<=>End overlap alignment

Alignment #1 HSP: 2000 bps / non-identical: 0 bps

Full alignment

BX248084.5	1	CAAACCTGCACATATACCCATGAACCTAAAATAAAAGTTAAAAAAACCTA	50
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX248093.4	109634	CAAACCTGCACATATACCCATGAACCTAAAATAAAAGTTAAAAAAACCTA	109683

BX248084.5	51	AACCCCAAATTACCTTCAACCTTTATGAGTTTTTACATTTGAAAGTTAAA	100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX248093.4	109684	AACCCCAAATTACCTTCAACCTTTATGAGTTTTTACATTTGAAAGTTAAA	109733

BX248084.5	101	TCGATAACTTAATGACAATAATTCAACTCTCTCATGCTTATCCCCCTCAT	150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX248093.4	109734	TCGATAACTTAATGACAATAATTCAACTCTCTCATGCTTATCCCCCTCAT	109783

BX248084.5	151	CTAACCCAAAACAAAACAAGATGGGATGCTGAGGTGAGGAACCTTTGAAT	200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX248093.4	109784	CTAACCCAAAACAAAACAAGATGGGATGCTGAGGTGAGGAACCTTTGAAT	109833

BX248084.5	201	TTTTAAATAGTATTAGGTCTAGCAGAACCTCAGAAAGACATGTTTACATT	250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX248093.4	109834	TTTTAAATAGTATTAGGTCTAGCAGAACCTCAGAAAGACATGTTTACATT	109883

BX248084.5	251	AAGAGGACTTTGACTATTGATATGGGCATGTAAGTTCTTTACTGCCACGT	300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX248093.4	109884	AAGAGGACTTTGACTATTGATATGGGCATGTAAGTTCTTTACTGCCACGT	109933

BX248084.5	301	TCCTAGTAATTCCTGAATTGCACATGTATGAAATGACATTAATTCTCTCA	350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX248093.4	109934	TCCTAGTAATTCCTGAATTGCACATGTATGAAATGACATTAATTCTCTCA	109983

BX248084.5	351	TACTTTAGGGTTGCTTGTTAGTGCCTAGAAGGAATACAGTCTCTGTGGCC	400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX248093.4	109984	TACTTTAGGGTTGCTTGTTAGTGCCTAGAAGGAATACAGTCTCTGTGGCC	110033

BX248084.5	401	AGTCTCCTTGGATCAACAAGAGCCTTGTAGTTTCCCATTTTTCATGCGCT	450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX248093.4	110034	AGTCTCCTTGGATCAACAAGAGCCTTGTAGTTTCCCATTTTTCATGCGCT	110083

BX248084.5	451	AATAGTGAAAATGTTTAGAAAGCCCCATCTATCCTCCCACATTGGCATCC	500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX248093.4	110084	AATAGTGAAAATGTTTAGAAAGCCCCATCTATCCTCCCACATTGGCATCC	110133

BX248084.5	501	CACTGATGTGCTGTCCTGGTTGCTAGGTGCAGATTTAGGTTCCAAGCAGA	550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX248093.4	110134	CACTGATGTGCTGTCCTGGTTGCTAGGTGCAGATTTAGGTTCCAAGCAGA	110183

BX248084.5	551	ACACTGCTAGTGTTCTCTGCAGTTTGTTGTAGAATCATAGTGTCTTGGCA	600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX248093.4	110184	ACACTGCTAGTGTTCTCTGCAGTTTGTTGTAGAATCATAGTGTCTTGGCA	110233

BX248084.5	601	ACCAAAGGCAGATCTGGTGCTATGGAGGACCTGCTTACTGCTATGAGGTG	650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX248093.4	110234	ACCAAAGGCAGATCTGGTGCTATGGAGGACCTGCTTACTGCTATGAGGTG	110283

