<=>End overlap alignment

Alignment #1 HSP: 2000 bps / non-identical: 0 bps

Full alignment

BX255945.6	1	GGCCAGGCTGGTCTCAAACTCCTGGCCTTGAGTGATCCCCTCACCTCGGC	50
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX119999.11	24038	GGCCAGGCTGGTCTCAAACTCCTGGCCTTGAGTGATCCCCTCACCTCGGC	24087

BX255945.6	51	CTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGTGTGAGCCTCCATACTGGGCCAAGAA	100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX119999.11	24088	CTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGTGTGAGCCTCCATACTGGGCCAAGAA	24137

BX255945.6	101	AGGAAATTCTTGAACTGAGTATTTTGTGGCGTTTCCCAGCTGAAGACAAA	150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX119999.11	24138	AGGAAATTCTTGAACTGAGTATTTTGTGGCGTTTCCCAGCTGAAGACAAA	24187

BX255945.6	151	TAAGCAGGGCAGTGGAAGGTATTTACTTGTTGCCTTACAGAGTAAAGAAG	200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX119999.11	24188	TAAGCAGGGCAGTGGAAGGTATTTACTTGTTGCCTTACAGAGTAAAGAAG	24237

BX255945.6	201	AAGATAAAAAAAACTTACGATGTACTTATCCTGCCAAAATACTGAATATT	250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX119999.11	24238	AAGATAAAAAAAACTTACGATGTACTTATCCTGCCAAAATACTGAATATT	24287

BX255945.6	251	GTGTGTTTTGGATTAAGGACATTGTCTCTGTGGATATTCTTCCTAATGGG	300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX119999.11	24288	GTGTGTTTTGGATTAAGGACATTGTCTCTGTGGATATTCTTCCTAATGGG	24337

BX255945.6	301	AGCATCAGAGTTAGTTCTTTTAGAGAGTACCACATTTTCCATACCAGACA	350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX119999.11	24338	AGCATCAGAGTTAGTTCTTTTAGAGAGTACCACATTTTCCATACCAGACA	24387

BX255945.6	351	GAATTCCTGATTATCTCTGTGGGGATCGATCACAAACTCAGTTGCATTAA	400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX119999.11	24388	GAATTCCTGATTATCTCTGTGGGGATCGATCACAAACTCAGTTGCATTAA	24437

BX255945.6	401	GGGGCCCAGCAGGTCTCATGATTGTGAATCTGCTAGTTATAAGGGATAGA	450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX119999.11	24438	GGGGCCCAGCAGGTCTCATGATTGTGAATCTGCTAGTTATAAGGGATAGA	24487

BX255945.6	451	GATGGTGAAAAGTCCATGCCCTACCCAGAGGCATTCAAATTCAAAATTTA	500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX119999.11	24488	GATGGTGAAAAGTCCATGCCCTACCCAGAGGCATTCAAATTCAAAATTTA	24537

BX255945.6	501	AAATAATACCATCCTGACGAAACAAAACACATCTATAGGTGGCACTGGGC	550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX119999.11	24538	AAATAATACCATCCTGACGAAACAAAACACATCTATAGGTGGCACTGGGC	24587

BX255945.6	551	TAGTGGTGGCTAATTTGGGAGCTCCGTTTTCAGATGAGAAGAGATTTAAG	600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX119999.11	24588	TAGTGGTGGCTAATTTGGGAGCTCCGTTTTCAGATGAGAAGAGATTTAAG	24637

BX255945.6	601	TGAGCACCATCTATACTTCAACAACAGTGCACTTTGAAATCAGTATCATA	650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX119999.11	24638	TGAGCACCATCTATACTTCAACAACAGTGCACTTTGAAATCAGTATCATA	24687

BX255945.6	651	TGGTTGCGGCCTGAGTTGGGATAGGGCAAGTGAATCCCTTCCTTTTCGTT	700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX119999.11	24688	TGGTTGCGGCCTGAGTTGGGATAGGGCAAGTGAATCCCTTCCTTTTCGTT	24737

