<=>End overlap alignment

Alignment #1 HSP: 2000 bps / non-identical: 0 bps

Full alignment

BX120009.10	1	AAATAAAAGGAAACATCAAATTCATTAAAATGTTTACCTATGAGGTAGGG	50
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX005422.5	95467	AAATAAAAGGAAACATCAAATTCATTAAAATGTTTACCTATGAGGTAGGG	95516

BX120009.10	51	GTAAGAGGTTAGATATGGGAGTAAGGACTGGAGATAAAAGGGACCAAATA	100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX005422.5	95517	GTAAGAGGTTAGATATGGGAGTAAGGACTGGAGATAAAAGGGACCAAATA	95566

BX120009.10	101	AATCAAGGGAGAGAGAGAGAGCTCGGAGGCACCAATGATGATCATATAAT	150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX005422.5	95567	AATCAAGGGAGAGAGAGAGAGCTCGGAGGCACCAATGATGATCATATAAT	95616

BX120009.10	151	GAACTGAGAAGTTCTTAACCTTTTGTACCTGAGGTCCAGCATGAATAACA	200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX005422.5	95617	GAACTGAGAAGTTCTTAACCTTTTGTACCTGAGGTCCAGCATGAATAACA	95666

BX120009.10	201	ATAATAATAATGAATTAGATGTGGTCATCTGCATGGAAGTTCACTGTCTA	250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX005422.5	95667	ATAATAATAATGAATTAGATGTGGTCATCTGCATGGAAGTTCACTGTCTA	95716

BX120009.10	251	ATGCTAAGAGAATTCCCAAAACATATAAAAATATAAAGCATGGTGAGTGT	300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX005422.5	95717	ATGCTAAGAGAATTCCCAAAACATATAAAAATATAAAGCATGGTGAGTGT	95766

BX120009.10	301	TATGATAAATAGAAACCTGTAAGATCTCTGGAGGGGCATTTTTTGTGTGA	350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX005422.5	95767	TATGATAAATAGAAACCTGTAAGATCTCTGGAGGGGCATTTTTTGTGTGA	95816

BX120009.10	351	ACATTGCCATGGAATGAGTCCAAGTAGAGACAGTAAGTAGTTACAGGCAC	400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX005422.5	95817	ACATTGCCATGGAATGAGTCCAAGTAGAGACAGTAAGTAGTTACAGGCAC	95866

BX120009.10	401	CCACCACACTGTGTTGTAATTATGTATAGAAATATAGATCTGACTCCATT	450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX005422.5	95867	CCACCACACTGTGTTGTAATTATGTATAGAAATATAGATCTGACTCCATT	95916

BX120009.10	451	ATTTGGCAATGGACTCTGGAGAATTTGAACTTGGTCTTTTCCTTCACAAA	500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX005422.5	95917	ATTTGGCAATGGACTCTGGAGAATTTGAACTTGGTCTTTTCCTTCACAAA	95966

BX120009.10	501	ATAGGGTGAATAGGACAGTGGATAAACAGTCTTGGATCCAGACTTTCTGG	550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX005422.5	95967	ATAGGGTGAATAGGACAGTGGATAAACAGTCTTGGATCCAGACTTTCTGG	96016

BX120009.10	551	ATTGGAAGCTAGCCCTACTACTTCATAGCTGTGGGAACTTGATCAAAGTG	600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX005422.5	96017	ATTGGAAGCTAGCCCTACTACTTCATAGCTGTGGGAACTTGATCAAAGTG	96066

BX120009.10	601	CTTAAAGTCTCTGTGTATGTAAAAAGATGTAAGTATCTCTCATGTGAAAT	650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX005422.5	96067	CTTAAAGTCTCTGTGTATGTAAAAAGATGTAAGTATCTCTCATGTGAAAT	96116

BX120009.10	651	AGTGAAAATAATAGTACCTACCTCAAAGACTATGTGTGAGAATAAAGTGA	700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX005422.5	96117	AGTGAAAATAATAGTACCTACCTCAAAGACTATGTGTGAGAATAAAGTGA	96166

