<=>End overlap alignment

Alignment #1 HSP: 2000 bps / non-identical: 0 bps

Full alignment

BX323007.11	1	CTGTGTGCCAGATGGCTGCGGTCAGTAGCACAGAGAGAAATCAGCCTTGC	50
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX005455.8	162742	CTGTGTGCCAGATGGCTGCGGTCAGTAGCACAGAGAGAAATCAGCCTTGC	162791

BX323007.11	51	TTAACCGTCTAATCGCTGTTTCCCAGAGTCCAGGAGGTTGCTCACTTATT	100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX005455.8	162792	TTAACCGTCTAATCGCTGTTTCCCAGAGTCCAGGAGGTTGCTCACTTATT	162841

BX323007.11	101	AAATGCGTTGCGTGTCTTTGGATGGAGCTCAGCCAAGATTAAAAAAAAAA	150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX005455.8	162842	AAATGCGTTGCGTGTCTTTGGATGGAGCTCAGCCAAGATTAAAAAAAAAA	162891

BX323007.11	151	CAATGCGGTGGCTGAGAATAGAATCCAAGGTTTGGATTTAACTCTATATT	200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX005455.8	162892	CAATGCGGTGGCTGAGAATAGAATCCAAGGTTTGGATTTAACTCTATATT	162941

BX323007.11	201	AGGGCTGCACAATATATCAAAAAGTTATCACCATCGCGATAATAGTAAAT	250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX005455.8	162942	AGGGCTGCACAATATATCAAAAAGTTATCACCATCGCGATAATAGTAAAT	162991

BX323007.11	251	GCAGCATCCATATAGCATAAAAGTGCAATATATTCAATTAATTTTAAGTG	300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX005455.8	162992	GCAGCATCCATATAGCATAAAAGTGCAATATATTCAATTAATTTTAAGTG	163041

BX323007.11	301	AAGTTTTACAAACTAATTTCTAGAGGAGCACACAATATAATTGATTGCGG	350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX005455.8	163042	AAGTTTTACAAACTAATTTCTAGAGGAGCACACAATATAATTGATTGCGG	163091

BX323007.11	351	CTTGCCTCACATCCATAATCAGCAATAATCCAATCGGATAAATCACTAAT	400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX005455.8	163092	CTTGCCTCACATCCATAATCAGCAATAATCCAATCGGATAAATCACTAAT	163141

BX323007.11	401	AAATAGACCGATCTCATCCTACTACCTCATCTTCTTCCCTTCCACCACAT	450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX005455.8	163142	AAATAGACCGATCTCATCCTACTACCTCATCTTCTTCCCTTCCACCACAT	163191

BX323007.11	451	CTTGTCCTTTTCCTACCTTTACCAGGGGGAGCTCTCGAGGCTTTAATAGC	500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX005455.8	163192	CTTGTCCTTTTCCTACCTTTACCAGGGGGAGCTCTCGAGGCTTTAATAGC	163241

BX323007.11	501	ATCAAGCATATCTAAGTGTGAACTCTTGAATTGATGAGCGTTTATGTGTT	550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX005455.8	163242	ATCAAGCATATCTAAGTGTGAACTCTTGAATTGATGAGCGTTTATGTGTT	163291

BX323007.11	551	GCATGTATTGACTATATTCCTAAATGTGGACGTGCAATCGTTTTTGCGAT	600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX005455.8	163292	GCATGTATTGACTATATTCCTAAATGTGGACGTGCAATCGTTTTTGCGAT	163341

BX323007.11	601	TGTTTTACTACATATAATTTAGCTGCCTATGGGAGAAATGACTAGAAATA	650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX005455.8	163342	TGTTTTACTACATATAATTTAGCTGCCTATGGGAGAAATGACTAGAAATA	163391

BX323007.11	651	ATGAATAAATAATTCATTAATAATAGAATACATATTAAATAAAGTCTTGA	700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX005455.8	163392	ATGAATAAATAATTCATTAATAATAGAATACATATTAAATAAAGTCTTGA	163441

