<=>End overlap alignment

Alignment #1 HSP: 2000 bps / non-identical: 0 bps

Full alignment

C  AL772132.6	205802	GAATTCATTTATTCTGTGAAAAAACAGATATTACTGTATGATGGTCCTCT	205753
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  BX005403.15	72370	GAATTCATTTATTCTGTGAAAAAACAGATATTACTGTATGATGGTCCTCT	72419

C  AL772132.6	205752	TTTTTAAAGGAAAAAGTCACTGTTTTCTATATTTCTTTCTCATTTGTGAT	205703
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  BX005403.15	72420	TTTTTAAAGGAAAAAGTCACTGTTTTCTATATTTCTTTCTCATTTGTGAT	72469

C  AL772132.6	205702	GTAAAGTAGGTTGTTTCAAACATTGTTCAGAAAAAGTGATTTAAATAAAA	205653
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  BX005403.15	72470	GTAAAGTAGGTTGTTTCAAACATTGTTCAGAAAAAGTGATTTAAATAAAA	72519

C  AL772132.6	205652	CGTTGATTGCATAAGGAAAAACATACACACTCACTGGCCACTTTATTAGG	205603
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  BX005403.15	72520	CGTTGATTGCATAAGGAAAAACATACACACTCACTGGCCACTTTATTAGG	72569

C  AL772132.6	205602	TACACCTTACTAGTATCAGATTGGACCCAATTTTGCCTTCAGAACTGTCC	205553
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  BX005403.15	72570	TACACCTTACTAGTATCAGATTGGACCCAATTTTGCCTTCAGAACTGTCC	72619

C  AL772132.6	205552	TAATCCGTTGTGGCATAGATTCAACAAGGTACTAAAAATATTCCTCAGAG	205503
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  BX005403.15	72620	TAATCCGTTGTGGCATAGATTCAACAAGGTACTAAAAATATTCCTCAGAG	72669

C  AL772132.6	205502	ATTTTGGTCCTTATTGACATAATAGCATCTCGCAGTTGCTGCAATATTTT	205453
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  BX005403.15	72670	ATTTTGGTCCTTATTGACATAATAGCATCTCGCAGTTGCTGCAATATTTT	72719

C  AL772132.6	205452	ATTGTCCAACTTTGGTGAGCCTGAGCGGATTATAGCCTTAGTTTCCTGTT	205403
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  BX005403.15	72720	ATTGTCCAACTTTGGTGAGCCTGAGCGGATTATAGCCTTAGTTTCCTGTT	72769

C  AL772132.6	205402	CTTAGTTGACAGGAGTGGCACCCGATCTGGTCTTTTGTTGCTGTAGCCCA	205353
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  BX005403.15	72770	CTTAGTTGACAGGAGTGGCACCCGATCTGGTCTTTTGTTGCTGTAGCCCA	72819

C  AL772132.6	205352	TTCTCCTTTGACCTCTGGCATCAACAAGGCATTTGCTCCCACAGAACCGC	205303
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  BX005403.15	72820	TTCTCCTTTGACCTCTGGCATCAACAAGGCATTTGCTCCCACAGAACCGC	72869

C  AL772132.6	205302	CGCTCAATGGATGTTTTCTCTTTTTCAGACCATTCTCCGTAAACCATAGA	205253
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  BX005403.15	72870	CGCTCAATGGATGTTTTCTCTTTTTCAGACCATTCTCCGTAAACCATAGA	72919

C  AL772132.6	205252	GATGGTTGTGCGTGAAAATCCCAGTAGATCAGCAGTTTCTGAAATACTTA	205203
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  BX005403.15	72920	GATGGTTGTGCGTGAAAATCCCAGTAGATCAGCAGTTTCTGAAATACTTA	72969

C  AL772132.6	205202	AATCAGCCCGTCTGGCACCAACACCCATGCCACATTCAAAGTCACTTAAA	205153
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  BX005403.15	72970	AATCAGCCCGTCTGGCACCAACACCCATGCCACATTCAAAGTCACTTAAA	73019

C  AL772132.6	205152	TCACCTTTCTTCCCCATTCCGATGCTTGGTTTGAACTGCAGCAGATCATT	205103
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  BX005403.15	73020	TCACCTTTCTTCCCCATTCCGATGCTTGGTTTGAACTGCAGCAGATCATT	73069

C  AL772132.6	205102	TTGACCGTGTCTACATGCCTAAATGCATTGAGAAGCTGCTATGTGATTGG	205053
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  BX005403.15	73070	TTGACCGTGTCTACATGCCTAAATGCATTGAGAAGCTGCTATGTGATTGG	73119