BX120009.10	701	GTTAATAAATGTAAATCCTCAGAATAGCGCCTGACCATATTAACTACTCA	750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX005422.5	96167	GTTAATAAATGTAAATCCTCAGAATAGCGCCTGACCATATTAACTACTCA	96216

BX120009.10	751	GTTAGTTATCGGTATTGTTGTTGTTATGTGGCTGAATGCTTTTAACCCAT	800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX005422.5	96217	GTTAGTTATCGGTATTGTTGTTGTTATGTGGCTGAATGCTTTTAACCCAT	96266

BX120009.10	801	TAGAAGATCAATGAACACTTATCAGATTGAATTTTTCCTCCCTTCCTTAC	850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX005422.5	96267	TAGAAGATCAATGAACACTTATCAGATTGAATTTTTCCTCCCTTCCTTAC	96316

BX120009.10	851	ATTCTACAAATCCTAGGGCCTCCTCTTTACATTCCCACCTTTACAGTATT	900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX005422.5	96317	ATTCTACAAATCCTAGGGCCTCCTCTTTACATTCCCACCTTTACAGTATT	96366

BX120009.10	901	TCACAGGGTCCCCTGGGCCCGGGGGTCATGGCCAGAACGCAGAGACTTTA	950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX005422.5	96367	TCACAGGGTCCCCTGGGCCCGGGGGTCATGGCCAGAACGCAGAGACTTTA	96416

BX120009.10	951	TGATGAGGACGGTGCCCACGATGATGCCGACTAGGCCCAGCACCAGGCCC	1000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX005422.5	96417	TGATGAGGACGGTGCCCACGATGATGCCGACTAGGCCCAGCACCAGGCCC	96466

BX120009.10	1001	AGGGCACAGAGCACAGTCTCCGTTGTCTCAGGCATCTGGATTGGCTCTTG	1050
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX005422.5	96467	AGGGCACAGAGCACAGTCTCCGTTGTCTCAGGCATCTGGATTGGCTCTTG	96516

BX120009.10	1051	GGCCTCTGGGGGAAGAATGAAGAGATAGGGTCAGGAGGTGCAGTGAGGGT	1100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX005422.5	96517	GGCCTCTGGGGGAAGAATGAAGAGATAGGGTCAGGAGGTGCAGTGAGGGT	96566

BX120009.10	1101	GGTGATGGCCTGGGATGGTTGTGGGAATTGAAGGTTATGGACCAGTTAAT	1150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX005422.5	96567	GGTGATGGCCTGGGATGGTTGTGGGAATTGAAGGTTATGGACCAGTTAAT	96616

BX120009.10	1151	TGGATGTTAGGACGAGGAGAGGACTGAGACCCAGCCAGTGCGGAAAGCTG	1200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX005422.5	96617	TGGATGTTAGGACGAGGAGAGGACTGAGACCCAGCCAGTGCGGAAAGCTG	96666

BX120009.10	1201	GTGCAGAGGACACCAGGTCTTTGGAATAGAGGATGCCAGGAGATTATGGA	1250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX005422.5	96667	GTGCAGAGGACACCAGGTCTTTGGAATAGAGGATGCCAGGAGATTATGGA	96716

BX120009.10	1251	GAGAAAAGCAGTTGCATACCCCAGTGCTTGAGGAGCGGCTGGTCCAAGCC	1300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX005422.5	96717	GAGAAAAGCAGTTGCATACCCCAGTGCTTGAGGAGCGGCTGGTCCAAGCC	96766

BX120009.10	1301	CCAGTGCTCCACCCTGCAGTCATAGAAGTCCTCTGCTGAGGGCACAAAGG	1350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX005422.5	96767	CCAGTGCTCCACCCTGCAGTCATAGAAGTCCTCTGCTGAGGGCACAAAGG	96816

