<=>End overlap alignment

Alignment #1 HSP: 2000 bps / non-identical: 0 bps

Full alignment

CR735122.6	10564	GAATTCTCGACGGAAAGCAACGAAATTGCTATCAAGAGATTCTTTTATAC	10613
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX005362.6	1	GAATTCTCGACGGAAAGCAACGAAATTGCTATCAAGAGATTCTTTTATAC	50

CR735122.6	10614	GTAAGTAGGGGCTGCTAATGATTGTTGGTCTTGTAAGGGAACCAATGACA	10663
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX005362.6	51	GTAAGTAGGGGCTGCTAATGATTGTTGGTCTTGTAAGGGAACCAATGACA	100

CR735122.6	10664	CCCCCCCCCCCCCCCCCCCCTAAAAAACACAAAAAAACAAGAAACATTAA	10713
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX005362.6	101	CCCCCCCCCCCCCCCCCCCCTAAAAAACACAAAAAAACAAGAAACATTAA	150

CR735122.6	10714	AGTCTGATTTAAATTAATACTATAAAATTAATTTCATCATTAAACCACAG	10763
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX005362.6	151	AGTCTGATTTAAATTAATACTATAAAATTAATTTCATCATTAAACCACAG	200

CR735122.6	10764	ATATTTGTCCTGTCTTTTTTACTCTTTTATTAAAATTCATTTGGCTTACT	10813
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX005362.6	201	ATATTTGTCCTGTCTTTTTTACTCTTTTATTAAAATTCATTTGGCTTACT	250

CR735122.6	10814	TTGTTACAATATAACCCAAGCCCTATTTTATAACTCTAACCACAACTTTC	10863
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX005362.6	251	TTGTTACAATATAACCCAAGCCCTATTTTATAACTCTAACCACAACTTTC	300

CR735122.6	10864	CCCAGTGTATTATAATGGCAGTCTGAGCTCCAGGCTGTGTATTGTCATTG	10913
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX005362.6	301	CCCAGTGTATTATAATGGCAGTCTGAGCTCCAGGCTGTGTATTGTCATTG	350

CR735122.6	10914	ACAGATGACAGTCGCTGTAACCCTGCAGGAATATCACGAGTGCTTCAAAC	10963
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX005362.6	351	ACAGATGACAGTCGCTGTAACCCTGCAGGAATATCACGAGTGCTTCAAAC	400

CR735122.6	10964	TGAGGTGACTGGCTTGCCAATTTCTCACTGCAATTGTAGATTCATTAGGC	11013
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX005362.6	401	TGAGGTGACTGGCTTGCCAATTTCTCACTGCAATTGTAGATTCATTAGGC	450

CR735122.6	11014	TAATGCTTGAAATACTTACAGACATGTGCTTTGGGTGTACATTTTAGTTT	11063
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX005362.6	451	TAATGCTTGAAATACTTACAGACATGTGCTTTGGGTGTACATTTTAGTTT	500

CR735122.6	11064	GTTCCGATAATGGAAAAAAATGTCCTGCAATATATTTCAAGGTCACCCTG	11113
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX005362.6	501	GTTCCGATAATGGAAAAAAATGTCCTGCAATATATTTCAAGGTCACCCTG	550

CR735122.6	11114	CCATCTTATACAATAATAATATTAATAATCAAAAATAATAATACAAGCAC	11163
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX005362.6	551	CCATCTTATACAATAATAATATTAATAATCAAAAATAATAATACAAGCAC	600

CR735122.6	11164	TTTACATTTTAAGGAATATCTCAATATGTATGAACATGATTTTAAAAAAG	11213
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX005362.6	601	TTTACATTTTAAGGAATATCTCAATATGTATGAACATGATTTTAAAAAAG	650

CR735122.6	11214	ACAGTTAAAATCAGTATCAAACTAAGATTTATGGATAAATAGTAAAAAAA	11263
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX005362.6	651	ACAGTTAAAATCAGTATCAAACTAAGATTTATGGATAAATAGTAAAAAAA	700

