<=>End overlap alignment

Alignment #1 HSP: 2000 bps / non-identical: 0 bps

Full alignment

BX088647.3	1	GGCCAATGTGGCTGAGCAAAGGAGAGCCTACCTGGAGGGCACCTGCATGG	50
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX120004.8	2837	GGCCAATGTGGCTGAGCAAAGGAGAGCCTACCTGGAGGGCACCTGCATGG	2886

BX088647.3	51	AGTGGCTCCGCAGACACCTGGAGAACGGGAAGGAGACGCTGCAGCGCGCG	100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX120004.8	2887	AGTGGCTCCGCAGACACCTGGAGAACGGGAAGGAGACGCTGCAGCGCGCG	2936

BX088647.3	101	GGTACCAGGGGCCATGGGGAGCCTGCTCGATCTCCTGTAGATCTCCCGGG	150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX120004.8	2937	GGTACCAGGGGCCATGGGGAGCCTGCTCGATCTCCTGTAGATCTCCCGGG	2986

BX088647.3	151	CTGGCCTCGCACAAGGAGGGGAAGAAAATGGAAACACCACCAGAATATCG	200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX120004.8	2987	CTGGCCTCGCACAAGGAGGGGAAGAAAATGGAAACACCACCAGAATATCG	3036

BX088647.3	201	CCCTCCCTCCTGTCCTGACGGAGAGGAATCCTCCTGGGTTTCCAGATCCT	250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX120004.8	3037	CCCTCCCTCCTGTCCTGACGGAGAGGAATCCTCCTGGGTTTCCAGATCCT	3086

BX088647.3	251	GTATCAGAGATTGACTCTGAGGGCCCACCCTGCTCTTCCTGGGACAATTA	300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX120004.8	3087	GTATCAGAGATTGACTCTGAGGGCCCACCCTGCTCTTCCTGGGACAATTA	3136

BX088647.3	301	AGGGATGAAGTCTCTGAGGGAGTGGAGGGGAAGACAATCCCTGGAAGACT	350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX120004.8	3137	AGGGATGAAGTCTCTGAGGGAGTGGAGGGGAAGACAATCCCTGGAAGACT	3186

BX088647.3	351	GATCCGCGGTCCCCTTTCACCCCACAGCAACCTTGGGCACCAGGACTTTT	400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX120004.8	3187	GATCCGCGGTCCCCTTTCACCCCACAGCAACCTTGGGCACCAGGACTTTT	3236

BX088647.3	401	CCTCCCGGGCCTTGTTCTCTGCCTCACACTCAATGTGTCGGAGTCTGACT	450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX120004.8	3237	CCTCCCGGGCCTTGTTCTCTGCCTCACACTCAATGTGTCGGAGTCTGACT	3286

BX088647.3	451	CCAGCTCCTCTGAGTCCCTTGGCCTCCACTCAGATCAGGACCAGAAGTCC	500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX120004.8	3287	CCAGCTCCTCTGAGTCCCTTGGCCTCCACTCAGATCAGGACCAGAAGTCC	3336

BX088647.3	501	CTGCTACCCTGCTCAGAGACTAGAACTTTCCAAGGAATAGGAGATTATCC	550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX120004.8	3337	CTGCTACCCTGCTCAGAGACTAGAACTTTCCAAGGAATAGGAGATTATCC	3386

BX088647.3	551	CAGGCGCCTGTGTCCAGGCTGGTGTCTGGGCTCTGTGCTCCCTTCCCCAC	600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX120004.8	3387	CAGGCGCCTGTGTCCAGGCTGGTGTCTGGGCTCTGTGCTCCCTTCCCCAC	3436

BX088647.3	601	CCCAGGTGTCCTATTCATCAGGATGGTCACATGGGCGCTGCTGGGGTGTC	650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX120004.8	3437	CCCAGGTGTCCTATTCATCAGGATGGTCACATGGGCGCTGCTGGGGTGTC	3486