BX120009.10	1351	TCAGGTAATGGAACTTGTGGAAGCTGTAATCTGTTCTGGGCAGGAAGAGG	1400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX005422.5	96817	TCAGGTAATGGAACTTGTGGAAGCTGTAATCTGTTCTGGGCAGGAAGAGG	96866

BX120009.10	1401	CTCTCAGCGACACCCTCAGTGACCAGCTCCCCGTTGCACAGCCACGTGAC	1450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX005422.5	96867	CTCTCAGCGACACCCTCAGTGACCAGCTCCCCGTTGCACAGCCACGTGAC	96916

BX120009.10	1451	GTTGAGCACTGGTGGGAAGAACTTGTCAATGTGGCAGATGAGGGTGTTGG	1500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX005422.5	96917	GTTGAGCACTGGTGGGAAGAACTTGTCAATGTGGCAGATGAGGGTGTTGG	96966

BX120009.10	1501	GCTGGCCCAGCTCCACAGGCTCCTTGGGAAACACGGTCACCTCAGGGGGA	1550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX005422.5	96967	GCTGGCCCAGCTCCACAGGCTCCTTGGGAAACACGGTCACCTCAGGGGGA	97016

BX120009.10	1551	TCTGGAAGGAGACAGCACCAGGTTAGGCCCCTCTTCTGGGATGAATCACA	1600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX005422.5	97017	TCTGGAAGGAGACAGCACCAGGTTAGGCCCCTCTTCTGGGATGAATCACA	97066

BX120009.10	1601	AAGGCTCCACCTCTTAGGGGAGGGTGGTCCTCTACCTCAGCCTTAGATTT	1650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX005422.5	97067	AAGGCTCCACCTCTTAGGGGAGGGTGGTCCTCTACCTCAGCCTTAGATTT	97116

BX120009.10	1651	TATGGCAGCTCTGAATCACAGAGAGGGGTATCACACCACTGACCAGCCTC	1700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX005422.5	97117	TATGGCAGCTCTGAATCACAGAGAGGGGTATCACACCACTGACCAGCCTC	97166

BX120009.10	1701	ACTCTGCTCACCTTTCTCTCTCCTGAGAAGAGAGGATGCAAGCCCTTGCT	1750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX005422.5	97167	ACTCTGCTCACCTTTCTCTCTCCTGAGAAGAGAGGATGCAAGCCCTTGCT	97216

BX120009.10	1751	GTAGTGGGATCAGCCCATGGCCACTAGGGGAAGAGGATCACACAGCAGGG	1800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX005422.5	97217	GTAGTGGGATCAGCCCATGGCCACTAGGGGAAGAGGATCACACAGCAGGG	97266

BX120009.10	1801	GGCACTTAGGCTTCCTAGTCTGAGGGTGGCAGAGAGGCCCTCTCATCCCT	1850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX005422.5	97267	GGCACTTAGGCTTCCTAGTCTGAGGGTGGCAGAGAGGCCCTCTCATCCCT	97316

BX120009.10	1851	TCCAGTTGGGCTACAGAGGAAGAGGCAAAGATAGGGCGTACCGTTGGTGG	1900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX005422.5	97317	TCCAGTTGGGCTACAGAGGAAGAGGCAAAGATAGGGCGTACCGTTGGTGG	97366

BX120009.10	1901	CCTGAGTGTGGTTGGAACGCTGGATCAAGGTATTCAAGTTGTTGTTCAAT	1950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX005422.5	97367	CCTGAGTGTGGTTGGAACGCTGGATCAAGGTATTCAAGTTGTTGTTCAAT	97416

BX120009.10	1951	ATAGCAATGTTAGCCAGCCCGCCCTGAGCCTCAAAGGAAAAGGCTTGGCC	2000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX005422.5	97417	ATAGCAATGTTAGCCAGCCCGCCCTGAGCCTCAAAGGAAAAGGCTTGGCC	97466

Overview

Query
BX120009.10 - 64380 bps
Hit
BX005422.5 - 97466 bps
Total alignments
1
Best alignment
alignment #1 (HSP: 2000 bps)
Best alignment cartoon

Alternate alignments

Short-link