<=>End overlap alignment

Alignment #1 HSP: 2000 bps / non-identical: 0 bps

Full alignment

BX248419.4	1	GGCCAGACTGAGCTGCACTTGCTGTTTTTTCCTGAGTTGTCTTATTCATT	50
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX005441.10	55265	GGCCAGACTGAGCTGCACTTGCTGTTTTTTCCTGAGTTGTCTTATTCATT	55314

BX248419.4	51	CCTGCTTCCAATACTTTTTGCACATAGTCTCTTCCTCCTAGAATACTCTT	100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX005441.10	55315	CCTGCTTCCAATACTTTTTGCACATAGTCTCTTCCTCCTAGAATACTCTT	55364

BX248419.4	101	CTCCCTTCCTCCCACCTCTCTCTCTGTTTTTAAGTATACAATTCAGGGGC	150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX005441.10	55365	CTCCCTTCCTCCCACCTCTCTCTCTGTTTTTAAGTATACAATTCAGGGGC	55414

BX248419.4	151	ACTAAGTCCTTTTCTTTTTTTTTTTATTATACATGTTCTGGGATACATAT	200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX005441.10	55415	ACTAAGTCCTTTTCTTTTTTTTTTTATTATACATGTTCTGGGATACATAT	55464

BX248419.4	201	GCAGAACGTGCAGGTTTGTTACATAGGTATATACGTGCCATGGTGGTTTG	250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX005441.10	55465	GCAGAACGTGCAGGTTTGTTACATAGGTATATACGTGCCATGGTGGTTTG	55514

BX248419.4	251	CTGCACCCATCAATCCATCATCTACATTAGGTATTTCTCCTAATGCTATC	300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX005441.10	55515	CTGCACCCATCAATCCATCATCTACATTAGGTATTTCTCCTAATGCTATC	55564

BX248419.4	301	CCTCCCCTAGTCCCCCAAGCCCTGACAGGCCCCGATGTGTGATGTTCCCC	350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX005441.10	55565	CCTCCCCTAGTCCCCCAAGCCCTGACAGGCCCCGATGTGTGATGTTCCCC	55614

BX248419.4	351	TCCCTGTGTCCATGTGTTCTCATTGTTCACCTCCCACTTATGAGTAAGAA	400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX005441.10	55615	TCCCTGTGTCCATGTGTTCTCATTGTTCACCTCCCACTTATGAGTAAGAA	55664

BX248419.4	401	CATGTGGTGTTTGGTTTTCTGTTCCTGTGTTAGTTTGCTGAGAATGATGG	450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX005441.10	55665	CATGTGGTGTTTGGTTTTCTGTTCCTGTGTTAGTTTGCTGAGAATGATGG	55714

BX248419.4	451	TTTCCAGCTTCATCCATATCCCTGCAAAGGACATGAACACATCTTTTTTA	500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX005441.10	55715	TTTCCAGCTTCATCCATATCCCTGCAAAGGACATGAACACATCTTTTTTA	55764

BX248419.4	501	TGCCTGCATAGTATTCCATGGCATATATGTGCCATATTTTCTTTATCCAG	550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX005441.10	55765	TGCCTGCATAGTATTCCATGGCATATATGTGCCATATTTTCTTTATCCAG	55814

BX248419.4	551	TCTATCATTGATGGACATTTGGGTTGGTTCCAAGTCTTTGCTATTGTGAA	600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX005441.10	55815	TCTATCATTGATGGACATTTGGGTTGGTTCCAAGTCTTTGCTATTGTGAA	55864

BX248419.4	601	CAGTGCTGCAATAAACATATGTGTGCATGTGTCTTTACAGTAGGATAATT	650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX005441.10	55865	CAGTGCTGCAATAAACATATGTGTGCATGTGTCTTTACAGTAGGATAATT	55914

BX248419.4	651	TATAATCCTCTGGGTATATACCCAGTAATGGGATTGCCAGGTCAAATGGT	700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX005441.10	55915	TATAATCCTCTGGGTATATACCCAGTAATGGGATTGCCAGGTCAAATGGT	55964

