<=>End overlap alignment

Alignment #1 HSP: 2000 bps / non-identical: 0 bps

Full alignment

BX296545.5	1	TGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCGAGGCGGGCAGATCACAAGGTCAGG	50
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX005209.7	63901	TGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCGAGGCGGGCAGATCACAAGGTCAGG	63950

BX296545.5	51	AGATCGAGACCATCCTGGCGAACACGGTGAAACCCCGTCTCTACTAAAAA	100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX005209.7	63951	AGATCGAGACCATCCTGGCGAACACGGTGAAACCCCGTCTCTACTAAAAA	64000

BX296545.5	101	TACAAAAAGCTAGCCGGGCGTGGTGGCGGGTGCCTGTAGTCCCAGCTACT	150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX005209.7	64001	TACAAAAAGCTAGCCGGGCGTGGTGGCGGGTGCCTGTAGTCCCAGCTACT	64050

BX296545.5	151	CGGGAGGCTGAGGCAGGAGAATGGCGTGAACCCAGGAGGCGGAGCTTGCA	200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX005209.7	64051	CGGGAGGCTGAGGCAGGAGAATGGCGTGAACCCAGGAGGCGGAGCTTGCA	64100

BX296545.5	201	GTGAGCCGAGATCACGCCACTGCACTCCAGCCTGGGCAACAGAGCAAGAC	250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX005209.7	64101	GTGAGCCGAGATCACGCCACTGCACTCCAGCCTGGGCAACAGAGCAAGAC	64150

BX296545.5	251	TCTGTCCCCCCCGCCCCCCAAAAAAAAAAAAACCCACACACACCAAAAAA	300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX005209.7	64151	TCTGTCCCCCCCGCCCCCCAAAAAAAAAAAAACCCACACACACCAAAAAA	64200

BX296545.5	301	CTGTTTTTACGTCATTATCTGAGCGGAAGCGGAACCGCATTAGAGGGTGA	350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX005209.7	64201	CTGTTTTTACGTCATTATCTGAGCGGAAGCGGAACCGCATTAGAGGGTGA	64250

BX296545.5	351	GTAGTTGGGCTAAATAGGACTCGCCTTTCTCATATTCTTTTTTCAGATGA	400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX005209.7	64251	GTAGTTGGGCTAAATAGGACTCGCCTTTCTCATATTCTTTTTTCAGATGA	64300

BX296545.5	401	TACCCTGTTGAGCTGGTAGGTAGGAAGAACCAGCGAAGCGCACAGTTACC	450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX005209.7	64301	TACCCTGTTGAGCTGGTAGGTAGGAAGAACCAGCGAAGCGCACAGTTACC	64350

BX296545.5	451	GGAGAGGTTATTTGCCCAATGTTGAGAAACATATGTGTGTATTAGAAAAA	500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX005209.7	64351	GGAGAGGTTATTTGCCCAATGTTGAGAAACATATGTGTGTATTAGAAAAA	64400

BX296545.5	501	ATCACATCGACTCCCAGGAATCCTGCAACATACTGCAACTGTGATGCTGA	550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX005209.7	64401	ATCACATCGACTCCCAGGAATCCTGCAACATACTGCAACTGTGATGCTGA	64450

BX296545.5	551	CCAGAATGAGTGGAGATTTCCTCATGATTTCTCTGTGTGAGATGCAGGTT	600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX005209.7	64451	CCAGAATGAGTGGAGATTTCCTCATGATTTCTCTGTGTGAGATGCAGGTT	64500

BX296545.5	601	AAAAAAATTATTACTTAATATATGAATAGGCAGATATTGAATAAGCTATT	650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX005209.7	64501	AAAAAAATTATTACTTAATATATGAATAGGCAGATATTGAATAAGCTATT	64550

