<=>End overlap alignment

Alignment #1 HSP: 2000 bps / non-identical: 0 bps

Full alignment

BX005432.7	1	TTCTTGAAAAATATGCATTTTGGTTTAGATCCTTGTCTTAGTCAAATTAA	50
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX248084.5	64069	TTCTTGAAAAATATGCATTTTGGTTTAGATCCTTGTCTTAGTCAAATTAA	64118

BX005432.7	51	AAAAGAAAACAAAACCTATTAGAGTCTACTAGATCAATGCACTCTTTGTG	100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX248084.5	64119	AAAAGAAAACAAAACCTATTAGAGTCTACTAGATCAATGCACTCTTTGTG	64168

BX005432.7	101	GCTTAAATTTGTTTGTGTAAGTTCTACTACTAGCTATTTACTGCTAAACT	150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX248084.5	64169	GCTTAAATTTGTTTGTGTAAGTTCTACTACTAGCTATTTACTGCTAAACT	64218

BX005432.7	151	CACTTTCTCACTAATGGTTTGCTCATAAATTTTTTCTTCTAACAAAAAAC	200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX248084.5	64219	CACTTTCTCACTAATGGTTTGCTCATAAATTTTTTCTTCTAACAAAAAAC	64268

BX005432.7	201	GTATCAGTTCAAATAAAAAGATGAGAAGTTTTCTTTTCTCAGATGTTTGG	250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX248084.5	64269	GTATCAGTTCAAATAAAAAGATGAGAAGTTTTCTTTTCTCAGATGTTTGG	64318

BX005432.7	251	TTATTCTTCTTGAAAGCAGACAATTCACTATAAATTACTTTCAAGGGCTT	300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX248084.5	64319	TTATTCTTCTTGAAAGCAGACAATTCACTATAAATTACTTTCAAGGGCTT	64368

BX005432.7	301	TGGTTTCCTATATTTTTACTGCATTTCTCCTCAACTTCCAAGTTAAAACT	350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX248084.5	64369	TGGTTTCCTATATTTTTACTGCATTTCTCCTCAACTTCCAAGTTAAAACT	64418

BX005432.7	351	AAGATACAACTTGACATTTATTTTTCTGAAGCATCATGTGCATTACGGCT	400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX248084.5	64419	AAGATACAACTTGACATTTATTTTTCTGAAGCATCATGTGCATTACGGCT	64468

BX005432.7	401	TTTATATTCTAAAGGTGTGAGAAAGGAAAAATGGAACACACATTGGGAAT	450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX248084.5	64469	TTTATATTCTAAAGGTGTGAGAAAGGAAAAATGGAACACACATTGGGAAT	64518

BX005432.7	451	GTTGACGCTGGATTGTGCTTTTATCTGTAGTTATTCATGTTTCAGGCAGT	500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX248084.5	64519	GTTGACGCTGGATTGTGCTTTTATCTGTAGTTATTCATGTTTCAGGCAGT	64568

BX005432.7	501	TCATTCCTACTTTCTGAGAAATTGATGAGTTGTTGTGTTTGTCCTTGCTA	550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX248084.5	64569	TCATTCCTACTTTCTGAGAAATTGATGAGTTGTTGTGTTTGTCCTTGCTA	64618

BX005432.7	551	TCTGTCTTTCTGGATAATGGGAAAATTCTCAAGGATTCTGAATAAGAGAC	600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX248084.5	64619	TCTGTCTTTCTGGATAATGGGAAAATTCTCAAGGATTCTGAATAAGAGAC	64668

BX005432.7	601	TCATATTTGATGTTTAAAGTCAAAGGAGGAGCAAGGGAGATTTTCACATA	650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX248084.5	64669	TCATATTTGATGTTTAAAGTCAAAGGAGGAGCAAGGGAGATTTTCACATA	64718

