<=>End overlap alignment

Alignment #1 HSP: 2000 bps / non-identical: 0 bps

Full alignment

BX247900.8	1	GAGACCAGCCTGGCCAACATGGTGAAACCCCGTCTCTACTAAATAAATAC	50
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX248321.5	27118	GAGACCAGCCTGGCCAACATGGTGAAACCCCGTCTCTACTAAATAAATAC	27167

BX247900.8	51	AAAAATCAGCCAGGAGTGGTGGCGAGTGCCTATAATCCCAGCTACTCGGG	100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX248321.5	27168	AAAAATCAGCCAGGAGTGGTGGCGAGTGCCTATAATCCCAGCTACTCGGG	27217

BX247900.8	101	ATGCTGAGGCAGGAGAATCGGTTGAATCTGGGAGGTGGAGGTTGCAGTGA	150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX248321.5	27218	ATGCTGAGGCAGGAGAATCGGTTGAATCTGGGAGGTGGAGGTTGCAGTGA	27267

BX247900.8	151	GCCGAGATTGTGCCACTGCACTCCAGCCTGGGCGACAGAGGAAGACTCTG	200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX248321.5	27268	GCCGAGATTGTGCCACTGCACTCCAGCCTGGGCGACAGAGGAAGACTCTG	27317

BX247900.8	201	TCTCAAAAAAAAAAAAAAGGTCATCATTTAATCCTCAGAAAATATCTTGG	250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX248321.5	27318	TCTCAAAAAAAAAAAAAAGGTCATCATTTAATCCTCAGAAAATATCTTGG	27367

BX247900.8	251	TGACCTTGAGGTAGGCAAAGATACTTAGATACTTAAGCAAGACACAAAAA	300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX248321.5	27368	TGACCTTGAGGTAGGCAAAGATACTTAGATACTTAAGCAAGACACAAAAA	27417

BX247900.8	301	GCACTAGCTATTAAAAGAAAGTGTGATGATTTGGACTTCATTAAAGCCTA	350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX248321.5	27418	GCACTAGCTATTAAAAGAAAGTGTGATGATTTGGACTTCATTAAAGCCTA	27467

BX247900.8	351	GTATCAGCATATACCTTTAAGAGGTATATTCTTAACTATAAAAGGAAAGT	400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX248321.5	27468	GTATCAGCATATACCTTTAAGAGGTATATTCTTAACTATAAAAGGAAAGT	27517

BX247900.8	401	CAAAGATGGGAGAAGATATTGCAACACATATAGCTAACAAACGACTCATA	450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX248321.5	27518	CAAAGATGGGAGAAGATATTGCAACACATATAGCTAACAAACGACTCATA	27567

BX247900.8	451	TCCAGAATGCAGAAAGAGCTACAATAAGAAAAAGATGATGCAATTTTAAA	500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX248321.5	27568	TCCAGAATGCAGAAAGAGCTACAATAAGAAAAAGATGATGCAATTTTAAA	27617

BX247900.8	501	TTGGGCAAAATATTTGATAAATAGTTAGCAAAAGAGGATATCAAAACAGC	550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX248321.5	27618	TTGGGCAAAATATTTGATAAATAGTTAGCAAAAGAGGATATCAAAACAGC	27667

BX247900.8	551	CGGTGAACATTTGAAAAGGTACCCAATATCACTGCTTATCAGAAGTGGAA	600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX248321.5	27668	CGGTGAACATTTGAAAAGGTACCCAATATCACTGCTTATCAGAAGTGGAA	27717

BX247900.8	601	TGTAAAACCGCAATGAGATACCACTACATACACACACTGTAATGACTAGC	650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX248321.5	27718	TGTAAAACCGCAATGAGATACCACTACATACACACACTGTAATGACTAGC	27767

BX247900.8	651	ATTTGAAAGACTGCCAGTACCAAGTATTGGAAAGGACATTGAACAACTGG	700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX248321.5	27768	ATTTGAAAGACTGCCAGTACCAAGTATTGGAAAGGACATTGAACAACTGG	27817