BX088647.3	651	CCATGAGGAATGCAAAGTGCCTGAGTTTTCCGACTCTTCCTTTCAGACCC	700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX120004.8	3487	CCATGAGGAATGCAAAGTGCCTGAGTTTTCCGACTCTTCCTTTCAGACCC	3536

BX088647.3	701	CCCCCAAGACACACGTGACCCACCCCCCTCTCTGAACATGAGGCATAACG	750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX120004.8	3537	CCCCCAAGACACACGTGACCCACCCCCCTCTCTGAACATGAGGCATAACG	3586

BX088647.3	751	AGGTCCTGGGTTCTGGGCTTCTACCCTGCGGAGATCACATTGACCTGGCA	800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX120004.8	3587	AGGTCCTGGGTTCTGGGCTTCTACCCTGCGGAGATCACATTGACCTGGCA	3636

BX088647.3	801	GCGGGATGGGGAGGACCAGACCCAGGACATGGAGCTCGTGGAGACCAGGC	850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX120004.8	3637	GCGGGATGGGGAGGACCAGACCCAGGACATGGAGCTCGTGGAGACCAGGC	3686

BX088647.3	851	CCACAGGGGATGGAACCTTCCAGAAGTGGGCGGTTGTGGTAGTGCCTTCT	900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX120004.8	3687	CCACAGGGGATGGAACCTTCCAGAAGTGGGCGGTTGTGGTAGTGCCTTCT	3736

BX088647.3	901	GGAGAGGAACAGAGATACACATGCCATGTGCAGCACAAGGGGCTGCCCAA	950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX120004.8	3737	GGAGAGGAACAGAGATACACATGCCATGTGCAGCACAAGGGGCTGCCCAA	3786

BX088647.3	951	GCCCCTCATCCTGAGATGGGGTAAGGAGAGAGATGGGGGCGGCCATGTCT	1000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX120004.8	3787	GCCCCTCATCCTGAGATGGGGTAAGGAGAGAGATGGGGGCGGCCATGTCT	3836

BX088647.3	1001	CTTAGGGAAAGCAGGAGCCCCTCTGGAGACCTTTAGCAGGGTCGGGGCTG	1050
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX120004.8	3837	CTTAGGGAAAGCAGGAGCCCCTCTGGAGACCTTTAGCAGGGTCGGGGCTG	3886

BX088647.3	1051	GGTCCTGGAGGTCAGAACCCTCACATTCCCCTCCTTTCCCAGAGCCCTCT	1100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX120004.8	3887	GGTCCTGGAGGTCAGAACCCTCACATTCCCCTCCTTTCCCAGAGCCCTCT	3936

BX088647.3	1101	CCCCAGCCCACCATCCCCATTGTGGGTATCATTGCTGGCCTGGTTCTCCT	1150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX120004.8	3937	CCCCAGCCCACCATCCCCATTGTGGGTATCATTGCTGGCCTGGTTCTCCT	3986

BX088647.3	1151	TGGAGCTGTGGTCACTGGAGCTGTGGTCACTGCTGTGATGTGGAGGAAGA	1200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX120004.8	3987	TGGAGCTGTGGTCACTGGAGCTGTGGTCACTGCTGTGATGTGGAGGAAGA	4036

BX088647.3	1201	AGAGCTCAGGTGGGGAAGGGGTGAGGAGTCGGGTTTGAGTTTTCTTGTCC	1250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX120004.8	4037	AGAGCTCAGGTGGGGAAGGGGTGAGGAGTCGGGTTTGAGTTTTCTTGTCC	4086

BX088647.3	1251	CACTGGGGGTTTCAAGCTCCAGGTAGAAATGTGTTCTGCCTGGTTACCGG	1300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX120004.8	4087	CACTGGGGGTTTCAAGCTCCAGGTAGAAATGTGTTCTGCCTGGTTACCGG	4136

BX088647.3	1301	GAAGCACCATCCACATTCATGGGCCTACCCAGCCTGGGCCCTGTGTGCCA	1350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX120004.8	4137	GAAGCACCATCCACATTCATGGGCCTACCCAGCCTGGGCCCTGTGTGCCA	4186

