<=>End overlap alignment

Alignment #1 HSP: 2000 bps / non-identical: 0 bps

Full alignment

BX247949.9	1	AAGACTCGGGTTTCCTGGACACCCCAGACTCTCACTGTCCCCTGCACTGC	50
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX005428.7	128935	AAGACTCGGGTTTCCTGGACACCCCAGACTCTCACTGTCCCCTGCACTGC	128984

BX247949.9	51	CTCTGTCTTTGCAGAAACTCAAAACTTTCTGCTTGCTCTTTTCCTCTCCC	100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX005428.7	128985	CTCTGTCTTTGCAGAAACTCAAAACTTTCTGCTTGCTCTTTTCCTCTCCC	129034

BX247949.9	101	CTCAAACAACCTGACTGTGGGGGAAATGATTCTGACTGTCTCTTATTGTA	150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX005428.7	129035	CTCAAACAACCTGACTGTGGGGGAAATGATTCTGACTGTCTCTTATTGTA	129084

BX247949.9	151	AACTTACCAGGCAGCGACTACACTAAGAACAAAAACATTGGCTCAGGAAA	200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX005428.7	129085	AACTTACCAGGCAGCGACTACACTAAGAACAAAAACATTGGCTCAGGAAA	129134

BX247949.9	201	GGCAAGGTGAGGCCACAGAGCACAGAACAAAGCCCAAAAAACAGCCCACT	250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX005428.7	129135	GGCAAGGTGAGGCCACAGAGCACAGAACAAAGCCCAAAAAACAGCCCACT	129184

BX247949.9	251	GGGTACTATGACCCTCGGGGGCTGGAAAAAGTAACACCTGGACATGGGAT	300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX005428.7	129185	GGGTACTATGACCCTCGGGGGCTGGAAAAAGTAACACCTGGACATGGGAT	129234

BX247949.9	301	GAAAACAGGGACCACAGCTGCCCTGACAGAGGGCTGGTCCCCACTCCCCA	350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX005428.7	129235	GAAAACAGGGACCACAGCTGCCCTGACAGAGGGCTGGTCCCCACTCCCCA	129284

BX247949.9	351	AATAGCCCAGGGACATCTGCTTATCAACTGGTCCATATTATCTGCAAGGA	400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX005428.7	129285	AATAGCCCAGGGACATCTGCTTATCAACTGGTCCATATTATCTGCAAGGA	129334

BX247949.9	401	AACACAGGGAGACAGGGGCCATATGGTGGGAACCCAGAAAAAGCACGGTC	450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX005428.7	129335	AACACAGGGAGACAGGGGCCATATGGTGGGAACCCAGAAAAAGCACGGTC	129384

BX247949.9	451	TCGAGGGACCCAGAGGACGTGACACCCCTGAGACAGCTCCCAGATGAGGC	500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX005428.7	129385	TCGAGGGACCCAGAGGACGTGACACCCCTGAGACAGCTCCCAGATGAGGC	129434

BX247949.9	501	ATATGGGGAGCTGCAAAGTGGACAGAGGATGGCCATGTGCACTCAGGACT	550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX005428.7	129435	ATATGGGGAGCTGCAAAGTGGACAGAGGATGGCCATGTGCACTCAGGACT	129484

BX247949.9	551	CTCCCTGTTACAAGGGGACCTCAAAGGGGCTGTACACATGGGGGCCCTCA	600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX005428.7	129485	CTCCCTGTTACAAGGGGACCTCAAAGGGGCTGTACACATGGGGGCCCTCA	129534

BX247949.9	601	TTCTGGGCCTCGTGGGTCTTTTTCTTGATGTCCTCCTGATGGCTGGAGAA	650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX005428.7	129535	TTCTGGGCCTCGTGGGTCTTTTTCTTGATGTCCTCCTGATGGCTGGAGAA	129584