BX247900.8	701	AACTCTCACACATTGTTAGTGGGAGTGTAAATTGATACAATTATCTTGGG	750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX248321.5	27818	AACTCTCACACATTGTTAGTGGGAGTGTAAATTGATACAATTATCTTGGG	27867

BX247900.8	751	AAAATGTTTGGCAATGCTAAAATTAAACACATACCCTATGACTCGGTACT	800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX248321.5	27868	AAAATGTTTGGCAATGCTAAAATTAAACACATACCCTATGACTCGGTACT	27917

BX247900.8	801	TCCACTCCTGAGAGTAAATATCCAGCAGAAATGAATACCTGTGTCCACCA	850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX248321.5	27918	TCCACTCCTGAGAGTAAATATCCAGCAGAAATGAATACCTGTGTCCACCA	27967

BX247900.8	851	AAAGACATGTACCATGCCAGCTTCATTCATACCACTGCAGGGTGGAAATT	900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX248321.5	27968	AAAGACATGTACCATGCCAGCTTCATTCATACCACTGCAGGGTGGAAATT	28017

BX247900.8	901	TAACCCCAAAGTCCACTAACATTAGAACAGGTAAGTAAATTGTGACATAT	950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX248321.5	28018	TAACCCCAAAGTCCACTAACATTAGAACAGGTAAGTAAATTGTGACATAT	28067

BX247900.8	951	TCATGCAGTGGAATGCTACCCAGTAGTGAAAAAAAAAACCTATGAAATCA	1000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX248321.5	28068	TCATGCAGTGGAATGCTACCCAGTAGTGAAAAAAAAAACCTATGAAATCA	28117

BX247900.8	1001	CACAATAACATTAATGAATCTCATAGTCAGTGTTGAGTAAAAGAAGTCAA	1050
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX248321.5	28118	CACAATAACATTAATGAATCTCATAGTCAGTGTTGAGTAAAAGAAGTCAA	28167

BX247900.8	1051	AACAAAAGTGTACCTACTGTATAATTCCATTCACATGCAGTTCAAGGCCA	1100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX248321.5	28168	AACAAAAGTGTACCTACTGTATAATTCCATTCACATGCAGTTCAAGGCCA	28217

BX247900.8	1101	TGTGACATTAACCTGTTGTAATAAAGGTCAGAGTTGAGGATGCCTTGGGG	1150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX248321.5	28218	TGTGACATTAACCTGTTGTAATAAAGGTCAGAGTTGAGGATGCCTTGGGG	28267

BX247900.8	1151	GAAAAGGCTGACCGGGAGAAGGCATGAGAAAGCCTTCTTGCAGGGGCAGA	1200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX248321.5	28268	GAAAAGGCTGACCGGGAGAAGGCATGAGAAAGCCTTCTTGCAGGGGCAGA	28317

BX247900.8	1201	CAGGGGAAGCTGAGAATGTTCTGTGTATGATCTGGGTGGTGATTACAAGG	1250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX248321.5	28318	CAGGGGAAGCTGAGAATGTTCTGTGTATGATCTGGGTGGTGATTACAAGG	28367

BX247900.8	1251	GTGTATAGATATGTAAAACTTCATTAAAATGTGCACATGAGATCTGTGCA	1300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX248321.5	28368	GTGTATAGATATGTAAAACTTCATTAAAATGTGCACATGAGATCTGTGCA	28417

BX247900.8	1301	CTTTATGGTATGTAAGTTATGTCTCAATTTGAAAAATGAAAAAGATATTC	1350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX248321.5	28418	CTTTATGGTATGTAAGTTATGTCTCAATTTGAAAAATGAAAAAGATATTC	28467