BX296545.5	651	GCAATGAAAAAATAAAAGTATGCCCTAGTGAGTAAAAAATGTAAGCTGAT	700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX005209.7	64551	GCAATGAAAAAATAAAAGTATGCCCTAGTGAGTAAAAAATGTAAGCTGAT	64600

BX296545.5	701	GAAATATAATACAATTAATATGAAAACTAAATATCAAGATGGAAGGTTTG	750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX005209.7	64601	GAAATATAATACAATTAATATGAAAACTAAATATCAAGATGGAAGGTTTG	64650

BX296545.5	751	CTAGTTCACTGTGGATAATAGATCATGTACATTTTTCTAGTAAATAGAAA	800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX005209.7	64651	CTAGTTCACTGTGGATAATAGATCATGTACATTTTTCTAGTAAATAGAAA	64700

BX296545.5	801	TACTTGGCTTCCATTCACTAGAAGTCCAACATCATCTCTTTAAATTTAAG	850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX005209.7	64701	TACTTGGCTTCCATTCACTAGAAGTCCAACATCATCTCTTTAAATTTAAG	64750

BX296545.5	851	TTCGATTAAGCAATCTATTACTACCAATATTTAAAGTAGTAATTCACAAA	900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX005209.7	64751	TTCGATTAAGCAATCTATTACTACCAATATTTAAAGTAGTAATTCACAAA	64800

BX296545.5	901	GTGTATCTGCTTATAAAAGTCCCATGATTATCTACATTTAAGAGTTAATG	950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX005209.7	64801	GTGTATCTGCTTATAAAAGTCCCATGATTATCTACATTTAAGAGTTAATG	64850

BX296545.5	951	CTGCATATCACACCCCTTGGGGACACCATACATTAACATATTTAGTTCTG	1000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX005209.7	64851	CTGCATATCACACCCCTTGGGGACACCATACATTAACATATTTAGTTCTG	64900

BX296545.5	1001	ATAGGACTGTTTACTTGTCTCAATCCTGATTTTCCAAAGTCAGTTAATCA	1050
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX005209.7	64901	ATAGGACTGTTTACTTGTCTCAATCCTGATTTTCCAAAGTCAGTTAATCA	64950

BX296545.5	1051	CAAAATTATGTAGGCAATGTCATATGATCAGGAAAAAAAGTGTTCCGTGA	1100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX005209.7	64951	CAAAATTATGTAGGCAATGTCATATGATCAGGAAAAAAAGTGTTCCGTGA	65000

BX296545.5	1101	ACCCCACCCTGCAAAGGGTGATCTAAAAAATGTCAGAGATTCGAAAATGT	1150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX005209.7	65001	ACCCCACCCTGCAAAGGGTGATCTAAAAAATGTCAGAGATTCGAAAATGT	65050

BX296545.5	1151	TTCAACTGTCTTTAGAACAAAGCAATAATCTCCTGTGGATTGCAATACTT	1200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX005209.7	65051	TTCAACTGTCTTTAGAACAAAGCAATAATCTCCTGTGGATTGCAATACTT	65100

BX296545.5	1201	CCTTTACTGAGAATTTGGAAAGTTTTTTGTAGATTTTTAGGTTATAGTTG	1250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX005209.7	65101	CCTTTACTGAGAATTTGGAAAGTTTTTTGTAGATTTTTAGGTTATAGTTG	65150

BX296545.5	1251	GAAAGTATGCTGATTTTTTTTAACATGGAAAGTAAAAGTGGTTTTTAAAT	1300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX005209.7	65151	GAAAGTATGCTGATTTTTTTTAACATGGAAAGTAAAAGTGGTTTTTAAAT	65200

BX296545.5	1301	CTCTGGATTAATTTATTAACATGTATCACTAACTCAAAAAAAAAAACCTT	1350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX005209.7	65201	CTCTGGATTAATTTATTAACATGTATCACTAACTCAAAAAAAAAAACCTT	65250

