<=>End overlap alignment

Alignment #1 HSP: 2000 bps / non-identical: 0 bps

Full alignment

BX005144.14	1	AAAAAAAAAAAAAAATTCCCATATACCCCTAATATAAATTAACACATCAG	50
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX119924.8	90059	AAAAAAAAAAAAAAATTCCCATATACCCCTAATATAAATTAACACATCAG	90108

BX005144.14	51	CCACTTGTTAAGGCCTTGAGACTGGAGGAAGAGGGCAGAGTAAAAAATTC	100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX119924.8	90109	CCACTTGTTAAGGCCTTGAGACTGGAGGAAGAGGGCAGAGTAAAAAATTC	90158

BX005144.14	101	AGAATTAAGGCATTGTTAAGAAAGGAGAATAAGCCAAAGAGAAGCAACAG	150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX119924.8	90159	AGAATTAAGGCATTGTTAAGAAAGGAGAATAAGCCAAAGAGAAGCAACAG	90208

BX005144.14	151	TGGGGATTACACAAATCCACTATTAGCAATTGTCTGCAGAATGGTACCAA	200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX119924.8	90209	TGGGGATTACACAAATCCACTATTAGCAATTGTCTGCAGAATGGTACCAA	90258

BX005144.14	201	CGCAAGCTAACTGTATCCAATAATTTTACCTATCTCAGCTTTGCCAAGGA	250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX119924.8	90259	CGCAAGCTAACTGTATCCAATAATTTTACCTATCTCAGCTTTGCCAAGGA	90308

BX005144.14	251	TCAACCCTGGTCTACGCAGTTAGCAGGTTAAAGTAAACTGACAGGTCTGA	300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX119924.8	90309	TCAACCCTGGTCTACGCAGTTAGCAGGTTAAAGTAAACTGACAGGTCTGA	90358

BX005144.14	301	TTTCCAAGGGTTCCAAACTTGGCTTCTCCATGCTTTCCCCAAAAGTAAGG	350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX119924.8	90359	TTTCCAAGGGTTCCAAACTTGGCTTCTCCATGCTTTCCCCAAAAGTAAGG	90408

BX005144.14	351	GAATCTTAGTTCTCCGGGTGAGTTCCCACTGCCATGTGCGGTTGATCCAC	400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX119924.8	90409	GAATCTTAGTTCTCCGGGTGAGTTCCCACTGCCATGTGCGGTTGATCCAC	90458

BX005144.14	401	CTCTACCTACAAGTTCTGGGTGACATGCTGGACAAGTTTAAGGGAAGTAA	450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX119924.8	90459	CTCTACCTACAAGTTCTGGGTGACATGCTGGACAAGTTTAAGGGAAGTAA	90508

BX005144.14	451	CATCAGCTCTACAGAAGAGGAGAGCACCAGCAGAACCAACTGTGAATTCC	500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX119924.8	90509	CATCAGCTCTACAGAAGAGGAGAGCACCAGCAGAACCAACTGTGAATTCC	90558

BX005144.14	501	AACAACCCTTACCAAGAGTTCAGCTCGTGCCTGTTCCCCCTGGGCCCGAC	550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX119924.8	90559	AACAACCCTTACCAAGAGTTCAGCTCGTGCCTGTTCCCCCTGGGCCCGAC	90608

BX005144.14	551	GTCTCTTCTTTAAATCTTTCACTCTTTTTAAATGGTCGAGCTGGTTCTGG	600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX119924.8	90609	GTCTCTTCTTTAAATCTTTCACTCTTTTTAAATGGTCGAGCTGGTTCTGG	90658

BX005144.14	601	ATTTGCTCCTGAGAAAAGCAAAACAGATGGGCAGTTCAAAATTAGGTAGA	650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX119924.8	90659	ATTTGCTCCTGAGAAAAGCAAAACAGATGGGCAGTTCAAAATTAGGTAGA	90708