BX323007.11	701	GCTAAAAAGATTCCAATAGCTGTGCCAGCTCGAATGTGGATAATAAGGTC	750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX005455.8	163442	GCTAAAAAGATTCCAATAGCTGTGCCAGCTCGAATGTGGATAATAAGGTC	163491

BX323007.11	751	AATAGGTTTTTTATCCAAATCTGGCCAATCCAATGGGGCATTTACTATCT	800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX005455.8	163492	AATAGGTTTTTTATCCAAATCTGGCCAATCCAATGGGGCATTTACTATCT	163541

BX323007.11	801	TTATTCCTAGATAGTAAGGTTAAGTTTAACCTAGAGTTGAAAATAAACAC	850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX005455.8	163542	TTATTCCTAGATAGTAAGGTTAAGTTTAACCTAGAGTTGAAAATAAACAC	163591

BX323007.11	851	TAATGCTGGGGACAAGAGAGGAAAATGTCAACAGCCAGCCTGATTTCACG	900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX005455.8	163592	TAATGCTGGGGACAAGAGAGGAAAATGTCAACAGCCAGCCTGATTTCACG	163641

BX323007.11	901	AGAAAACATAAGTATTTTAAGTTTTTTCAGTTTAGTGGAGAGTTCAGTAC	950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX005455.8	163642	AGAAAACATAAGTATTTTAAGTTTTTTCAGTTTAGTGGAGAGTTCAGTAC	163691

BX323007.11	951	GAAATTGAAAAGATCTTAAAAAGGAGGTGTGGCACCAAACCCCACCCCTA	1000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX005455.8	163692	GAAATTGAAAAGATCTTAAAAAGGAGGTGTGGCACCAAACCCCACCCCTA	163741

BX323007.11	1001	AACCCAACCATCATTGGGGGATGAGCAAATCGTACTAAATTATATGAATT	1050
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX005455.8	163742	AACCCAACCATCATTGGGGGATGAGCAAATCGTACTAAATTATATGAATT	163791

BX323007.11	1051	AGATATTGCAAATTCATACGAATTAGCCACTACATCAAAAAGTTACGAAT	1100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX005455.8	163792	AGATATTGCAAATTCATACGAATTAGCCACTACATCAAAAAGTTACGAAT	163841

BX323007.11	1101	TGCCGTGAGATTATGTTGCAGCAGCCAATAAGAATCAGAATACTCATCGA	1150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX005455.8	163842	TGCCGTGAGATTATGTTGCAGCAGCCAATAAGAATCAGAATACTCATCGA	163891

BX323007.11	1151	GGTTTTAAGTTATTTACTGTTTTTTTAAATTGAAATGTTTTTCTAATATT	1200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX005455.8	163892	GGTTTTAAGTTATTTACTGTTTTTTTAAATTGAAATGTTTTTCTAATATT	163941

BX323007.11	1201	ATTATTAGTTTATTTTAGTATGATCATTACATAAAACAATATTTTTTTAT	1250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX005455.8	163942	ATTATTAGTTTATTTTAGTATGATCATTACATAAAACAATATTTTTTTAT	163991

BX323007.11	1251	TTGCTTATCAAATAATGTTTTTTTTTTAAGTTAGTTATATTGTAAGAAAT	1300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX005455.8	163992	TTGCTTATCAAATAATGTTTTTTTTTTAAGTTAGTTATATTGTAAGAAAT	164041

BX323007.11	1301	AGTTATTGCAAGACTCAACACTATCGATCGATAATTTACCCAGTAGATTT	1350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX005455.8	164042	AGTTATTGCAAGACTCAACACTATCGATCGATAATTTACCCAGTAGATTT	164091

BX323007.11	1351	TGAAAAATACACTTTGAACATCTTAAAAATATTGGAGTTTTTTTTTTCTC	1400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX005455.8	164092	TGAAAAATACACTTTGAACATCTTAAAAATATTGGAGTTTTTTTTTTCTC	164141

BX323007.11	1401	AATTAAAAATGTAACTTTGGTTCAAAATATAAAATTGTATTTAATCTAAA	1450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX005455.8	164142	AATTAAAAATGTAACTTTGGTTCAAAATATAAAATTGTATTTAATCTAAA	164191

