<=>End overlap alignment

Alignment #1 HSP: 2000 bps / non-identical: 0 bps

Full alignment

CR751550.1	1	AATCATGATAAGGACACATGCACATGTATGTTTATTGCGGCACTAGTCAC	50
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX248096.10	21482	AATCATGATAAGGACACATGCACATGTATGTTTATTGCGGCACTAGTCAC	21531

CR751550.1	51	AGTAGCAAAGACTTGGAACCAACCCAGATGTCCATCAATGATAGACTGGA	100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX248096.10	21532	AGTAGCAAAGACTTGGAACCAACCCAGATGTCCATCAATGATAGACTGGA	21581

CR751550.1	101	TTAAGAAAATGTGGCACATATACACCGTGGAATACTATGCAGCCATAAAA	150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX248096.10	21582	TTAAGAAAATGTGGCACATATACACCGTGGAATACTATGCAGCCATAAAA	21631

CR751550.1	151	AAGGATGAGTTCATGTCCTTTGCAGGGACATGGATGAAGCTGGAAACCAT	200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX248096.10	21632	AAGGATGAGTTCATGTCCTTTGCAGGGACATGGATGAAGCTGGAAACCAT	21681

CR751550.1	201	CATTCTCAGCAAACTATCACAAGGACAGAAAACCAAACACTACATGTTCT	250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX248096.10	21682	CATTCTCAGCAAACTATCACAAGGACAGAAAACCAAACACTACATGTTCT	21731

CR751550.1	251	CACTCATAAGTGGGAGTTGAACAATGAGAATACACAGACACAGGGCAGGG	300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX248096.10	21732	CACTCATAAGTGGGAGTTGAACAATGAGAATACACAGACACAGGGCAGGG	21781

CR751550.1	301	AACATCACACACCGAGGCCTGTGGGGGGGTTGGGGGTTAGGGAAGGGATA	350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX248096.10	21782	AACATCACACACCGAGGCCTGTGGGGGGGTTGGGGGTTAGGGAAGGGATA	21831

CR751550.1	351	GCATTAGGAGAACTACCTAATGTAAATCACGAGTTGATGGGTGCAGCAAA	400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX248096.10	21832	GCATTAGGAGAACTACCTAATGTAAATCACGAGTTGATGGGTGCAGCAAA	21881

CR751550.1	401	CCACCATGGCACAGGTATACCTATGTAACAAACATGCATGTTGTGCACAT	450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX248096.10	21882	CCACCATGGCACAGGTATACCTATGTAACAAACATGCATGTTGTGCACAT	21931

CR751550.1	451	GTACCCCAGATCTTAAAGTATAATAAAATAAAAAATAAAAAAAATCTTCC	500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX248096.10	21932	GTACCCCAGATCTTAAAGTATAATAAAATAAAAAATAAAAAAAATCTTCC	21981

CR751550.1	501	CTACTTTTTAAACTGTATGTTGCTTTGTAGCAATACATTATGCACATTAT	550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX248096.10	21982	CTACTTTTTAAACTGTATGTTGCTTTGTAGCAATACATTATGCACATTAT	22031

CR751550.1	551	AAAGTGTTTTAATTAGAAATTTTAGAAGATATGATAAAGAAAAATAATTT	600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX248096.10	22032	AAAGTGTTTTAATTAGAAATTTTAGAAGATATGATAAAGAAAAATAATTT	22081

CR751550.1	601	AAATAACAATTTTTATTCAAAATACAAATAATAGGGCTGGGCGCGGTGGC	650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX248096.10	22082	AAATAACAATTTTTATTCAAAATACAAATAATAGGGCTGGGCGCGGTGGC	22131

CR751550.1	651	TGACGCCTGTAATCCTAGCACTTTGGCAGGCCGAGGCGGGCAGATCACGA	700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX248096.10	22132	TGACGCCTGTAATCCTAGCACTTTGGCAGGCCGAGGCGGGCAGATCACGA	22181

