<=>End overlap alignment

Alignment #1 HSP: 2000 bps / non-identical: 0 bps

Full alignment

BX571807.5	1	AAACCAGAGGATGCCCAGGTAAATTTGAATTTCCAAGAAATCATGGTTGT	50
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX120007.9	107683	AAACCAGAGGATGCCCAGGTAAATTTGAATTTCCAAGAAATCATGGTTGT	107732

BX571807.5	51	GTATCTGAAATTCAGATTTAACTAGGAACATGTATTTTATTTGGTAACTC	100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX120007.9	107733	GTATCTGAAATTCAGATTTAACTAGGAACATGTATTTTATTTGGTAACTC	107782

BX571807.5	101	TAGCCCAACTTGCTAGTCAAACCTCAGAAGAAGGAGTGATTTAATACTTC	150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX120007.9	107783	TAGCCCAACTTGCTAGTCAAACCTCAGAAGAAGGAGTGATTTAATACTTC	107832

BX571807.5	151	CTTGTGTTCTTCAACACATGACCATTATAGACATACAGAACTTTTAAAAT	200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX120007.9	107833	CTTGTGTTCTTCAACACATGACCATTATAGACATACAGAACTTTTAAAAT	107882

BX571807.5	201	GATAAATGTGAAATGAATGAAAGTTTCTCCTATACATCGGAACTAGCAGC	250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX120007.9	107883	GATAAATGTGAAATGAATGAAAGTTTCTCCTATACATCGGAACTAGCAGC	107932

BX571807.5	251	CCTTGCATCTCTGTCTGCACTCTAAGAAGCAACCTGGTACATTTGAATAT	300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX120007.9	107933	CCTTGCATCTCTGTCTGCACTCTAAGAAGCAACCTGGTACATTTGAATAT	107982

BX571807.5	301	CAGAAATTCTGTCAATAATTCAGACACAATATAGTCACTACTCACTAATG	350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX120007.9	107983	CAGAAATTCTGTCAATAATTCAGACACAATATAGTCACTACTCACTAATG	108032

BX571807.5	351	ATGGTCAGTCAAACTCTCAAACTCTAGAATCAGATAACCTGAATAAAAAA	400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX120007.9	108033	ATGGTCAGTCAAACTCTCAAACTCTAGAATCAGATAACCTGAATAAAAAA	108082

BX571807.5	401	CATGATCTCTTCTACTTGGGGCAATTTTTACCAACCATAATCCTTTTTGT	450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX120007.9	108083	CATGATCTCTTCTACTTGGGGCAATTTTTACCAACCATAATCCTTTTTGT	108132

BX571807.5	451	AATCTATCAAATGCATTTAATAATAGCGTAATCCTCACAGGATTACTGTT	500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX120007.9	108133	AATCTATCAAATGCATTTAATAATAGCGTAATCCTCACAGGATTACTGTT	108182

BX571807.5	501	AAGTGTAAAATTAAATGATGACTCTTATTAGCACTGATCACATAATAAAC	550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX120007.9	108183	AAGTGTAAAATTAAATGATGACTCTTATTAGCACTGATCACATAATAAAC	108232

BX571807.5	551	ACTCAAATGCATTCCCATTTTAACTTTTATGATCCCTATAACTGCAGCTC	600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX120007.9	108233	ACTCAAATGCATTCCCATTTTAACTTTTATGATCCCTATAACTGCAGCTC	108282

BX571807.5	601	ACATCATTTTATGTATTCCTGAATTCTAGAGCAATTAGTATCTTCATCAT	650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX120007.9	108283	ACATCATTTTATGTATTCCTGAATTCTAGAGCAATTAGTATCTTCATCAT	108332

BX571807.5	651	GATTTTGCAATTGTCTTCTGTTCTTCTATTAGTTTCATAAGGAATTGTCA	700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX120007.9	108333	GATTTTGCAATTGTCTTCTGTTCTTCTATTAGTTTCATAAGGAATTGTCA	108382

BX571807.5	701	TTCTGAAAACATAGGGCAGAAACACTGGTTTATGTCTAATAAAGCAGTAT	750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX120007.9	108383	TTCTGAAAACATAGGGCAGAAACACTGGTTTATGTCTAATAAAGCAGTAT	108432

BX571807.5	751	ACCTAAACCTCACACAAAAGGCATCTGCTGACATAGAAGAAAGGGACTTT	800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX120007.9	108433	ACCTAAACCTCACACAAAAGGCATCTGCTGACATAGAAGAAAGGGACTTT	108482

BX571807.5	801	CTACATGCTCAGATTTAAACTGCAATCTGATTTCCAGCACTAAATTTGTA	850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX120007.9	108483	CTACATGCTCAGATTTAAACTGCAATCTGATTTCCAGCACTAAATTTGTA	108532

BX571807.5	851	ACACTGGGTTTTACTTATATCCTCTCAATTTTAGATTCCAGAGATGTATA	900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX120007.9	108533	ACACTGGGTTTTACTTATATCCTCTCAATTTTAGATTCCAGAGATGTATA	108582

BX571807.5	901	TGTTTTTTAAATACCACAGATACAACAGGATAATTATTGAAATTGCATAC	950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX120007.9	108583	TGTTTTTTAAATACCACAGATACAACAGGATAATTATTGAAATTGCATAC	108632

BX571807.5	951	TGAAAATCATAGGCCTGGTACACAGTCACTGCAAAATGTTACCTGGCATA	1000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX120007.9	108633	TGAAAATCATAGGCCTGGTACACAGTCACTGCAAAATGTTACCTGGCATA	108682

BX571807.5	1001	TACTGATGGCGACCAGATTCATTTTATTTATCACTCCATTCTCATGACCT	1050
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX120007.9	108683	TACTGATGGCGACCAGATTCATTTTATTTATCACTCCATTCTCATGACCT	108732