BX248419.4	701	ATTTCTCATTCTAGATTCTTGAGGAGTTGCCACACTGTCTTCCACAACGG	750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX005441.10	55965	ATTTCTCATTCTAGATTCTTGAGGAGTTGCCACACTGTCTTCCACAACGG	56014

BX248419.4	751	TTGAACTAATTTACACTCCCACCAACATTGTAAAAGCATTCTTATTTCTC	800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX005441.10	56015	TTGAACTAATTTACACTCCCACCAACATTGTAAAAGCATTCTTATTTCTC	56064

BX248419.4	801	CACATCATCTCCAGCATCTGTTATTTCCTGACTTTTTAATGATCACCATT	850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX005441.10	56065	CACATCATCTCCAGCATCTGTTATTTCCTGACTTTTTAATGATCACCATT	56114

BX248419.4	851	CTAACTGGTGTGAGATGGTATCTCATTGTGGTTTTGATTTGCATTTCTCT	900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX005441.10	56115	CTAACTGGTGTGAGATGGTATCTCATTGTGGTTTTGATTTGCATTTCTCT	56164

BX248419.4	901	AATGACCAGTGATGATGAGCTTCTTTTCATAGGTTTGTTGGCCACATAAA	950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX005441.10	56165	AATGACCAGTGATGATGAGCTTCTTTTCATAGGTTTGTTGGCCACATAAA	56214

BX248419.4	951	TGTCTTCTTTTGAGAAGTGTCTGTTCATATCCTTCACCTACTTTTTGATG	1000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX005441.10	56215	TGTCTTCTTTTGAGAAGTGTCTGTTCATATCCTTCACCTACTTTTTGATG	56264

BX248419.4	1001	GGGCTGTTTGTTTTTTTCTTGTAAATTTGTTTAAGTTCTTTGTAGATTTT	1050
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX005441.10	56265	GGGCTGTTTGTTTTTTTCTTGTAAATTTGTTTAAGTTCTTTGTAGATTTT	56314

BX248419.4	1051	GGATATTAGCCCTTTGTCAGATGGATAGATTGCAAAATGTTTCTCCCATT	1100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX005441.10	56315	GGATATTAGCCCTTTGTCAGATGGATAGATTGCAAAATGTTTCTCCCATT	56364

BX248419.4	1101	CTGTAGGTTGCCTGTTCACTCTGATGATAGTTTCTTTTGCTGTGCAGAAG	1150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX005441.10	56365	CTGTAGGTTGCCTGTTCACTCTGATGATAGTTTCTTTTGCTGTGCAGAAG	56414

BX248419.4	1151	CTCTTTCATTTAATTAGATACCATTTGTCAATTTAGGCTTTTGTTGCCAT	1200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX005441.10	56415	CTCTTTCATTTAATTAGATACCATTTGTCAATTTAGGCTTTTGTTGCCAT	56464

BX248419.4	1201	TGCTTTTGGTGTTCTAGTCATGAAGTCTTTGCCCATGCCTATGTCCTGAA	1250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX005441.10	56465	TGCTTTTGGTGTTCTAGTCATGAAGTCTTTGCCCATGCCTATGTCCTGAA	56514

BX248419.4	1251	TGGTATTGCCTAGGTTTTCTTCTAGGGTTTTTATGGTTTTAGGTCTTACG	1300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX005441.10	56515	TGGTATTGCCTAGGTTTTCTTCTAGGGTTTTTATGGTTTTAGGTCTTACG	56564

BX248419.4	1301	TTTAAGTCTTTAATCCATCTTGAGTTAATTTTTATTTCAGGTGTAAGGAA	1350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX005441.10	56565	TTTAAGTCTTTAATCCATCTTGAGTTAATTTTTATTTCAGGTGTAAGGAA	56614