BX248084.5	651	TTACTTTATAGAGGTCCTGGAGAAGCTGATTGAGGCCACGTCAATGTTGC	700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX248093.4	110284	TTACTTTATAGAGGTCCTGGAGAAGCTGATTGAGGCCACGTCAATGTTGC	110333

BX248084.5	701	AAGGAGACATGAGACTCACATCAGAGTTCTATGGCTTAACATGGGGGATG	750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX248093.4	110334	AAGGAGACATGAGACTCACATCAGAGTTCTATGGCTTAACATGGGGGATG	110383

BX248084.5	751	GTGGTAAGTGCGGCTCTATTTGGATTTTGTAATTATAAAAGCCCACTTTA	800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX248093.4	110384	GTGGTAAGTGCGGCTCTATTTGGATTTTGTAATTATAAAAGCCCACTTTA	110433

BX248084.5	801	TGTAGAGAGAAAAAAAAGAGTTTACCAGAGAAGTTTCTTCTGTAGTTGAA	850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX248093.4	110434	TGTAGAGAGAAAAAAAAGAGTTTACCAGAGAAGTTTCTTCTGTAGTTGAA	110483

BX248084.5	851	GACAAATGTAATGTTTTAATAAATTAGGCTGATTAAAAAAGAATATGAGC	900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX248093.4	110484	GACAAATGTAATGTTTTAATAAATTAGGCTGATTAAAAAAGAATATGAGC	110533

BX248084.5	901	TTGGTGTGGTGGCTCATGCCTGTAATCCCAGCGCTTTGGGAGGCTGAGGC	950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX248093.4	110534	TTGGTGTGGTGGCTCATGCCTGTAATCCCAGCGCTTTGGGAGGCTGAGGC	110583

BX248084.5	951	GGGTGGATCACCTGAGGTCAGGAGTTTGAGACCAGCCCGGCCAACATGGT	1000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX248093.4	110584	GGGTGGATCACCTGAGGTCAGGAGTTTGAGACCAGCCCGGCCAACATGGT	110633

BX248084.5	1001	GAAATTCCGTCTCTACTAAAAATACAAAAAATTAGCCAGGCATGGTGGCA	1050
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX248093.4	110634	GAAATTCCGTCTCTACTAAAAATACAAAAAATTAGCCAGGCATGGTGGCA	110683

BX248084.5	1051	GATCCTGTAATCCCAGCTACTTGGGAGGCCGAGGCAGGATAATCCTTGAA	1100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX248093.4	110684	GATCCTGTAATCCCAGCTACTTGGGAGGCCGAGGCAGGATAATCCTTGAA	110733

BX248084.5	1101	CCTGGGAGGCAGAGGTTGCAGTGAGCCGAGATCACGCCATTGTACTACAG	1150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX248093.4	110734	CCTGGGAGGCAGAGGTTGCAGTGAGCCGAGATCACGCCATTGTACTACAG	110783

BX248084.5	1151	CCTGGGCAATGGGAGTGAAACTTTGTCTCTTAAAAAAAAAACGAGTATGA	1200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX248093.4	110784	CCTGGGCAATGGGAGTGAAACTTTGTCTCTTAAAAAAAAAACGAGTATGA	110833

BX248084.5	1201	AGAGTATAAATTATTTTTCATGGAGTCTTGCCCTTAGAACAAGGCATTAA	1250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX248093.4	110834	AGAGTATAAATTATTTTTCATGGAGTCTTGCCCTTAGAACAAGGCATTAA	110883

BX248084.5	1251	ATCCTCTAAGTGTATAGGAAATTTGAGTTCAAAATAGATGCTTTGAAAAA	1300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX248093.4	110884	ATCCTCTAAGTGTATAGGAAATTTGAGTTCAAAATAGATGCTTTGAAAAA	110933

BX248084.5	1301	AAGGAATGTTTTTGAAAAATGCGAATTTTTACAGATTTACAATGTAGAAG	1350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX248093.4	110934	AAGGAATGTTTTTGAAAAATGCGAATTTTTACAGATTTACAATGTAGAAG	110983

