<=>End overlap alignment

Alignment #1 HSP: 2000 bps / non-identical: 0 bps

Full alignment

BX004837.9	186326	TAGGGTCACAGTGAAGGAATGAATGTAAAAGGTGATCAAAGAAAGAGAGA	186375
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX005267.7	1	TAGGGTCACAGTGAAGGAATGAATGTAAAAGGTGATCAAAGAAAGAGAGA	50

BX004837.9	186376	TTTTGTCCTCATGAGGATTGCTTTAAAGGAAGCACTTTTTTAAAGATTGG	186425
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX005267.7	51	TTTTGTCCTCATGAGGATTGCTTTAAAGGAAGCACTTTTTTAAAGATTGG	100

BX004837.9	186426	CTAAGCCATCTCAAGCAAGTTGAGTAAAGATGACGAAACAACTGCCATTT	186475
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX005267.7	101	CTAAGCCATCTCAAGCAAGTTGAGTAAAGATGACGAAACAACTGCCATTT	150

BX004837.9	186476	AAGTCATTCAAAGCGAGTCGAATGAAAGTATGAATGCGAATAAGGATGGA	186525
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX005267.7	151	AAGTCATTCAAAGCGAGTCGAATGAAAGTATGAATGCGAATAAGGATGGA	200

BX004837.9	186526	ATGGAAATACGTACAGAGACTGTTTATATATTTACGAGAGATACGAGAGA	186575
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX005267.7	201	ATGGAAATACGTACAGAGACTGTTTATATATTTACGAGAGATACGAGAGA	250

BX004837.9	186576	CAAAGTGTAAGTGAGAAACTCTGGCTACGGTAATCTTTGGAGGATCGAAG	186625
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX005267.7	251	CAAAGTGTAAGTGAGAAACTCTGGCTACGGTAATCTTTGGAGGATCGAAG	300

BX004837.9	186626	AGTGTCATATACTTGTTTGTTAGCAATGTGTGTGATCGTGCCCGCATGCG	186675
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX005267.7	301	AGTGTCATATACTTGTTTGTTAGCAATGTGTGTGATCGTGCCCGCATGCG	350

BX004837.9	186676	AGTTTGTGTGCAGCCGCACACATGCACATGTACACACGGTTACGGTGATT	186725
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX005267.7	351	AGTTTGTGTGCAGCCGCACACATGCACATGTACACACGGTTACGGTGATT	400

BX004837.9	186726	TTCAGTCATGTTGAAATAGACATGTCATGTATTTTTTGTACATTAACGTG	186775
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX005267.7	401	TTCAGTCATGTTGAAATAGACATGTCATGTATTTTTTGTACATTAACGTG	450

BX004837.9	186776	TATAGAACTGCATATGCTATATCTATCTTACTGTATGAGAGCGCAAGACT	186825
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX005267.7	451	TATAGAACTGCATATGCTATATCTATCTTACTGTATGAGAGCGCAAGACT	500

BX004837.9	186826	ACATGAGCACGTTTTTAGTCCCGTCCCCCAAGACACTGACTCATCGAACG	186875
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX005267.7	501	ACATGAGCACGTTTTTAGTCCCGTCCCCCAAGACACTGACTCATCGAACG	550

BX004837.9	186876	TATGTGAAAGCAATCATGTAGTCATTTCAGTTTTGTGTGAGTGCGTGTGT	186925
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX005267.7	551	TATGTGAAAGCAATCATGTAGTCATTTCAGTTTTGTGTGAGTGCGTGTGT	600

BX004837.9	186926	GTTTGGGTGCGTGCATGTGTGTGTACATACCACACATATTATAAATAGAT	186975
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX005267.7	601	GTTTGGGTGCGTGCATGTGTGTGTACATACCACACATATTATAAATAGAT	650

BX004837.9	186976	ATTTAAGTTCTACTTAAAAGAATATTGCAATTTGCACATCTGGAGAGATA	187025
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX005267.7	651	ATTTAAGTTCTACTTAAAAGAATATTGCAATTTGCACATCTGGAGAGATA	700

BX004837.9	187026	GTAACATGATTTATTTTGTTTTCTGCCAGCACAGACAGGGCCGAAAACCA	187075
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX005267.7	701	GTAACATGATTTATTTTGTTTTCTGCCAGCACAGACAGGGCCGAAAACCA	750

