAGGAGCCAAAC	160788

BX957229.8	1851	ATTGTCAAAACAATCCTTGTAACTTCAGTGGTTCAACTGTAATCATACAA	1900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX248397.8	160789	ATTGTCAAAACAATCCTTGTAACTTCAGTGGTTCAACTGTAATCATACAA	160838

BX957229.8	1901	AGCTCACACACTTGAGCACTTTTGTGCAACAAACACAATTACTATGGGAA	1950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX248397.8	160839	AGCTCACACACTTGAGCACTTTTGTGCAACAAACACAATTACTATGGGAA	160888

BX957229.8	1951	ACAATATCAGATAGCTGGATGTCAGTGTGGAAACAGAGGTAAAAGAATTC	2000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX248397.8	160889	ACAATATCAGATAGCTGGATGTCAGTGTGGAAACAGAGGTAAAAGAATTC	160938

Overview

Query
BX957229.8 - 3994 bps
Hit
BX248397.8 - 160938 bps
Total alignments
1
Best alignment
alignment #1 (HSP: 2000 bps)
Best alignment cartoon

Alternate alignments

#%IDscoreHSPstartendstrandhstarthendhstrand
1100195520001200011589391609381
Short-link