<=>End overlap alignment

Alignment #1 HSP: 2000 bps / non-identical: 0 bps

Full alignment

BX664702.5	1	CTGTAATCCCAGCTACTTGGGAGGCTGAGGCAGGAGAGTCTCTTGAACCC	50
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX088556.11	112577	CTGTAATCCCAGCTACTTGGGAGGCTGAGGCAGGAGAGTCTCTTGAACCC	112626

BX664702.5	51	CAGAGGCAGGGGTTGCAGGGAGCCGAGATCACGTCACTGCACTCTAGCCT	100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX088556.11	112627	CAGAGGCAGGGGTTGCAGGGAGCCGAGATCACGTCACTGCACTCTAGCCT	112676

BX664702.5	101	GGGTGACAGAGCGAGATGCCGTGTCAAAAAAAATAAATTAAATCAAATAA	150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX088556.11	112677	GGGTGACAGAGCGAGATGCCGTGTCAAAAAAAATAAATTAAATCAAATAA	112726

BX664702.5	151	AAAATTTAAAAATGTATATATATAAAATAAAGTGACAGATTCAGAGTCAC	200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX088556.11	112727	AAAATTTAAAAATGTATATATATAAAATAAAGTGACAGATTCAGAGTCAC	112776

BX664702.5	201	TGTTCATTGTGTGTTTGGGGGCTGCACAAAGACACCTAGCCAAAGAAGCA	250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX088556.11	112777	TGTTCATTGTGTGTTTGGGGGCTGCACAAAGACACCTAGCCAAAGAAGCA	112826

BX664702.5	251	AGTGAAAGCCTGCATTCTGCTCACCATGCCATACATCCTGGCATAGGGCT	300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX088556.11	112827	AGTGAAAGCCTGCATTCTGCTCACCATGCCATACATCCTGGCATAGGGCT	112876

BX664702.5	301	GTATCCTCCCAAAGGGGATTCCTTTGTCTAATTCATACCAGGCCACTGTA	350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX088556.11	112877	GTATCCTCCCAAAGGGGATTCCTTTGTCTAATTCATACCAGGCCACTGTA	112926

BX664702.5	351	TTGACTAGAGAAGGCCATGGATGGGTTTCTCACTCTTAGAAGGGAAAGAG	400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX088556.11	112927	TTGACTAGAGAAGGCCATGGATGGGTTTCTCACTCTTAGAAGGGAAAGAG	112976

BX664702.5	401	GAGGAATGGCTACAGCCTCCCCAAGCCATAGATGGGACTGCCTCCCACTA	450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX088556.11	112977	GAGGAATGGCTACAGCCTCCCCAAGCCATAGATGGGACTGCCTCCCACTA	113026

BX664702.5	451	TCCCCAGACACAAATGGTAAATTGGAAAACCTGTATCCAGACATTTCTTC	500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX088556.11	113027	TCCCCAGACACAAATGGTAAATTGGAAAACCTGTATCCAGACATTTCTTC	113076

BX664702.5	501	AGCCACTTCATTGGCACCAAGCGTCTCTCAAAATGTCTTCTGTTCCTTAA	550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX088556.11	113077	AGCCACTTCATTGGCACCAAGCGTCTCTCAAAATGTCTTCTGTTCCTTAA	113126

BX664702.5	551	CCTACCAGGCCTCCCAAAGACAGCAATGGGAGAAGTGACCCCATAACTGC	600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX088556.11	113127	CCTACCAGGCCTCCCAAAGACAGCAATGGGAGAAGTGACCCCATAACTGC	113176

BX664702.5	601	ATAAAATAATCCCTCTTCTTTGAAGCTCTTGGCAGGAATCGCTCAGCCAG	650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX088556.11	113177	ATAAAATAATCCCTCTTCTTTGAAGCTCTTGGCAGGAATCGCTCAGCCAG	113226

BX664702.5	651	CAGGAAACCTTTAACCCAATACCCAGAAAAACAGACATTTGGAGGAAGAG	700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX088556.11	113227	CAGGAAACCTTTAACCCAATACCCAGAAAAACAGACATTTGGAGGAAGAG	113276