BX004837.9	187076	GATTTTTACTGAAATGTAGCAGTTTCTTGGCAAGTTTGTTTAGTTCGCGG	187125
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX005267.7	751	GATTTTTACTGAAATGTAGCAGTTTCTTGGCAAGTTTGTTTAGTTCGCGG	800

BX004837.9	187126	GTCTGTTAGGTTCATTTTCATTAGGAAAACCAGGAAGCTCCTTTTCTGGA	187175
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX005267.7	801	GTCTGTTAGGTTCATTTTCATTAGGAAAACCAGGAAGCTCCTTTTCTGGA	850

BX004837.9	187176	GGGTTTGAATCAGCAGGATTTTTGCACGGTGCTGTGTTGAAGAGTTCGCT	187225
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX005267.7	851	GGGTTTGAATCAGCAGGATTTTTGCACGGTGCTGTGTTGAAGAGTTCGCT	900

BX004837.9	187226	CATAGCCTGTAGTCTGCATACTTGTCAAGTCGTTCGAGTGGCCACGCTCA	187275
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX005267.7	901	CATAGCCTGTAGTCTGCATACTTGTCAAGTCGTTCGAGTGGCCACGCTCA	950

BX004837.9	187276	AGTTAACTTGGGTAGGTGAAAATCTGGCAGGAAGATGGGTTGTAGTAGAG	187325
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX005267.7	951	AGTTAACTTGGGTAGGTGAAAATCTGGCAGGAAGATGGGTTGTAGTAGAG	1000

BX004837.9	187326	AATAAAAAGATGAATGAATGGATTTAATGAGTGGTGGAGGGTGGGTGAGT	187375
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX005267.7	1001	AATAAAAAGATGAATGAATGGATTTAATGAGTGGTGGAGGGTGGGTGAGT	1050

BX004837.9	187376	GAGTGCACCCCATATACAATTTGAAAATGCTTTATTTTTTATAATAAAAC	187425
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX005267.7	1051	GAGTGCACCCCATATACAATTTGAAAATGCTTTATTTTTTATAATAAAAC	1100

BX004837.9	187426	AGGGTTTCTCAGATCAACACCACAACCATGCATTTTTTTCCCTTTTTTTC	187475
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX005267.7	1101	AGGGTTTCTCAGATCAACACCACAACCATGCATTTTTTTCCCTTTTTTTC	1150

BX004837.9	187476	CATTGGAAATGTCTCCACTTCTGTCTTTTGACCTGTGTGTGTGAGTTTTA	187525
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX005267.7	1151	CATTGGAAATGTCTCCACTTCTGTCTTTTGACCTGTGTGTGTGAGTTTTA	1200

BX004837.9	187526	CTTGGATTATATGTGTGAATGTATCCACTTCAACCAATCAAACTTGATAT	187575
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX005267.7	1201	CTTGGATTATATGTGTGAATGTATCCACTTCAACCAATCAAACTTGATAT	1250

BX004837.9	187576	TTTCATTGTGTTCGACGTTTATTTTGGGCCAAACGCTAGAAATATTGTTT	187625
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX005267.7	1251	TTTCATTGTGTTCGACGTTTATTTTGGGCCAAACGCTAGAAATATTGTTT	1300

BX004837.9	187626	GTCCGTTGAACCACCCCAAGAACAGAACTGTCGATGGCGGTCTCGCATTT	187675
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX005267.7	1301	GTCCGTTGAACCACCCCAAGAACAGAACTGTCGATGGCGGTCTCGCATTT	1350

BX004837.9	187676	TTGTCTGGTTTTTCCAATCTTTTCCCTTTGTCCTTCTCTTCATGTAATGA	187725
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX005267.7	1351	TTGTCTGGTTTTTCCAATCTTTTCCCTTTGTCCTTCTCTTCATGTAATGA	1400

BX004837.9	187726	TCAGTGTTTTCAATGTCGCTCATTGCTTCAATCATTTAACAGTCTGCCTC	187775
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX005267.7	1401	TCAGTGTTTTCAATGTCGCTCATTGCTTCAATCATTTAACAGTCTGCCTC	1450