BX005432.7	651	AGCAGTTATTTACCAGAGGGAAGGGCAGGGCCCAAGGGATCTCATTATGA	700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX248084.5	64719	AGCAGTTATTTACCAGAGGGAAGGGCAGGGCCCAAGGGATCTCATTATGA	64768

BX005432.7	701	AGTGAATGGAATTACTGGCATTGATGATCTCACTTTGTTCCTATCCCAAA	750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX248084.5	64769	AGTGAATGGAATTACTGGCATTGATGATCTCACTTTGTTCCTATCCCAAA	64818

BX005432.7	751	AGATTCTGTTACTTTAGATTTTAACTTCTCCCAATGCTATGTGAAGCAAT	800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX248084.5	64819	AGATTCTGTTACTTTAGATTTTAACTTCTCCCAATGCTATGTGAAGCAAT	64868

BX005432.7	801	TAAAACGTTTCAGATAAATTTCATAGTAGTTCGTACAGCAAAATTACTTT	850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX248084.5	64869	TAAAACGTTTCAGATAAATTTCATAGTAGTTCGTACAGCAAAATTACTTT	64918

BX005432.7	851	TAGAGTTTTTTCTCTTCAAGGAAATACACAATAAAATAATTAACTGTTCA	900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX248084.5	64919	TAGAGTTTTTTCTCTTCAAGGAAATACACAATAAAATAATTAACTGTTCA	64968

BX005432.7	901	GAATGAAAGTGAACTAGCTAAAACTCAACCCAATGTCTTTCATTTTCAGA	950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX248084.5	64969	GAATGAAAGTGAACTAGCTAAAACTCAACCCAATGTCTTTCATTTTCAGA	65018

BX005432.7	951	CACTAGGAATTTGTCAAAGCAACCAGATCACCAGGGACTAGCAACAATAT	1000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX248084.5	65019	CACTAGGAATTTGTCAAAGCAACCAGATCACCAGGGACTAGCAACAATAT	65068

BX005432.7	1001	CTAATAACCCCCTTCTTCAGGGATGATTAGCTAGTTAAGTGCCTGGAATG	1050
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX248084.5	65069	CTAATAACCCCCTTCTTCAGGGATGATTAGCTAGTTAAGTGCCTGGAATG	65118

BX005432.7	1051	TCTCTGTAGACAAGACTTGAGGGAAAAAGCTTTAATATTATGTTGCTTCA	1100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX248084.5	65119	TCTCTGTAGACAAGACTTGAGGGAAAAAGCTTTAATATTATGTTGCTTCA	65168

BX005432.7	1101	TTGCCAGATCTATTCATAAAGGGATTATTCTACCTCTCAGATGAGAAAAT	1150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX248084.5	65169	TTGCCAGATCTATTCATAAAGGGATTATTCTACCTCTCAGATGAGAAAAT	65218

BX005432.7	1151	CTGAATCTGCAAACTGGCTTAATATGGAAACTGGGTAAAAAGCCATGAAT	1200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX248084.5	65219	CTGAATCTGCAAACTGGCTTAATATGGAAACTGGGTAAAAAGCCATGAAT	65268

BX005432.7	1201	CCCTATTATATTGTTTCAAGTTATGTTTCTGTCTCCACACCTAGAATTTT	1250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX248084.5	65269	CCCTATTATATTGTTTCAAGTTATGTTTCTGTCTCCACACCTAGAATTTT	65318

BX005432.7	1251	TTCTGCTAATATACTCCAGCTAACATCTTAGTAGGTATCTTAGTCCATTT	1300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX248084.5	65319	TTCTGCTAATATACTCCAGCTAACATCTTAGTAGGTATCTTAGTCCATTT	65368

BX005432.7	1301	GGGTTGCTATAACAAAATACCATAAACTGGGTAGCTAATAAACAAAAAAA	1350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX248084.5	65369	GGGTTGCTATAACAAAATACCATAAACTGGGTAGCTAATAAACAAAAAAA	65418