BX088647.3	1351	GCACTTACTCTTTTGTAAGCACCTGTGACAATGAAGGACAGATTTCTCAC	1400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX120004.8	4187	GCACTTACTCTTTTGTAAGCACCTGTGACAATGAAGGACAGATTTCTCAC	4236

BX088647.3	1401	CTTGATGATTGTAGTGATGGGGATCTGACCCCAGTAATCACAGGTCAGGG	1450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX120004.8	4237	CTTGATGATTGTAGTGATGGGGATCTGACCCCAGTAATCACAGGTCAGGG	4286

BX088647.3	1451	GAAGGTCCCTGCTGAGGACAGACCTTAGGAGGGCAGTTGGTCCAGGACCC	1500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX120004.8	4287	GAAGGTCCCTGCTGAGGACAGACCTTAGGAGGGCAGTTGGTCCAGGACCC	4336

BX088647.3	1501	ACATCTGCTTTCCTTGTTTTTCCTGATCCTGCCCTTGGTTTGCAGTCACA	1550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX120004.8	4337	ACATCTGCTTTCCTTGTTTTTCCTGATCCTGCCCTTGGTTTGCAGTCACA	4386

BX088647.3	1551	CATTTCTGGAAACTTCTCGAGGTTCCAAGACTAGGAGGTTCCTCTAGGAC	1600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX120004.8	4387	CATTTCTGGAAACTTCTCGAGGTTCCAAGACTAGGAGGTTCCTCTAGGAC	4436

BX088647.3	1601	CTCATGGCCCTGCTACCTTCCTGGCCTCTCACAGGACGTTTTCTTCCCGC	1650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX120004.8	4437	CTCATGGCCCTGCTACCTTCCTGGCCTCTCACAGGACGTTTTCTTCCCGC	4486

BX088647.3	1651	AGATAGAAAAGGAGGGAGCTACTCTCAGGCTGCAAGTAAGTATGAAGGAG	1700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX120004.8	4487	AGATAGAAAAGGAGGGAGCTACTCTCAGGCTGCAAGTAAGTATGAAGGAG	4536

BX088647.3	1701	GCTGATCCCTGAGATCCTTGGGATATTGTGGTTGGGAGCCCATGGGGGAG	1750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX120004.8	4537	GCTGATCCCTGAGATCCTTGGGATATTGTGGTTGGGAGCCCATGGGGGAG	4586

BX088647.3	1751	CTCACCCACCCCACAATTCCTCCTCTAGCCACATCTCCTGTGGGATCTGA	1800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX120004.8	4587	CTCACCCACCCCACAATTCCTCCTCTAGCCACATCTCCTGTGGGATCTGA	4636

BX088647.3	1801	CCAGGTTCTGTTTTTGTTCTACCCCAGGCAGCCAAAGTGCCCAGGGCTCT	1850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX120004.8	4637	CCAGGTTCTGTTTTTGTTCTACCCCAGGCAGCCAAAGTGCCCAGGGCTCT	4686

BX088647.3	1851	GATGTGTCTCTCACGGCTTGTAAAGGTGAGACCCTGGGGAGGCTGATGTG	1900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX120004.8	4687	GATGTGTCTCTCACGGCTTGTAAAGGTGAGACCCTGGGGAGGCTGATGTG	4736

BX088647.3	1901	TGTGGGTTGTTGGGGTAACAGTGGATATAGCTGTGCTATGGGGTTTCTTT	1950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX120004.8	4737	TGTGGGTTGTTGGGGTAACAGTGGATATAGCTGTGCTATGGGGTTTCTTT	4786

BX088647.3	1951	GACTTGGATGTATTCAGCACATGATGGGCTGTTGAAGGTGTGACCCCTCA	2000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX120004.8	4787	GACTTGGATGTATTCAGCACATGATGGGCTGTTGAAGGTGTGACCCCTCA	4836

Overview

Query
BX088647.3 - 100183 bps
Hit
BX120004.8 - 4836 bps
Total alignments
1
Best alignment
alignment #1 (HSP: 2000 bps)
Best alignment cartoon

Alternate alignments

Short-link