BX005144.14	651	CCTTAGCATCAGCATGGTACTTCTTATCACACATGGAGTCCACACACCTG	700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX119924.8	90709	CCTTAGCATCAGCATGGTACTTCTTATCACACATGGAGTCCACACACCTG	90758

BX005144.14	701	ATGCCAAGTCTCCAGTTGGCGCTTGTCCTTAGGCCACACTGCCACCCACA	750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX119924.8	90759	ATGCCAAGTCTCCAGTTGGCGCTTGTCCTTAGGCCACACTGCCACCCACA	90808

BX005144.14	751	AGAGACTCAGGGCGCAGGGGCAAACAAGCCACTCCTTTGGCAATCTGTGT	800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX119924.8	90809	AGAGACTCAGGGCGCAGGGGCAAACAAGCCACTCCTTTGGCAATCTGTGT	90858

BX005144.14	801	CTATCTTAGCAGCCTGTGGCTTCAACCACTCAGCTACCTCGTCAGGACTA	850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX119924.8	90859	CTATCTTAGCAGCCTGTGGCTTCAACCACTCAGCTACCTCGTCAGGACTA	90908

BX005144.14	851	TTTGTGTCTATCTTAAACAATGAGTCATCTACCTGTCCCTGGTAGGATAT	900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX119924.8	90909	TTTGTGTCTATCTTAAACAATGAGTCATCTACCTGTCCCTGGTAGGATAT	90958

BX005144.14	901	TGCATGACTTAGCGGAACTGTGACTGGAGTAGGAGGCTTAGAACTATGTT	950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX119924.8	90959	TGCATGACTTAGCGGAACTGTGACTGGAGTAGGAGGCTTAGAACTATGTT	91008

BX005144.14	951	GTATTGTAGCTCTTCCATATAGGTACACTGTGAAAGTGACTTATTTCCCT	1000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX119924.8	91009	GTATTGTAGCTCTTCCATATAGGTACACTGTGAAAGTGACTTATTTCCCT	91058

BX005144.14	1001	CATGTGTGAAATGGGCAAACACCATCTTCCCAACCTACTCAAGAGTTCTC	1050
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX119924.8	91059	CATGTGTGAAATGGGCAAACACCATCTTCCCAACCTACTCAAGAGTTCTC	91108

BX005144.14	1051	ACCAGAGTGAGTGAAATAATATAGCTGAAAGGTCCATAAATGTTAAGTGA	1100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX119924.8	91109	ACCAGAGTGAGTGAAATAATATAGCTGAAAGGTCCATAAATGTTAAGTGA	91158

BX005144.14	1101	TTGCACATGAATGTACTCATATTTAAACACGGACATAATTGTGTACGCAT	1150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX119924.8	91159	TTGCACATGAATGTACTCATATTTAAACACGGACATAATTGTGTACGCAT	91208

BX005144.14	1151	TCCTGAAGCCCTCAACGTACAGAAAATACACAGTATCATGGACTCCTTGA	1200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX119924.8	91209	TCCTGAAGCCCTCAACGTACAGAAAATACACAGTATCATGGACTCCTTGA	91258

BX005144.14	1201	AGGTCACCTTACAACTGTTTTATATGTAATACTTTGTTTCCACGTTTCTG	1250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX119924.8	91259	AGGTCACCTTACAACTGTTTTATATGTAATACTTTGTTTCCACGTTTCTG	91308

BX005144.14	1251	TTTAGCTGTGCCAGTTCACAAAGGGCTCTGTGAGTCACATGATTCCACAA	1300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX119924.8	91309	TTTAGCTGTGCCAGTTCACAAAGGGCTCTGTGAGTCACATGATTCCACAA	91358

BX005144.14	1301	TATTCCTCATAACTGTGTTATCTCCTGAGTCTCAGAGTGGTTAAGTGACT	1350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX119924.8	91359	TATTCCTCATAACTGTGTTATCTCCTGAGTCTCAGAGTGGTTAAGTGACT	91408