C  AL772132.6	205052	CTGATTAGAAATTTGAGTAAGTTGGACAGGTGTACCAAATAAAGTGACCG	205003
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  BX005403.15	73120	CTGATTAGAAATTTGAGTAAGTTGGACAGGTGTACCAAATAAAGTGACCG	73169

C  AL772132.6	205002	ATGCAAGATTGGCAGCAAATTATAGGATTCCCATCAAAAAATGAACTCAA	204953
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  BX005403.15	73170	ATGCAAGATTGGCAGCAAATTATAGGATTCCCATCAAAAAATGAACTCAA	73219

C  AL772132.6	204952	ATACTTTCAAGTGGCAAGAAAAAAACTAAAACATGCAACAATCTCGCAGC	204903
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  BX005403.15	73220	ATACTTTCAAGTGGCAAGAAAAAAACTAAAACATGCAACAATCTCGCAGC	73269

C  AL772132.6	204902	AAATTCATAACTTTTTGATTTAGTGGCTAATTCATATTAATTTGTATTAC	204853
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  BX005403.15	73270	AAATTCATAACTTTTTGATTTAGTGGCTAATTCATATTAATTTGTATTAC	73319

C  AL772132.6	204852	CTCATTTAGTCATTCTAGTTCAAGTTGGTGATCCTCTAATGAGGGACAGA	204803
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  BX005403.15	73320	CTCATTTAGTCATTCTAGTTCAAGTTGGTGATCCTCTAATGAGGGACAGA	73369

C  AL772132.6	204802	AATGGAGTTTGAGGGTACGGCTCCTTTTAAAAATGATACATTTTTAACAC	204753
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  BX005403.15	73370	AATGGAGTTTGAGGGTACGGCTCCTTTTAAAAATGATACATTTTTAACAC	73419

C  AL772132.6	204752	AAATAAAACAACTACATTTTAAGCAAATATATACCGATGAGAACAAGCAA	204703
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  BX005403.15	73420	AAATAAAACAACTACATTTTAAGCAAATATATACCGATGAGAACAAGCAA	73469

C  AL772132.6	204702	CCACAGTTAAAACAGATCAAGAATGGTCTGAAGGGCAAAGATTCAGCAAA	204653
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  BX005403.15	73470	CCACAGTTAAAACAGATCAAGAATGGTCTGAAGGGCAAAGATTCAGCAAA	73519

C  AL772132.6	204652	ACATCACTTCCAGACAGATCAAAGATGATCTTAAATGACCTTTAAGTACA	204603
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  BX005403.15	73520	ACATCACTTCCAGACAGATCAAAGATGATCTTAAATGACCTTTAAGTACA	73569

C  AL772132.6	204602	GTTACTGTCAAAAGATGTTTGATGGAAGATCCGCTGTCAGCAAGAAGCCC	204553
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  BX005403.15	73570	GTTACTGTCAAAAGATGTTTGATGGAAGATCCGCTGTCAGCAAGAAGCCC	73619

C  AL772132.6	204552	CCGTAAAACTCCATTGTTGAAAAATGCTGAATCGGTTAAAATTGTTCAAG	204503
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  BX005403.15	73620	CCGTAAAACTCCATTGTTGAAAAATGCTGAATCGGTTAAAATTGTTCAAG	73669

C  AL772132.6	204502	GAACACACTGACAAAGCCCAAAGATGTGAACTGATGAAAGTAAAAATAAT	204453
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  BX005403.15	73670	GAACACACTGACAAAGCCCAAAGATGTGAACTGATGAAAGTAAAAATAAT	73719

C  AL772132.6	204452	TTTTTCAGATGTAGTGTCATAGACGGTCTGTCAGACGACATACAGGTACT	204403
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  BX005403.15	73720	TTTTTCAGATGTAGTGTCATAGACGGTCTGTCAGACGACATACAGGTACT	73769

C  AL772132.6	204402	GAATTTAATACAGTGAGAAGAATGTTGGCACAAAAATCATGTGATGTTCC	204353
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  BX005403.15	73770	GAATTTAATACAGTGAGAAGAATGTTGGCACAAAAATCATGTGATGTTCC	73819

C  AL772132.6	204352	TCATACTAGTGGTGTTGGACCCTTGTACTGTTTACCAGGTATCGTAGATC	204303
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  BX005403.15	73820	TCATACTAGTGGTGTTGGACCCTTGTACTGTTTACCAGGTATCGTAGATC	73869

C  AL772132.6	204302	AGTTTGAATACATCAGAATACTTGAAGAGATTATGTTGCTCTATGCTGAG	204253
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  BX005403.15	73870	AGTTTGAATACATCAGAATACTTGAAGAGATTATGTTGCTCTATGCTGAG	73919

