<=>End overlap alignment

Alignment #1 HSP: 2000 bps / non-identical: 0 bps

Full alignment

AL929508.6	1	GAATTCTTCATCACTTTCTCCTTCTGTCTGAGAGGTCTTAAGATTTGTTT	50
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX005199.10	117114	GAATTCTTCATCACTTTCTCCTTCTGTCTGAGAGGTCTTAAGATTTGTTT	117163

AL929508.6	51	TATGATCTTCTGTGGAAACAAAAATAAAACTGTCACAATTGACTATAAAC	100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX005199.10	117164	TATGATCTTCTGTGGAAACAAAAATAAAACTGTCACAATTGACTATAAAC	117213

AL929508.6	101	TGCAATAAATTATGAACACATAAAAATATAAGAGCATAAAATTTGATTTG	150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX005199.10	117214	TGCAATAAATTATGAACACATAAAAATATAAGAGCATAAAATTTGATTTG	117263

AL929508.6	151	ACCAGAATCAGTTACCTTGAGAATTAGTAAGAAGAATACGCCCAAGGTCT	200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX005199.10	117264	ACCAGAATCAGTTACCTTGAGAATTAGTAAGAAGAATACGCCCAAGGTCT	117313

AL929508.6	201	ACAACAACTAGCATGGGGTCTTCAGACTGAAAATCATCCGGGAAGATGAC	250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX005199.10	117314	ACAACAACTAGCATGGGGTCTTCAGACTGAAAATCATCCGGGAAGATGAC	117363

AL929508.6	251	TTGAGGGGCACAAATATCCAATTTCATAGTCCAATGTTTACTGTTCTCCT	300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX005199.10	117364	TTGAGGGGCACAAATATCCAATTTCATAGTCCAATGTTTACTGTTCTCCT	117413

AL929508.6	301	GTAAAAGGAAAACACATCAGAATTATGAAAACATTTCACAATTGATTTAC	350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX005199.10	117414	GTAAAAGGAAAACACATCAGAATTATGAAAACATTTCACAATTGATTTAC	117463

AL929508.6	351	TATAATAAATGAATGAGTATTGACTGATTGTAATTTATTTTTTCTCGTAC	400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX005199.10	117464	TATAATAAATGAATGAGTATTGACTGATTGTAATTTATTTTTTCTCGTAC	117513

AL929508.6	401	AATGAACTCTCCAACAAGCAGCTGATCAATGGTTTGTCTGATTTCTGCCT	450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX005199.10	117514	AATGAACTCTCCAACAAGCAGCTGATCAATGGTTTGTCTGATTTCTGCCT	117563

AL929508.6	451	TGGTTTGCATCTTCAGCTTGTTATATTGCCTCCTGGCTGCTTCAGCCACT	500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX005199.10	117564	TGGTTTGCATCTTCAGCTTGTTATATTGCCTCCTGGCTGCTTCAGCCACT	117613

AL929508.6	501	CTCAGCTCTAACTCAGACTGATATCCAAACCCTGAAAAATATCACGTAAA	550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX005199.10	117614	CTCAGCTCTAACTCAGACTGATATCCAAACCCTGAAAAATATCACGTAAA	117663

AL929508.6	551	CCATATTGAACAGATATTTCACAAAAGCAATTCAAACTAATTTAAGAGGG	600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX005199.10	117664	CCATATTGAACAGATATTTCACAAAAGCAATTCAAACTAATTTAAGAGGG	117713

AL929508.6	601	ATGCTTATCTATAATACAAACCCGAAGTGTGGACCCTTCCTTTGTAGAAA	650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX005199.10	117714	ATGCTTATCTATAATACAAACCCGAAGTGTGGACCCTTCCTTTGTAGAAA	117763

AL929508.6	651	AACTCTGCCACTTTCTTGATAGCCTGAGGGTTATAAATGATATTAAGAGG	700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX005199.10	117764	AACTCTGCCACTTTCTTGATAGCCTGAGGGTTATAAATGATATTAAGAGG	117813

AL929508.6	701	ACTGGTATTGACCTCTAGTCTCCTCTCAAATTTGCTCCTTATTGGATTAC	750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX005199.10	117814	ACTGGTATTGACCTCTAGTCTCCTCTCAAATTTGCTCCTTATTGGATTAC	117863

