<=>End overlap alignment

Alignment #1 HSP: 2000 bps / non-identical: 0 bps

Full alignment

C  AL928555.8	189224	AAGCTTGTAAGGGTCTGAAAAAAAGAAGCAGAGATCTGACTATGAAATCC	189175
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  BX119907.8	179061	AAGCTTGTAAGGGTCTGAAAAAAAGAAGCAGAGATCTGACTATGAAATCC	179110

C  AL928555.8	189174	CTGAAATCTCCTTGCTATGATTTCAGCTACTGCTTCCGCTGTCTTTGAAC	189125
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  BX119907.8	179111	CTGAAATCTCCTTGCTATGATTTCAGCTACTGCTTCCGCTGTCTTTGAAC	179160

C  AL928555.8	189124	TTCCCTTCAGTTGAGATTTAGCTGCATAGTTATTTTATTACAATCTTATT	189075
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  BX119907.8	179161	TTCCCTTCAGTTGAGATTTAGCTGCATAGTTATTTTATTACAATCTTATT	179210

C  AL928555.8	189074	ACATTCATTTTGTCTCTCAGAACTACACTGCATATCTTTTACCCAATTAA	189025
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  BX119907.8	179211	ACATTCATTTTGTCTCTCAGAACTACACTGCATATCTTTTACCCAATTAA	179260

C  AL928555.8	189024	ATAACTTTTATATGAGTTTTGTACTTCTGCACTTTTGATAAGGCTATAGA	188975
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  BX119907.8	179261	ATAACTTTTATATGAGTTTTGTACTTCTGCACTTTTGATAAGGCTATAGA	179310

C  AL928555.8	188974	TGTAATTAAACCCAGCCATTGTTTTGCTTGTCAATCTCTCTCTCCCTTTG	188925
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  BX119907.8	179311	TGTAATTAAACCCAGCCATTGTTTTGCTTGTCAATCTCTCTCTCCCTTTG	179360

C  AL928555.8	188924	TTCTTTGTAATGGTGCAGTATTTGAAAGGAGTTTGAAAAAAAGAAACCTG	188875
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  BX119907.8	179361	TTCTTTGTAATGGTGCAGTATTTGAAAGGAGTTTGAAAAAAAGAAACCTG	179410

C  AL928555.8	188874	CTTTTGAACTTGGGCTGCTTTTACTGCATTTATTCATATAGATTGGTCAC	188825
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  BX119907.8	179411	CTTTTGAACTTGGGCTGCTTTTACTGCATTTATTCATATAGATTGGTCAC	179460

C  AL928555.8	188824	ATTTTATTTTGATGGTCTACATGCCAACTAATTTTCATTAAATTATAAGT	188775
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  BX119907.8	179461	ATTTTATTTTGATGGTCTACATGCCAACTAATTTTCATTAAATTATAAGT	179510

C  AL928555.8	188774	AGACTGTTAGGTTGCGGTTAGGGTTAAGTGTAAGTTGACACTTGCAAAGT	188725
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  BX119907.8	179511	AGACTGTTAGGTTGCGGTTAGGGTTAAGTGTAAGTTGACACTTGCAAAGT	179560

C  AL928555.8	188724	TTCTTCTAGCCAGTTGAAAGTCTGTTGGAGGAGCAGTATCAACAGATATT	188675
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  BX119907.8	179561	TTCTTCTAGCCAGTTGAAAGTCTGTTGGAGGAGCAGTATCAACAGATATT	179610

C  AL928555.8	188674	AAGCAGTCTACTAATACACAAATGGACCATCAAAATAAAGTGTTACCATC	188625
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  BX119907.8	179611	AAGCAGTCTACTAATACACAAATGGACCATCAAAATAAAGTGTTACCATC	179660

C  AL928555.8	188624	CACTACACATCCTCTAATATGAAATATTTTTTCCAACCACTTTTATGAGG	188575
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  BX119907.8	179661	CACTACACATCCTCTAATATGAAATATTTTTTCCAACCACTTTTATGAGG	179710

C  AL928555.8	188574	ATTTTAGCATACAGATAGCAAATATGCTATTGCTAATGATTTGTTTCAGC	188525
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  BX119907.8	179711	ATTTTAGCATACAGATAGCAAATATGCTATTGCTAATGATTTGTTTCAGC	179760

