<=>End overlap alignment

Alignment #1 HSP: 2000 bps / non-identical: 0 bps

Full alignment

BX248109.8	1	GGCCAGGGTGGTCTTGAACTCCTGACCTCAGGCAATCCGCCTGCCTCGGC	50
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX005144.14	17087	GGCCAGGGTGGTCTTGAACTCCTGACCTCAGGCAATCCGCCTGCCTCGGC	17136

BX248109.8	51	GTCCCAAAGTGCTGGGATTATAGGCATGAGCCACCGTGCCCAGCCTCATA	100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX005144.14	17137	GTCCCAAAGTGCTGGGATTATAGGCATGAGCCACCGTGCCCAGCCTCATA	17186

BX248109.8	101	TGTATAATTTTTAGTTAAATTAATAAATTAATATTTATGGTTTTCATCAT	150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX005144.14	17187	TGTATAATTTTTAGTTAAATTAATAAATTAATATTTATGGTTTTCATCAT	17236

BX248109.8	151	TATGACTTTGTAATATTTTTCACAGCTGAGCTCCATGGTATACCATAATT	200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX005144.14	17237	TATGACTTTGTAATATTTTTCACAGCTGAGCTCCATGGTATACCATAATT	17286

BX248109.8	201	ACCTTCTTTGACAACCTTTTGTTCTTCCTGGGATTAATAATTGCCTCCTG	250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX005144.14	17287	ACCTTCTTTGACAACCTTTTGTTCTTCCTGGGATTAATAATTGCCTCCTG	17336

BX248109.8	251	TTCTTTGCTTACTTTTCTAAATATTTATTCCTAATTCAATACCAGCTTTC	300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX005144.14	17337	TTCTTTGCTTACTTTTCTAAATATTTATTCCTAATTCAATACCAGCTTTC	17386

BX248109.8	301	TGACACTATTTTCTCGTCAAATGCATGAGGCAGTATGTCAGTTCCATTTT	350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX005144.14	17387	TGACACTATTTTCTCGTCAAATGCATGAGGCAGTATGTCAGTTCCATTTT	17436

BX248109.8	351	CCCCCATTGGAAACAACCCTCGTTTAGCCCTCTTTTTTCTATTCCACCGT	400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX005144.14	17437	CCCCCATTGGAAACAACCCTCGTTTAGCCCTCTTTTTTCTATTCCACCGT	17486

BX248109.8	401	AGACTGATTGCCTTCTAGCCTGGTAGCTCAGCAGTTGCCCCGGAGTTTTT	450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX005144.14	17487	AGACTGATTGCCTTCTAGCCTGGTAGCTCAGCAGTTGCCCCGGAGTTTTT	17536

BX248109.8	451	TCCTTTACCTTTCTCCTGTGTTAGGTCCCCAGTCACCGGATTTCATATTT	500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX005144.14	17537	TCCTTTACCTTTCTCCTGTGTTAGGTCCCCAGTCACCGGATTTCATATTT	17586

BX248109.8	501	CCTTTTTCTTAGTTTAATTCCCTAGTTAGTGGACAATTCTCCAGAAGCTT	550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX005144.14	17587	CCTTTTTCTTAGTTTAATTCCCTAGTTAGTGGACAATTCTCCAGAAGCTT	17636

BX248109.8	551	TCTGAGAAAAGGTACTTGGGAGATAATGTTCTGCAAATGTCCATTCACAT	600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX005144.14	17637	TCTGAGAAAAGGTACTTGGGAGATAATGTTCTGCAAATGTCCATTCACAT	17686

BX248109.8	601	TTGATTGATAGTTTGGCTGGGTTCAGAAATCTAGTTGTGGAAACTATTTT	650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX005144.14	17687	TTGATTGATAGTTTGGCTGGGTTCAGAAATCTAGTTGTGGAAACTATTTT	17736