CR751550.1	701	GGTCAGGAGTTCAAGACCAGCCTGGCCAACATGGTGAAACCCTGTCTCTA	750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX248096.10	22182	GGTCAGGAGTTCAAGACCAGCCTGGCCAACATGGTGAAACCCTGTCTCTA	22231

CR751550.1	751	CTAAAAATACAAAAAATTAGCTGGGCGTAGTGGCGGGTGCCTGTAATCCC	800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX248096.10	22232	CTAAAAATACAAAAAATTAGCTGGGCGTAGTGGCGGGTGCCTGTAATCCC	22281

CR751550.1	801	AGCTACTCGGGAGACTAAGGCACAAGAATCGCTTGAACCCGGGAGGCGGA	850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX248096.10	22282	AGCTACTCGGGAGACTAAGGCACAAGAATCGCTTGAACCCGGGAGGCGGA	22331

CR751550.1	851	GGTTGCAGTGAGCCGAGATCGCACCACTGCACTCCAGCCTAGGCGACAGA	900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX248096.10	22332	GGTTGCAGTGAGCCGAGATCGCACCACTGCACTCCAGCCTAGGCGACAGA	22381

CR751550.1	901	GTGAGACTGTGTCTCAAAAAAGAAAAAAAAAGAAAAGAAAAGAAAAAGAA	950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX248096.10	22382	GTGAGACTGTGTCTCAAAAAAGAAAAAAAAAGAAAAGAAAAGAAAAAGAA	22431

CR751550.1	951	AAAAGAATATTTTGCCCTTATAACATTATTAATTATATACTTTCAAGTGA	1000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX248096.10	22432	AAAAGAATATTTTGCCCTTATAACATTATTAATTATATACTTTCAAGTGA	22481

CR751550.1	1001	GAGCAATATGACTAATTATGCTTAATTATTTTTGAAAATGATGCTTTAAC	1050
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX248096.10	22482	GAGCAATATGACTAATTATGCTTAATTATTTTTGAAAATGATGCTTTAAC	22531

CR751550.1	1051	AATTTGTAATGCAGACATTTGATGGTCTGGTTCTATGTTGAGTTCATGTT	1100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX248096.10	22532	AATTTGTAATGCAGACATTTGATGGTCTGGTTCTATGTTGAGTTCATGTT	22581

CR751550.1	1101	GATACTTGGTCTTAAGGACAGTTAGAGCTGATAAAAATAACTTGTGCATA	1150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX248096.10	22582	GATACTTGGTCTTAAGGACAGTTAGAGCTGATAAAAATAACTTGTGCATA	22631

CR751550.1	1151	GACCAGGCGCGGTGGCTCACGCCTGTAATACCAGCACTTTGGGAGTCTGA	1200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX248096.10	22632	GACCAGGCGCGGTGGCTCACGCCTGTAATACCAGCACTTTGGGAGTCTGA	22681

CR751550.1	1201	GGCGGGCGGATCACGAGATCAGGAGATGGAGACCATCCTGGCTAACACGG	1250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX248096.10	22682	GGCGGGCGGATCACGAGATCAGGAGATGGAGACCATCCTGGCTAACACGG	22731

CR751550.1	1251	TGAAGCCCCGTCTCTATTAAAAATACAAAAAAAATTAGCCAGGTGCGGTG	1300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX248096.10	22732	TGAAGCCCCGTCTCTATTAAAAATACAAAAAAAATTAGCCAGGTGCGGTG	22781

CR751550.1	1301	GCAGGCACCTGTAGTCCCAGCTACTTGGAAGGCTGAGGCAGGAGAATGGT	1350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX248096.10	22782	GCAGGCACCTGTAGTCCCAGCTACTTGGAAGGCTGAGGCAGGAGAATGGT	22831