BX005144.14	1351	TACTCCAGCAGCGAAAAGCTGTTCTTTTCTGTGAGTTTCTAGACCAGGAC	1400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX119924.8	91409	TACTCCAGCAGCGAAAAGCTGTTCTTTTCTGTGAGTTTCTAGACCAGGAC	91458

BX005144.14	1401	GGATTGCAGGAAAGTGCTGGGGAAATGCTTATAGACTAAGGAATGGGCAT	1450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX119924.8	91459	GGATTGCAGGAAAGTGCTGGGGAAATGCTTATAGACTAAGGAATGGGCAT	91508

BX005144.14	1451	AAGTCAGTTAACGTCCAACTGCGTTTTGTCTGAGAGCCGATGGGAGTAAG	1500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX119924.8	91509	AAGTCAGTTAACGTCCAACTGCGTTTTGTCTGAGAGCCGATGGGAGTAAG	91558

BX005144.14	1501	AGTGTCTGCAGCTTGTCGATGTGTACGCGGTTTTATGCACTTCTTTTAAA	1550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX119924.8	91559	AGTGTCTGCAGCTTGTCGATGTGTACGCGGTTTTATGCACTTCTTTTAAA	91608

BX005144.14	1551	CTGTCAAAAGGATGTCTCCGTGTACAATGTGTCCGTGAGACAGGTAACAT	1600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX119924.8	91609	CTGTCAAAAGGATGTCTCCGTGTACAATGTGTCCGTGAGACAGGTAACAT	91658

BX005144.14	1601	GGGGGTAAACAGAGAAAAGAGAGTGGGGGTGGGGACACTCCTGCCTTCCT	1650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX119924.8	91659	GGGGGTAAACAGAGAAAAGAGAGTGGGGGTGGGGACACTCCTGCCTTCCT	91708

BX005144.14	1651	CGCCAGCTACAGGTTTTCCTCCAAATCTGAGTGCTGAGGCTCTGGAGCGG	1700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX119924.8	91709	CGCCAGCTACAGGTTTTCCTCCAAATCTGAGTGCTGAGGCTCTGGAGCGG	91758

BX005144.14	1701	ACAGAGAGGAAATGACGGCTGTGAACCACACGTCCGGCTCAGCCATTTTC	1750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX119924.8	91759	ACAGAGAGGAAATGACGGCTGTGAACCACACGTCCGGCTCAGCCATTTTC	91808

BX005144.14	1751	TAGGCGGAAAAAAGGAAGCCCCTTTGGCTCTCTCCTCCCTTTGTCCGACT	1800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX119924.8	91809	TAGGCGGAAAAAAGGAAGCCCCTTTGGCTCTCTCCTCCCTTTGTCCGACT	91858

BX005144.14	1801	CGCGCTCCCGCCCTCCCGGATCCGCGCCCTCACCTTGAAGCCCTCCACCG	1850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX119924.8	91859	CGCGCTCCCGCCCTCCCGGATCCGCGCCCTCACCTTGAAGCCCTCCACCG	91908

BX005144.14	1851	CCTCCTCGAGCGGCAGCACGCTGTGGCCGCGGTGCTCGCGGGAGCGGTCG	1900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX119924.8	91909	CCTCCTCGAGCGGCAGCACGCTGTGGCCGCGGTGCTCGCGGGAGCGGTCG	91958

BX005144.14	1901	CACACCACGCAGATGGGCATCTGGTCCTCCTCGCAGTACAGCTTCAGGGG	1950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX119924.8	91959	CACACCACGCAGATGGGCATCTGGTCCTCCTCGCAGTACAGCTTCAGGGG	92008

BX005144.14	1951	CTCGCGGTGCTTCTCGCACACGCCCATCTCGCCGCCGGGCCCCGACGGCC	2000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX119924.8	92009	CTCGCGGTGCTTCTCGCACACGCCCATCTCGCCGCCGGGCCCCGACGGCC	92058

Overview

Query
BX005144.14 - 19086 bps
Hit
BX119924.8 - 92058 bps
Total alignments
1
Best alignment
alignment #1 (HSP: 2000 bps)
Best alignment cartoon

Alternate alignments

Short-link