BX255945.6	701	ACTTTAAGGATAGGTATTGGTTGGATCACATTTAATTAAAACCTGTGAGT	750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX119999.11	24738	ACTTTAAGGATAGGTATTGGTTGGATCACATTTAATTAAAACCTGTGAGT	24787

BX255945.6	751	AATAAACTTGTTCAGATTGTGAAGCATCTGGAAGTTTTGATACCTTTTAG	800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX119999.11	24788	AATAAACTTGTTCAGATTGTGAAGCATCTGGAAGTTTTGATACCTTTTAG	24837

BX255945.6	801	AAAAAATAATGAAATATGATATATTTAATTCCATCTTTGAACAAGAAACA	850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX119999.11	24838	AAAAAATAATGAAATATGATATATTTAATTCCATCTTTGAACAAGAAACA	24887

BX255945.6	851	ACTTTGCTAGTAGGAAATGTGACCCTAATATGCAACCACAAATGTAATAG	900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX119999.11	24888	ACTTTGCTAGTAGGAAATGTGACCCTAATATGCAACCACAAATGTAATAG	24937

BX255945.6	901	TCAGTATGAAAACTTTTGTAGGAAAAGCACATAGATCAGAAAAAAAACCC	950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX119999.11	24938	TCAGTATGAAAACTTTTGTAGGAAAAGCACATAGATCAGAAAAAAAACCC	24987

BX255945.6	951	TGTCCAGTCAGGATTATCTGTTTTGGATTTTTTGCCGATTTCCTCACTTC	1000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX119999.11	24988	TGTCCAGTCAGGATTATCTGTTTTGGATTTTTTGCCGATTTCCTCACTTC	25037

BX255945.6	1001	CCTCCTCCTCATTCCTGTCACAGTCTTCCCTTCATTTAGAAAATGTGTTC	1050
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX119999.11	25038	CCTCCTCCTCATTCCTGTCACAGTCTTCCCTTCATTTAGAAAATGTGTTC	25087

BX255945.6	1051	TTTTTTTTTTCTTTTTGACAATCAATTGAAATCAGTTTCAGAAGGTTTAT	1100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX119999.11	25088	TTTTTTTTTTCTTTTTGACAATCAATTGAAATCAGTTTCAGAAGGTTTAT	25137

BX255945.6	1101	TTAAACTTTACCTCTTTGGTTTTCCTCCCTTCTCCATTCATTTTTTCCAG	1150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX119999.11	25138	TTAAACTTTACCTCTTTGGTTTTCCTCCCTTCTCCATTCATTTTTTCCAG	25187

BX255945.6	1151	CTTCCCTCACTTCTCTGTTCTTTTTTTTTTTTTGAGATGGAGTCTCACTC	1200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX119999.11	25188	CTTCCCTCACTTCTCTGTTCTTTTTTTTTTTTTGAGATGGAGTCTCACTC	25237

BX255945.6	1201	TGTCACCCAGGTTGGATGGCAGTGTTGCGATCCTGGCTCACTGCAACCTC	1250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX119999.11	25238	TGTCACCCAGGTTGGATGGCAGTGTTGCGATCCTGGCTCACTGCAACCTC	25287

BX255945.6	1251	CTCTCCCAGGTTCAAGCAATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCGAGTAGCTGGA	1300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX119999.11	25288	CTCTCCCAGGTTCAAGCAATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCGAGTAGCTGGA	25337

BX255945.6	1301	ATTACAGGAGCATACCACCACGCCCAACTAATTTTGTATTTTTGGTAGAG	1350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX119999.11	25338	ATTACAGGAGCATACCACCACGCCCAACTAATTTTGTATTTTTGGTAGAG	25387