BX664702.5	701	GGATCTTCCAGATTATTCTTCCATTCTGCCCCATCCTCTACAGAGAAGGA	750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX088556.11	113277	GGATCTTCCAGATTATTCTTCCATTCTGCCCCATCCTCTACAGAGAAGGA	113326

BX664702.5	751	AACTAAGACACTTTTCAAGAATCACAAGATAAGTTAATGATAGAAAGCAG	800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX088556.11	113327	AACTAAGACACTTTTCAAGAATCACAAGATAAGTTAATGATAGAAAGCAG	113376

BX664702.5	801	AGTAGAATCTTGAGTGGAGGAGTGAAAATAACATTCACTTTGTTCAAATC	850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX088556.11	113377	AGTAGAATCTTGAGTGGAGGAGTGAAAATAACATTCACTTTGTTCAAATC	113426

BX664702.5	851	CCAGCTCTACCACTTTCCAATGGTGTGAACTTGCACAAATAACTCTGAGT	900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX088556.11	113427	CCAGCTCTACCACTTTCCAATGGTGTGAACTTGCACAAATAACTCTGAGT	113476

BX664702.5	901	CTCATTTTCTTCATTTGTAAAATGGAGAGAACAATCTCCGCTTCAAGAGA	950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX088556.11	113477	CTCATTTTCTTCATTTGTAAAATGGAGAGAACAATCTCCGCTTCAAGAGA	113526

BX664702.5	951	TTGTCTTAAATGGAACATGCAAAGCATCACTGATATCGTTTACCAACCAC	1000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX088556.11	113527	TTGTCTTAAATGGAACATGCAAAGCATCACTGATATCGTTTACCAACCAC	113576

BX664702.5	1001	ACATAGCAGCTGTCTTTCCCCACTCCCCTGTTGTTTCCACTGCCTCATAA	1050
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX088556.11	113577	ACATAGCAGCTGTCTTTCCCCACTCCCCTGTTGTTTCCACTGCCTCATAA	113626

BX664702.5	1051	GACTTCCCACCACTCACAAAGCACAGCGCTTTTCCTCACAAAGCTGAGTG	1100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX088556.11	113627	GACTTCCCACCACTCACAAAGCACAGCGCTTTTCCTCACAAAGCTGAGTG	113676

BX664702.5	1101	GGCTCCCTAGGTTCAGGATGGAAGTAAATAGGAGTACCATCTTACCTTCA	1150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX088556.11	113677	GGCTCCCTAGGTTCAGGATGGAAGTAAATAGGAGTACCATCTTACCTTCA	113726

BX664702.5	1151	GGGACGGCCCAGGAGTGGGGTAGCAGCCACAGAAGTGGTAACATCTGTAG	1200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX088556.11	113727	GGGACGGCCCAGGAGTGGGGTAGCAGCCACAGAAGTGGTAACATCTGTAG	113776

BX664702.5	1201	CAGCGCAGCTCCTTGGTTCTGTTCATGACCCATACCTTCTTGCCACACAG	1250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX088556.11	113777	CAGCGCAGCTCCTTGGTTCTGTTCATGACCCATACCTTCTTGCCACACAG	113826

BX664702.5	1251	TAGGTAGGAGCTACCAACCCAGCCAACCCAGCTTCCCCAACTCCCTCCCC	1300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX088556.11	113827	TAGGTAGGAGCTACCAACCCAGCCAACCCAGCTTCCCCAACTCCCTCCCC	113876

BX664702.5	1301	GAGAGGGTGGCCTTAGATCATGTTTTGCCAGATCATTTCCAATAGGTGCC	1350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX088556.11	113877	GAGAGGGTGGCCTTAGATCATGTTTTGCCAGATCATTTCCAATAGGTGCC	113926

