<=>End overlap alignment

Alignment #1 HSP: 2000 bps / non-identical: 0 bps

Full alignment

BX005428.7	1	GGCCAGGTGTTGTGGTACATGCCTTTAGTCCTAGGTGCTTAGGAGGTTGA	50
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX120002.12	49243	GGCCAGGTGTTGTGGTACATGCCTTTAGTCCTAGGTGCTTAGGAGGTTGA	49292

BX005428.7	51	GGTGGGAGGATTGCTTGAGCTCAGGAGTTTGAGGTTACAGTGAGCTATGA	100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX120002.12	49293	GGTGGGAGGATTGCTTGAGCTCAGGAGTTTGAGGTTACAGTGAGCTATGA	49342

BX005428.7	101	TTGCACCACTGCATTCCAGCCTTGGCAATGGAGTGAGGCCCTATTTCTAA	150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX120002.12	49343	TTGCACCACTGCATTCCAGCCTTGGCAATGGAGTGAGGCCCTATTTCTAA	49392

BX005428.7	151	ACAGAACAAAAAAAAAGAATGCCTGCTGATAAACCTTGTGACAGGACATT	200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX120002.12	49393	ACAGAACAAAAAAAAAGAATGCCTGCTGATAAACCTTGTGACAGGACATT	49442

BX005428.7	201	CATGAAGGATGAAGAAAAGATTTCTTTTATTTTTTTATTTTTATTTTTTT	250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX120002.12	49443	CATGAAGGATGAAGAAAAGATTTCTTTTATTTTTTTATTTTTATTTTTTT	49492

BX005428.7	251	GAGACAGAGTCTCGCTCTGTTGCCCCGGCTGGAGTGCAGTGGCGCCATCT	300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX120002.12	49493	GAGACAGAGTCTCGCTCTGTTGCCCCGGCTGGAGTGCAGTGGCGCCATCT	49542

BX005428.7	301	CAGCTCACTGCAACCTCCAACTCCTGAGTAGCTGGGATTACAGGTGCGTG	350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX120002.12	49543	CAGCTCACTGCAACCTCCAACTCCTGAGTAGCTGGGATTACAGGTGCGTG	49592

BX005428.7	351	CCACCATACCCGGTTAATTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTAGTACAC	400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX120002.12	49593	CCACCATACCCGGTTAATTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTAGTACAC	49642

BX005428.7	401	ACAGGGTTTCACCATGTTGGTCAGGCTGGTCTCAAACTCCTGACCTCATG	450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX120002.12	49643	ACAGGGTTTCACCATGTTGGTCAGGCTGGTCTCAAACTCCTGACCTCATG	49692

BX005428.7	451	ATCTGCCTGCCTCAGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCGTGAGCCAC	500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX120002.12	49693	ATCTGCCTGCCTCAGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCGTGAGCCAC	49742

BX005428.7	501	CGCGCCCGGCTAGAAAAGATTTCTTTCTTTTTTCTTTTTTTTTTTTAATT	550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX120002.12	49743	CGCGCCCGGCTAGAAAAGATTTCTTTCTTTTTTCTTTTTTTTTTTTAATT	49792

BX005428.7	551	ATACTGTAAGTTTTAGGGTACATATGCACAACATGCCGGTTAGTTACATA	600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX120002.12	49793	ATACTGTAAGTTTTAGGGTACATATGCACAACATGCCGGTTAGTTACATA	49842

BX005428.7	601	TGTATACATGTGCCATGTTGGTGTGCTGCACCCATAACTCATCATTTAAC	650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX120002.12	49843	TGTATACATGTGCCATGTTGGTGTGCTGCACCCATAACTCATCATTTAAC	49892

BX005428.7	651	ATTAGATATATCTCCTAATGCTATCCCTCCCCACTCCCTAGAAAAGATTT	700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX120002.12	49893	ATTAGATATATCTCCTAATGCTATCCCTCCCCACTCCCTAGAAAAGATTT	49942

BX005428.7	701	CTTGTGGAGTTTTTAAAAAGTCCTTTGAAACAATTCTTTTCTTTTCCTTT	750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX120002.12	49943	CTTGTGGAGTTTTTAAAAAGTCCTTTGAAACAATTCTTTTCTTTTCCTTT	49992

BX005428.7	751	TTTTTTTTTTTCGATACAGAGTTTTGCTCTTGTTGCCCAGGCTAGAGTGC	800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX120002.12	49993	TTTTTTTTTTTCGATACAGAGTTTTGCTCTTGTTGCCCAGGCTAGAGTGC	50042

BX005428.7	801	AATGGCATGATCTCGGCTCACCGCAACCTCCGCCTCCCGGGTTCAAGCGA	850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX120002.12	50043	AATGGCATGATCTCGGCTCACCGCAACCTCCGCCTCCCGGGTTCAAGCGA	50092

BX005428.7	851	TTCTCCTGCCTCAGCCTCCCTAGTAGCTGGGATTACAGGCATGCACCACC	900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX120002.12	50093	TTCTCCTGCCTCAGCCTCCCTAGTAGCTGGGATTACAGGCATGCACCACC	50142

BX005428.7	901	ATGCTTGGCTAATTTTGTATTTTTAGTAGAGATGGGGTTTCTCCATGTTG	950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX120002.12	50143	ATGCTTGGCTAATTTTGTATTTTTAGTAGAGATGGGGTTTCTCCATGTTG	50192

BX005428.7	951	GTCAGGCTGTTCTCGAACTCCCAACCTCAGGTGATCCACCCACCTCGGCC	1000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX120002.12	50193	GTCAGGCTGTTCTCGAACTCCCAACCTCAGGTGATCCACCCACCTCGGCC	50242