AL929508.6	751	GTTCATAAATCATCTCAAAGACGGGAGGCGCTGATGATTCCACATCTGAA	800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX005199.10	117864	GTTCATAAATCATCTCAAAGACGGGAGGCGCTGATGATTCCACATCTGAA	117913

AL929508.6	801	GCTGAAAAAGGTCATAAAAATAATTATAAGTATATAAATACATATTTTGA	850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX005199.10	117914	GCTGAAAAAGGTCATAAAAATAATTATAAGTATATAAATACATATTTTGA	117963

AL929508.6	851	AAAGTTGTAGCCAATGATATCTGTAGTAGAAAAACAATATGTTGTGAAAA	900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX005199.10	117964	AAAGTTGTAGCCAATGATATCTGTAGTAGAAAAACAATATGTTGTGAAAA	118013

AL929508.6	901	AAATGTTTAACAAATTTTTTTTTGCTCTAACAGGTTTGGAACAGTAGAGG	950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX005199.10	118014	AAATGTTTAACAAATTTTTTTTTGCTCTAACAGGTTTGGAACAGTAGAGG	118063

AL929508.6	951	GAGAGAGAATAATATTTTTTTTTTTGTTTTTGGGATGAACTATCCCTTTA	1000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX005199.10	118064	GAGAGAGAATAATATTTTTTTTTTTGTTTTTGGGATGAACTATCCCTTTA	118113

AL929508.6	1001	ATCAATTACTTACCCGGATTGCTATATTCTGTGCTGTTAGTCTGGCCAAA	1050
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX005199.10	118114	ATCAATTACTTACCCGGATTGCTATATTCTGTGCTGTTAGTCTGGCCAAA	118163

AL929508.6	1051	CGGTTGATTGATCGCAACAACAACCTTGTCCTTAAATGAAAAGTAATGAT	1100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX005199.10	118164	CGGTTGATTGATCGCAACAACAACCTTGTCCTTAAATGAAAAGTAATGAT	118213

AL929508.6	1101	ATGAAATCTATTATAACATTTCTATTTATGCCAAGTATCATTTCAACACA	1150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX005199.10	118214	ATGAAATCTATTATAACATTTCTATTTATGCCAAGTATCATTTCAACACA	118263

AL929508.6	1151	AGAAATTACTGATCTATAGCACCAAGCAACTATAAATGTATGTAAATCTA	1200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX005199.10	118264	AGAAATTACTGATCTATAGCACCAAGCAACTATAAATGTATGTAAATCTA	118313

AL929508.6	1201	ACCGGTTTTGGAGAAACTAGGACAGGAAAAATTGAGCCCTGGGTAGTGAG	1250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX005199.10	118314	ACCGGTTTTGGAGAAACTAGGACAGGAAAAATTGAGCCCTGGGTAGTGAG	118363

AL929508.6	1251	ATCACGAAGAAACAGCCCACCAAGTTTTACTGTGAGCAAGGATGACTCAG	1300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX005199.10	118364	ATCACGAAGAAACAGCCCACCAAGTTTTACTGTGAGCAAGGATGACTCAG	118413

AL929508.6	1301	AACGAGGTAGAGACTCAACTTCAATCTTCACACCTGCAATGCAAAATAGA	1350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX005199.10	118414	AACGAGGTAGAGACTCAACTTCAATCTTCACACCTGCAATGCAAAATAGA	118463

AL929508.6	1351	AAATGTGAAAATCAACATCGAAACTGACTCAACACCATTAAAACATTAAT	1400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX005199.10	118464	AAATGTGAAAATCAACATCGAAACTGACTCAACACCATTAAAACATTAAT	118513

AL929508.6	1401	GCAATAAGAAGTAGATACTGTAAATACCTGAAAATTCCAGCTGAATGACC	1450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX005199.10	118514	GCAATAAGAAGTAGATACTGTAAATACCTGAAAATTCCAGCTGAATGACC	118563