BX247900.8	1351	TGAGGCTATTTTCTCAGCATATTATGATTTCCTTGGTCAGAGAATGTGGT	1400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX248321.5	28468	TGAGGCTATTTTCTCAGCATATTATGATTTCCTTGGTCAGAGAATGTGGT	28517

BX247900.8	1401	TGGAGACACATGACGATAAATGAGGCATTTGGTAAGCCCAAAGACAGTGG	1450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX248321.5	28518	TGGAGACACATGACGATAAATGAGGCATTTGGTAAGCCCAAAGACAGTGG	28567

BX247900.8	1451	TGCTGCAGGAAGCATTGTGTGCAAGGGAGGCAAGCAGCTATTTTCAATGA	1500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX248321.5	28568	TGCTGCAGGAAGCATTGTGTGCAAGGGAGGCAAGCAGCTATTTTCAATGA	28617

BX247900.8	1501	GGACAAATCACCTCTCTCTTTAGGTTGAAATAGGTCTGATATAATTAATC	1550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX248321.5	28618	GGACAAATCACCTCTCTCTTTAGGTTGAAATAGGTCTGATATAATTAATC	28667

BX247900.8	1551	TGCCATTCTCTCTGGAGAATGGTGCCACATAACGGGGCCAACACTGATCT	1600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX248321.5	28668	TGCCATTCTCTCTGGAGAATGGTGCCACATAACGGGGCCAACACTGATCT	28717

BX247900.8	1601	CTGCTGTTAGCAGTTGAGGCACTCAGCCATGGATTATCTGTCCAGCTTGG	1650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX248321.5	28718	CTGCTGTTAGCAGTTGAGGCACTCAGCCATGGATTATCTGTCCAGCTTGG	28767

BX247900.8	1651	CCTTGGTGAGGGGAAGGCCAGCTCACTGAGCCTTGCATACGCTTCATCCC	1700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX248321.5	28768	CCTTGGTGAGGGGAAGGCCAGCTCACTGAGCCTTGCATACGCTTCATCCC	28817

BX247900.8	1701	TGCCAGCCTGTCTGCTTTGTCCATGTCCCTGCTGAGCGAGCACTAGAGCA	1750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX248321.5	28818	TGCCAGCCTGTCTGCTTTGTCCATGTCCCTGCTGAGCGAGCACTAGAGCA	28867

BX247900.8	1751	GCTGGAAAAAGAGATTGACTGACGTCTGCAGAATGGATCGCTTGGTCAAC	1800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX248321.5	28868	GCTGGAAAAAGAGATTGACTGACGTCTGCAGAATGGATCGCTTGGTCAAC	28917

BX247900.8	1801	CTCATCATGGAAGATTTCCTCTGTAGTGAACGCCCATTGGTGAACAGTCA	1850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX248321.5	28918	CTCATCATGGAAGATTTCCTCTGTAGTGAACGCCCATTGGTGAACAGTCA	28967

BX247900.8	1851	CATGGGATGCACATACTCTCACCATCTGTGCCCTTCCCAAGAGACTCGTC	1900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX248321.5	28968	CATGGGATGCACATACTCTCACCATCTGTGCCCTTCCCAAGAGACTCGTC	29017

BX247900.8	1901	CACCTTCCTCTTTCCCAGACTTCCTTGTCATCAATTCACCATGTCTTTCC	1950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX248321.5	29018	CACCTTCCTCTTTCCCAGACTTCCTTGTCATCAATTCACCATGTCTTTCC	29067

BX247900.8	1951	TCACCCTGAGTTATCTAGCCAAACTGTTAGCCACTGCCTATTGATCAGGG	2000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX248321.5	29068	TCACCCTGAGTTATCTAGCCAAACTGTTAGCCACTGCCTATTGATCAGGG	29117

Overview

Query
BX247900.8 - 75621 bps
Hit
BX248321.5 - 29117 bps
Total alignments
1
Best alignment
alignment #1 (HSP: 2000 bps)
Best alignment cartoon

Alternate alignments

Short-link