BX248109.8	651	CCTTTATTGAAATGATTTAGAAGGCATTGCCTCATTGTCTTTCAGCTTTT	700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX005144.14	17737	CCTTTATTGAAATGATTTAGAAGGCATTGCCTCATTGTCTTTCAGCTTTT	17786

BX248109.8	701	GGTGTTGGTGCTGCTGTGGAGAAAAAAAGATGACATTCTAATTCATAATC	750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX005144.14	17787	GGTGTTGGTGCTGCTGTGGAGAAAAAAAGATGACATTCTAATTCATAATC	17836

BX248109.8	751	CTTTCTGTGCAATCTTTTAGTTTTGTTTTCCTTCTGGAAACATTTAGGAT	800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX005144.14	17837	CTTTCTGTGCAATCTTTTAGTTTTGTTTTCCTTCTGGAAACATTTAGGAT	17886

BX248109.8	801	ATTCACTTTATTCGTCTGATATTTCACAATGACAAGCTTTATTGTGGGGC	850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX005144.14	17887	ATTCACTTTATTCGTCTGATATTTCACAATGACAAGCTTTATTGTGGGGC	17936

BX248109.8	851	TTTGCCACACCCTATGCAGGGTAGTTGGTGGGCCTTTTAAATCTGGAGAC	900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX005144.14	17937	TTTGCCACACCCTATGCAGGGTAGTTGGTGGGCCTTTTAAATCTGGAGAC	17986

BX248109.8	901	TTAAGGTCTTTGGTTCTGAAAAATAATCTTATATTACATCTTTATCTCCT	950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX005144.14	17987	TTAAGGTCTTTGGTTCTGAAAAATAATCTTATATTACATCTTTATCTCCT	18036

BX248109.8	951	TTATTCCACTTTCTCCTCTTTTCCTAGAATCCCTGTTAGTTTGTTGGCAT	1000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX005144.14	18037	TTATTCCACTTTCTCCTCTTTTCCTAGAATCCCTGTTAGTTTGTTGGCAT	18086

BX248109.8	1001	ATCTTCTATTATACACCATTTTATTTTCTTATCAATTCTTTGCTATTTTC	1050
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX005144.14	18087	ATCTTCTATTATACACCATTTTATTTTCTTATCAATTCTTTGCTATTTTC	18136

BX248109.8	1051	CATCATTCACCCCAAACTTTCCAGATTTCTACAACCTTATTTTGAAATTT	1100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX005144.14	18137	CATCATTCACCCCAAACTTTCCAGATTTCTACAACCTTATTTTGAAATTT	18186

BX248109.8	1101	TAGGCCAGGCGCAGTGGCTCACAACTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCT	1150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX005144.14	18187	TAGGCCAGGCGCAGTGGCTCACAACTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCT	18236

BX248109.8	1151	GAGGCGGGCGGATCACCTGAGGTTGGGAGTTCGAGACCAGTCAGACCAAC	1200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX005144.14	18237	GAGGCGGGCGGATCACCTGAGGTTGGGAGTTCGAGACCAGTCAGACCAAC	18286

BX248109.8	1201	ATGGAGAAACCCTGTCTTAACTAAAAACATAAAATTAGCCGGGCGTGGTG	1250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX005144.14	18287	ATGGAGAAACCCTGTCTTAACTAAAAACATAAAATTAGCCGGGCGTGGTG	18336

BX248109.8	1251	GCGCATGCCTGTAATCCCAGCTACTCTGGAGGCAGAAGAATCTCTTGAAC	1300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX005144.14	18337	GCGCATGCCTGTAATCCCAGCTACTCTGGAGGCAGAAGAATCTCTTGAAC	18386

BX248109.8	1301	CTGGAAGGCAGAGGTTGTGGTGAGCCGAGATTGCATCATTGCACTCCAGC	1350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX005144.14	18387	CTGGAAGGCAGAGGTTGTGGTGAGCCGAGATTGCATCATTGCACTCCAGC	18436

