<=>End overlap alignment

Alignment #1 HSP: 2000 bps / non-identical: 0 bps

Full alignment

BX511262.7	1	GGCCGACGCTGGGGGCCCGCCTCCTTAGCCAATCGGGGTCCTAGTGCCCT	50
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX248305.13	14686	GGCCGACGCTGGGGGCCCGCCTCCTTAGCCAATCGGGGTCCTAGTGCCCT	14735

BX511262.7	51	TAAGTCCCTCCTCTTTATGCAAATAACCTCCGCATGCTCCGCGCGCCCGG	100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX248305.13	14736	TAAGTCCCTCCTCTTTATGCAAATAACCTCCGCATGCTCCGCGCGCCCGG	14785

BX511262.7	101	CCCTTTTTTTTTTTTTTTTTAAACTAAAGACAGCCCTGGAAGTAGAGGGT	150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX248305.13	14786	CCCTTTTTTTTTTTTTTTTTAAACTAAAGACAGCCCTGGAAGTAGAGGGT	14835

BX511262.7	151	TAGGGTAGAAAGTGCCCCGCCCTTTATGCAAATTAAGGGGCGTGTCTAGG	200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX248305.13	14836	TAGGGTAGAAAGTGCCCCGCCCTTTATGCAAATTAAGGGGCGTGTCTAGG	14885

BX511262.7	201	CGCGGAGGGAGGTGGGAGGTGGGAGGGGGTGCTCCCGGGGGCGGCGGTTG	250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX248305.13	14886	CGCGGAGGGAGGTGGGAGGTGGGAGGGGGTGCTCCCGGGGGCGGCGGTTG	14935

BX511262.7	251	CCCGGATGGGCCGTTAGTCGGGGCTCAGCCGCGGAGTGAGCGAGGGAGAC	300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX248305.13	14936	CCCGGATGGGCCGTTAGTCGGGGCTCAGCCGCGGAGTGAGCGAGGGAGAC	14985

BX511262.7	301	GGGAGGAGCCGAACCCGGCGCCATCCGCCGCCATCCTCCCCCGCCCCACC	350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX248305.13	14986	GGGAGGAGCCGAACCCGGCGCCATCCGCCGCCATCCTCCCCCGCCCCACC	15035

BX511262.7	351	GCCATCCCGTCCCGGGGAGCCCCTAGGCCCGGGTCCCGGATCCCCGCGCA	400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX248305.13	15036	GCCATCCCGTCCCGGGGAGCCCCTAGGCCCGGGTCCCGGATCCCCGCGCA	15085

BX511262.7	401	CCCGGCCAGGTGAGTCTGGGTGAACCGTGCGCTGACGCCCTTTTCCGGCG	450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX248305.13	15086	CCCGGCCAGGTGAGTCTGGGTGAACCGTGCGCTGACGCCCTTTTCCGGCG	15135

BX511262.7	451	CGGGAGAGGTGGTGGCGGTGGCGGTGGCGGCGGCGGCGGCGGTGGTGGGC	500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX248305.13	15136	CGGGAGAGGTGGTGGCGGTGGCGGTGGCGGCGGCGGCGGCGGTGGTGGGC	15185

BX511262.7	501	CGGGGGGAGGAGAAGCTGCCATTAGCCGCCGCCATTTTGTCCTCCTGCTG	550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX248305.13	15186	CGGGGGGAGGAGAAGCTGCCATTAGCCGCCGCCATTTTGTCCTCCTGCTG	15235

BX511262.7	551	CCGGGCCTGCTTGCCCCTCCCCCTCCGGTACCTCTACTCCGGGACCCGCA	600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX248305.13	15236	CCGGGCCTGCTTGCCCCTCCCCCTCCGGTACCTCTACTCCGGGACCCGCA	15285

BX511262.7	601	CCTCCGGCAGTTCATTCAGGATCCGTAGTCTGCCCCTAACCACCCACCGT	650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX248305.13	15286	CCTCCGGCAGTTCATTCAGGATCCGTAGTCTGCCCCTAACCACCCACCGT	15335