BX004837.9	187776	CTTCTGGTTGCACAGTGTGGTTCCACGTACGCATGAGAAGCATTCCGAAC	187825
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX005267.7	1451	CTTCTGGTTGCACAGTGTGGTTCCACGTACGCATGAGAAGCATTCCGAAC	1500

BX004837.9	187826	AACGGCACGTAGCAATAACCCTTAGTCTCTAGTGCTGAACCAAAAATACA	187875
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX005267.7	1501	AACGGCACGTAGCAATAACCCTTAGTCTCTAGTGCTGAACCAAAAATACA	1550

BX004837.9	187876	AAAAAAAACACACACACACACAGACATCAACACCAGACCTTCTGTTCGAC	187925
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX005267.7	1551	AAAAAAAACACACACACACACAGACATCAACACCAGACCTTCTGTTCGAC	1600

BX004837.9	187926	CTCAGCAAGCTGTTTTTTTATCCTCTTTAGGTTGATTTGCAGTTTGCACA	187975
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX005267.7	1601	CTCAGCAAGCTGTTTTTTTATCCTCTTTAGGTTGATTTGCAGTTTGCACA	1650

BX004837.9	187976	GCCGGCCCTCAGTAACTTCAGGGAGAAATGTAAATTAATATGCAGTGACA	188025
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX005267.7	1651	GCCGGCCCTCAGTAACTTCAGGGAGAAATGTAAATTAATATGCAGTGACA	1700

BX004837.9	188026	GAGTCTGTCCCCTCCTAGCCGTCTTAACCCGTAATCTATAGTGACCTCTA	188075
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX005267.7	1701	GAGTCTGTCCCCTCCTAGCCGTCTTAACCCGTAATCTATAGTGACCTCTA	1750

BX004837.9	188076	GATGCTCTTCAGGTGCCCATACAGAACCAGTACGCCTCTCTCAGAGTATG	188125
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX005267.7	1751	GATGCTCTTCAGGTGCCCATACAGAACCAGTACGCCTCTCTCAGAGTATG	1800

BX004837.9	188126	TTTACCCAACCGCAACCGTTAGCTACCTTCTGTTGCCTGGCACGTACGTT	188175
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX005267.7	1801	TTTACCCAACCGCAACCGTTAGCTACCTTCTGTTGCCTGGCACGTACGTT	1850

BX004837.9	188176	TGACCGCTTTCTCACAAGGCACAACCACCTACAGTTCCTACAGTTTCTCT	188225
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX005267.7	1851	TGACCGCTTTCTCACAAGGCACAACCACCTACAGTTCCTACAGTTTCTCT	1900

BX004837.9	188226	CTTTTTAGCTGTCTTTCACATTCATAGCCATATAACCTTGACAGTATTTT	188275
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX005267.7	1901	CTTTTTAGCTGTCTTTCACATTCATAGCCATATAACCTTGACAGTATTTT	1950

BX004837.9	188276	TGACCGAGTTTCATGTCAAATTTAGGTTTCGGGGTTTCAGGGGAGAATTC	188325
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX005267.7	1951	TGACCGAGTTTCATGTCAAATTTAGGTTTCGGGGTTTCAGGGGAGAATTC	2000

Overview

Query
BX004837.9 - 188325 bps
Hit
BX005267.7 - 104035 bps
Total alignments
20
Best alignment
alignment #1 (HSP: 2000 bps)
Best alignment cartoon

Alternate alignments

#%IDscoreHSPstartendstrandhstarthendhstrand
1100197420001863261883251120001
284.3790206174235174440-1282130311
385.341753417519275532-110778111181
482.17149348117520117867-110778111191
580.241705452102721571117863184241
688.43731252235122475121286214061
78555128157295157422121286214051
885.84541137519275304121294214061
987.16831477538675532121475216221
1093.335875145862145936-121756218301
1182.921473344516045493-122438227651
1282.61804771056011036-128449289251
1381.641353392237322711138461387871
1484.451392807520875487138463387451
1590.589413911081246138870390071
1692.77261346134619134964192774931191
1781.731112813917139451193628939171
1882.21146451122815123265196672971321
1984.23199483153169153651196738972381
2086.6871816059360773-196907971001
Short-link