BX005428.7	1001	TCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCATGAGCTACCACGCCCAACTTAACAA	1050
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX120002.12	50243	TCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCATGAGCTACCACGCCCAACTTAACAA	50292

BX005428.7	1051	TTCTTACTTCAAACATGTAAGCATGACGTTCCTCTCCTTCATGCCTTCCT	1100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX120002.12	50293	TTCTTACTTCAAACATGTAAGCATGACGTTCCTCTCCTTCATGCCTTCCT	50342

BX005428.7	1101	GGCCTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTGAGACAGAGTCTCGCTTCTTCA	1150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX120002.12	50343	GGCCTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTGAGACAGAGTCTCGCTTCTTCA	50392

BX005428.7	1151	CCTAGGCTAGCGTGCAATGGTGTGATCTTGGCTCACTGCAACCTCCACCT	1200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX120002.12	50393	CCTAGGCTAGCGTGCAATGGTGTGATCTTGGCTCACTGCAACCTCCACCT	50442

BX005428.7	1201	CCCAGGTTCAAGCAATTCTCGTGCCTCAGCCTCCCCAGTAGCTGGGATTA	1250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX120002.12	50443	CCCAGGTTCAAGCAATTCTCGTGCCTCAGCCTCCCCAGTAGCTGGGATTA	50492

BX005428.7	1251	CAACCACATGCCAGCACGTCCGACTAATTTTTGTACTTTTAGTAGAGATG	1300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX120002.12	50493	CAACCACATGCCAGCACGTCCGACTAATTTTTGTACTTTTAGTAGAGATG	50542

BX005428.7	1301	GGGGTTTCACTATGTAGGCCAGGCTGGTCTCGAACTCCTGACCTCAGGTG	1350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX120002.12	50543	GGGGTTTCACTATGTAGGCCAGGCTGGTCTCGAACTCCTGACCTCAGGTG	50592

BX005428.7	1351	ATCCGCTCGCCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAAGCGTAAGCCAC	1400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX120002.12	50593	ATCCGCTCGCCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAAGCGTAAGCCAC	50642

BX005428.7	1401	CGTGCCTGGCCTGGCCCTATTTTATCTGGGTCTGACAAAAGTTATTTCAT	1450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX120002.12	50643	CGTGCCTGGCCTGGCCCTATTTTATCTGGGTCTGACAAAAGTTATTTCAT	50692

BX005428.7	1451	CCTAGTATCTGCAATTTTTCCGCAGAAAATTACAGAGACGCACAGTGAAT	1500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX120002.12	50693	CCTAGTATCTGCAATTTTTCCGCAGAAAATTACAGAGACGCACAGTGAAT	50742

BX005428.7	1501	GTGAAAGGAGGGAAATTAACAATAGCTATTGGCAGAGCCAAACAAATCAT	1550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX120002.12	50743	GTGAAAGGAGGGAAATTAACAATAGCTATTGGCAGAGCCAAACAAATCAT	50792

BX005428.7	1551	TACACTTTAGCTGGATCATCTGGGAGTTGAGACCTTGAGGGTATAAGGAG	1600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX120002.12	50793	TACACTTTAGCTGGATCATCTGGGAGTTGAGACCTTGAGGGTATAAGGAG	50842

BX005428.7	1601	GTAGCATGTCAATGCTTGTTAAGAAAGAATGGCAACAACTGTGCTGCCTT	1650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX120002.12	50843	GTAGCATGTCAATGCTTGTTAAGAAAGAATGGCAACAACTGTGCTGCCTT	50892

BX005428.7	1651	ACAGATCAGCACCTTCTGCAGTCTGCGAGCCCAACCTTAGATCCATTTGT	1700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX120002.12	50893	ACAGATCAGCACCTTCTGCAGTCTGCGAGCCCAACCTTAGATCCATTTGT	50942

BX005428.7	1701	AGGCAACAGTAAAAGGTCTCATATTTTCATCGCAGTGAGCCCTGACTGCC	1750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX120002.12	50943	AGGCAACAGTAAAAGGTCTCATATTTTCATCGCAGTGAGCCCTGACTGCC	50992

BX005428.7	1751	ATCAGGAAGATTTGGTCCTCTAGGTAAGATTTCCCTGAGACAAAGTACTA	1800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX120002.12	50993	ATCAGGAAGATTTGGTCCTCTAGGTAAGATTTCCCTGAGACAAAGTACTA	51042

BX005428.7	1801	TGGGAAATCAAGTGCATATTCAGCCTCTTAGTACTCTGGGTTGGTGTTAC	1850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX120002.12	51043	TGGGAAATCAAGTGCATATTCAGCCTCTTAGTACTCTGGGTTGGTGTTAC	51092

BX005428.7	1851	CGTACTGACGAAGGCGATCCATTGATGAAAAACAAACTGACCTAAAGAAA	1900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX120002.12	51093	CGTACTGACGAAGGCGATCCATTGATGAAAAACAAACTGACCTAAAGAAA	51142

BX005428.7	1901	TGTAAATAAATGCTTGCAGTCAGCCCTGTTCCTCTGAAAAATTCCCCTAG	1950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX120002.12	51143	TGTAAATAAATGCTTGCAGTCAGCCCTGTTCCTCTGAAAAATTCCCCTAG	51192

BX005428.7	1951	CCCTTATGTTGAAACCTGATGAGAACTTTAAAAATGTTAACTTGGTAATG	2000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX120002.12	51193	CCCTTATGTTGAAACCTGATGAGAACTTTAAAAATGTTAACTTGGTAATG	51242

Overview

Query
BX005428.7 - 130934 bps
Hit
BX120002.12 - 51242 bps
Total alignments
1
Best alignment
alignment #1 (HSP: 2000 bps)
Best alignment cartoon

Alternate alignments

Short-link