BX511262.7	651	CTTGGCTTCAGGGGGTGACCCCTGCGCCTGGGTCCGTAACTCCCTACCCT	700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX248305.13	15336	CTTGGCTTCAGGGGGTGACCCCTGCGCCTGGGTCCGTAACTCCCTACCCT	15385

BX511262.7	701	CCGCTGCGCTCCTGGCTTTTCACCCCCATTTGTGGGCCCCCTCCCCGGCT	750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX248305.13	15386	CCGCTGCGCTCCTGGCTTTTCACCCCCATTTGTGGGCCCCCTCCCCGGCT	15435

BX511262.7	751	GCCGCCCCGTGGTGGGCCGCGCCCGACGGTTCTCTCGGAAGGGCGCTTTT	800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX248305.13	15436	GCCGCCCCGTGGTGGGCCGCGCCCGACGGTTCTCTCGGAAGGGCGCTTTT	15485

BX511262.7	801	CCTCCATATTGGACCCCCTCCTATCATCCAGCGCTGTGTTCCCCCCTCTG	850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX248305.13	15486	CCTCCATATTGGACCCCCTCCTATCATCCAGCGCTGTGTTCCCCCCTCTG	15535

BX511262.7	851	GACGCCCCTCTTCGTGTCGAGCCACTCCCACTCTAGAATCCTGCTTTTAT	900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX248305.13	15536	GACGCCCCTCTTCGTGTCGAGCCACTCCCACTCTAGAATCCTGCTTTTAT	15585

BX511262.7	901	CCCAGCATCTTTGCTTTCTATGTTGCTCAGTCGCCCTATGTCTGCTTTTT	950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX248305.13	15586	CCCAGCATCTTTGCTTTCTATGTTGCTCAGTCGCCCTATGTCTGCTTTTT	15635

BX511262.7	951	CATTTTTCCTGTTCCTCGTCTCCTTTCTCCCCCAACCCCGTTTTTCTTCT	1000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX248305.13	15636	CATTTTTCCTGTTCCTCGTCTCCTTTCTCCCCCAACCCCGTTTTTCTTCT	15685

BX511262.7	1001	TGGGCCTCTGCCCCCTTACTTCGTTGTCTACATCGTTTTTTTTTTTGCCA	1050
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX248305.13	15686	TGGGCCTCTGCCCCCTTACTTCGTTGTCTACATCGTTTTTTTTTTTGCCA	15735

BX511262.7	1051	TTCCTGTTTCCATATATTTTCCACCTGCTTTCGTATTCATTATTTTCTGT	1100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX248305.13	15736	TTCCTGTTTCCATATATTTTCCACCTGCTTTCGTATTCATTATTTTCTGT	15785

BX511262.7	1101	TAGTTTTGGTCTATTCGCTACATGACTCTTGTATTCGTTTTCCCTTCATA	1150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX248305.13	15786	TAGTTTTGGTCTATTCGCTACATGACTCTTGTATTCGTTTTCCCTTCATA	15835

BX511262.7	1151	TATTTATCTTCACAGATTGGCCTCCTCAAACACCTACGAAGCAACATCCA	1200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX248305.13	15836	TATTTATCTTCACAGATTGGCCTCCTCAAACACCTACGAAGCAACATCCA	15885

BX511262.7	1201	TCTTATCTCTAGCTTGTCATAAAGTTCTTTCTCCCCAATTTTAGCTTTCA	1250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX248305.13	15886	TCTTATCTCTAGCTTGTCATAAAGTTCTTTCTCCCCAATTTTAGCTTTCA	15935

BX511262.7	1251	TTCTGGGCCTGTCTGGATTTCCCTGCTTTCTTCCCCACTATTTCTCATCT	1300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX248305.13	15936	TTCTGGGCCTGTCTGGATTTCCCTGCTTTCTTCCCCACTATTTCTCATCT	15985

BX511262.7	1301	CTTTACACTGTTCCCGTCCATAAACGAATGCCTGGTCACTCTGGAATGGA	1350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX248305.13	15986	CTTTACACTGTTCCCGTCCATAAACGAATGCCTGGTCACTCTGGAATGGA	16035