CR735122.6	11264	GAAATTAAAAAATGTTTTAAAAAGGTATGTTTTATGACGTTTTTTAAAGC	11313
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX005362.6	701	GAAATTAAAAAATGTTTTAAAAAGGTATGTTTTATGACGTTTTTTAAAGC	750

CR735122.6	11314	ATCAGATGTTTGTGTTCAGGGAAGAGAATTCAGTAGGTGGGGGATAAGCG	11363
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX005362.6	751	ATCAGATGTTTGTGTTCAGGGAAGAGAATTCAGTAGGTGGGGGATAAGCG	800

CR735122.6	11364	GCGCAAAAGCCTCCATCCCTAATAGTCTGGGTTTTAGTCTTAGGGTGAAG	11413
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX005362.6	801	GCGCAAAAGCCTCCATCCCTAATAGTCTGGGTTTTAGTCTTAGGGTGAAG	850

CR735122.6	11414	CTGTCGGTGAGCATTTGTGGAGCGGAGACAATGCGCTGCTCTGTGGAGTA	11463
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX005362.6	851	CTGTCGGTGAGCATTTGTGGAGCGGAGACAATGCGCTGCTCTGTGGAGTA	900

CR735122.6	11464	ATAAGGAGATTTTTAAAAGGTAAATGGGAGCATTGCCATGGACACACTGA	11513
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX005362.6	901	ATAAGGAGATTTTTAAAAGGTAAATGGGAGCATTGCCATGGACACACTGA	950

CR735122.6	11514	TGTAATTGATACTCGATCTGGGCTGAAATGTGAAGCCAGTCTGTAGCAAT	11563
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX005362.6	951	TGTAATTGATACTCGATCTGGGCTGAAATGTGAAGCCAGTCTGTAGCAAT	1000

CR735122.6	11564	TGAAGAATTAGGAGGATGTGCTCGTATTCATATCACTGTTCTGTGTGTGC	11613
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX005362.6	1001	TGAAGAATTAGGAGGATGTGCTCGTATTCATATCACTGTTCTGTGTGTGC	1050

CR735122.6	11614	TGGAGTTTCTTATTGAGTTTCTCAGTATCATGTTGGGTGAGTGTGGGAAG	11663
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX005362.6	1051	TGGAGTTTCTTATTGAGTTTCTCAGTATCATGTTGGGTGAGTGTGGGAAG	1100

CR735122.6	11664	TATAGTCTTGCTACATTCCTGAGATGATGAAAAGGGATGTTTGATTTGGG	11713
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX005362.6	1101	TATAGTCTTGCTACATTCCTGAGATGATGAAAAGGGATGTTTGATTTGGG	1150

CR735122.6	11714	CCTCAATGGTTAGATTAGCATCAAACCTAACACTAAGATTGATGACTAGT	11763
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX005362.6	1151	CCTCAATGGTTAGATTAGCATCAAACCTAACACTAAGATTGATGACTAGT	1200

CR735122.6	11764	GGTGACATGGAAATGTCCTGGATAGAAAAGGTGGATGAAGATGGCTTTAG	11813
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX005362.6	1201	GGTGACATGGAAATGTCCTGGATAGAAAAGGTGGATGAAGATGGCTTTAG	1250

CR735122.6	11814	TTTTTGAGCTATACAGACAGGCTGTAAGGGTGGATAAAAATGTTGATGAT	11863
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX005362.6	1251	TTTTTGAGCTATACAGACAGGCTGTAAGGGTGGATAAAAATGTTGATGAT	1300

CR735122.6	11864	AAAAATGATAATGATGATGAAGTGAATTCCAGATTTCACAATTATTTGCT	11913
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX005362.6	1301	AAAAATGATAATGATGATGAAGTGAATTCCAGATTTCACAATTATTTGCT	1350

