<=>End overlap alignment

Alignment #1 HSP: 2000 bps / non-identical: 0 bps

Full alignment

BX119958.10	1	GGCCCCTAGGCTTCTAAGGGGCACTCTCCTCCTGCTAGTGCCAAGCTAAG	50
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX248310.3	114321	GGCCCCTAGGCTTCTAAGGGGCACTCTCCTCCTGCTAGTGCCAAGCTAAG	114370

BX119958.10	51	CTGTGGGGAGCAGCATGCCTCTGCATGCTGCCTGACAAACTGCAGCCCCA	100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX248310.3	114371	CTGTGGGGAGCAGCATGCCTCTGCATGCTGCCTGACAAACTGCAGCCCCA	114420

BX119958.10	101	GCCCCTGCCACAGACACCCTGGCCTGTACCCTAGTGCTTTGTATGGCTGT	150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX248310.3	114421	GCCCCTGCCACAGACACCCTGGCCTGTACCCTAGTGCTTTGTATGGCTGT	114470

BX119958.10	151	GGCTATTCAGCCGCTACTTCTGATCCCCTAGGACTGGGAGCAGCCTGCCT	200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX248310.3	114471	GGCTATTCAGCCGCTACTTCTGATCCCCTAGGACTGGGAGCAGCCTGCCT	114520

BX119958.10	201	GGGGGAGACCATCAGGATGTCTATGGAAGGCTGCTTCATGCTACAAGGGC	250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX248310.3	114521	GGGGGAGACCATCAGGATGTCTATGGAAGGCTGCTTCATGCTACAAGGGC	114570

BX119958.10	251	AGAGTTAAGTCTTTGGTATAGAGACTGGTTGGCAAAGTTGAAAATGTTGC	300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX248310.3	114571	AGAGTTAAGTCTTTGGTATAGAGACTGGTTGGCAAAGTTGAAAATGTTGC	114620

BX119958.10	301	CTCAGGTCCTTTTGGGGATTATTTACCAGCCCCTGGTTTGAGTGTTGTCT	350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX248310.3	114621	CTCAGGTCCTTTTGGGGATTATTTACCAGCCCCTGGTTTGAGTGTTGTCT	114670

BX119958.10	351	GGCAGGACCCAGGCTCTGGGAGCTGATCCTCCCTCACTCAAGGCCTGCTG	400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX248310.3	114671	GGCAGGACCCAGGCTCTGGGAGCTGATCCTCCCTCACTCAAGGCCTGCTG	114720

BX119958.10	401	CAGCCTCCCGCTGAGGTCTTGAAACCATCAGGAGCAGTTGTTCTTTGGCC	450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX248310.3	114721	CAGCCTCCCGCTGAGGTCTTGAAACCATCAGGAGCAGTTGTTCTTTGGCC	114770

BX119958.10	451	TCCGGGACACCGCAGGGCTGAGTTGCTCCCTGCCTGGAGGTGGTCCCATG	500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX248310.3	114771	TCCGGGACACCGCAGGGCTGAGTTGCTCCCTGCCTGGAGGTGGTCCCATG	114820

BX119958.10	501	GGGCCCACTGTCTGGGTCAAGAATGGTGCAGAGCTGGTGTCCTCAAAATG	550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX248310.3	114821	GGGCCCACTGTCTGGGTCAAGAATGGTGCAGAGCTGGTGTCCTCAAAATG	114870

BX119958.10	551	CATCCTGGTGGAGCCCCAGCAGCTGCAGGTGCTGACTGCCTCTCACGAGG	600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX248310.3	114871	CATCCTGGTGGAGCCCCAGCAGCTGCAGGTGCTGACTGCCTCTCACGAGG	114920

BX119958.10	601	ACCCTGGGGGCCTGCAGCTGCAGCGACTCACCCAGCATGAGCGGTGCCAC	650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX248310.3	114921	ACCCTGGGGGCCTGCAGCTGCAGCGACTCACCCAGCATGAGCGGTGCCAC	114970

