<=>End overlap alignment

Alignment #1 HSP: 2000 bps / non-identical: 0 bps

Full alignment

BX005439.8	1	GGCCAGGAAAAGAGTATGAAGTTCATGTGCCAGTTTCTCAAAATTCCTGC	50
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX119958.10	36593	GGCCAGGAAAAGAGTATGAAGTTCATGTGCCAGTTTCTCAAAATTCCTGC	36642

BX005439.8	51	TTTCAATGTTGATGTCCAGTAAAGATATTCGTAATTTCAGCTCTATAATC	100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX119958.10	36643	TTTCAATGTTGATGTCCAGTAAAGATATTCGTAATTTCAGCTCTATAATC	36692

BX005439.8	101	TTAATAGGATTTCCTCTAATATTGTGAAGCATATTATATGAAACAGGAAC	150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX119958.10	36693	TTAATAGGATTTCCTCTAATATTGTGAAGCATATTATATGAAACAGGAAC	36742

BX005439.8	151	ACAAATTTCTCAAAATTCCTGCGATGTCCAATAAAGATTTTCATAATTTC	200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX119958.10	36743	ACAAATTTCTCAAAATTCCTGCGATGTCCAATAAAGATTTTCATAATTTC	36792

BX005439.8	201	AGCTCTGCAATCTTAATAGGATTTCCTAATACTGTAAAGCATATTAAATG	250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX119958.10	36793	AGCTCTGCAATCTTAATAGGATTTCCTAATACTGTAAAGCATATTAAATG	36842

BX005439.8	251	AAACAGGAACTCAAATTTGGAGCCCCCTCTCCAGGAGGTTCTGTGTGGAG	300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX119958.10	36843	AAACAGGAACTCAAATTTGGAGCCCCCTCTCCAGGAGGTTCTGTGTGGAG	36892

BX005439.8	301	ATGGTGGCTGTGGCAGTGGCAGTTCCCAGGTGCAGAGGGTGGGCAGAGGC	350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX119958.10	36893	ATGGTGGCTGTGGCAGTGGCAGTTCCCAGGTGCAGAGGGTGGGCAGAGGC	36942

BX005439.8	351	AGCCTCAGGCTAAGGGGTCTCCCCTACTCCACATGGAGAAAATCCCTTGT	400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX119958.10	36943	AGCCTCAGGCTAAGGGGTCTCCCCTACTCCACATGGAGAAAATCCCTTGT	36992

BX005439.8	401	AGGTTGCAAGGGCAGTGGCCGGGTGGAATCCCTGCTAGGGACAGAGCAGG	450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX119958.10	36993	AGGTTGCAAGGGCAGTGGCCGGGTGGAATCCCTGCTAGGGACAGAGCAGG	37042

BX005439.8	451	AAGGCCTCGCAGCCTCACCAAGCAGCAGCCCTGGGGTGGAGCTGCGTTTC	500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX119958.10	37043	AAGGCCTCGCAGCCTCACCAAGCAGCAGCCCTGGGGTGGAGCTGCGTTTC	37092

BX005439.8	501	CAGGGTTAAGCGGACCAGGCAGGAGTAGCGGTTACTCAAGAGCAGGTCAC	550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX119958.10	37093	CAGGGTTAAGCGGACCAGGCAGGAGTAGCGGTTACTCAAGAGCAGGTCAC	37142

BX005439.8	551	AGGCTTGGGTTGTGAGGGTCAGGAGAGGCCAGGCCTCCTCGAGCAAGGTG	600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX119958.10	37143	AGGCTTGGGTTGTGAGGGTCAGGAGAGGCCAGGCCTCCTCGAGCAAGGTG	37192

BX005439.8	601	GGGGTCCCAGGGTCAGGTCAGGTGCAGATCCTGTGGCAGCCACGTCTTTC	650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX119958.10	37193	GGGGTCCCAGGGTCAGGTCAGGTGCAGATCCTGTGGCAGCCACGTCTTTC	37242