BX511262.7	1351	CTGAGAGACCTGTCGTCCGGCTTGCTTAGGGAGCTGGAGGTATCGAGTAA	1400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX248305.13	16036	CTGAGAGACCTGTCGTCCGGCTTGCTTAGGGAGCTGGAGGTATCGAGTAA	16085

BX511262.7	1401	AGAAACACTGGTGATGGACATTTTTAATGAGGATAGGAAAACGAAGATGG	1450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX248305.13	16086	AGAAACACTGGTGATGGACATTTTTAATGAGGATAGGAAAACGAAGATGG	16135

BX511262.7	1451	CTCTGGCCTTGGCCCTCTGTTTTCTGGCCCATGGTTACAGGGTGCTAAGG	1500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX248305.13	16136	CTCTGGCCTTGGCCCTCTGTTTTCTGGCCCATGGTTACAGGGTGCTAAGG	16185

BX511262.7	1501	TGGCTCCATAATGCTTTTTCTCAGTTCTTCATATGGTAAAACAGTATTTC	1550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX248305.13	16186	TGGCTCCATAATGCTTTTTCTCAGTTCTTCATATGGTAAAACAGTATTTC	16235

BX511262.7	1551	ATCTGGAGGCGATTTTTTCCAGGAGCCAATACAGGAGCAAGTTTAGGAAA	1600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX248305.13	16236	ATCTGGAGGCGATTTTTTCCAGGAGCCAATACAGGAGCAAGTTTAGGAAA	16285

BX511262.7	1601	AGATGGGATATTTCAAATACTTGAGGTTCCTATAGCCTGGGAGTATGTAC	1650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX248305.13	16286	AGATGGGATATTTCAAATACTTGAGGTTCCTATAGCCTGGGAGTATGTAC	16335

BX511262.7	1651	AGCCCTAGTTGTTCTATGAGGATTTCTCTGGTACCAACCCCCATTCCGGC	1700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX248305.13	16336	AGCCCTAGTTGTTCTATGAGGATTTCTCTGGTACCAACCCCCATTCCGGC	16385

BX511262.7	1701	TGAGCAAGCTCATAAAATCCTTAAACTCCCAGCATACCTTCCTGCAAACC	1750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX248305.13	16386	TGAGCAAGCTCATAAAATCCTTAAACTCCCAGCATACCTTCCTGCAAACC	16435

BX511262.7	1751	TTCCCAGATGGACACGAGGCTGCTGGGCTGGGAGCCTGGGGTACAGGGCC	1800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX248305.13	16436	TTCCCAGATGGACACGAGGCTGCTGGGCTGGGAGCCTGGGGTACAGGGCC	16485

BX511262.7	1801	CTGGGGGCATGATTAGGGAGCTTGTGTCCAATAAACAGGGAATCTAAAGT	1850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX248305.13	16486	CTGGGGGCATGATTAGGGAGCTTGTGTCCAATAAACAGGGAATCTAAAGT	16535

BX511262.7	1851	GTTGTTTCTTCTTCTCTGATGGAATTGTATGCTTCTTTTTTAGTTTTCTC	1900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX248305.13	16536	GTTGTTTCTTCTTCTCTGATGGAATTGTATGCTTCTTTTTTAGTTTTCTC	16585

BX511262.7	1901	TTGCTTGAATTTGTCCTGTTGTAAGTCTCTGAAACGATTTTGGTGGAGAG	1950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX248305.13	16586	TTGCTTGAATTTGTCCTGTTGTAAGTCTCTGAAACGATTTTGGTGGAGAG	16635

BX511262.7	1951	AGAAGAGATTATTACTTGTAGGGAATTACTCTTTGTAGACAGGCACAAAG	2000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX248305.13	16636	AGAAGAGATTATTACTTGTAGGGAATTACTCTTTGTAGACAGGCACAAAG	16685

Overview

Query
BX511262.7 - 69009 bps
Hit
BX248305.13 - 16685 bps
Total alignments
1
Best alignment
alignment #1 (HSP: 2000 bps)
Best alignment cartoon

Alternate alignments

Short-link