BX255945.6	1351	ACGGGGTTTCAGCAGGCTGGTCTCGAACTCCTGACCTCAGGTGATCCACC	1400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX119999.11	25388	ACGGGGTTTCAGCAGGCTGGTCTCGAACTCCTGACCTCAGGTGATCCACC	25437

BX255945.6	1401	TGCCTCAGCCTCCTAAAGTGTCATGATTACGGGCGTGAGCCATGGTGCCC	1450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX119999.11	25438	TGCCTCAGCCTCCTAAAGTGTCATGATTACGGGCGTGAGCCATGGTGCCC	25487

BX255945.6	1451	AGCCTCTTCTCTGTTCTTTTATTTGATTAATTTTCAACTGGTTGTTGAAA	1500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX119999.11	25488	AGCCTCTTCTCTGTTCTTTTATTTGATTAATTTTCAACTGGTTGTTGAAA	25537

BX255945.6	1501	TTAGTTATGTAACGGACTTGAAATTTTAATGAGAGATTAAATAACTTGCC	1550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX119999.11	25538	TTAGTTATGTAACGGACTTGAAATTTTAATGAGAGATTAAATAACTTGCC	25587

BX255945.6	1551	TATGTTCAAATAAATAGTAAGTAGGGAGCTGGGATACAACTCCAGTTAGC	1600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX119999.11	25588	TATGTTCAAATAAATAGTAAGTAGGGAGCTGGGATACAACTCCAGTTAGC	25637

BX255945.6	1601	CTGGCTCTAGAGTCTGCATGCTTAACTGCTAGGCAATAGTCCTCTGTAAA	1650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX119999.11	25638	CTGGCTCTAGAGTCTGCATGCTTAACTGCTAGGCAATAGTCCTCTGTAAA	25687

BX255945.6	1651	TTGAAAATAATTAACAAGCAAATTTATTTTAAAAGTGATTTTTTAGTAGG	1700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX119999.11	25688	TTGAAAATAATTAACAAGCAAATTTATTTTAAAAGTGATTTTTTAGTAGG	25737

BX255945.6	1701	TCTTATTATATTATTCTCAATTCATGGAGAAATAGTGTATAGTTCAGATA	1750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX119999.11	25738	TCTTATTATATTATTCTCAATTCATGGAGAAATAGTGTATAGTTCAGATA	25787

BX255945.6	1751	CGAAGTGAGCAATAACTTTTTCCTAAGCCTACAGTCAGAGTGTACAGCAT	1800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX119999.11	25788	CGAAGTGAGCAATAACTTTTTCCTAAGCCTACAGTCAGAGTGTACAGCAT	25837

BX255945.6	1801	AATTTCCTCCCTTGAAGGTAGGCTGTGATTAGAGAGGGACATAGTCAAGG	1850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX119999.11	25838	AATTTCCTCCCTTGAAGGTAGGCTGTGATTAGAGAGGGACATAGTCAAGG	25887

BX255945.6	1851	GAGGATCTGTTTAAGATGGAAGAAAATCAAACCTGTTCTATACCTTAAGG	1900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX119999.11	25888	GAGGATCTGTTTAAGATGGAAGAAAATCAAACCTGTTCTATACCTTAAGG	25937

BX255945.6	1901	AGAAGCAATTAAAGGAAGGAAAATATTTAAAGATGTAGAAGAGAGAAGAA	1950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX119999.11	25938	AGAAGCAATTAAAGGAAGGAAAATATTTAAAGATGTAGAAGAGAGAAGAA	25987

BX255945.6	1951	ATGACTTCTGAAGAAATAAGGGGGTGAGAGGATGTGGTCAAAGGCAAGAA	2000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX119999.11	25988	ATGACTTCTGAAGAAATAAGGGGGTGAGAGGATGTGGTCAAAGGCAAGAA	26037

Overview

Query
BX255945.6 - 96060 bps
Hit
BX119999.11 - 26037 bps
Total alignments
1
Best alignment
alignment #1 (HSP: 2000 bps)
Best alignment cartoon

Alternate alignments

Short-link