C  AL772132.6	204252	GAGGAAATGTCCCTGAAATTTGTGTTTAAGTAATAAAAATAGTGTTTAAG	204203
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  BX005403.15	73920	GAGGAAATGTCCCTGAAATTTGTGTTTAAGTAATAAAAATAGTGTTTAAG	73969

C  AL772132.6	204202	TAAAAACTTTTTTTTTTCTCTTTAAAAAGAAAAATATTGATACTGCTATT	204153
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  BX005403.15	73970	TAAAAACTTTTTTTTTTCTCTTTAAAAAGAAAAATATTGATACTGCTATT	74019

C  AL772132.6	204152	TTTTTAACAGACTGATAATCCTTTGTATAAGCATTTATTCTTTATTTTAT	204103
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  BX005403.15	74020	TTTTTAACAGACTGATAATCCTTTGTATAAGCATTTATTCTTTATTTTAT	74069

C  AL772132.6	204102	TATTTATTTGACTTTGTTATTTAACATTTAACAACTGTCAAATTCTGTAG	204053
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  BX005403.15	74070	TATTTATTTGACTTTGTTATTTAACATTTAACAACTGTCAAATTCTGTAG	74119

C  AL772132.6	204052	ATAAAAAAAAACATTTATATTAATATTTTAGCAATATTTTATTTTCAATT	204003
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  BX005403.15	74120	ATAAAAAAAAACATTTATATTAATATTTTAGCAATATTTTATTTTCAATT	74169

C  AL772132.6	204002	CAGAATAAATCAGATCGTCATATAACAAAACAAACAAATACTCAAATCCT	203953
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  BX005403.15	74170	CAGAATAAATCAGATCGTCATATAACAAAACAAACAAATACTCAAATCCT	74219

C  AL772132.6	203952	TAAAACTGTCGTACACAGTGGTGCAGTGAGTAGCACAATCGCCTCACAGC	203903
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  BX005403.15	74220	TAAAACTGTCGTACACAGTGGTGCAGTGAGTAGCACAATCGCCTCACAGC	74269

C  AL772132.6	203902	AAGAAAGTTGCTGGTTCGAGCCTCTGCTGGGTCAGTTGCCATTTCTGTGT	203853
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  BX005403.15	74270	AAGAAAGTTGCTGGTTCGAGCCTCTGCTGGGTCAGTTGCCATTTCTGTGT	74319

C  AL772132.6	203852	GGAGTTTGCATGTTCTCCCCTTGTCTGCATGCTCTTGTTTCCCCCACAGT	203803
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  BX005403.15	74320	GGAGTTTGCATGTTCTCCCCTTGTCTGCATGCTCTTGTTTCCCCCACAGT	74369

Overview

Query
AL772132.6 - 205802 bps
Hit
BX005403.15 - 74369 bps
Total alignments
45
Best alignment
alignment #1 (HSP: 2000 bps)
Best alignment cartoon

Alternate alignments

#%IDscoreHSPstartendstrandhstarthendhstrand
110019412000203803205802-172370743691
285.58223509104935105443-1511456331
383.611784728623886709-1517156401
485.71387241008410791902490931
585.1956110114305114414110150102571
686.79601083006730174110152102571
798.945914757747667-115552156421
810046884755947646115555156421
997.853993185419185511115557156491
1098.78378231753256115558156391
1198.78378231753256-115560156411
121004184185416185499-115560156431
131003781150598150678115583156631
1491.08110156114305114460115673158291
1596.234253157269157321116481165331
1695.33411074755247658-121723218291
1796.9442984756147658121723218201
1895.137103148298148400121723218241
1995.793796148302148397-121726218201
2097.56378231753256121732218131
2197.734088185416185503-121734218211
2297.56378231753256-121738218191
2310038794756247640-134241343191
241003879185418185496-134241343191
2598.78378231783259134241343221
2610038794756147639134241343191
271003981185421185501134241343211
2892.4642107148289148395-138483385881
2994.06451014756247662138483385831
301003973113587113659138483385551
3194.06451014756247662-138484385841
3293.753780148154148233138498385771
3395.6178114163362163475138608387211
3495.964099185405185503140279403771
3510047964756247657-140284403791
3697.924097148289148385-140284403791
3710047964756247657140284403791
3897.924097148289148385140284403791
3998.853987185417185503-140292403781
4098.8378331743256-140298403801
4198.82388531753259140298403821
4289.3349753549035564-150680507541
4384.25661277716877294156290564161
4488.89931443549235635-172546726891
4584.161523205613056449172850731711
Short-link