BX119958.10	651	TCAGTGTGCACATGACAGATGCTCCATCCTCAGGAGATGACAAAGACGTG	700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX248310.3	114971	TCAGTGTGCACATGACAGATGCTCCATCCTCAGGAGATGACAAAGACGTG	115020

BX119958.10	701	GAGGACAAGGCTGAAGACACAAGTGCATAATCTCCTACTCACCTCATCTG	750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX248310.3	115021	GAGGACAAGGCTGAAGACACAAGTGCATAATCTCCTACTCACCTCATCTG	115070

BX119958.10	751	GCACATTAGAAACCTGTCCTCGGCTCATGCACAAATCCACCTCTGGGTGG	800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX248310.3	115071	GCACATTAGAAACCTGTCCTCGGCTCATGCACAAATCCACCTCTGGGTGG	115120

BX119958.10	801	CCAAAGGCTCCAGCTTACTACAGAGGCCATGTGTACTCTGTGTAATCAAC	850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX248310.3	115121	CCAAAGGCTCCAGCTTACTACAGAGGCCATGTGTACTCTGTGTAATCAAC	115170

BX119958.10	851	ACACCCCAGCTTCTTCCCACCTCCAGTCATCTCACTGTATCTGACATGAT	900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX248310.3	115171	ACACCCCAGCTTCTTCCCACCTCCAGTCATCTCACTGTATCTGACATGAT	115220

BX119958.10	901	GCCAGCAGATTGTCTCAGCTCAAATTCCAGCTCCATTACTTACTGCTGTG	950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX248310.3	115221	GCCAGCAGATTGTCTCAGCTCAAATTCCAGCTCCATTACTTACTGCTGTG	115270

BX119958.10	951	TGACCTTGACCAAGTCACTTAACCTCTCTGTGCTTCACGAGCTTCCATTG	1000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX248310.3	115271	TGACCTTGACCAAGTCACTTAACCTCTCTGTGCTTCACGAGCTTCCATTG	115320

BX119958.10	1001	TAAATGCGTGTGTTTACATATGCCAAGTACCCAGAAAGATGCCTGGAACA	1050
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX248310.3	115321	TAAATGCGTGTGTTTACATATGCCAAGTACCCAGAAAGATGCCTGGAACA	115370

BX119958.10	1051	TGGCAACACCCACCACAGAAGTAGTAGCTGCAATTATTGCCTCATTAAAA	1100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX248310.3	115371	TGGCAACACCCACCACAGAAGTAGTAGCTGCAATTATTGCCTCATTAAAA	115420

BX119958.10	1101	CAGTGGAGATGTCACCCATCAGGGCTAGAGAGAATTTGGGAAATCCTGAT	1150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX248310.3	115421	CAGTGGAGATGTCACCCATCAGGGCTAGAGAGAATTTGGGAAATCCTGAT	115470

BX119958.10	1151	CTGCTTCTGGTTTCAGGTGGGGAAACCTGTAGGACCAGCAGGAACACGGC	1200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX248310.3	115471	CTGCTTCTGGTTTCAGGTGGGGAAACCTGTAGGACCAGCAGGAACACGGC	115520

BX119958.10	1201	TGCCTCAGTGCAGCTGGCACAGGGCACTGCCAGCCCAGAGCAACTCAGAG	1250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX248310.3	115521	TGCCTCAGTGCAGCTGGCACAGGGCACTGCCAGCCCAGAGCAACTCAGAG	115570

BX119958.10	1251	CTCAGAACACTCTGGGGTCCGAAGTCCGAACTGCTGGGGCTCAACTGTGG	1300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX248310.3	115571	CTCAGAACACTCTGGGGTCCGAAGTCCGAACTGCTGGGGCTCAACTGTGG	115620

BX119958.10	1301	CGTCAGTTATGGAATGTGGACCCCTCCCTAGGGAGTCTCCCGGGCTCAAA	1350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX248310.3	115621	CGTCAGTTATGGAATGTGGACCCCTCCCTAGGGAGTCTCCCGGGCTCAAA	115670