C  AL928555.8	188524	CTTGGATAATTTATTGAGGACGCAAACTAAGGCTGCAGAATATATTGTTT	188475
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  BX119907.8	179761	CTTGGATAATTTATTGAGGACGCAAACTAAGGCTGCAGAATATATTGTTT	179810

C  AL928555.8	188474	CAGCATTGATCTCACAATATGTGAAAAACATCCAGGATCTGCAAAGTTAA	188425
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  BX119907.8	179811	CAGCATTGATCTCACAATATGTGAAAAACATCCAGGATCTGCAAAGTTAA	179860

C  AL928555.8	188424	ATAGGGATTATTGTTGACCAGGAGCTGCAGTTCAGAACATGAGATTTGTG	188375
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  BX119907.8	179861	ATAGGGATTATTGTTGACCAGGAGCTGCAGTTCAGAACATGAGATTTGTG	179910

C  AL928555.8	188374	GAGTCACTGAAGATTTTTACCATAAATAACGGAACAAAAATTTAGAGTTC	188325
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  BX119907.8	179911	GAGTCACTGAAGATTTTTACCATAAATAACGGAACAAAAATTTAGAGTTC	179960

C  AL928555.8	188324	GCATGTGTTTTGAGGCCTGTGACTGTATAAGCATATTGAGAGAGTTTAAA	188275
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  BX119907.8	179961	GCATGTGTTTTGAGGCCTGTGACTGTATAAGCATATTGAGAGAGTTTAAA	180010

C  AL928555.8	188274	GCATTCAGACAGTAAGAAATTGTAACATTTATAAGTTTAATAAACATGAT	188225
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  BX119907.8	180011	GCATTCAGACAGTAAGAAATTGTAACATTTATAAGTTTAATAAACATGAT	180060

C  AL928555.8	188224	TTTATTTAATTATTTGTACAAAGACTATGCAGTGCTGTTTTACATTAGAT	188175
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  BX119907.8	180061	TTTATTTAATTATTTGTACAAAGACTATGCAGTGCTGTTTTACATTAGAT	180110

C  AL928555.8	188174	TATTCAATTTCTGTACCTGAGTTCTTACCAAATTGAGCTATTTAAGCCAT	188125
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  BX119907.8	180111	TATTCAATTTCTGTACCTGAGTTCTTACCAAATTGAGCTATTTAAGCCAT	180160

C  AL928555.8	188124	CTGGTAAAATTGTATGCATATCACAATATATATTGCATAAAAATAAAATA	188075
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  BX119907.8	180161	CTGGTAAAATTGTATGCATATCACAATATATATTGCATAAAAATAAAATA	180210

C  AL928555.8	188074	TCGCAATGTTAGATTTTTACAATATTGTGCAGCCCTAACTCATACTTTGC	188025
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  BX119907.8	180211	TCGCAATGTTAGATTTTTACAATATTGTGCAGCCCTAACTCATACTTTGC	180260

C  AL928555.8	188024	TTGAATTATAACTAATTCTAACTAAATTACTGTGATAACCGGCCAATCAC	187975
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  BX119907.8	180261	TTGAATTATAACTAATTCTAACTAAATTACTGTGATAACCGGCCAATCAC	180310

C  AL928555.8	187974	ATTCATTCATTCATTTTCTTTTCGGCTTAGTCCTTTTATTAATCTGGGGT	187925
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  BX119907.8	180311	ATTCATTCATTCATTTTCTTTTCGGCTTAGTCCTTTTATTAATCTGGGGT	180360

C  AL928555.8	187924	CGCCACAGCGAAATTAACTGCCAACTTATCCATATGTTTTACGCAGCGGA	187875
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  BX119907.8	180361	CGCCACAGCGAAATTAACTGCCAACTTATCCATATGTTTTACGCAGCGGA	180410

C  AL928555.8	187874	TGCCCTTCCAGCTGCAACCCATCACTGGGAAATACCCATACACTCTCATT	187825
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  BX119907.8	180411	TGCCCTTCCAGCTGCAACCCATCACTGGGAAATACCCATACACTCTCATT	180460

C  AL928555.8	187824	CACACACATACACTACGGACAATTGTAGCTTACCCAATCCCCCTACCACG	187775
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  BX119907.8	180461	CACACACATACACTACGGACAATTGTAGCTTACCCAATCCCCCTACCACG	180510