CR751550.1	1351	GTGAACCTTGCAGTGAGCCGAGATCACGCCACTGCACTACAGCCTGGGCA	1400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX248096.10	22832	GTGAACCTTGCAGTGAGCCGAGATCACGCCACTGCACTACAGCCTGGGCA	22881

CR751550.1	1401	ACAGAGCGAAACCCTGTCTCAAAAAAAAAAAAAAAAAGAAAAAAAAAAAG	1450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX248096.10	22882	ACAGAGCGAAACCCTGTCTCAAAAAAAAAAAAAAAAAGAAAAAAAAAAAG	22931

CR751550.1	1451	AAATAACTTCTGCACACATCATAACGTTCATACATAATGAATCATTGATA	1500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX248096.10	22932	AAATAACTTCTGCACACATCATAACGTTCATACATAATGAATCATTGATA	22981

CR751550.1	1501	TACTCATTAAAATGTGACTCATCCAGGAAAATCCCATCCCTAAATTATTT	1550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX248096.10	22982	TACTCATTAAAATGTGACTCATCCAGGAAAATCCCATCCCTAAATTATTT	23031

CR751550.1	1551	AAAGTTTTTGTTTTCCCTCAGCTACTATATTTCTGTTCTACCTTATGCAA	1600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX248096.10	23032	AAAGTTTTTGTTTTCCCTCAGCTACTATATTTCTGTTCTACCTTATGCAA	23081

CR751550.1	1601	ACTAATGAGAAACCATTGTCCCAAGACTGGTGGCCTCCTGGCATGGTTGT	1650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX248096.10	23082	ACTAATGAGAAACCATTGTCCCAAGACTGGTGGCCTCCTGGCATGGTTGT	23131

CR751550.1	1651	GCAACAGCTGTTGTCAAACTCCAGAGTCTAAAGTGCACCACGAAAGCCAG	1700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX248096.10	23132	GCAACAGCTGTTGTCAAACTCCAGAGTCTAAAGTGCACCACGAAAGCCAG	23181

CR751550.1	1701	ATGGCAGGCCAGATCCAGCCTCCCTGCTAAATGAAATGTTCACTGGCCAG	1750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX248096.10	23182	ATGGCAGGCCAGATCCAGCCTCCCTGCTAAATGAAATGTTCACTGGCCAG	23231

CR751550.1	1751	GGAGAAACAACCACGTGGAAAATTAAATAAACCCATGACATTTGTAGCCA	1800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX248096.10	23232	GGAGAAACAACCACGTGGAAAATTAAATAAACCCATGACATTTGTAGCCA	23281

CR751550.1	1801	GCAGCTCGGGTGTTTTGTAGGGTTTTCCCTGAGAAGTGGGGACTAATCGC	1850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX248096.10	23282	GCAGCTCGGGTGTTTTGTAGGGTTTTCCCTGAGAAGTGGGGACTAATCGC	23331

CR751550.1	1851	ATGAATCACTTTTTTTTTCTTTTTAGAGTCTTATCTATTTGTGAGTAAAT	1900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX248096.10	23332	ATGAATCACTTTTTTTTTCTTTTTAGAGTCTTATCTATTTGTGAGTAAAT	23381

CR751550.1	1901	GTTTCCAATTAAAGCATTGCTACTAAGCCTCAGTTTTCTCACCTCTACCA	1950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX248096.10	23382	GTTTCCAATTAAAGCATTGCTACTAAGCCTCAGTTTTCTCACCTCTACCA	23431

CR751550.1	1951	TGGAGTTAAAATGTCTACTTCACACTGTCCATAAAAGAATTAAGATGGCC	2000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX248096.10	23432	TGGAGTTAAAATGTCTACTTCACACTGTCCATAAAAGAATTAAGATGGCC	23481

Overview

Query
CR751550.1 - 10086 bps
Hit
BX248096.10 - 23481 bps
Total alignments
1
Best alignment
alignment #1 (HSP: 2000 bps)
Best alignment cartoon

Alternate alignments

Short-link