BX248109.8	1351	CTGGGCAACAAGCGCCAAACCCCGTCTCAAGAAAAAAAAAAAAGAAATTT	1400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX005144.14	18437	CTGGGCAACAAGCGCCAAACCCCGTCTCAAGAAAAAAAAAAAAGAAATTT	18486

BX248109.8	1401	TTAAAAATCCAGCCATCATAATATTATTAATAATTTTAAGAACTCCCCTC	1450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX005144.14	18487	TTAAAAATCCAGCCATCATAATATTATTAATAATTTTAAGAACTCCCCTC	18536

BX248109.8	1451	CTTTTTGTTTCATGAGTGCAGTATCTTCTCTTACTTTCCCGAGGATTAAT	1500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX005144.14	18537	CTTTTTGTTTCATGAGTGCAGTATCTTCTCTTACTTTCCCGAGGATTAAT	18586

BX248109.8	1501	TATAATTTTTAAAAAATCCAACTTCCTGCATTGTATTTGTTTCCTCTTAG	1550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX005144.14	18587	TATAATTTTTAAAAAATCCAACTTCCTGCATTGTATTTGTTTCCTCTTAG	18636

BX248109.8	1551	GTTCTTCCTGCCCCCTTCTGTTTGTATTCGTCCTTGTCTTATTGTAGAAA	1600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX005144.14	18637	GTTCTTCCTGCCCCCTTCTGTTTGTATTCGTCCTTGTCTTATTGTAGAAA	18686

BX248109.8	1601	TATTTTCACAACCACCTGATTATCCTTGGTTGTCGTACATATTTTAAGTA	1650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX005144.14	18687	TATTTTCACAACCACCTGATTATCCTTGGTTGTCGTACATATTTTAAGTA	18736

BX248109.8	1651	AGGCACTAAACACCTGATTCTGGAAGCTCTGTGGACCTGCTCCAAGCCTG	1700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX005144.14	18737	AGGCACTAAACACCTGATTCTGGAAGCTCTGTGGACCTGCTCCAAGCCTG	18786

BX248109.8	1701	TAGACTGCAGAGTCTTTGGGGATTCTATGGAGACCCAGCCATTTCTTTGG	1750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX005144.14	18787	TAGACTGCAGAGTCTTTGGGGATTCTATGGAGACCCAGCCATTTCTTTGG	18836

BX248109.8	1751	GAGATCCTCAAATACCAGTGTTTGTCGTTGTTTTAATTTTTATTTTTTCC	1800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX005144.14	18837	GAGATCCTCAAATACCAGTGTTTGTCGTTGTTTTAATTTTTATTTTTTCC	18886

BX248109.8	1801	TTGTAAATTGACTTGGATATCTCATCTGTCTTTCTTTATCTCTGGAAAAC	1850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX005144.14	18887	TTGTAAATTGACTTGGATATCTCATCTGTCTTTCTTTATCTCTGGAAAAC	18936

BX248109.8	1851	TTTATCCCAGTTTCCCTTGACATACTCCTTCAACCTCCTGGGAGAGGTAG	1900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX005144.14	18937	TTTATCCCAGTTTCCCTTGACATACTCCTTCAACCTCCTGGGAGAGGTAG	18986

BX248109.8	1901	GGGGAGGGGAGATGAGCCTGTTTGACTAGTTCTGGGAATGTGGTGAGGGA	1950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX005144.14	18987	GGGGAGGGGAGATGAGCCTGTTTGACTAGTTCTGGGAATGTGGTGAGGGA	19036

BX248109.8	1951	AGAGATCTGGGGATTTCGGCTCTGTGCTGACACTTCCTTCATGCTACTCT	2000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX005144.14	19037	AGAGATCTGGGGATTTCGGCTCTGTGCTGACACTTCCTTCATGCTACTCT	19086

Overview

Query
BX248109.8 - 52611 bps
Hit
BX005144.14 - 19086 bps
Total alignments
1
Best alignment
alignment #1 (HSP: 2000 bps)
Best alignment cartoon

Alternate alignments

Short-link