<=>End overlap alignment

Alignment #1 HSP: 2000 bps / non-identical: 0 bps

Full alignment

BX284699.4	1	GTGCAGCTGAGCAGCTGGGGGTCTCACCAGTGCTGAGCTGAGAAGTTGCC	50
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX247949.9	54571	GTGCAGCTGAGCAGCTGGGGGTCTCACCAGTGCTGAGCTGAGAAGTTGCC	54620

BX284699.4	51	TTGGTTAGGGAGTGCTATGGCACATGCAGTGATAGAATGCCCTGCATAAT	100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX247949.9	54621	TTGGTTAGGGAGTGCTATGGCACATGCAGTGATAGAATGCCCTGCATAAT	54670

BX284699.4	101	AAGGACAGGGTTGGAAGAAACCTACAAAGACAGTGGCTTTGGCTAGTTAC	150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX247949.9	54671	AAGGACAGGGTTGGAAGAAACCTACAAAGACAGTGGCTTTGGCTAGTTAC	54720

BX284699.4	151	TTCTCAGCTGCATCGATGCTGTGTAAAAAGATAATGAGAATCTGCGGATT	200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX247949.9	54721	TTCTCAGCTGCATCGATGCTGTGTAAAAAGATAATGAGAATCTGCGGATT	54770

BX284699.4	201	GTTGACAGCTATGACTGGCTACATTTGACACCCTCGGCAGTGTCTCATGG	250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX247949.9	54771	GTTGACAGCTATGACTGGCTACATTTGACACCCTCGGCAGTGTCTCATGG	54820

BX284699.4	251	ACAGGTCTTTATCTCCTGTAGCAAAAGGGCAGATAGCAAGGAATGTTAGC	300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX247949.9	54821	ACAGGTCTTTATCTCCTGTAGCAAAAGGGCAGATAGCAAGGAATGTTAGC	54870

BX284699.4	301	TCTACATCACTATGAGGGCCACAGTGCTCCAGAGATGTTTGACACTCAGC	350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX247949.9	54871	TCTACATCACTATGAGGGCCACAGTGCTCCAGAGATGTTTGACACTCAGC	54920

BX284699.4	351	CAAGGCAGGCCTGTTACAGGAAAGTCAGGGCTTTGGTGGGGAAACCTGAG	400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX247949.9	54921	CAAGGCAGGCCTGTTACAGGAAAGTCAGGGCTTTGGTGGGGAAACCTGAG	54970

BX284699.4	401	ATTCTGCAAACTGGAACAGGATTATGCGATGCATGCCCTCCAGGATCTTC	450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX247949.9	54971	ATTCTGCAAACTGGAACAGGATTATGCGATGCATGCCCTCCAGGATCTTC	55020

BX284699.4	451	TGGGCATGCAGAGGAGGCTCACCCTTCTCTAGTAATGGTTCCCACTTTCA	500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX247949.9	55021	TGGGCATGCAGAGGAGGCTCACCCTTCTCTAGTAATGGTTCCCACTTTCA	55070

BX284699.4	501	CTGCTGGAAGATGCTACACAATCCTCACCCCTATGATGCCGCGGGAATCC	550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX247949.9	55071	CTGCTGGAAGATGCTACACAATCCTCACCCCTATGATGCCGCGGGAATCC	55120

BX284699.4	551	CACTCAGGAGGTTTGCAGGAACTAGCCAGCACGTCCCCATAGGAGCCCAG	600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX247949.9	55121	CACTCAGGAGGTTTGCAGGAACTAGCCAGCACGTCCCCATAGGAGCCCAG	55170

BX284699.4	601	GGACTACTTCTGGGATTGGAATTTGAGGGTGTTTGATCAAGGAACCAGAA	650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX247949.9	55171	GGACTACTTCTGGGATTGGAATTTGAGGGTGTTTGATCAAGGAACCAGAA	55220