BX571807.5	1051	AGAGTAATAACTGGTATATGTATGCTATGTCATTAATAAATATTGGCTGT	1100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX120007.9	108733	AGAGTAATAACTGGTATATGTATGCTATGTCATTAATAAATATTGGCTGT	108782

BX571807.5	1101	GTGAAATACTGGCTGCGTTAAATATTGGCTGTGTGACCTTTTGCATAAGT	1150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX120007.9	108783	GTGAAATACTGGCTGCGTTAAATATTGGCTGTGTGACCTTTTGCATAAGT	108832

BX571807.5	1151	AGTCAGCACTGCACACAGGGGCTCTCTAGCATTTCCTCGCTAATAATGAC	1200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX120007.9	108833	AGTCAGCACTGCACACAGGGGCTCTCTAGCATTTCCTCGCTAATAATGAC	108882

BX571807.5	1201	TGAGCATCTCTGGTTCACAAGTCCTCCTCCTTCTCTTCAGCTTCTTTTTA	1250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX120007.9	108883	TGAGCATCTCTGGTTCACAAGTCCTCCTCCTTCTCTTCAGCTTCTTTTTA	108932

BX571807.5	1251	TTTATTTATTTATTTATTTATTTATTTTTTATTATACTTTAAGTTCTAGG	1300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX120007.9	108933	TTTATTTATTTATTTATTTATTTATTTTTTATTATACTTTAAGTTCTAGG	108982

BX571807.5	1301	GTACATGTGCACAATGTGCAGGTTTGTTACACACATATACATGTGCCGTG	1350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX120007.9	108983	GTACATGTGCACAATGTGCAGGTTTGTTACACACATATACATGTGCCGTG	109032

BX571807.5	1351	TTGGTGTGCTGCACCCATTAACTCGTCATTTACATTATGCATATCTCCTA	1400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX120007.9	109033	TTGGTGTGCTGCACCCATTAACTCGTCATTTACATTATGCATATCTCCTA	109082

BX571807.5	1401	ATGCTATCCCTCCCCCCTCCCCCCGGTGTGTGATGTTCCTCTTCCTGTGT	1450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX120007.9	109083	ATGCTATCCCTCCCCCCTCCCCCCGGTGTGTGATGTTCCTCTTCCTGTGT	109132

BX571807.5	1451	CCAAGTGTTCTCATTGTTCAATTCCCACCTATGAGTGAGAACATGTGGTG	1500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX120007.9	109133	CCAAGTGTTCTCATTGTTCAATTCCCACCTATGAGTGAGAACATGTGGTG	109182

BX571807.5	1501	TTTGGTTTTTTTCTGCTTGTGATAGTTTGCTGAGAATTATGGTTTCCAGC	1550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX120007.9	109183	TTTGGTTTTTTTCTGCTTGTGATAGTTTGCTGAGAATTATGGTTTCCAGC	109232

BX571807.5	1551	TTCATCCATGTCCCTACAAAGGACATGAACTCATCCTTTTTTATGGCTGC	1600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX120007.9	109233	TTCATCCATGTCCCTACAAAGGACATGAACTCATCCTTTTTTATGGCTGC	109282

BX571807.5	1601	ATAGTATTCCATGGTGTGTATGTGCCACATTTTCTTCATCCAGTCTATCA	1650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX120007.9	109283	ATAGTATTCCATGGTGTGTATGTGCCACATTTTCTTCATCCAGTCTATCA	109332

BX571807.5	1651	TTGATGGACATTTGGGTTGGTTCCAAGTCTTTGCTATTGTGAATAGTGCC	1700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX120007.9	109333	TTGATGGACATTTGGGTTGGTTCCAAGTCTTTGCTATTGTGAATAGTGCC	109382

BX571807.5	1701	ACAATAAACATACGTGTGCATGTGTCTTTATAGCAGCATGATTTATAATC	1750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX120007.9	109383	ACAATAAACATACGTGTGCATGTGTCTTTATAGCAGCATGATTTATAATC	109432

BX571807.5	1751	CTTTGGGTATATACCCAGTAATGGGATGGCTGGGTCAAACAGTATTTCTA	1800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX120007.9	109433	CTTTGGGTATATACCCAGTAATGGGATGGCTGGGTCAAACAGTATTTCTA	109482

BX571807.5	1801	GTTCTAGATCCTTAAGGAATCACCACACTGTCTTCCACAATGGTTGAACT	1850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX120007.9	109483	GTTCTAGATCCTTAAGGAATCACCACACTGTCTTCCACAATGGTTGAACT	109532

BX571807.5	1851	CGTTTACAGTCCCACCAACAGTGTAAAAGTGTTCCTATTTCTCCACATCC	1900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX120007.9	109533	CGTTTACAGTCCCACCAACAGTGTAAAAGTGTTCCTATTTCTCCACATCC	109582

BX571807.5	1901	TCTCTAGCACCTGTTGTTTCCTGACTTTTTAATGAATGCCATTCTAACTG	1950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX120007.9	109583	TCTCTAGCACCTGTTGTTTCCTGACTTTTTAATGAATGCCATTCTAACTG	109632

BX571807.5	1951	GTGTGAGATGGTATCTCATTGTGGTTTTGATTTGCATTTCTCTGATGGCC	2000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX120007.9	109633	GTGTGAGATGGTATCTCATTGTGGTTTTGATTTGCATTTCTCTGATGGCC	109682

Overview

Query
BX571807.5 - 68685 bps
Hit
BX120007.9 - 109682 bps
Total alignments
1
Best alignment
alignment #1 (HSP: 2000 bps)
Best alignment cartoon

Alternate alignments

Short-link