BX296545.5	1351	TTTTTTTTTTTTTTGAGGTGGAGTATCACTCTGTTGCCCAGGCTGCAGTG	1400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX005209.7	65251	TTTTTTTTTTTTTTGAGGTGGAGTATCACTCTGTTGCCCAGGCTGCAGTG	65300

BX296545.5	1401	CAGTGGCACAATCTCAGCTGACTGCAGTCTCCACTTCCCGTGTTCAAGTG	1450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX005209.7	65301	CAGTGGCACAATCTCAGCTGACTGCAGTCTCCACTTCCCGTGTTCAAGTG	65350

BX296545.5	1451	ATTCTCATGCCTCAGCCTCCCAAATAGCTGGGATGACAGGTGTGCACCAC	1500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX005209.7	65351	ATTCTCATGCCTCAGCCTCCCAAATAGCTGGGATGACAGGTGTGCACCAC	65400

BX296545.5	1501	CATGCCTGGCTAATTTTGTATTTTTAGTAAAGATGTTTTGCCACGTTGGC	1550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX005209.7	65401	CATGCCTGGCTAATTTTGTATTTTTAGTAAAGATGTTTTGCCACGTTGGC	65450

BX296545.5	1551	CAAGCTAGTCTCGAACTTCTCACCTCAAGTGGTCTGCCTGCTTGGGCCTC	1600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX005209.7	65451	CAAGCTAGTCTCGAACTTCTCACCTCAAGTGGTCTGCCTGCTTGGGCCTC	65500

BX296545.5	1601	CCAAACTGCTGGGATTATAGGCTTGAGCCACAGCACCGGCCCTCAAAAAA	1650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX005209.7	65501	CCAAACTGCTGGGATTATAGGCTTGAGCCACAGCACCGGCCCTCAAAAAA	65550

BX296545.5	1651	GGTTTCATAAAGCCCTAGTGCTTCATCTACTAGCCTATGTATCTCCAAAT	1700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX005209.7	65551	GGTTTCATAAAGCCCTAGTGCTTCATCTACTAGCCTATGTATCTCCAAAT	65600

BX296545.5	1701	CCATTTGACCATGCAGCATACATTTATTTTTAAACTCTTAAAGGTCAATC	1750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX005209.7	65601	CCATTTGACCATGCAGCATACATTTATTTTTAAACTCTTAAAGGTCAATC	65650

BX296545.5	1751	TGGGTGTATATATCATTGATTTGGCTACAGAATGTCAGTTATATTTTATG	1800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX005209.7	65651	TGGGTGTATATATCATTGATTTGGCTACAGAATGTCAGTTATATTTTATG	65700

BX296545.5	1801	TCTTTGGTTAAAAAGTGAGGATACAAAATTTTATTCTCAAAACACGTTTA	1850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX005209.7	65701	TCTTTGGTTAAAAAGTGAGGATACAAAATTTTATTCTCAAAACACGTTTA	65750

BX296545.5	1851	TGTAATGTTGATTAATAAAAATAATTCACCTACTCATGTTTGATAATTAA	1900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX005209.7	65751	TGTAATGTTGATTAATAAAAATAATTCACCTACTCATGTTTGATAATTAA	65800

BX296545.5	1901	ATAATTAGTTTTATCTTTCCCATCACAGTAGGTGACACATAGAATATTTA	1950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX005209.7	65801	ATAATTAGTTTTATCTTTCCCATCACAGTAGGTGACACATAGAATATTTA	65850

BX296545.5	1951	GGTTTTGATTTTGTCAAGATGAAAATGAATAGCAAACCTGTTTGGAATTC	2000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX005209.7	65851	GGTTTTGATTTTGTCAAGATGAAAATGAATAGCAAACCTGTTTGGAATTC	65900

Overview

Query
BX296545.5 - 132383 bps
Hit
BX005209.7 - 65900 bps
Total alignments
1
Best alignment
alignment #1 (HSP: 2000 bps)
Best alignment cartoon

Alternate alignments

Short-link