CR735122.6	11914	TATCATCAGTGAGGTAAGGGTTGTTTATGGACAAATATGGACAAACACAC	11963
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX005362.6	1351	TATCATCAGTGAGGTAAGGGTTGTTTATGGACAAATATGGACAAACACAC	1400

CR735122.6	11964	CACTAAGTTGCATTTAAAATATAATTTTAACAACATTTCTAAATTTCAGA	12013
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX005362.6	1401	CACTAAGTTGCATTTAAAATATAATTTTAACAACATTTCTAAATTTCAGA	1450

CR735122.6	12014	TGATGAATAGCTTGTCATGTGATTGTCATGATATTATTTGTTAAATTTAG	12063
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX005362.6	1451	TGATGAATAGCTTGTCATGTGATTGTCATGATATTATTTGTTAAATTTAG	1500

CR735122.6	12064	GTGCTAATATGGGAATTTAAAGTGGGAAAGAATTAAAAATCTACTCTTCT	12113
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX005362.6	1501	GTGCTAATATGGGAATTTAAAGTGGGAAAGAATTAAAAATCTACTCTTCT	1550

CR735122.6	12114	TTTGTTTATTTGTTTACAGTTCTGCTTGTTATAAATGTTGTGCACTTCAT	12163
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX005362.6	1551	TTTGTTTATTTGTTTACAGTTCTGCTTGTTATAAATGTTGTGCACTTCAT	1600

CR735122.6	12164	TATTTTGTTTAAAAAATTGCCCCATAATCTTTAATGAAATATCATAACCT	12213
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX005362.6	1601	TATTTTGTTTAAAAAATTGCCCCATAATCTTTAATGAAATATCATAACCT	1650

CR735122.6	12214	CATAGCCTGTTTTTTTCTGAACGCTACCCTAATTTACAAGTAGCTAAGTC	12263
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX005362.6	1651	CATAGCCTGTTTTTTTCTGAACGCTACCCTAATTTACAAGTAGCTAAGTC	1700

CR735122.6	12264	TTGCTTATTCAGAGGCAGAAACTGGAGGATGTGCAACAAATGTGAACACA	12313
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX005362.6	1701	TTGCTTATTCAGAGGCAGAAACTGGAGGATGTGCAACAAATGTGAACACA	1750

CR735122.6	12314	AAACTGGAGCTCCTTCAACGGACTCGACACTTGTAAACACTCGTACCATC	12363
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX005362.6	1751	AAACTGGAGCTCCTTCAACGGACTCGACACTTGTAAACACTCGTACCATC	1800

CR735122.6	12364	GGGCTCTTGGCTATCAGCACTGCCCACACTCGTCACAGCTACCAAGATGA	12413
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX005362.6	1801	GGGCTCTTGGCTATCAGCACTGCCCACACTCGTCACAGCTACCAAGATGA	1850

CR735122.6	12414	CCAATCACAGAGCTTGTGCTACGCGTCTTTGCGTTGTGTAGTTACAATAT	12463
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX005362.6	1851	CCAATCACAGAGCTTGTGCTACGCGTCTTTGCGTTGTGTAGTTACAATAT	1900

CR735122.6	12464	GGTCAATGCGCGTCAATCACGACGAGGAGTATGTGACTGCACGAAGGTTG	12513
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX005362.6	1901	GGTCAATGCGCGTCAATCACGACGAGGAGTATGTGACTGCACGAAGGTTG	1950

CR735122.6	12514	CGCCGGACCATACATAGGCACTTGACGCGGAAGTATAAATAAGCCTTTTG	12563
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX005362.6	1951	CGCCGGACCATACATAGGCACTTGACGCGGAAGTATAAATAAGCCTTTTG	2000

Overview

Query
CR735122.6 - 12563 bps
Hit
BX005362.6 - 178151 bps
Total alignments
2
Best alignment
alignment #1 (HSP: 2000 bps)
Best alignment cartoon

Alternate alignments

#%IDscoreHSPstartendstrandhstarthendhstrand
11001947200010564125631120001
284.695311069717080-123051231611
Short-link