BX284699.4	651	TTTCAGGCTGGATGAATATAATCCTTTGGCTTGAAGACACTTTCTCAGGG	700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX247949.9	55221	TTTCAGGCTGGATGAATATAATCCTTTGGCTTGAAGACACTTTCTCAGGG	55270

BX284699.4	701	CATGGATTTATCAAACACTCCAGGACTTTGATAAGTGGAGTAAACCCACT	750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX247949.9	55271	CATGGATTTATCAAACACTCCAGGACTTTGATAAGTGGAGTAAACCCACT	55320

BX284699.4	751	GCTGGGGTGTATCCACATAGTCTAGAAAAAAACATGCCCAACTCTCAACA	800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX247949.9	55321	GCTGGGGTGTATCCACATAGTCTAGAAAAAAACATGCCCAACTCTCAACA	55370

BX284699.4	801	AGGTAGACATGTCTTAGTTGCCCTGGAACATGTAGAGGATGGAATAACAA	850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX247949.9	55371	AGGTAGACATGTCTTAGTTGCCCTGGAACATGTAGAGGATGGAATAACAA	55420

BX284699.4	851	GCTGAGGGGAGTGGGCTTGGTGAAGGCCTACCAAAACCATGCTCTACAAG	900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX247949.9	55421	GCTGAGGGGAGTGGGCTTGGTGAAGGCCTACCAAAACCATGCTCTACAAG	55470

BX284699.4	901	AGGGCCCAGAGGACACACCTTCCACCAGAGCCTCAGGAACTTGATGGTGA	950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX247949.9	55471	AGGGCCCAGAGGACACACCTTCCACCAGAGCCTCAGGAACTTGATGGTGA	55520

BX284699.4	951	GAGGGACCTGCATCACTAAGAAGTGTCAGGGTATTGTCCTTTGTAGGCTG	1000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX247949.9	55521	GAGGGACCTGCATCACTAAGAAGTGTCAGGGTATTGTCCTTTGTAGGCTG	55570

BX284699.4	1001	GGGGTGATGGTAGTAAAGATAGTCCCAGAGTTTCATTTCTAATATCACTG	1050
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX247949.9	55571	GGGGTGATGGTAGTAAAGATAGTCCCAGAGTTTCATTTCTAATATCACTG	55620

BX284699.4	1051	GGGAGAGTGTGGCCCTGAAGAGACAAAGACCAAGTGGTGGCAGTGACTTG	1100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX247949.9	55621	GGGAGAGTGTGGCCCTGAAGAGACAAAGACCAAGTGGTGGCAGTGACTTG	55670

BX284699.4	1101	CAAAAGCCAGAGGGCACGGTTACTATGGCAACCTCGGAGGAGAAGCCAAG	1150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX247949.9	55671	CAAAAGCCAGAGGGCACGGTTACTATGGCAACCTCGGAGGAGAAGCCAAG	55720

BX284699.4	1151	AGGACTCAAGCTGCAGGGAATGTGGGGAAGTATAATAGAGGGTGGTGTCC	1200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX247949.9	55721	AGGACTCAAGCTGCAGGGAATGTGGGGAAGTATAATAGAGGGTGGTGTCC	55770

BX284699.4	1201	CAGGGTTAGGACAGGCAGCTGGTTGATATCTATGATAAGAAAGCAAGAAT	1250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX247949.9	55771	CAGGGTTAGGACAGGCAGCTGGTTGATATCTATGATAAGAAAGCAAGAAT	55820

BX284699.4	1251	TGAGAAGCAGGAGGGTGAAGGTGTTTGACTCAATACAAAATCATGATCCC	1300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX247949.9	55821	TGAGAAGCAGGAGGGTGAAGGTGTTTGACTCAATACAAAATCATGATCCC	55870

BX284699.4	1301	ATCCTCAATGCCTAGACCTCAGCCAAGATGCAGATTCAGATCTCAGTGAC	1350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX247949.9	55871	ATCCTCAATGCCTAGACCTCAGCCAAGATGCAGATTCAGATCTCAGTGAC	55920

