<=>End overlap alignment

Alignment #1 HSP: 1999 bps / non-identical: 0 bps

Full alignment

BX293545.10	1	GGCCGAGCGGTCTAAGGCGCTGGATTAAGGCTCCAGTCTCTTCGGGGGCG	50
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX248109.8	50613	GGCCGAGCGGTCTAAGGCGCTGGATTAAGGCTCCAGTCTCTTCGGGGGCG	50662

BX293545.10	51	TGGGTTCAAATCCCACCGCTGCCAAGTACTTTTCATTCTCACTAGGGACT	100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX248109.8	50663	TGGGTTCAAATCCCACCGCTGCCAAGTACTTTTCATTCTCACTAGGGACT	50712

BX293545.10	101	GTTTTTAGGAGAATCCCTTTCCAAATGTTCAGTATGAATGGTTCTTACGT	150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX248109.8	50713	GTTTTTAGGAGAATCCCTTTCCAAATGTTCAGTATGAATGGTTCTTACGT	50762

BX293545.10	151	ATCAATCCCATTCTCCTCTTCGACTTCTGTTTACCACGGAGCCAGAGATA	200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX248109.8	50763	ATCAATCCCATTCTCCTCTTCGACTTCTGTTTACCACGGAGCCAGAGATA	50812

BX293545.10	201	ACCGTCCCCAGAACAATGTTCCCCCATTATTTAGAGGACAGTGTACTCCA	250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX248109.8	50813	ACCGTCCCCAGAACAATGTTCCCCCATTATTTAGAGGACAGTGTACTCCA	50862

BX293545.10	251	GGCGCCTCAGATACAGCAATGAGTGACACAAGCAAAAAAACCCTTAATGG	300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX248109.8	50863	GGCGCCTCAGATACAGCAATGAGTGACACAAGCAAAAAAACCCTTAATGG	50912

BX293545.10	301	CACATACTTAGTGAGGTGGCACGATCTCGGCTCACTGTAACCTCCGCCTC	350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX248109.8	50913	CACATACTTAGTGAGGTGGCACGATCTCGGCTCACTGTAACCTCCGCCTC	50962

BX293545.10	351	CCCGGTTCAAGCCATTCTCCTGCCTCAGTCTCCCGAGTGGCTGGGATTAC	400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX248109.8	50963	CCCGGTTCAAGCCATTCTCCTGCCTCAGTCTCCCGAGTGGCTGGGATTAC	51012

BX293545.10	401	AGGTGCGCGCCACCACGCCCTGGCTAATTTTTGTATTTTTAGTAGAGACG	450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX248109.8	51013	AGGTGCGCGCCACCACGCCCTGGCTAATTTTTGTATTTTTAGTAGAGACG	51062

BX293545.10	451	GGGTTTCGCCATGTTGGTCAGGCTGGTCTCGAACTCCTGGCCTCAAGTGA	500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX248109.8	51063	GGGTTTCGCCATGTTGGTCAGGCTGGTCTCGAACTCCTGGCCTCAAGTGA	51112

BX293545.10	501	TCCTCCCTCCTCGGCCTCCCACAGTGCTGGGATTACAGGCGTGGGCCACC	550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX248109.8	51113	TCCTCCCTCCTCGGCCTCCCACAGTGCTGGGATTACAGGCGTGGGCCACC	51162

BX293545.10	551	GCACGCAGCCTGAAGGATTAATTTATGTTTGGAATCAGCTGCTGTTCTTC	600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX248109.8	51163	GCACGCAGCCTGAAGGATTAATTTATGTTTGGAATCAGCTGCTGTTCTTC	51212

BX293545.10	601	CTCCAGCCTCTCTGTAGTGTGCTCACTTCACACTTGGAACCATAGTTATA	650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX248109.8	51213	CTCCAGCCTCTCTGTAGTGTGCTCACTTCACACTTGGAACCATAGTTATA	51262