BX005439.8	651	CATGCTGGGCCTGCTGGGCCCCCCAGGCTTCCTGATGGGGTCCCCAGTTA	700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX119958.10	37243	CATGCTGGGCCTGCTGGGCCCCCCAGGCTTCCTGATGGGGTCCCCAGTTA	37292

BX005439.8	701	GGAGCTGCCTGCTCAGGGCTGGGAGGGGAGGAGCACTGAGCTGCAGATAG	750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX119958.10	37293	GGAGCTGCCTGCTCAGGGCTGGGAGGGGAGGAGCACTGAGCTGCAGATAG	37342

BX005439.8	751	AGGGCAGAGCCCACAGTGGGCAGGGCCTGCCCTGGTGTGTAGGTGCCTCT	800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX119958.10	37343	AGGGCAGAGCCCACAGTGGGCAGGGCCTGCCCTGGTGTGTAGGTGCCTCT	37392

BX005439.8	801	GCAGGAGAGGAGGGCCTGGGGACTGAGAGCAAGGGTCAGGGCCTCTCTTT	850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX119958.10	37393	GCAGGAGAGGAGGGCCTGGGGACTGAGAGCAAGGGTCAGGGCCTCTCTTT	37442

BX005439.8	851	GGGGAGGCCTCTCACTGTAACAGGACTGGTCAGGCCTGAGAGGAGGGCAC	900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX119958.10	37443	GGGGAGGCCTCTCACTGTAACAGGACTGGTCAGGCCTGAGAGGAGGGCAC	37492

BX005439.8	901	TGGGTTCCCTCTTGGGTCTTGTCCTTTAGTCTTGGGGCCCTTTCCCTCCC	950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX119958.10	37493	TGGGTTCCCTCTTGGGTCTTGTCCTTTAGTCTTGGGGCCCTTTCCCTCCC	37542

BX005439.8	951	TGCACGATGAGTGGTGGGCACAGGGCACGGGCTGATGTTGATGGAGTGAT	1000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX119958.10	37543	TGCACGATGAGTGGTGGGCACAGGGCACGGGCTGATGTTGATGGAGTGAT	37592

BX005439.8	1001	GGGAGGGAACTGGCAGGGGCTGGGAAAAGCAAGGAGGGAGGAAGAAAAAA	1050
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX119958.10	37593	GGGAGGGAACTGGCAGGGGCTGGGAAAAGCAAGGAGGGAGGAAGAAAAAA	37642

BX005439.8	1051	GTGGGGGCCTCATCTTCCCTCAGAGAAAGGGCAAATCTGGTTTTGGAGCA	1100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX119958.10	37643	GTGGGGGCCTCATCTTCCCTCAGAGAAAGGGCAAATCTGGTTTTGGAGCA	37692

BX005439.8	1101	ACTGAAGAGTGAAAAGTCCCCAGGGAATAAACACAACACTGCACCCAGTG	1150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX119958.10	37693	ACTGAAGAGTGAAAAGTCCCCAGGGAATAAACACAACACTGCACCCAGTG	37742

BX005439.8	1151	GAGCATTTACCCATTTCCCTCTTTTCTCCAGAGCTCGTGAGCCTGCAGGT	1200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX119958.10	37743	GAGCATTTACCCATTTCCCTCTTTTCTCCAGAGCTCGTGAGCCTGCAGGT	37792

BX005439.8	1201	CCTGGATCAACACCCAGTTGGGACGAGTGACCACAGGGATGCCACACAGC	1250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX119958.10	37793	CCTGGATCAACACCCAGTTGGGACGAGTGACCACAGGGATGCCACACAGC	37842

BX005439.8	1251	TCGGATTTCAGCCTCTGATGTCAGCTCTTGGGTCCACTGGCTCCACTGAG	1300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX119958.10	37843	TCGGATTTCAGCCTCTGATGTCAGCTCTTGGGTCCACTGGCTCCACTGAG	37892

BX005439.8	1301	GGCACCTAGACTCTACAGCCAGGCGGCTGGAATTGAATTCCCTGCCTGGA	1350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX119958.10	37893	GGCACCTAGACTCTACAGCCAGGCGGCTGGAATTGAATTCCCTGCCTGGA	37942