BX284699.4	1351	AGAGGAAGAGTCCATATCTCTAGGCGGAATACTCTGCAACCCCGTGGAAG	1400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX247949.9	55921	AGAGGAAGAGTCCATATCTCTAGGCGGAATACTCTGCAACCCCGTGGAAG	55970

BX284699.4	1401	TATATGCTGGGACAATTCCCTCAGTCCTTCGGCAAAGGACCATATAGCCA	1450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX247949.9	55971	TATATGCTGGGACAATTCCCTCAGTCCTTCGGCAAAGGACCATATAGCCA	56020

BX284699.4	1451	TTTACTCAGGAGATTGTACACTGGGGAAAGGAAACAGGCAGAACTGGGGA	1500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX247949.9	56021	TTTACTCAGGAGATTGTACACTGGGGAAAGGAAACAGGCAGAACTGGGGA	56070

BX284699.4	1501	GATTATTGACACTGGGTGTGAACTGACATTGATGCTCAGATGCCCACAGC	1550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX247949.9	56071	GATTATTGACACTGGGTGTGAACTGACATTGATGCTCAGATGCCCACAGC	56120

BX284699.4	1551	ACTATCATGTCTCTCATCACAGTGGGGCTTATGGAGCTCAGGGAGTAAAC	1600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX247949.9	56121	ACTATCATGTCTCTCATCACAGTGGGGCTTATGGAGCTCAGGGAGTAAAC	56170

BX284699.4	1601	CTGGACACATTATGGCCCACAATGGAACTACTGGATCCATAGACCCAGCC	1650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX247949.9	56171	CTGGACACATTATGGCCCACAATGGAACTACTGGATCCATAGACCCAGCC	56220

BX284699.4	1651	CTGGTTATCTTCCTATACCCTGAGTGCATAATTGACACTGATGCACTGCT	1700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX247949.9	56221	CTGGTTATCTTCCTATACCCTGAGTGCATAATTGACACTGATGCACTGCT	56270

BX284699.4	1701	AAGTGGAGTTACCCCCACCCTGGGTCCCTAGTCTGTGGAGTAAGGACTTT	1750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX247949.9	56271	AAGTGGAGTTACCCCCACCCTGGGTCCCTAGTCTGTGGAGTAAGGACTTT	56320

BX284699.4	1751	CATTGTGCTGAAAGCCAAAGGGAAACCTCTGACACTGCCCCCATCCTGGC	1800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX247949.9	56321	CATTGTGCTGAAAGCCAAAGGGAAACCTCTGACACTGCCCCCATCCTGGC	56370

BX284699.4	1801	CAAATCAAAAATCATAGTGTGTCCCAGGGTGGGTCTTGTGTAAGATACTT	1850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX247949.9	56371	CAAATCAAAAATCATAGTGTGTCCCAGGGTGGGTCTTGTGTAAGATACTT	56420

BX284699.4	1851	CAAGTATTGTGGGGATCACATCACCATTACAGAGCTGAAGGATGTGGGAT	1900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX247949.9	56421	CAAGTATTGTGGGGATCACATCACCATTACAGAGCTGAAGGATGTGGGAT	56470

BX284699.4	1901	GGTGTTGGGGCTGTCTATTGTCTCTACGTAATCCAGCAACCTGTCCCTGA	1950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX247949.9	56471	GGTGTTGGGGCTGTCTATTGTCTCTACGTAATCCAGCAACCTGTCCCTGA	56520

BX284699.4	1951	AGAAGCCTGATGAAGCCTAAAGAATGAACTAGATTACTCCAGGTCTGGCC	2000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX247949.9	56521	AGAAGCCTGATGAAGCCTAAAGAATGAACTAGATTACTCCAGGTCTGGCC	56570

Overview

Query
BX284699.4 - 39108 bps
Hit
BX247949.9 - 56570 bps
Total alignments
1
Best alignment
alignment #1 (HSP: 2000 bps)
Best alignment cartoon

Alternate alignments

Short-link