BX293545.10	651	TGGTATAGAGAAGAGACAACTCTAGGGAAAGTGCCAGTGCCTTGCCTTAC	700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX248109.8	51263	TGGTATAGAGAAGAGACAACTCTAGGGAAAGTGCCAGTGCCTTGCCTTAC	51312

BX293545.10	701	CTTACAACTGCCAGACACACCCAGTCAGGTACCTTCTCTGTGGGCTTCTC	750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX248109.8	51313	CTTACAACTGCCAGACACACCCAGTCAGGTACCTTCTCTGTGGGCTTCTC	51362

BX293545.10	751	AGTACCCCATATCTCTGTGGTTGCCGGGGGAGCCCTATCTCTCCTCGGAG	800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX248109.8	51363	AGTACCCCATATCTCTGTGGTTGCCGGGGGAGCCCTATCTCTCCTCGGAG	51412

BX293545.10	801	CAGTTCTCTCTGCATACTTCTGGTCTGTCTCTCATTCTCTAGACCTCAGC	850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX248109.8	51413	CAGTTCTCTCTGCATACTTCTGGTCTGTCTCTCATTCTCTAGACCTCAGC	51462

BX293545.10	851	TTGGAAGTTGTTTCTCCTTGGAAGCCTTCCCTCATCTCCTTCTCTTCCTC	900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX248109.8	51463	TTGGAAGTTGTTTCTCCTTGGAAGCCTTCCCTCATCTCCTTCTCTTCCTC	51512

BX293545.10	901	TTTCCAGCTTCATAAAGTTTGGGAGGGTATGGAGAGGATAAGGAAGGGAA	950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX248109.8	51513	TTTCCAGCTTCATAAAGTTTGGGAGGGTATGGAGAGGATAAGGAAGGGAA	51562

BX293545.10	951	CAGCACAGAACGTCCTTGCCCCACGGAACTCAGAGTTTAGTGGGGTTCTC	1000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX248109.8	51563	CAGCACAGAACGTCCTTGCCCCACGGAACTCAGAGTTTAGTGGGGTTCTC	51612

BX293545.10	1001	ATGGGGGTTCACAAGGATTAGATAAGTTATTGCCCTAATATGGGGCAAAC	1050
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX248109.8	51613	ATGGGGGTTCACAAGGATTAGATAAGTTATTGCCCTAATATGGGGCAAAC	51662

BX293545.10	1051	TCTACTAAAAAGGAGATAGCTTTCTATGTGTAGATTTTGAATGATGTTCC	1100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX248109.8	51663	TCTACTAAAAAGGAGATAGCTTTCTATGTGTAGATTTTGAATGATGTTCC	51712

BX293545.10	1101	AGATTTAAGAGAATAAAAAGAAAATAATATGAATTGTATGTTAGAAAGAA	1150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX248109.8	51713	AGATTTAAGAGAATAAAAAGAAAATAATATGAATTGTATGTTAGAAAGAA	51762

BX293545.10	1151	GGACTGTCACAGAATTGTTCCCAACTGGGATTACAGGTGCAGGCCACTAG	1200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX248109.8	51763	GGACTGTCACAGAATTGTTCCCAACTGGGATTACAGGTGCAGGCCACTAG	51812

BX293545.10	1201	GTCCGGCTAATTTTTGTATTTTTAGTAGAGAGGGGCGTTTTGCCATGTTG	1250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX248109.8	51813	GTCCGGCTAATTTTTGTATTTTTAGTAGAGAGGGGCGTTTTGCCATGTTG	51862

BX293545.10	1251	GCCAGGCTGGTCTCAAACTCCTGACCTCAAGTGATCCTCCCACCTGGGAC	1300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX248109.8	51863	GCCAGGCTGGTCTCAAACTCCTGACCTCAAGTGATCCTCCCACCTGGGAC	51912

BX293545.10	1301	TCCCCAAGTGCTGGGATTACAGGTGTGAGCCACCACGCCTGACCACCTTT	1350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX248109.8	51913	TCCCCAAGTGCTGGGATTACAGGTGTGAGCCACCACGCCTGACCACCTTT	51962