C  AL928555.8	187774	TCTTTGGACTTGTGGGAGTCACTGGAGCACCCAAAGGAAACCCAGTTTGA	187725
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  BX119907.8	180511	TCTTTGGACTTGTGGGAGTCACTGGAGCACCCAAAGGAAACCCAGTTTGA	180560

C  AL928555.8	187724	GATGATTTAAACAAGTAACATCAGTTGTAATTCTGCTGTAAACAGCCATC	187675
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  BX119907.8	180561	GATGATTTAAACAAGTAACATCAGTTGTAATTCTGCTGTAAACAGCCATC	180610

C  AL928555.8	187674	ACAAATATAGATTTTGTTGATTTTAACGTATATTTTGTGAAATGTGCTGC	187625
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  BX119907.8	180611	ACAAATATAGATTTTGTTGATTTTAACGTATATTTTGTGAAATGTGCTGC	180660

C  AL928555.8	187624	GAATGTTTGTAGTGAGGCAATGTACATGTAAACGACTAAATATATGTATT	187575
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  BX119907.8	180661	GAATGTTTGTAGTGAGGCAATGTACATGTAAACGACTAAATATATGTATT	180710

C  AL928555.8	187574	CAAGAACTTGCTCAACAGTGCTACAATTTTTTTTACATTTCAGTACCAAT	187525
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  BX119907.8	180711	CAAGAACTTGCTCAACAGTGCTACAATTTTTTTTACATTTCAGTACCAAT	180760

C  AL928555.8	187524	TGGTACCGAACTTGAAACTTTTGGCATTTCTACACTGCTAACTCTAAGAG	187475
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  BX119907.8	180761	TGGTACCGAACTTGAAACTTTTGGCATTTCTACACTGCTAACTCTAAGAG	180810

C  AL928555.8	187474	TTAAAATCAACTCTAAATGAGTAAAAATATTGTCCCAATATTTTCAGAGT	187425
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  BX119907.8	180811	TTAAAATCAACTCTAAATGAGTAAAAATATTGTCCCAATATTTTCAGAGT	180860

C  AL928555.8	187424	TAAAATAACAGTATTACTAGTAATAAGAGTATTGCTTGTACAACACTATA	187375
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  BX119907.8	180861	TAAAATAACAGTATTACTAGTAATAAGAGTATTGCTTGTACAACACTATA	180910

C  AL928555.8	187374	AATAAGTTGTGTATATATATATATATATATATATATATATATATATATAT	187325
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  BX119907.8	180911	AATAAGTTGTGTATATATATATATATATATATATATATATATATATATAT	180960

C  AL928555.8	187324	ATATATATATATATATATATATATATATATACACTGTATCAAGTTAAAAA	187275
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  BX119907.8	180961	ATATATATATATATATATATATATATATATACACTGTATCAAGTTAAAAA	181010

C  AL928555.8	187274	TAACTCTGGTCTACACTACTGCAAGTTGTTAATTTATTGAGAGTGTAAAG	187225
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  BX119907.8	181011	TAACTCTGGTCTACACTACTGCAAGTTGTTAATTTATTGAGAGTGTAAAG	181060

Overview

Query
AL928555.8 - 189224 bps
Hit
BX119907.8 - 181060 bps
Total alignments
26
Best alignment
alignment #1 (HSP: 2000 bps)
Best alignment cartoon

Alternate alignments

#%IDscoreHSPstartendstrandhstarthendhstrand
110019092000187225189224-11790611810601
290.73103151125844125994114868150181
387.96167274148822149095114868151411
487.97142260101555101814-123010232751
585.02122244187731187974-131383316291
683.21182528179982050-135620358691
778.91153695691357281135625359841
885.194188187787187974-135625358121
982.3895221166566166786145328455541
1084.491172463664436889-164631648751
1181.51223225696157282166568668751
1282.04251671111913112583-177320780041
1380.411273475691457260-182328826691
1485.061412628524185502182402826621
1584.6299200818498204811090631092571
1684.9414728116662816690811119091121871
1785.151452925695057241-11249621252641
1885.561422853304533329-11249821252791
1989.89514614882114896611249911251371
2090.4219128412585012613311249981252791
2180.48108301476374793711294911297771
2285.8614729115730415759411329341332231
2391.79991348191082043-11386051387381
2484.4499210897778998611426211428321
2582.2411926315997816024011662041664621
2690.471261918185582045-11803101804981
Short-link