BX248419.4	1351	GGGGTCCAGTTTCAGTTTTCTGCATATGGCTAGCCAGTTTTCCCAACACC	1400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX005441.10	56615	GGGGTCCAGTTTCAGTTTTCTGCATATGGCTAGCCAGTTTTCCCAACACC	56664

BX248419.4	1401	ATTTATTAAATAGGGAATCCTTTCCCCATTGCTTGTTTTTGTCAGGTTTG	1450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX005441.10	56665	ATTTATTAAATAGGGAATCCTTTCCCCATTGCTTGTTTTTGTCAGGTTTG	56714

BX248419.4	1451	TCAAAGATCAGATGGTTGTAGATGTGTGGTGTTATTTCTGAGGCCCTTCT	1500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX005441.10	56715	TCAAAGATCAGATGGTTGTAGATGTGTGGTGTTATTTCTGAGGCCCTTCT	56764

BX248419.4	1501	TCTGTTCCATTTGTCTATATGTCTGTTTTGATACCAGACATATTTGATAT	1550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX005441.10	56765	TCTGTTCCATTTGTCTATATGTCTGTTTTGATACCAGACATATTTGATAT	56814

BX248419.4	1551	CATATACTACAGCCTTGTAGTATAGTTTGAAGTCAGGTAGCATGATGCCT	1600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX005441.10	56815	CATATACTACAGCCTTGTAGTATAGTTTGAAGTCAGGTAGCATGATGCCT	56864

BX248419.4	1601	CCAGCTTCGTTCTTTTTGCTTAAGATTGTATTGGCTATGTGGGCTCTTTA	1650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX005441.10	56865	CCAGCTTCGTTCTTTTTGCTTAAGATTGTATTGGCTATGTGGGCTCTTTA	56914

BX248419.4	1651	TTGGTTCCATATGAAATATAAAGTAGTTTTTTCTAATTCTGTGAAGAAAG	1700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX005441.10	56915	TTGGTTCCATATGAAATATAAAGTAGTTTTTTCTAATTCTGTGAAGAAAG	56964

BX248419.4	1701	TCAATGGTAGCTTGATAGGGATAACACTGAATCTATAAATTACTTTGGGC	1750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX005441.10	56965	TCAATGGTAGCTTGATAGGGATAACACTGAATCTATAAATTACTTTGGGC	57014

BX248419.4	1751	AGTATGGCCATTTTCACAATATTGATTCTTCCTATCCATGAGCATGGAAT	1800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX005441.10	57015	AGTATGGCCATTTTCACAATATTGATTCTTCCTATCCATGAGCATGGAAT	57064

BX248419.4	1801	GTTTTTCCATTTGTCTGTGTTCTCTCTGATTTCCTTGAGCAGTGGTTTGT	1850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX005441.10	57065	GTTTTTCCATTTGTCTGTGTTCTCTCTGATTTCCTTGAGCAGTGGTTTGT	57114

BX248419.4	1851	AGTTCTCCTTGAAGAGGTCCTTCACATCTGTGGGCACTAAGTCCTTTTCT	1900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX005441.10	57115	AGTTCTCCTTGAAGAGGTCCTTCACATCTGTGGGCACTAAGTCCTTTTCT	57164

BX248419.4	1901	CTCCCTCTCTATTCAACTGGAAATTTATCTTTCAAGGCACATTGTAAATG	1950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX005441.10	57165	CTCCCTCTCTATTCAACTGGAAATTTATCTTTCAAGGCACATTGTAAATG	57214

BX248419.4	1951	TTTTCTGCTTTCCAAACCTTCCCTTAGGCCTACAGGCAGAGCTGACCTCT	2000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX005441.10	57215	TTTTCTGCTTTCCAAACCTTCCCTTAGGCCTACAGGCAGAGCTGACCTCT	57264

Overview

Query
BX248419.4 - 122321 bps
Hit
BX005441.10 - 57264 bps
Total alignments
1
Best alignment
alignment #1 (HSP: 2000 bps)
Best alignment cartoon

Alternate alignments

Short-link