AL929508.6	1451	CCACTCTCGCTCAAAAGAGGTTTATTTTTGTTTTCATGGTACAGTGTGAC	1500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX005199.10	118564	CCACTCTCGCTCAAAAGAGGTTTATTTTTGTTTTCATGGTACAGTGTGAC	118613

AL929508.6	1501	AGCTGCTTTCTCAAGCTTAAAGTCCAGCCGTGCAAAGAGATGATCCCTTC	1550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX005199.10	118614	AGCTGCTTTCTCAAGCTTAAAGTCCAGCCGTGCAAAGAGATGATCCCTTC	118663

AL929508.6	1551	TTGTAAAGGTATTCAGTGTTTGTGAATCCTCCAAAGGGTCAAAGAGATCA	1600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX005199.10	118664	TTGTAAAGGTATTCAGTGTTTGTGAATCCTCCAAAGGGTCAAAGAGATCA	118713

AL929508.6	1601	TCTGTCTCAGCTGTTTGAAGAAGACAGATGTCTTGTTACATGGTTCATTA	1650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX005199.10	118714	TCTGTCTCAGCTGTTTGAAGAAGACAGATGTCTTGTTACATGGTTCATTA	118763

AL929508.6	1651	TACTATTTGATACAGATTTCATTTCCAAAAAGCACTGCATGTAAAATTAT	1700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX005199.10	118764	TACTATTTGATACAGATTTCATTTCCAAAAAGCACTGCATGTAAAATTAT	118813

AL929508.6	1701	GTTAAACCATGATAAGCATAAATAGAAAACTGACCAAGAATTTCCCACTG	1750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX005199.10	118814	GTTAAACCATGATAAGCATAAATAGAAAACTGACCAAGAATTTCCCACTG	118863

AL929508.6	1751	TGCAGTGCCTGGTAAAAGCTCATCCGAAACCGGCTGTCCATCTGGCCCTC	1800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX005199.10	118864	TGCAGTGCCTGGTAAAAGCTCATCCGAAACCGGCTGTCCATCTGGCCCTC	118913

AL929508.6	1801	TTTCAGTCCCCCCATACCAACCACCCCAGCCTGGGAACCAAGACTGTAGA	1850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX005199.10	118914	TTTCAGTCCCCCCATACCAACCACCCCAGCCTGGGAACCAAGACTGTAGA	118963

AL929508.6	1851	TACTGAATCATTCCAGAACTCCCACTTTTAGGTATGGAGCCTGAGGGAGA	1900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX005199.10	118964	TACTGAATCATTCCAGAACTCCCACTTTTAGGTATGGAGCCTGAGGGAGA	119013

AL929508.6	1901	AGTGGCTGGGGACTCATTTATTAGAGGTTCCCGTAGACTCTAAATGGATG	1950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX005199.10	119014	AGTGGCTGGGGACTCATTTATTAGAGGTTCCCGTAGACTCTAAATGGATG	119063

AL929508.6	1951	AGAGGTACGATTCAAATTATTAATGAGTGTTTTTGGGTTACAACAGTGAT	2000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX005199.10	119064	AGAGGTACGATTCAAATTATTAATGAGTGTTTTTGGGTTACAACAGTGAT	119113

Overview

Query
AL929508.6 - 180029 bps
Hit
BX005199.10 - 119113 bps
Total alignments
20
Best alignment
alignment #1 (HSP: 2000 bps)
Best alignment cartoon

Alternate alignments

#%IDscoreHSPstartendstrandhstarthendhstrand
1100194420001200011171141191131
284.581332539706397315-110323105751
388.74178293176753177045-125727260371
482.66152359172712173070129834302081
586.88184326176720177045-129840301821
683.511242801038210661-129921302111
789.24135213176807177019130429306511
883.56163417171189171605134439348701
986.48279503144022144524142465429521
1092.49242326176720177045-162463627951
1185.91193363172718173080162463628311
1286.741472771038510661-162543628211
1393.66162205120416120620162622628261
1486.112574571753817994-169130695901
1587.44125214133099133312-169168693821
1680.7148435165062165496-169312697411
1784.37177360172718173077-172762731321
1884.921382661038810653172772730431
1988.95126190172881173070-181814820031
2082.69131319176720177038181840821741
Short-link