BX664702.5	1351	CTTGTCATTTTGTCTAAACCAATCAGAGAAGCGTAGGGTTTAACATCATC	1400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX088556.11	113927	CTTGTCATTTTGTCTAAACCAATCAGAGAAGCGTAGGGTTTAACATCATC	113976

BX664702.5	1401	AGTCACTGGGGAGACGCCTGGGGCCAGTAACCTCCTGAAGACTTGGCTGT	1450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX088556.11	113977	AGTCACTGGGGAGACGCCTGGGGCCAGTAACCTCCTGAAGACTTGGCTGT	114026

BX664702.5	1451	TTGACCAGGGCAGAGTATGGCATGTAACTGGGCTGGGAAGCCCAGTGGAG	1500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX088556.11	114027	TTGACCAGGGCAGAGTATGGCATGTAACTGGGCTGGGAAGCCCAGTGGAG	114076

BX664702.5	1501	GAATGTTGCTTCCTGGTGGAGTTCCCTCTTTGGTTTCAAGCTGTCAGCCT	1550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX088556.11	114077	GAATGTTGCTTCCTGGTGGAGTTCCCTCTTTGGTTTCAAGCTGTCAGCCT	114126

BX664702.5	1551	CAGTCTGTAAGCGACCAGCTGGCTCTTCAGAGCAGTGCCACCTCCTGGCA	1600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX088556.11	114127	CAGTCTGTAAGCGACCAGCTGGCTCTTCAGAGCAGTGCCACCTCCTGGCA	114176

BX664702.5	1601	GAATGCTGCAATGGGGAACCGCATCTTCCCCAAGTAAACCCCCAGGGCTC	1650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX088556.11	114177	GAATGCTGCAATGGGGAACCGCATCTTCCCCAAGTAAACCCCCAGGGCTC	114226

BX664702.5	1651	TTCGGACCCTGCCTTCTCCTCCCTCCTGGCTCTTCCTCTTTCTCAAAAAA	1700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX088556.11	114227	TTCGGACCCTGCCTTCTCCTCCCTCCTGGCTCTTCCTCTTTCTCAAAAAA	114276

BX664702.5	1701	ACTTATTCTCCTTCAGGCATTAGCTCTAATTCATTTGGCAGACATATATT	1750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX088556.11	114277	ACTTATTCTCCTTCAGGCATTAGCTCTAATTCATTTGGCAGACATATATT	114326

BX664702.5	1751	GAAAATACAAGAAATTCTGGGTGTTGGGCCCAGGGCTAGAAATACAAAGA	1800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX088556.11	114327	GAAAATACAAGAAATTCTGGGTGTTGGGCCCAGGGCTAGAAATACAAAGA	114376

BX664702.5	1801	TGAATAGGCATAGTCTGCCTTCAAAGAGCTTAGAGTCTAGTGCTGGGGGA	1850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX088556.11	114377	TGAATAGGCATAGTCTGCCTTCAAAGAGCTTAGAGTCTAGTGCTGGGGGA	114426

BX664702.5	1851	GGGGGCCAAGGGATAATTACACAACAATGTAATGTATTCAAATAAGAATG	1900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX088556.11	114427	GGGGGCCAAGGGATAATTACACAACAATGTAATGTATTCAAATAAGAATG	114476

BX664702.5	1901	TGCCAAGTGTTTTGGAAGTCGCAGTAATTTTATGAGGATGCGGAATAGGA	1950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX088556.11	114477	TGCCAAGTGTTTTGGAAGTCGCAGTAATTTTATGAGGATGCGGAATAGGA	114526

BX664702.5	1951	GGAACATAATCAGGCAGGCTCCTAAGACTTGAAGGAAAAACAATTTGGCC	2000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX088556.11	114527	GGAACATAATCAGGCAGGCTCCTAAGACTTGAAGGAAAAACAATTTGGCC	114576

Overview

Query
BX664702.5 - 20225 bps
Hit
BX088556.11 - 114576 bps
Total alignments
1
Best alignment
alignment #1 (HSP: 2000 bps)
Best alignment cartoon

Alternate alignments

Short-link