BX119958.10	1351	GTCTTCCCTCAACTCCAGAAATTCAAACCCAACACTGACCTCACGGAGAA	1400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX248310.3	115671	GTCTTCCCTCAACTCCAGAAATTCAAACCCAACACTGACCTCACGGAGAA	115720

BX119958.10	1401	GTTCTGAAGGTTAAGGAGGAGACACGTGAAAAGTGCCTGGTGGACACCAG	1450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX248310.3	115721	GTTCTGAAGGTTAAGGAGGAGACACGTGAAAAGTGCCTGGTGGACACCAG	115770

BX119958.10	1451	GGATGCCAGTGAGATGGGGGACAATGGTGAGGCAGAGTGGAGGGGCAGGT	1500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX248310.3	115771	GGATGCCAGTGAGATGGGGGACAATGGTGAGGCAGAGTGGAGGGGCAGGT	115820

BX119958.10	1501	GCCCCCTCCTCAGTATGTCTCCCCCAGGTACTGTGAGGACAGGTGGAGGC	1550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX248310.3	115821	GCCCCCTCCTCAGTATGTCTCCCCCAGGTACTGTGAGGACAGGTGGAGGC	115870

BX119958.10	1551	TGTCTCCAGGCTCTCACCCGGCCACACACCAGCACGTCTCCAGGTTCCTC	1600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX248310.3	115871	TGTCTCCAGGCTCTCACCCGGCCACACACCAGCACGTCTCCAGGTTCCTC	115920

BX119958.10	1601	TCAGCCCCGGTTACCCCCAGCCCTGCAGTTAATCCCTGAGCTGGGAAGGA	1650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX248310.3	115921	TCAGCCCCGGTTACCCCCAGCCCTGCAGTTAATCCCTGAGCTGGGAAGGA	115970

BX119958.10	1651	GCCCTTGAATCCACCCTGTCCTGTGTCACAGTGTCGTCCACTCGGGCTCA	1700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX248310.3	115971	GCCCTTGAATCCACCCTGTCCTGTGTCACAGTGTCGTCCACTCGGGCTCA	116020

BX119958.10	1701	CATTGCCACTAGGCCACTTGGCAGCCAAGGGATGGGGCCACGTTTTGTAC	1750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX248310.3	116021	CATTGCCACTAGGCCACTTGGCAGCCAAGGGATGGGGCCACGTTTTGTAC	116070

BX119958.10	1751	TTCCTGAAACATGGCTTCACCTTCAAGTGCGGGTGATGACAGTGCCACAC	1800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX248310.3	116071	TTCCTGAAACATGGCTTCACCTTCAAGTGCGGGTGATGACAGTGCCACAC	116120

BX119958.10	1801	AGAACAAATGTTACTGTCTATCCTCATCGACCGTAATTTTCCAGTTTTCC	1850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX248310.3	116121	AGAACAAATGTTACTGTCTATCCTCATCGACCGTAATTTTCCAGTTTTCC	116170

BX119958.10	1851	AACCCTCAGGGAGCAAGGAAGAGCATGGCTTCCACCAAAGGGCGTGAGGT	1900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX248310.3	116171	AACCCTCAGGGAGCAAGGAAGAGCATGGCTTCCACCAAAGGGCGTGAGGT	116220

BX119958.10	1901	CAGCAGTCTTAGGGGCAACCAACAGGCAAAGACCCCTGAAAATAGACCCC	1950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX248310.3	116221	CAGCAGTCTTAGGGGCAACCAACAGGCAAAGACCCCTGAAAATAGACCCC	116270

BX119958.10	1951	GCAGGGAAGCACAAGTATTCACTGACGGTGGGAACCCCACAGATCTGGCC	2000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX248310.3	116271	GCAGGGAAGCACAAGTATTCACTGACGGTGGGAACCCCACAGATCTGGCC	116320

Overview

Query
BX119958.10 - 38592 bps
Hit
BX248310.3 - 116320 bps
Total alignments
1
Best alignment
alignment #1 (HSP: 2000 bps)
Best alignment cartoon

Alternate alignments

Short-link