BX293545.10	1351	ATTGATTTTTGAATGCTAATCCAACTTCTCCATGCTAGAATAATCTTAAC	1400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX248109.8	51963	ATTGATTTTTGAATGCTAATCCAACTTCTCCATGCTAGAATAATCTTAAC	52012

BX293545.10	1401	TTGTTCAAGACATGTAATCTTTTAAAAAATGTATATTCCTGGATTCAGTT	1450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX248109.8	52013	TTGTTCAAGACATGTAATCTTTTAAAAAATGTATATTCCTGGATTCAGTT	52062

BX293545.10	1451	TGTTACTATCTCAAGATTTTTCTCACTACATTCATGAATGATAATAGCCT	1500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX248109.8	52063	TGTTACTATCTCAAGATTTTTCTCACTACATTCATGAATGATAATAGCCT	52112

BX293545.10	1501	GTAATTTTCTTTTTTAAAAAATTTCCTTGTGTTGTTTGTTTTTCCTCATC	1550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX248109.8	52113	GTAATTTTCTTTTTTAAAAAATTTCCTTGTGTTGTTTGTTTTTCCTCATC	52162

BX293545.10	1551	GTTCCCTAATGGTTTGGTATTAAGGTTATACAGGCCTCATAAAATGAGTT	1600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX248109.8	52163	GTTCCCTAATGGTTTGGTATTAAGGTTATACAGGCCTCATAAAATGAGTT	52212

BX293545.10	1601	TAACATTGGGATTATTTTCCCTTGCATGTTTAGTAGAATTAACTGGTGAA	1650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX248109.8	52213	TAACATTGGGATTATTTTCCCTTGCATGTTTAGTAGAATTAACTGGTGAA	52262

BX293545.10	1651	AACATCTGACCCTTGAGTTTTATTTCTGGGAATATATATTATAGGTTCTA	1700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX248109.8	52263	AACATCTGACCCTTGAGTTTTATTTCTGGGAATATATATTATAGGTTCTA	52312

BX293545.10	1701	TTTAAATAATTGGTATCAGACTATTCAGATCTTATATTTTTTTCCTGTAC	1750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX248109.8	52313	TTTAAATAATTGGTATCAGACTATTCAGATCTTATATTTTTTTCCTGTAC	52362

BX293545.10	1751	TAGTTTTAGAAACAAGAGTCTTCCTAAGGAAATATACCAGATGAACCTGG	1800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX248109.8	52363	TAGTTTTAGAAACAAGAGTCTTCCTAAGGAAATATACCAGATGAACCTGG	52412

BX293545.10	1801	AAAATCTTTTCACCAGAAAGCAAGGAGGCTACTGAAGACTACTTTAGTCA	1850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX248109.8	52413	AAAATCTTTTCACCAGAAAGCAAGGAGGCTACTGAAGACTACTTTAGTCA	52462

BX293545.10	1851	TGTTAAACAAAAAAGGCTTGTGCTGACACCTATGAAGTAGTCTTACCCAA	1900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX248109.8	52463	TGTTAAACAAAAAAGGCTTGTGCTGACACCTATGAAGTAGTCTTACCCAA	52512

BX293545.10	1901	ATCAAATCTAAATATAGAATTTGATAAAGCCCTTAGATCTAACTATTAAT	1950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX248109.8	52513	ATCAAATCTAAATATAGAATTTGATAAAGCCCTTAGATCTAACTATTAAT	52562

BX293545.10	1951	TTTTAGGACATGCAGGGGCAGAGGAATGTGTTAAATACTACCAAAGGTG	1999
			|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX248109.8	52563	TTTTAGGACATGCAGGGGCAGAGGAATGTGTTAAATACTACCAAAGGTG	52611

Overview

Query
BX293545.10 - 24292 bps
Hit
BX248109.8 - 52611 bps
Total alignments
1
Best alignment
alignment #1 (HSP: 1999 bps)
Best alignment cartoon

Alternate alignments

Short-link