BX247949.9	651	ACAGGGGAGGGGGATGCAGAGAGGAAGGGACTAGAGGCACCACCTCTCCT	700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX005428.7	129585	ACAGGGGAGGGGGATGCAGAGAGGAAGGGACTAGAGGCACCACCTCTCCT	129634

BX247949.9	701	TGGATTCCTCTCCAGTTTCTAGCCCTCCCTAGATCACATCTGCCTTTACT	750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX005428.7	129635	TGGATTCCTCTCCAGTTTCTAGCCCTCCCTAGATCACATCTGCCTTTACT	129684

BX247949.9	751	ATTTGCTCCCTCTGAGATAGTGATCATCCAGGCCCTCAGCAATCAGCACG	800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX005428.7	129685	ATTTGCTCCCTCTGAGATAGTGATCATCCAGGCCCTCAGCAATCAGCACG	129734

BX247949.9	801	CAATTCCCAACTCACCCACCTGGATGCGACCTGGTAAGCCTGAGAGACAG	850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX005428.7	129735	CAATTCCCAACTCACCCACCTGGATGCGACCTGGTAAGCCTGAGAGACAG	129784

BX247949.9	851	AGACCGGGATGGGGACAAAGCAGGCACCACGGCCCTCCCTGCTGCCCACT	900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX005428.7	129785	AGACCGGGATGGGGACAAAGCAGGCACCACGGCCCTCCCTGCTGCCCACT	129834

BX247949.9	901	CCTCACCTGCAGCAGGAGGAGGCCACAGCTGGATGTTCGAGGGCCTTGGC	950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX005428.7	129835	CCTCACCTGCAGCAGGAGGAGGCCACAGCTGGATGTTCGAGGGCCTTGGC	129884

BX247949.9	951	CCAGCCCTGGCTTGGGCAGGACTTAAGGGTGTAAAAAATAACCTACATGT	1000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX005428.7	129885	CCAGCCCTGGCTTGGGCAGGACTTAAGGGTGTAAAAAATAACCTACATGT	129934

BX247949.9	1001	GATGGTTCATTTTCAATTCTATGTGCCTTAGTATAGGTTTAAGCAGGCCA	1050
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX005428.7	129935	GATGGTTCATTTTCAATTCTATGTGCCTTAGTATAGGTTTAAGCAGGCCA	129984

BX247949.9	1051	CATGGTCATAAAGAGATAAAGAAGGAAAATGTACTAAGCCACCATCCCCC	1100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX005428.7	129985	CATGGTCATAAAGAGATAAAGAAGGAAAATGTACTAAGCCACCATCCCCC	130034

BX247949.9	1101	CTACTTCTTGCTTTCCCTTTCATGCACTGGCCAGGCACCTATCGGTTGGG	1150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX005428.7	130035	CTACTTCTTGCTTTCCCTTTCATGCACTGGCCAGGCACCTATCGGTTGGG	130084

BX247949.9	1151	GCCCCCTCAACGACCCCTTCCCCACCTCACCAAAAAATGTAGTTTAGGCT	1200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX005428.7	130085	GCCCCCTCAACGACCCCTTCCCCACCTCACCAAAAAATGTAGTTTAGGCT	130134

BX247949.9	1201	AGCTTGCAACATAGATAATTGTACCCTTTCTTATCAACTAAGTGCAGCCA	1250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX005428.7	130135	AGCTTGCAACATAGATAATTGTACCCTTTCTTATCAACTAAGTGCAGCCA	130184

BX247949.9	1251	TTAGGGACATAAGTCAAATGTTTAAAGAGTCCTGAGACAATCACAATGCA	1300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX005428.7	130185	TTAGGGACATAAGTCAAATGTTTAAAGAGTCCTGAGACAATCACAATGCA	130234

BX247949.9	1301	TTATGGGCTGCAACAAAATGCAGCAAAAAAAAAAAAAAAAAAAACCCTAA	1350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX005428.7	130235	TTATGGGCTGCAACAAAATGCAGCAAAAAAAAAAAAAAAAAAAACCCTAA	130284