BX005439.8	1351	TCTCACAAGCACTTTCCCTCTTGGTGCCTCAGTTTCCTGACCTATGAAAC	1400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX119958.10	37943	TCTCACAAGCACTTTCCCTCTTGGTGCCTCAGTTTCCTGACCTATGAAAC	37992

BX005439.8	1401	AGAGAAAATAAAAGCACTTATTTATTGTTGTTGGAGGCTGCAAAATGTTA	1450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX119958.10	37993	AGAGAAAATAAAAGCACTTATTTATTGTTGTTGGAGGCTGCAAAATGTTA	38042

BX005439.8	1451	GTAGATATGAGGCATTTGCAGCTGTGCCATATTAATTGGTGTCATTGTTT	1500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX119958.10	38043	GTAGATATGAGGCATTTGCAGCTGTGCCATATTAATTGGTGTCATTGTTT	38092

BX005439.8	1501	TTGTTGTTTTCGTATTATTATTTTTTTTTTTTAAGACAGAGTCTCAGGCC	1550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX119958.10	38093	TTGTTGTTTTCGTATTATTATTTTTTTTTTTTAAGACAGAGTCTCAGGCC	38142

BX005439.8	1551	AGGCACGGTGGCTCACGCCTGTAATCCCAACACTTTGGGAGGCCGAGGCG	1600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX119958.10	38143	AGGCACGGTGGCTCACGCCTGTAATCCCAACACTTTGGGAGGCCGAGGCG	38192

BX005439.8	1601	GGCGGATCACAAGGTCAAGAGATCGAGACCATCCTGATCAACATGGTGAA	1650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX119958.10	38193	GGCGGATCACAAGGTCAAGAGATCGAGACCATCCTGATCAACATGGTGAA	38242

BX005439.8	1651	ACCCTGTCTCTACTAAAAATACAAAAAATTAGCTGGGCCTGGTGGCGTGT	1700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX119958.10	38243	ACCCTGTCTCTACTAAAAATACAAAAAATTAGCTGGGCCTGGTGGCGTGT	38292

BX005439.8	1701	GCCTGTAGTCCCAGCTACTCAGGAGCTGAGGCAGGAAAATCACTTGAACC	1750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX119958.10	38293	GCCTGTAGTCCCAGCTACTCAGGAGCTGAGGCAGGAAAATCACTTGAACC	38342

BX005439.8	1751	TGGGAGGTGGAGGTTGCAGTGAGCTGAGATCACACCACTGCACTCCAGCC	1800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX119958.10	38343	TGGGAGGTGGAGGTTGCAGTGAGCTGAGATCACACCACTGCACTCCAGCC	38392

BX005439.8	1801	TGGCGACAGAGCGAGACTCTGTCTCAAAAAAAAAAAAAAAAAAAGACAGA	1850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX119958.10	38393	TGGCGACAGAGCGAGACTCTGTCTCAAAAAAAAAAAAAAAAAAAGACAGA	38442

BX005439.8	1851	GTCTCACTCTGTCACCCAGGCTGCAGTTCAGTGACATGATCTCAGCTCGT	1900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX119958.10	38443	GTCTCACTCTGTCACCCAGGCTGCAGTTCAGTGACATGATCTCAGCTCGT	38492

BX005439.8	1901	TGCAGCCTCCGCCTCCCGGGTTCAAGCACTTCTCTTGCCTCAGCCTCCCG	1950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX119958.10	38493	TGCAGCCTCCGCCTCCCGGGTTCAAGCACTTCTCTTGCCTCAGCCTCCCG	38542

BX005439.8	1951	AGTAGCTGGGGTTACAGACATGCACCACCATACCCGGCTAATTTTTGCAT	2000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX119958.10	38543	AGTAGCTGGGGTTACAGACATGCACCACCATACCCGGCTAATTTTTGCAT	38592

Overview

Query
BX005439.8 - 110001 bps
Hit
BX119958.10 - 38592 bps
Total alignments
1
Best alignment
alignment #1 (HSP: 2000 bps)
Best alignment cartoon

Alternate alignments

Short-link