BX323007.11	1451	AATTAATACATTCACACAAAATATATTCACACAAAATATATTCACACAAA	1500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX005455.8	164192	AATTAATACATTCACACAAAATATATTCACACAAAATATATTCACACAAA	164241

BX323007.11	1501	GTTTTAATAAAAATATTGTTTAATATAGAACTCTTTAATCTTAGATGTAA	1550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX005455.8	164242	GTTTTAATAAAAATATTGTTTAATATAGAACTCTTTAATCTTAGATGTAA	164291

BX323007.11	1551	GTATAATCTTGCTTTGGACTAACCAAAAAATCTACTGTAATTTGCTACAG	1600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX005455.8	164292	GTATAATCTTGCTTTGGACTAACCAAAAAATCTACTGTAATTTGCTACAG	164341

BX323007.11	1601	CTAAATGTATTAATTATCCTCAAAATATATTAGAGTTGGTTGAAAATTAA	1650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX005455.8	164342	CTAAATGTATTAATTATCCTCAAAATATATTAGAGTTGGTTGAAAATTAA	164391

BX323007.11	1651	ACATTCATTCATTTTCCTTCAGCTTAATCCCTTATTTATCAGGTCTCACC	1700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX005455.8	164392	ACATTCATTCATTTTCCTTCAGCTTAATCCCTTATTTATCAGGTCTCACC	164441

BX323007.11	1701	ACAGGAAAATGACCTTCTTGGTGTGAAGCAACAGTGCTAACCACTGAGCT	1750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX005455.8	164442	ACAGGAAAATGACCTTCTTGGTGTGAAGCAACAGTGCTAACCACTGAGCT	164491

BX323007.11	1751	ACCGTGCCGCTGAAAATGAAACATTCCGCTCTTAGAAAAAAAAAAAGATA	1800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX005455.8	164492	ACCGTGCCGCTGAAAATGAAACATTCCGCTCTTAGAAAAAAAAAAAGATA	164541

BX323007.11	1801	TTGGCTGCGTCTGAAACCGCATACTTCCTTACTATATAGTACACTAAAAT	1850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX005455.8	164542	TTGGCTGCGTCTGAAACCGCATACTTCCTTACTATATAGTACACTAAAAT	164591

BX323007.11	1851	CAGTATGTGAGCCGAGTAGTATGTCCGAATTCATAGAATTCGAAAATCCG	1900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX005455.8	164592	CAGTATGTGAGCCGAGTAGTATGTCCGAATTCATAGAATTCGAAAATCCG	164641

BX323007.11	1901	TATACGAGAAGTACCCGGATGACTTACTACTTCCGACGAGATTCTGGAGT	1950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX005455.8	164642	TATACGAGAAGTACCCGGATGACTTACTACTTCCGACGAGATTCTGGAGT	164691

BX323007.11	1951	GCGCATCCCATGCACGCTGCGCTATCCCATGATGCCCCGCGAGAGAATTC	2000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX005455.8	164692	GCGCATCCCATGCACGCTGCGCTATCCCATGATGCCCCGCGAGAGAATTC	164741

Overview

Query
BX323007.11 - 130807 bps
Hit
BX005455.8 - 164741 bps
Total alignments
22
Best alignment
alignment #1 (HSP: 2000 bps)
Best alignment cartoon

Alternate alignments

#%IDscoreHSPstartendstrandhstarthendhstrand
1100192120001200011627421647411
284.832305028758988090-1235728571
384.592335209101491533-1237228901
485.4220850491014915171743779301
589.572343562504025395-112705130681
691.672603562221422569-112706130651
788.06209344123217123560112738130721
889.522333572221322569126974273261
987.782093522504325394126975273261
1088.57199332123217123548-126980272941
1190.732503526692667277-172917732721
1290.262113096683067138191882921891
1387.552434565994160396-11099541103951
1489.5222234012321712355611111941115271
1595.362102572545725713-11153901156481
1684.462025076462365129-11325921331121
1786.562244599101291470-11325921330521
1886.59268536910159155011357231362661
1986.82241474876028807511357721362491
2089.49216342123218123559-11466271469591
2191.23258361222092256911466281469921
2287.723075006683067329-11488451493491
Short-link