BX005432.7	1351	ATTTACTTATCATAGTTCTAGAAGTTAGGAAGTCTGACATTAAGGTTCTG	1400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX248084.5	65419	ATTTACTTATCATAGTTCTAGAAGTTAGGAAGTCTGACATTAAGGTTCTG	65468

BX005432.7	1401	GCAGATTGGTGTCTGGTGAAGGCCCCTTTATGGTTCACAGATGGTGTCTT	1450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX248084.5	65469	GCAGATTGGTGTCTGGTGAAGGCCCCTTTATGGTTCACAGATGGTGTCTT	65518

BX005432.7	1451	CTCACTGTGTCTTCACATGGTGGAAGAGACAAAGCAGCTCTCTGAGGCCT	1500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX248084.5	65519	CTCACTGTGTCTTCACATGGTGGAAGAGACAAAGCAGCTCTCTGAGGCCT	65568

BX005432.7	1501	CTTCTATAAAGGCATGAATTCCATTCAAGAAGGCTGTGCCCTCATGATTT	1550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX248084.5	65569	CTTCTATAAAGGCATGAATTCCATTCAAGAAGGCTGTGCCCTCATGATTT	65618

BX005432.7	1551	AATCACCTCCCAAGGGCCTACCTGCTAACACCATCACACTGGTGATTAGG	1600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX248084.5	65619	AATCACCTCCCAAGGGCCTACCTGCTAACACCATCACACTGGTGATTAGG	65668

BX005432.7	1601	TTTTAACATGTTTTGGGGGACACAGACATTCACAATACAGTGGTAGGTTA	1650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX248084.5	65669	TTTTAACATGTTTTGGGGGACACAGACATTCACAATACAGTGGTAGGTTA	65718

BX005432.7	1651	CCAAATATTGTGTTTTTAAGTACCGTTTGATAAACTGTGTATCACTACAG	1700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX248084.5	65719	CCAAATATTGTGTTTTTAAGTACCGTTTGATAAACTGTGTATCACTACAG	65768

BX005432.7	1701	GTCCCTGTAGGTCACAATACCCTAGTCAATGTGACTTACTTGTAGTAACT	1750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX248084.5	65769	GTCCCTGTAGGTCACAATACCCTAGTCAATGTGACTTACTTGTAGTAACT	65818

BX005432.7	1751	ACTTCCACTTTGTCTATGATGGTGTCACTTCCTGGCATTTAATTTTCCAG	1800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX248084.5	65819	ACTTCCACTTTGTCTATGATGGTGTCACTTCCTGGCATTTAATTTTCCAG	65868

BX005432.7	1801	AATTATCATTTTTCTCAAGACCATATAATCCAATTTCAGTTTCATTCCCC	1850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX248084.5	65869	AATTATCATTTTTCTCAAGACCATATAATCCAATTTCAGTTTCATTCCCC	65918

BX005432.7	1851	ACCATCAGCTCTGCACCAAAGAATTCAGATGCCACAGAGCATTTTAAGAC	1900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX248084.5	65919	ACCATCAGCTCTGCACCAAAGAATTCAGATGCCACAGAGCATTTTAAGAC	65968

BX005432.7	1901	CACTGATGCCCTCCTCACTGATCCATTTCTTAATGCTATAGGGAAGAAAA	1950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX248084.5	65969	CACTGATGCCCTCCTCACTGATCCATTTCTTAATGCTATAGGGAAGAAAA	66018

BX005432.7	1951	TGTCTTCCAATCTTATAGCACAGGGTCTTATGTACAGAGGGCAGATGGCC	2000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX248084.5	66019	TGTCTTCCAATCTTATAGCACAGGGTCTTATGTACAGAGGGCAGATGGCC	66068

Overview

Query
BX005432.7 - 56644 bps
Hit
BX248084.5 - 66068 bps
Total alignments
1
Best alignment
alignment #1 (HSP: 2000 bps)
Best alignment cartoon

Alternate alignments

Short-link