BX247949.9	1351	GGAACATACTTGAAGTCTTAAACTACCAATAGGTGACATCCGGGAAGATC	1400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX005428.7	130285	GGAACATACTTGAAGTCTTAAACTACCAATAGGTGACATCCGGGAAGATC	130334

BX247949.9	1401	GTAAGTCCTTGGTACTCAGCTAATGAGCAACTGGGGGAGGGAGTTGCGCA	1450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX005428.7	130335	GTAAGTCCTTGGTACTCAGCTAATGAGCAACTGGGGGAGGGAGTTGCGCA	130384

BX247949.9	1451	CTAGGGAATAAATTGTTGAAACTCTCCCTGGTGTGCCTGCATTCCAGACA	1500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX005428.7	130385	CTAGGGAATAAATTGTTGAAACTCTCCCTGGTGTGCCTGCATTCCAGACA	130434

BX247949.9	1501	CCCAATATTGCAAAACCATCACTAACACTCTCACTTTTGCTGTTCTCTGG	1550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX005428.7	130435	CCCAATATTGCAAAACCATCACTAACACTCTCACTTTTGCTGTTCTCTGG	130484

BX247949.9	1551	GTCTCAGAGTCCATTCTTTGGGTTTGGATGGGTGCGTTTGTTTCTCATAA	1600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX005428.7	130485	GTCTCAGAGTCCATTCTTTGGGTTTGGATGGGTGCGTTTGTTTCTCATAA	130534

BX247949.9	1601	TCTAGTTGCCTATATGGGGATCTCTGTGCTTGTGTGAAGTGAGTGAGACT	1650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX005428.7	130535	TCTAGTTGCCTATATGGGGATCTCTGTGCTTGTGTGAAGTGAGTGAGACT	130584

BX247949.9	1651	CTGCCTGAAAGGAGAAACACGTACCAATTGATTCATGTGGCCCATTCTAT	1700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX005428.7	130585	CTGCCTGAAAGGAGAAACACGTACCAATTGATTCATGTGGCCCATTCTAT	130634

BX247949.9	1701	CTGGATGTCCTGGCTCCTCACAGAAGCCATAGACAAACTTGAAACTGTTA	1750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX005428.7	130635	CTGGATGTCCTGGCTCCTCACAGAAGCCATAGACAAACTTGAAACTGTTA	130684

BX247949.9	1751	TTCAGGACACAATGAAAGTGACATGGGGGTACGGGAGGGTGGGGTGGAAA	1800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX005428.7	130685	TTCAGGACACAATGAAAGTGACATGGGGGTACGGGAGGGTGGGGTGGAAA	130734

BX247949.9	1801	GCGGGCACCACAGCAACCAGGCAACCTCATGTGTCTTGTGGAAGGCACTG	1850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX005428.7	130735	GCGGGCACCACAGCAACCAGGCAACCTCATGTGTCTTGTGGAAGGCACTG	130784

BX247949.9	1851	AAAGTACTGTGGGGGTCACATCACCATGAGAGAGCTGAAGGATGTGGGGT	1900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX005428.7	130785	AAAGTACTGTGGGGGTCACATCACCATGAGAGAGCTGAAGGATGTGGGGT	130834

BX247949.9	1901	GGTGTTGGGGCTGTCTATCGTCTCTACGTAATCCAGCAAACTGTCCCTGA	1950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX005428.7	130835	GGTGTTGGGGCTGTCTATCGTCTCTACGTAATCCAGCAAACTGTCCCTGA	130884

BX247949.9	1951	GGGAGCCTGATGATGCCTAAAGAATGAATGAGATTACTCTAGGTATGGCC	2000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX005428.7	130885	GGGAGCCTGATGATGCCTAAAGAATGAATGAGATTACTCTAGGTATGGCC	130934

Overview

Query
BX247949.9 - 56570 bps
Hit
BX005428.7 - 130934 bps
Total alignments
1
Best alignment
alignment #1 (HSP: 2000 bps)
Best alignment cartoon

Alternate alignments

Short-link