BX248084.5	1351	TGCAGTTGTGTTCCATGGATATATTGCATAGTGGTGAAGTCTGATTTTTC	1400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX248093.4	110984	TGCAGTTGTGTTCCATGGATATATTGCATAGTGGTGAAGTCTGATTTTTC	111033

BX248084.5	1401	AATGTATCCATCATCCAAATAAAATACATTGTCCTCAGTAGGTAGTCTTT	1450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX248093.4	111034	AATGTATCCATCATCCAAATAAAATACATTGTCCTCAGTAGGTAGTCTTT	111083

BX248084.5	1451	CATCCCTCAACCCTTTCCCAGCCTCCCACCTTTTGGAGTCTCCAATGCCT	1500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX248093.4	111084	CATCCCTCAACCCTTTCCCAGCCTCCCACCTTTTGGAGTCTCCAATGCCT	111133

BX248084.5	1501	ATATTTCACTCTATATCCACATGTACCCATTGTTTAGCTCCCACTTATAA	1550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX248093.4	111134	ATATTTCACTCTATATCCACATGTACCCATTGTTTAGCTCCCACTTATAA	111183

BX248084.5	1551	TTGATAATATGTAGCATTTGGCTTTTTGTTTCTGAGTTCTCTTAAGCCAA	1600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX248093.4	111184	TTGATAATATGTAGCATTTGGCTTTTTGTTTCTGAGTTCTCTTAAGCCAA	111233

BX248084.5	1601	TGGCCTCCAGTTACAGTCACGTTGCTGCAAAAGACATGATTTCAGTCTTT	1650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX248093.4	111234	TGGCCTCCAGTTACAGTCACGTTGCTGCAAAAGACATGATTTCAGTCTTT	111283

BX248084.5	1651	TTATGGCCAAGTAGTATTCTAAAGTGTGTATATATGTATACCACATTTTA	1700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX248093.4	111284	TTATGGCCAAGTAGTATTCTAAAGTGTGTATATATGTATACCACATTTTA	111333

BX248084.5	1701	GAAATCCAATAGTCCACTGATGGACACTCAGGCTGATTTTATTACTTTGC	1750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX248093.4	111334	GAAATCCAATAGTCCACTGATGGACACTCAGGCTGATTTTATTACTTTGC	111383

BX248084.5	1751	TATTGTGGATAGTGCTGCGATATACATAGACACATAGGTTTCTTTTTGAT	1800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX248093.4	111384	TATTGTGGATAGTGCTGCGATATACATAGACACATAGGTTTCTTTTTGAT	111433

BX248084.5	1801	ATAATGATTTCTTTACCTTTAGCTTGATATCCAGTAATGGGATTGCTGGA	1850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX248093.4	111434	ATAATGATTTCTTTACCTTTAGCTTGATATCCAGTAATGGGATTGCTGGA	111483

BX248084.5	1851	TCGAATGGTAGCTCTATTTTTAGTTCTTTGAAAAGTCTCCATACTGTTTT	1900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX248093.4	111484	TCGAATGGTAGCTCTATTTTTAGTTCTTTGAAAAGTCTCCATACTGTTTT	111533

BX248084.5	1901	CCACAGAGGTTGTACTAATTTACATTCCCACCAATAGTGTATGTAATCCT	1950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX248093.4	111534	CCACAGAGGTTGTACTAATTTACATTCCCACCAATAGTGTATGTAATCCT	111583

BX248084.5	1951	TTTCTCTATACCCTCGGCAAAATTTTTTTTTTCTGAATTTAATAATGGCC	2000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX248093.4	111584	TTTCTCTATACCCTCGGCAAAATTTTTTTTTTCTGAATTTAATAATGGCC	111633

Overview

Query
BX248084.5 - 66068 bps
Hit
BX248093.4 - 111633 bps
Total alignments
1
Best alignment
alignment #1 (HSP: 2000 bps)
Best alignment cartoon

Alternate alignments

Short-link